藤本仰一 (Koichi Fujimoto) - マイポータル

基本情報

所属: 大阪大学理学研究科生物科学専攻准教授

学位: 学術博士(2001年3月東京大学総合文化研究科広域科学専攻)
学士(1996年3月東京大学工学部物理工学科)

J-GLOBAL ID: 201101083147200705
researchmap会員ID: B000003456

外部リンク: http://www.bio.sci.osaka-u.ac.jp/~fujimoto/

研究キーワード

研究分野

論文

Patterned proliferation orients tissue-wide stress to control root vascular symmetry in Arabidopsis

Motohiro Fujiwara, Miyu Imamura, Katsuyoshi Matsushita, Pawel Roszak, Takafumi Yamashino, Yoichiroh Hosokawa, Keiji Nakajima, Koichi Fujimoto, Shunsuke Miyashima

Current Biology 33(5) 886-898.e8 2023年3月
GRAS transcription factors regulate cell division planes in moss overriding the default rule.

Masaki Ishikawa, Ayaka Fujiwara, Ken Kosetsu, Yuta Horiuchi, Naoya Kamamoto, Naoyuki Umakawa, Yosuke Tamada, Liechi Zhang, Katsuyoshi Matsushita, Gergo Palfalvi, Tomoaki Nishiyama, Sota Kitasaki, Yuri Masuda, Yoshiki Shiroza, Munenori Kitagawa, Toru Nakamura, Hongchang Cui, Yuji Hiwatashi, Yukiko Kabeya, Shuji Shigenobu, Tsuyoshi Aoyama, Kagayaki Kato, Takashi Murata, Koichi Fujimoto, Philip N Benfey, Mitsuyasu Hasebe, Rumiko Kofuji

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 120(4) e2210632120 2023年1月24日
Neural mechanism of experience-dependent sensory gain control in C. elegans

Yosuke Ikejiri, Yuki Tanimoto, Kosuke Fujita, Fumie Hiramatsu, Shuhei J. Yamazaki, Yuto Endo, Yasushi Iwatani, Koichi Fujimoto, Koutarou D. Kimura

Neuroscience Research 2023年1月
Collective Cell Movement under Cell-Scale Tension Gradient at Tissue Interface

Katsuyoshi Matsushita, Hidenori Hashimura, Hidekazu Kuwayama, Koichi Fujimoto

Journal of the Physical Society of Japan 91(5) 2022年5月15日
Traveling wave of inflammatory response to regulate the expansion or shrinkage of skin erythema.

Maki Sudo, Koichi Fujimoto

PloS one 17(2) e0263049 2022年
Polymorphism in the symmetries of gastric pouch arrangements in the sea anemone D. lineata.

Safiye E Sarper, Tamami Hirai, Take Matsuyama, Shigeru Kuratani, Koichi Fujimoto

Zoological letters 7(1) 12-12 2021年9月6日査読有り責任著者
Polarity Fluctuation Inhibition by Memory in Collective Cell Motion

Katsuyoshi Matsushita, Shunsuke Yabunaka, Koichi Fujimoto

JOURNAL OF THE PHYSICAL SOCIETY OF JAPAN 90(5) 2021年5月査読有り
Rotation angle of stem cell division plane controls spiral phyllotaxis in mosses.

Naoya Kamamoto, Taishi Tano, Koichi Fujimoto, Masaki Shimamura

Journal of plant research 134(3) 457-473 2021年5月査読有り責任著者
Tissue growth constrains root organ outlines into an isometrically scalable shape.

Motohiro Fujiwara, Tatsuaki Goh, Satoru Tsugawa, Keiji Nakajima, Hidehiro Fukaki, Koichi Fujimoto

Development (Cambridge, England) 148(4) 2021年2月26日査読有り最終著者責任著者
A Mechanical Instability in Planar Epithelial Monolayers Leads to Cell Extrusion.

Satoru Okuda, Koichi Fujimoto

Biophysical journal 118(10) 2549-2560 2020年5月19日査読有り最終著者
Perianth Phyllotaxis Is Polymorphic in the Basal Eudicot Anemone and Eranthis Species

Miho S. Kitazawa, Koichi Fujimoto

Frontiers in Ecology and Evolution 8 2020年3月27日査読有り責任著者
A design principle for floral organ number and arrangement in flowers with bilateral symmetry.

