古田智敬 (Tomoyuki Furuta) - マイポータル

基本情報

所属: 岡山大学資源植物科学研究所助教

学位: 農学博士(名古屋大学)

J-GLOBAL ID: 201701001110787941
researchmap会員ID: B000275897

研究分野

環境・農学 / 遺伝育種科学 / 植物遺伝育種学

経歴

2024年3月 - 現在

岡山大学, 資源植物科学研究所, 准教授
2019年3月 - 2024年2月

岡山大学, 資源植物科学研究所, 助教
2014年4月 - 2019年2月

名古屋大学, 生物機能開発利用研究センター, 博士研究員

学歴

2011年4月 - 2014年3月

名古屋大学, 生命農学研究科生命技術科学専攻, 高次生体分子機能研究分野
2009年4月 - 2011年3月

名古屋大学, 理学研究科生命理学専攻, 分子神経生物学研究室
2005年4月 - 2009年3月

名古屋大学, 理学部生命理学科, 分子神経生物学研究室

受賞

2023年9月

第144回講演会日本育種学会優秀発表賞, アジアイネゲノムとの網羅的オーソログ解析に基づくアフリカイネゲノムの特徴づけ, 日本育種学会

古田智敬, 佐藤豊, 吉村淳, 芦苅基行
2022年3月

第141回講演会日本育種学会優秀発表賞, 他殖性作物の多系交雑集団にも対応した遺伝子型データエラー修正ツール「GBScleanR」の開発, 日本育種学会

古田智敬, 芦苅基行, 山本敏央

論文

Genetic variation in heading dates and phenological parameters of Myanmar rice

Moe Moe Hlaing, Yoshiyuki Yamagata, Tomoyuki Furuta, Khin Thanda Win, Ohm Mar Saw, Akinori Ozaki, Hideshi Yasui, Atsushi Yoshimura

Plant Production Science 2024年2月18日査読有り
MCPtaggR: R package for accurate genotype calling in reduced representation sequencing data by eliminating error-prone markers based on genome comparison

Tomoyuki Furuta, Toshio Yamamoto

DNA Research 2024年2月1日査読有り筆頭著者責任著者
Development of genomic and genetic resources facilitating molecular genetic studies on untapped Myanmar rice germplasms

Tomoyuki Furuta, Ohm Mar Saw, Sandar Moe, Khin Thanda Win, Moe Moe Hlaing, Aye Lae Lae Hlaing, Min San Thein, Hideshi Yasui, Motoyuki Ashikari, Atsushi Yoshimura …

Breeding Science 2024年
GBScleanR: Robust genotyping error correction using a hidden Markov model with error pattern recognition.

Tomoyuki Furuta, Toshio Yamamoto, Motoyuki Ashikari

Genetics 224(2) 2023年3月29日査読有り筆頭著者責任著者
Regulator of Awn Elongation 3, an E3 ubiquitin ligase, is responsible for loss of awns during African rice domestication.

Kanako Bessho-Uehara, Kengo Masuda, Diane R Wang, Rosalyn B Angeles-Shim, Keisuke Obara, Keisuke Nagai, Riri Murase, Shin-Ichiro Aoki, Tomoyuki Furuta, Kotaro Miura …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 120(4) e2207105120 2023年1月24日査読有り
Effectiveness of Create ML in microscopy image classifications: a simple and inexpensive deep learning pipeline for non-data scientists.

Kiyotaka Nagaki, Tomoyuki Furuta, Naoki Yamaji, Daichi Kuniyoshi, Megumi Ishihara, Yuji Kishima, Minoru Murata, Atsushi Hoshino, Hirotomo Takatsuka

Chromosome research 29(3-4) 361-371 2021年10月14日査読有り
Antagonistic regulation of the gibberellic acid response during stem growth in rice.

Keisuke Nagai, Yoshinao Mori, Shin Ishikawa, Tomoyuki Furuta, Rico Gamuyao, Yoko Niimi, Tokunori Hobo, Moyuri Fukuda, Mikiko Kojima, Yumiko Takebayashi …

Nature 584(7819) 109-114 2020年8月査読有り
Ethylene-gibberellin signaling underlies adaptation of rice to periodic flooding

Takeshi Kuroha, Keisuke Nagai, Rico Gamuyao, Diane R. Wang, Tomoyuki Furuta, Masanari Nakamori, Takuya Kitaoka, Keita Adachi, Anzu Minami, Yoshinao Mori …

Science 361(6398) 181-186 2018年7月13日査読有り
Assembling the genome of the African wild rice Oryza longistaminata by exploiting synteny in closely related Oryza species.

