秋山真那斗 (Manato Akiyama) - マイポータル

基本情報

所属: 北里大学未来工学部データサイエンス学科専任講師

研究者番号: 20992704
J-GLOBAL ID: 202401005329693500
researchmap会員ID: R000069602

経歴

2025年4月 - 現在

北里大学, 未来工学部データサイエンス学科, 専任講師
2022年5月 - 2025年4月

慶應義塾大学, 理工学部生命情報学科, 助教

論文

Leveraging tree-transformer VAE with fragment tokenization for high-performance large chemical model generation

Tensei Inukai, Aoi Yamato, Manato Akiyama, Yasubumi Sakakibara

Communications Chemistry 8(1) 2025年8月5日査読有り
Generative AI-driven artificial DNA design for enhancing inter-species gene activation and enzymatic degradation of PET

Manato Akiyama, Motohiko Tashiro, Ying Huang, Mika Uehara, Taiki Kanzaki, Mitsuhiro Itaya, Masakazu Kataoka, Kenji Miyamoto, Yasubumi Sakakibara

2025年5月14日筆頭著者
Deep learning of multimodal networks with topological regularization for drug repositioning

Yuto Ohnuki, Manato Akiyama, Yasubumi Sakakibara

Journal of Cheminformatics 16(1) 2024年8月23日査読有り
Variational autoencoder-based chemical latent space for large molecular structures with 3D complexity

Toshiki Ochiai, Tensei Inukai, Manato Akiyama, Kairi Furui, Masahito Ohue, Nobuaki Matsumori, Shinsuke Inuki, Motonari Uesugi, Toshiaki Sunazuka, Kazuya Kikuchi …

Communications Chemistry 6(1) 2023年11月16日査読有り
RNA Secondary Structure Prediction Based on Energy Models

Manato Akiyama, Kengo Sato

Methods in Molecular Biology 89-105 2023年1月28日
Direct Inference of Base-Pairing Probabilities with Neural Networks Improves Prediction of RNA Secondary Structures with Pseudoknots

Manato Akiyama, Yasubumi Sakakibara, Kengo Sato

Genes 13(11) 2155-2155 2022年11月18日査読有り筆頭著者
Informative RNA base embedding for RNA structural alignment and clustering by deep representation learning

Manato Akiyama, Yasubumi Sakakibara

NAR Genomics and Bioinformatics 4(1) 2022年1月13日査読有り
RNA secondary structure prediction using deep learning with thermodynamic integration

Kengo Sato, Manato Akiyama, Yasubumi Sakakibara

Nature Communications 12(1) 2021年2月11日査読有り
Genomic style: yet another deep-learning approach to characterize bacterial genome sequences

Yuka Yoshimura, Akifumi Hamada, Yohann Augey, Manato Akiyama, Yasubumi Sakakibara

Bioinformatics Advances 1(1) 2021年1月1日査読有り
Analysis and synthesis of feature map for kernel-based quantum classifier

Yudai Suzuki, Hiroshi Yano, Qi Gao, Shumpei Uno, Tomoki Tanaka, Manato Akiyama, Naoki Yamamoto

Quantum Machine Intelligence 2(1) 2020年6月査読有り筆頭著者
A max-margin training of RNA secondary structure prediction integrated with the thermodynamic model

Manato Akiyama, Kengo Sato, Yasubumi Sakakibara

Journal of Bioinformatics and Computational Biology 16(06) 1840025-1840025 2018年12月査読有り筆頭著者

秋山真那斗

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