Aiko Nakagawa, Miho S Kitazawa, Koichi Fujimoto

Development (Cambridge, England) 147(3) 2020年2月4日査読有り最終著者責任著者
Crowding-Boosting Polarity and Motion Order of Cells (込み合いによる細胞の極性と運動の秩序促進)

松下勝義, 堀部和也, 鎌本直也, 薮中俊介, 藤本仰一

Proceedings of the Symposium on Simulation of Traffic Flow 25 21-24 2019年12月査読有り
Optimal Scaling of Critical Size for Metamorphosis in the Genus Drosophila.

Ken-Ichi Hironaka, Koichi Fujimoto, Takashi Nishimura

iScience 20 348-358 2019年10月25日査読有り
Cell Motion Alignment as a Polarity Memory Effect

Katsuyoshi Matsushita, Kazuya Horibe, Naoya Kamamoto, Koichi Fujimoto

Journal of the Physical Society of Japan 88(10) 103801-103801 2019年10月15日査読有り
Curved surface geometry-induced topological change of an excitable planar wavefront.

Kazuya Horibe, Ken-Ichi Hironaka, Katsuyoshi Matsushita, Koichi Fujimoto

Chaos (Woodbury, N.Y.) 29(9) 093120-093120 2019年9月査読有り最終著者責任著者
Lateral Inhibition by a Peptide Hormone-Receptor Cascade during Arabidopsis Lateral Root Founder Cell Formation.

Koichi Toyokura, Tatsuaki Goh, Hidefumi Shinohara, Akinori Shinoda, Yuki Kondo, Yoshie Okamoto, Takeo Uehara, Koichi Fujimoto, Yoko Okushima, Yoshifumi Ikeyama, Keiji Nakajima, Tetsuro Mimura, Masao Tasaka, Yoshikatsu Matsubayashi, Hidehiro Fukaki

Developmental cell 48(1) 64-75 2019年1月7日査読有り
Cell Migration driven by Receptor Density Polarity of Cell-Matrix Adhesion (細胞基質間接着の受容体密度極性による細胞運動)

松下勝義, 堀部和也, 鎌本直也, 藤本仰一

Proseeding of the Symposium on Simulation of Traffic Flow 24 5-8 2018年12月査読有り
Competition for Space Is Controlled by Apoptosis-Induced Change of Local Epithelial Topology.

Alice Tsuboi, Shizue Ohsawa, Daiki Umetsu, Yukari Sando, Erina Kuranaga, Tatsushi Igaki, Koichi Fujimoto

Current biology : CB 28(13) 2115-2128 2018年7月9日査読有り最終著者責任著者
A quantitative study of the diversity of stripe-forming processes in an arthropod cell-based field undergoing axis formation and growth.

Natsuki Hemmi, Yasuko Akiyama-Oda, Koichi Fujimoto, Hiroki Oda

Developmental biology 437(2) 84-104 2018年5月15日査読有り

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MISC

器官の形に種を超えた共通性をもたらす物理

郷達明, 藤原基洋, 津川暁, 藤本仰一

生物物理 62(1) 7-12 2022年1月査読有り招待有り最終著者
多種少量データを対象とした隣接花弁の重なり順推定

中谷友哉, 内海ゆづ子, 藤本仰一, 岩村雅一, 黄瀬浩一

電子情報通信学会技術研究報告(Web) 120(409(PRMU2020 69-101)) 2021年
少数性制御による細胞の集団回転

松下勝義, 藪中俊介, 橋村秀典, 桑山秀一, 藤本仰一

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 76(1) 2021年
細胞から個体に至る動植物の形を定量し,生まれる仕組みを探る数理

藤本仰一

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 23rd 2021年
Macro Scope : サイエンティストが導く地球市民への道生き物の性質は数式で予測できる

藤本仰一, 佐藤邦彦

Works 26(3) 38-41 2020年8月
細胞競合の力学的理解 (第1土曜特集細胞競合による生体制御とがん) -- (細胞競合の力学・動態・数理)