Stefan Reuscher, Tomoyuki Furuta, Kanako Bessho-Uehara, Michele Cosi, Kshirod K Jena, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, Nori Kurata, Motoyuki Ashikari

Communications biology 1 162-162 2018年査読有り
Construction of rice chromosome segment substitution lines harboring Oryza barthii genome and evaluation of yield-related traits

Kanako Bessho-Uehara, Tomoyuki Furuta, Kengo Masuda, Shuto Yamada, Rosalyn B. Angeles-Shim, Motoyuki Ashikari, Tomonori Takashi

BREEDING SCIENCE 67(4) 408-415 2017年9月査読有り
Adapting Genotyping-by-Sequencing for Rice F2 Populations

Tomoyuki Furuta, Motoyuki Ashikari, Kshirod K. Jena, Kazuyuki Doi, Stefan Reuscher

G3-GENES GENOMES GENETICS 7(3) 881-893 2017年3月査読有り
Development of chromosome segment substitution lines harboring Oryza nivara genomic segments in Koshihikari and evaluation of yield-related traits

Tomoyuki Furuta, Kanako Uehara, Rosalyn B. Angeles-Shim, Junghyun Shim, Keisuke Nagai, Motoyuki Ashikari, Tomonori Takashi

BREEDING SCIENCE 66(5) 845-850 2016年12月査読有り
Loss of function at RAE2, a previously unidentified EPFL, is required for awnlessness in cultivated Asian rice

Kanako Bessho-Uehara, Diane R. Wang, Tomoyuki Furuta, Anzu Minami, Keisuke Nagai, Rico Gamuyao, Kenji Asano, Rosalyn B. Angeles-Shim, Yoshihiro Shimizu, Madoka Ayano …

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 113(32) 8969-8974 2016年8月査読有り
Development of chromosome segment substitution lines (CSSLs) of Oryza longistaminata A. Chev. & Röhr in the background of the elite japonica rice cultivar, Taichung 65 and their evaluation for yield traits

Joie M. Ramos, Joie M. Ramos, Tomoyuki Furuta, Kanako Uehara, Niwa Chihiro, Rosalyn B. Angeles-Shim, Rosalyn B. Angeles-Shim, Junghyun Shim, Darshan S. Brar, Motoyuki Ashikari …

Euphytica 210(2) 151-163 2016年7月査読有り
Construction of a versatile SNP array for pyramiding useful genes of rice

Yusuke Kurokawa, Tomonori Noda, Yoshiyuki Yamagata, Rosalyn Angeles-Shim, Hidehiko Sunohara, Kanako Uehara, Tomoyuki Furuta, Keisuke Nagai, Kshirod Kumar Jena, Hideshi Yasui …

PLANT SCIENCE 242 131-139 2016年1月査読有り
Convergent Loss of Awn in Two Cultivated Rice Species Oryza sativa and Oryza glaberrima Is Caused by Mutations in Different Loci

Tomoyuki Furuta, Norio Komeda, Kenji Asano, Kanako Uehara, Rico Gamuyao, Rosalyn B. Angeles-Shim, Keisuke Nagai, Kazuyuki Doi, Diane R. Wang, Hideshi Yasui …

G3-GENES GENOMES GENETICS 5(11) 2267-2274 2015年11月査読有り
Rare allele of a previously unidentified histone H4 acetyltransferase enhances grain weight, yield, and plant biomass in rice

Xian Jun Song, Takeshi Kuroha, Madoka Ayano, Tomoyuki Furuta, Keisuke Nagai, Norio Komeda, Shuhei Segami, Kotaro Miura, Daisuke Ogawa, Takumi Kamura …

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 112(1) 76-81 2015年1月査読有り
Development and evaluation of chromosome segment substitution lines (CSSLs) carrying chromosome segments derived from Oryza rufipogon in the genetic background of Oryza sativa L.

