鴫田玄太郎 (Gentaro Shigita) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構野菜花き研究部門プロジェクト型任期付研究職員

学位: 博士（農学）(2021年3月岡山大学)

研究者番号: 91011055
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-1732-7830
J-GLOBAL ID: 202101009847261596
researchmap会員ID: R000021972

研究分野

経歴

2026年4月 - 2029年3月

国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構, 野菜花き研究部門, プロジェクト型任期付研究職員
2023年4月 - 2026年3月

筑波大学, 生命環境系, 日本学術振興会特別研究員-PD
2023年4月 - 2025年2月

ミュンヘン工科大学, 客員研究員
2020年9月 - 2023年3月

ミュンヘン工科大学, 研究助手

学歴

2018年4月 - 2021年3月

岡山大学, 大学院環境生命科学研究科, 博士後期課程
2016年4月 - 2018年3月

岡山大学, 大学院環境生命科学研究科, 博士前期課程
2012年4月 - 2016年3月

岡山大学, 農学部, 総合農業科学科

受賞

2025年11月

優秀発表賞, 葉緑体パンゲノミクスで遡る栽培メロンの起源, 日本育種学会

鴫田玄太郎, 大熊眞歩, 十河奈々, 清古貴, 武藤千秋, 田中克典, 下村晃一郎, 杉山充啓, 川頭洋一, 江面浩, 内藤健, 友岡憲彦, 加藤鎌司
2024年11月

論文賞（第56号）, Elucidation of genetic variation and population structure of melon genetic resources in the NARO Genebank, and construction of the World Melon Core Collection, 日本育種学会

Gentaro Shigita, Tran Phuong Dung, Mst. Naznin Pervin, Thanh-Thuy Duong, Odirich Nnennaya Imoh, Yuki Monden, Hidetaka Nishida, Katsunori Tanaka, Mitsuhiro Sugiyama, Yoichi Kawazu, Norihiko Tomooka, Kenji Kato

論文

A novel phylogenomics pipeline reveals extensive topological conflict in the evolution of the angiosperm order Cucurbitales

Edgardo M. Ortiz, Alina Höwener, Gentaro Shigita, Mustafa Raza, Olivier Maurin, Alexandre Zuntini, Félix Fores, William J. Baker, Hanno Schaefer

Systematic Biology 2026年査読有り
Polyphyletic domestication and inter-lineage hybridization magnified genetic diversity of cultivated melon, Cucumis melo L.

Katsunori Tanaka, Gentaro Shigita, Tran Phuong Dung, Phan Thi Phuong Nhi, Mami Takahashi, Yuki Monden, Hidetaka Nishida, Ryuji Ishikawa, Kenji Kato

Breeding Science 75(3) 168-178 2025年7月査読有り
Molecular polymorphisms of the nuclear and chloroplast genomes among African melon germplasms reveal abundant and unique genetic diversity, especially in Sudan

Odirichi Nnennaya Imoh, Gentaro Shigita, Mitsuhiro Sugiyama, Tran Phuong Dung, Katsunori Tanaka, Mami Takahashi, Kazusa Nishimura, Yuki Monden, Hidetaka Nishida, Mashaer Goda …

Annals of Botany 135(7) 1329-1344 2025年4月17日査読有り
Current and future pangenomic research in cucurbit crops

Gentaro Shigita, Katsunori Tanaka, Kenji Kato

Breeding Science 75(1) 34-50 2025年3月査読有り筆頭著者
Genetic characterization of cucumber genetic resources in the NARO Genebank indicates their multiple dispersal trajectories to the East

Gentaro Shigita, Koichiro Shimomura, Tran Phuong Dung, Naznin Pervin Haque, Thuy Thanh Duong, Odirich Nnennaya Imoh, Yuki Monden, Hidetaka Nishida, Katsunori Tanaka, Mitsuhiro Sugiyama …

Theoretical and Applied Genetics 137 174 2024年7月2日査読有り筆頭著者
A deletion in FLS2 and its expansion after domestication caused global dissemination of melon cultivars defective in flagellin recognition

Chujia Jin, Hiroki Matsuo, Yoshizo Nakayama, Gentaro Shigita, Yoshihiro Inoue, Kenji Kato, Yoshitaka Takano

The Plant Journal 119 1671-1684 2024年6月26日査読有り
Resolving the phylogeny of Thladiantha (Cucurbitaceae) with three different target capture pipelines

Mustafa Raza, Edgardo M. Ortiz, Lea Schwung, Gentaro Shigita, Hanno Schaefer

BMC Ecology and Evolution 23 75 2023年12月12日査読有り
A novel phylogenomics pipeline reveals complex pattern of reticulate evolution in Cucurbitales