坪井有寿, 奥田覚, 藤本仰一

医学のあゆみ 274(5) 537-543 2020年8月1日
組織界面での細胞流-細胞性粘菌の細胞流の機構の候補として-

松下勝義, 橋村秀典, 桑山秀一, 藤本仰一

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 75(2) 2020年
限られた空間で正確な組織収納を可能にするECMの時空間制御の解明

坪井有寿, 藤本仰一, 近藤武史, 近藤武史

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
込み合った細胞集団運動での閾駆動力の低減

松下勝義, 堀部和也, 鎌本直也, 薮中俊介, 藤本仰一

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 75(1) 2020年
花のボディプランの種内多型

藤本仰一, 北沢美帆

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 22nd 2020年
発生過程からみる花器官配置のゆらぎと多様化

北沢美帆, 北沢美帆, 藤本仰一

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 21st 2019年
細胞競合の多細胞力学:勝者細胞の優先的拡大と敗者細胞の逸脱方向の調節ロジック

坪井有寿, 坪井有寿, 奥田覚, 奥田覚, 藤本仰一

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年
根端のカテナリー形状は異方的な細胞伸長により達成される

藤原基洋, 郷達明, 津川暁, 藤本仰一

日本植物学会大会研究発表記録 83rd 2019年
維管束の側方成長と組織パターンを統合する細胞間相互作用

宮島俊介, 藤原基洋, 藤本仰一, 中島敬二

日本植物学会大会研究発表記録 83rd 2019年
側根原基のドーム形状形成の安定化は異方的な細胞成長の局在により実現される

藤原基洋, 郷達明, 中島啓二, 藤本仰一

Plant Morphology 31(1) 2019年
花の器官数を決める数理

北沢美帆, 藤本仰一

生物物理 59(5) 266-270 2019年査読有り
細胞基質間接着の受容体密度極性による細胞運動

松下勝義, 堀部和也, 鎌本直也, 藤本仰一

交通流と自己駆動粒子系シンポジウム論文集 24th 2018年
細胞分裂面制御からみるボディプランの進化

鎌本直也, 松下勝義, 長谷部光泰, 藤本仰一

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 20th 2018年
形の空間にみる制約された揺らぎと多様性:花器官配置の数理解析

北沢美帆, 北沢美帆, 藤本仰一

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 20th 2018年
Evo-Devoの数理;発展と未来

藤本仰一

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 20th 2018年

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講演・口頭発表等

単純な力学模型による脳の皺形成のシミュレーション

松下勝義, 堀部和也, 鎌本直也, 廣中謙一, 藤本仰一

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 2018年9月21日
2種類の細胞間の真っ直ぐで滑らかな境界は,境界から離れた局所的な細胞成長により促進される

藤原基洋, 宮島俊介, 中島敬二, 藤本仰一

日本植物学会大会研究発表記録 2018年9月1日
形の空間にみる制約された揺らぎと多様性:花器官配置の数理解析

北沢美帆, 北沢美帆, 藤本仰一

日本植物学会大会研究発表記録 2018年9月1日
細胞分裂面制御からみるボディプランの進化

鎌本直也, 松下勝義, 長谷部光泰, 藤本仰一

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 2018年8月22日
Evo‐Devoの数理;発展と未来

藤本仰一

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 2018年8月22日
形の空間にみる制約された揺らぎと多様性:花器官配置の数理解析

北沢美帆, 北沢美帆, 藤本仰一

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 2018年8月22日
花器官配置の多様性を数理モデルから読み解く

北沢美帆, 北沢美帆, 藤本仰一

日本植物学会大会研究発表記録 2017年9月1日
植物組織では異方的な細胞成長が細胞間の滑らかな境界形成を促進する

藤原基洋, 藤本仰一, 宮島俊介

日本植物学会大会研究発表記録 2017年9月1日
花器官配置の制約された揺らぎ:花器官数の多様化との相関

藤本仰一, 北沢美帆

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 2017年8月24日
完全変態昆虫における変態のための臨界重量の適応的意義