Tomoyuki Furuta, Kanako Uehara, Rosalyn B. Angeles-Shim, Junghyun Shim, Motoyuki Ashikari, Tomonori Takashi

BREEDING SCIENCE 63(5) 468-475 2014年1月査読有り

MISC

アフリカ栽培イネOryza glaberrimaにおける雑種不稔遺伝子座S1の進化的特異性の検討

山口圭太, 小出陽平, 山形悦透, 古田智敬, 貴島祐治

日本育種学会・日本作物学会北海道談話会会報 62 44-45 2021年
異なる地点でのイネMAGIC集団の出穂期評価で検出された遺伝子型×環境相互作用

山本敏央, 柏原壱成, 古田智敬, 小川大輔, 野々上慈徳, 常松浩史, 米丸淳一

育種学研究 22 2020年
イネ育種における遺伝的多様性を拡大するための2,3のアプローチ

山本敏央, 古田智敬, 小川大輔, 米丸淳一, 國吉大地, 貴島祐治

作物研究 65 2020年
イネの芒はどうして消失したか?~植物ホルモンとの関係~

別所-上原奏子, 古田智敬, 芦苅基行

生物の科学遺伝 70(5) 58-62 2016年

講演・口頭発表等

Development of R packages for accurate genotype calling and error correction in reduced representation sequencing based genotyping

Plant and Animal Genome 31 2024年1月15日
アジアイネゲノムとの網羅的オーソログ解析に基づくアフリカイネゲノムの特徴づけ

古田智敬, 佐藤豊, 吉村淳, 芦苅基行

日本育種学会第144回講演会 2023年9月16日
Pipeline for accurate Genotype-by-Sequencing via eliminating error prone markers

Tomoyuki Furuta, Toshio Yamamoto

The 19th International Symposium on Rice Functional Genomics 2022年11月4日
エラーを低減した Genotyping-by-Sequencing 解析パイプラインの構築

古田智敬

第5回植物インフォマティクス研究会・年会 2022年10月18日
Pipeline for accurate genotype calling via eliminating error prone markers.

古田智敬

第18回日本ナス科コンソーシアム年会 2022年10月9日招待有り
次世代シークエンスを用いたジェノタイピングにおける比較ゲノム情報に基づく誤判定の低減法

古田智敬, 鳥羽大陽, 貴島祐治, 山本敏央

日本育種学会第142回講演会 2022年9月23日
他殖性作物の多型交雑集団にも対応した遺伝子型データエラー修正ツール「GBScleanR」の開発

古田智敬, 芦苅基行, 山本敏央

日本育種学会第141回講演会 2022年3月21日
アフリカイネOryza glaberrima品種群を用いたゲノム育種基盤構築

古田智敬, 佐藤豊, 芦苅基行

日本育種学会第139回講演会 2021年3月21日
隠れマルコフモデルを用いたエラー修正による低コスト育種のためのGBSパイプライン構築

日本育種学会第133回講演会 2018年3月25日
Exploring rhizome formation loci in Rice

古田智敬

Towards Increased Plant Productivity through Understanding of Environmental Responses and Epigenetic Regulation 2015年11月24日招待有り
GBSを利用した野生イネと栽培イネの交雑に由来するF2 集団におけるQTL解析」

古田智敬

日本育種学会第128回講演会 2015年9月11日招待有り
QTL analysis for rhizome formation loci using Genotyping-By-Sequencing on F2 population from the cross between Oryza sativa and Oryza longistaminata.

Furuta T, Reuscher S, Uehara K, Kondo H, Shim-Angels RB, Doi K, Ashikari M

International ERATO Higashiyama Live-Holonics Symposium & Technical Workshop 2015 2015年8月

所属学協会

2014年4月 - 現在

日本育種学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

有用遺伝子探索を革新するオミクスベースクローニング法の実証

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2027年3月

古田智敬, 鳥羽大陽, 永井啓祐, 黒羽剛
限られた育種母本から高能率に遺伝的多様性を生み出す多系交雑育種システムの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2020年4月 - 2024年3月

山本敏央, 小川大輔, 米丸淳一, 古田智敬
アフリカ栽培イネ特異的な高温ストレス耐性のゲノムワイド解析とGWASカタログ構築

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究若手研究 2020年4月 - 2023年3月

古田智敬

古田智敬

基本情報

研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

MISC

講演・口頭発表等

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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