Edgardo M. Ortiz, Alina Höwener, Gentaro Shigita, Mustafa Raza, Olivier Maurin, Alexandre Zuntini, Félix Forest, William J. Baker, Hanno Schaefer

bioRxiv 2023.10.27.564367 2023年11月1日
Analysis of genetic diversity and population structure in Cambodian melon landraces using molecular markers

Pervin Mst Naznin, Odirichi Nnennaya Imoh, Katsunori Tanaka, Ouch Sreynech, ·, Gentaro Shigita, ·, Yon Sophea, Sakhan Sophany, Ouk Makara …

Genetic Resources and Crop Evolution 71 1067-1083 2023年7月23日査読有り
Elucidation of genetic variation and population structure of melon genetic resources in the NARO Genebank, and construction of the World Melon Core Collection

Gentaro Shigita, Tran Phuong Dung, Mst. Naznin Pervin, Thanh-Thuy Duong, Odirich Nnennaya Imoh, Yuki Monden, Hidetaka Nishida, Katsunori Tanaka, Mitsuhiro Sugiyama, Yoichi Kawazu …

Breeding Science 73(3) 269-277 2023年査読有り筆頭著者
Melon diversity on the Silk Road by molecular phylogenetic analysis in Kazakhstan melons

Katsunori Tanaka, Mitsuhiro Sugiyama, Gentaro Shigita, Ryoma Murakami, Thanh-Thuy Duong, Yasheng Aierken, Anna M Artemyeva, Zharas Mamypbelov, Ryuji Ishikawa, Hidetaka Nishida …

Breeding Science 73(2) 219-229 2023年査読有り
Distribution of two groups of melon landraces and inter-group hybridization enhanced genetic diversity in Vietnam

Thanh-Thuy Duong, Tran Phuong Dung, Katsunori Tanaka, Phan Thi Phuong Nhi, Gentaro Shigita, Odirichi Nnennaya Imoh, Hidetaka Nishida, Kenji Kato

Breeding Science 71(5) 564-574 2021年査読有り
2017年度カンボジアにおけるウリ科作物遺伝資源の探索

田中克典, 鴫田玄太郎, Tran Phuong Dung, Yon Sophea, Vathany Thun, Sakhan Sophany, 加藤鎌司

植物遺伝資源探索導入調査報告書 35 121-146 2020年3月査読有り
2016年度カンボジアにおけるウリ科作物遺伝資源の探索

田中克典, 鴫田玄太郎, Yon Sophea, Vathany Thun, Sakhan Sophany, 加藤鎌司

植物遺伝資源探索導入調査報告書 33 175-205 2018年3月査読有り

書籍等出版物

Die Stechpalme im Gebiet der Bayerischen Voralpen: Vorkommen und Genetik

Jörg Ewald, Hanno Schäfer, Michelangelo Olleck, Sabine Rösler, Florian Gibis, Toni Kastner, Alina Höwener, Edgardo M. Ortiz, Gentaro Shigita (担当:共著)

Zentrum Wald Forst Holz Weihenstephan 2022年12月 (ISBN: 3933506549)

講演・口頭発表等

葉緑体パンゲノミクスで遡る栽培メロンの起源

鴫田玄太郎, 大熊眞歩, 十河奈々, 清古貴, 武藤千秋, 田中克典, 下村晃一郎, 杉山充啓, 川頭洋一, 江面浩, 内藤健, 友岡憲彦, 加藤鎌司

日本育種学会第148回講演会 2025年9月11日
マクワとシロウリにおける果実形質関連QTLsの推定と成立過程

田中克典, 中嶋くるみ, 鴫田玄太郎, 大熊眞歩, 石川隆二, 西田英隆, 加藤鎌司

日本育種学会第147回講演会 2025年3月21日
日本の在来メロンであるマクワとシロウリの果実形質に関わるQTLsの推定

中嶋くるみ, 鴫田玄太郎, 大熊眞歩, 石川隆二, 西田英隆, 加藤鎌司, 田中克典

日本育種学会第146回講演会 2024年9月20日
日本のネットメロンにおける全可溶性固形物含量関連遺伝子座の効果と起源

山中麻友香, 佐藤奈乃佳, 鴫田玄太郎, 大熊眞歩, 石川隆二, 西田英隆, 加藤鎌司, 田中克典

日本育種学会第146回講演会 2024年9月20日
Development of core collections for melon and cucumber in the NARO Genebank, Japan

Gentaro Shigita, Koichiro Shimomura, Tran Phuong Dung, Naznin Pervin Haque, Thuy Thanh Duong, Odirich Nnennaya Imoh, Yuki Monden, Hidetaka Nishida, Katsunori Tanaka, Mitsuhiro Sugiyama, Yoichi Kawazu, Norihiko Tomooka, Kenji Kato

EUCARPIA General Congress 2024 2024年8月19日
Phylogenomics and a revised classification of the Cucurbitales