廣中謙一, 廣中謙一, 西村隆史, 藤本仰一

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 2017年3月21日
曲面による進行パルス波の分裂

堀部和也, 廣中謙一, 松下勝義, 藤本仰一

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 2017年3月21日
細胞壁をもつ植物における器官形成の解析―側根形成をモデルとして―

郷達明, 郷達明, 藤原基洋, 藤本仰一, 深城英弘

日本細胞生物学会大会(Web) 2017年
細胞死により空いた隙間をめぐる力学的な細胞競合

坪井有寿, 大澤志津江, 井垣達吏, 藤本仰一

日本細胞生物学会大会(Web) 2017年
曲面によって引き起こされる進行パルス波の分裂

堀部和也, 廣中謙一, 松下勝義, 藤本仰一

日本物理学会講演概要集 2017年
細胞死で空いた領地をめぐる力学的な細胞競合

坪井有寿, 大澤志津江, 井垣達吏, 藤本仰一

日本物理学会講演概要集 2017年
陸上植物の根端分裂組織に見られるドーム形状の曲線は共通する

藤原基洋, 藤本仰一

日本植物学会大会研究発表記録 2016年9月1日
花器官配置の対称性の発生進化を数理モデルでたどる

中川愛子, 北沢美帆, 藤本仰一

日本植物学会大会研究発表記録 2016年9月1日
細胞競合その本質と生理的意義に迫る細胞競合の数理モデル不均一な増殖に対する上皮組織の恒常的な変形

坪井有寿, 大澤志津江, 井垣達吏, 藤本仰一

日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集 2015年12月
細胞社会を支える適者生存システム細胞競合の分子基盤とその役割細胞競合の数理モデル不均一な増殖により生じる細胞の形の恒常性破綻とその維持

坪井有寿, 大澤志津江, 井垣達吏, 藤本仰一

日本細胞生物学会大会講演要旨集 2015年6月
花の左右対称と回転対称を切り替える仕組み

中川愛子, 北沢美帆, 藤本仰一

形の科学会誌 2015年6月

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

器官配置の周期を構成し変調するメリステム動態の理論生物学

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2022年4月 - 2024年3月

藤本仰一
刺胞動物の放射対称性と左右対称性を調節する原理の構成的理解：実験と数理モデル

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2021年7月 - 2024年3月

藤本仰一
ホヤ心臓の構築と動作に関する分子メカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

西野敦雄, 藤原滋樹, 藤本仰一
器官配置の周期を構成し変調するメリステム動態の理論生物学：コケと花

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2020年4月 - 2022年3月

藤本仰一
進化のゆらぎ応答理論の確立と多階層・発生過程への展開

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2017年6月 - 2022年3月

金子邦彦, 藤本仰一
植物発生進化のグランドプランとしての細胞分裂軸制御機構とその時空間制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2016年5月 - 2021年3月

長谷部光泰, 村田隆, 石川雅樹, 望月敦史, 関本弘之, 小藤累美子, 藤本仰一, 玉田洋介
細胞競合の数理解析：適応度の差がもたらす多細胞力学

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2017年4月 - 2019年3月

藤本仰一
ヒト脳の形態形成から行動生成に至る発達のダイナミクス

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2014年5月 - 2019年3月

多賀厳太郎, 山田重人, 藤本仰一, 佐藤譲, 高橋尚人, 高桑徹也, 保前文高, 小薮大輔, 渡辺はま, 佐治量哉
数と対称性の発生進化ロジック：花器官配置の数理解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2016年4月 - 2018年3月

藤本仰一
「自伐型林業」方式による中山間地域の経済循環と環境保全モデルの構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2015年4月 - 2018年3月

家中茂, 興梠克久, 鎌田磨人, 佐藤宣子, 松村和則, 笠松浩樹, 藤本仰一, 田村隆雄
細胞競合の数理解析:増殖速度の差と極性崩壊がもたらす多細胞力学

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2015年4月 - 2017年3月

藤本仰一
花器官数の正確性と確率性を調節する発生基盤の数理解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2014年4月 - 2016年3月

藤本仰一
細胞密度に依存した細胞の集団的応答の分子ネットワーク設計

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2011年4月 - 2015年3月

藤本仰一

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