2016年4月 - 2019年3月
発生系譜のインフォマティクス技術の構築と、胚の生きの良さの定量化への応用
日本学術振興会 科学研究費助成事業 若手研究(A)
本研究では、哺乳類着床前胚の発生系譜を定量的に解析する手法の構築を目指し、画像解析技術・統計解析技術・シミュレーション技術の構築を行った。
画像解析では、胚内の細胞を同定する手法を改良し、最終的にはそこから得られたデータを用いた深層画像解析法の提案を行った。系譜統計解析では、細胞の分裂待ち時間などから細胞の潜在情報を推定する手法を提案した。そして、胚内の細胞における力学的相互作用と発生プロセスの再現を目指し力学モデルの構築を行った。
これらを異なる培養条件で得られたマウス着床前胚の解析に応用することで、培養条件依存的な分裂パターンの脱同調や胚全体での構造変化と細胞周期の関係などが明らかになった。
画像解析では、胚内の細胞を同定する手法を改良し、最終的にはそこから得られたデータを用いた深層画像解析法の提案を行った。系譜統計解析では、細胞の分裂待ち時間などから細胞の潜在情報を推定する手法を提案した。そして、胚内の細胞における力学的相互作用と発生プロセスの再現を目指し力学モデルの構築を行った。
これらを異なる培養条件で得られたマウス着床前胚の解析に応用することで、培養条件依存的な分裂パターンの脱同調や胚全体での構造変化と細胞周期の関係などが明らかになった。
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- ID情報
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- 課題番号 : 16H06155
- 体系的課題番号 : JP16H06155
この研究課題の成果一覧
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論文
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npj Systems Biology and Applications 6(1) 32-32 2020年12月 査読有り
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Bioinformatics 36(9) 2829-2838 2020年5月1日 査読有り最終著者
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Physical Review E 99(1) 012413 2019年1月 査読有り
講演・口頭発表等
1-
第42回日本分子生物学会年会 2019年12月