Hanno Schaefer, Gentaro Shigita, Edgardo M. Ortiz

XX International Botanical Congress 2024年7月26日
The draft genome of the cucumber tree (Dendrosicyos socotranus, Cucurbitaceae) as a genomic basis of adaptive evolution on islands

Gentaro Shigita, Edgardo M. Ortiz, Alina Höwener, Hiroshi Ezura, Hanno Schaefer

XX International Botanical Congress 2024年7月25日
Applying the phylogenomics package Captus to polyploid, contaminated, and degraded samples

Edgardo M. Ortiz, Gentaro Shigita, Hanno Schaefer

XX International Botanical Congress 2024年7月22日
Loss of CmFLS2 and subsequent expansion after domestication have generated commercial cultivars defective in flagellin recognition

Chujia Jin, Hiroki Matsuo, Yoshizo Nakayama, Gentaro Shigita, Yoshihiro Inoue, Kenji Kato, Yoshitaka Takano

2024 Annual Meeting of the Phytopathological Society of Japan 2024年3月14日
メロンにおけるワタアブラムシ抵抗性遺伝子座周辺配列の比較解析および選抜マーカーの開発

十河奈々, 大熊眞歩, Odirichi Nnennaya Imoh, 長井朋美, 鴫田玄太郎, 田中克典, 西村和紗, 清古貴, 武藤千秋, 内藤健, 門田有希, 杉山充啓, 西田英隆, 川頭洋一, 友岡憲彦, 加藤鎌司

日本育種学会第144回講演会 2023年9月16日
Molecular polymorphisms reveals genetic diversity among African melon germplasms with emphasis on Sudan melon

Odirichi Nnennaya Imoh, Gentaro Shigita, Tran Phoung Dung, Katsunori Tanaka, Phan Thi Phuong Nhi, Yuki Monden, Hidetaka Nishida, Kenji Kato

The 143rd Meeting of the Japanese Society of Breeding 2023年3月18日
メロンにおける種間雑種の作出およびそのゲノム解析

長井朋美, 鴫田玄太郎, 十河奈々, Odirichi Nnennaya Imoh, 清古貴, 武藤千秋, 内藤健, 門田有希, 田中克典, 西田英隆, 加藤鎌司

日本育種学会第143回講演会 2023年3月18日
メロンの全ゲノム解析により明らかになった葉緑体ゲノム（母系）の多様性と系統進化

十河奈々, 大熊眞歩, Odirichi Nnennaya Imoh, 長井朋美, 清古貴, 武藤千秋, 内藤健, 門田有希, 杉山充啓, 鴫田玄太郎, 田中克典, 西田英隆, 川頭洋一, 友岡憲彦, 加藤鎌司

日本育種学会第142回講演会 2022年9月23日
Genetic diversity of European holly (Ilex aquifolium) in the German Alps

Gentaro Shigita, Edgardo M. Ortiz, Florian M. Gibis, Toni Kastner, Alina Hoewener, Joerg Ewald, Hanno Schaefer

Botany 2022 2022年7月26日
Assessing Cucurbitaceae diversity in Madagascar using Nanopore-based field genomics

Edgardo M. Ortiz, Alina Hoewener, Minosoa Andriamiharisoa, Gentaro Shigita, Tendro Radanielina, Hanno Schaefer

Botany 2022 2022年7月25日
ゲノムサイズの多様性に基づくCucumis属の系統進化に関する検討

長井朋美, 鴫田玄太郎, 十河奈々, Odirichi Nnennaya Imoh, 田中克典, 西田英隆, 加藤鎌司

日本育種学会第141回講演会 2022年3月21日
モルディブで採種された野生(?)メロンの特性解析

十河奈々, Odirichi Nnennaya Imoh, 長井朋美, 鴫田玄太郎, 田中克典, 西田英隆, 加藤鎌司

日本育種学会第141回講演会 2022年3月21日
Southeast Asia is rich in melon landraces harboring resistant allele of MeVat gene for cotton aphid resistance

Odirichi Nnennaya Imoh, Tran Phuong Dung, Mst. Naznin Pervin, Katsunori Tanaka, Gentaro Shigita, Hidetaka Nishida, Kenji Kato

The 141st Meeting of the Japanese Society of Breeding 2022年3月21日
Southeast Asia is rich in melon landraces resistant to Melon Necrotic Spot Virus (MNSV)

Odirichi Nnennaya Imoh, Tran Phuong Dung, Mst. Naznin Pervin, 鴫田玄太郎, 田中克典, 西田英隆, 加藤鎌司

The 139th Meeting of the Japanese Society of Breeding 2021年3月21日
葉緑体ゲノムの配列変異解析が示すメロンの近縁野生種

長井朋美, 丸山純, 田中克典, 鴫田玄太郎, Odirichi Nnennaya Imoh, 西田英隆, 加藤鎌司

日本育種学会第139回講演会 2021年3月21日