合田浩明 (Hiroaki Gouda) - マイポータル

基本情報

所属: 昭和大学薬学部基礎薬学講座生物物理化学部門教授

学位: 博士(薬学)(東京大学)
薬学修士(東京大学)

J-GLOBAL ID: 200901033761084546
researchmap会員ID: 1000189223

研究キーワード

研究分野

論文

Three-Dimensional CH/π and CH/N Interactions from Quantum-Mechanical and Database Analyses

Daichi Hayakawa, Hiroaki Gouda

Journal of Chemical Information and Modeling 2025年4月14日
Molecular Interaction Fields Describing Halogen Bond Formable Areas on Protein Surfaces

Daichi Hayakawa, Yurie Watanabe, Hiroaki Gouda

Journal of Chemical Information and Modeling 2024年7月16日
A water-mediated hydrogen-bond network facilitates an exceptionally strong preference for asparagine in the S2 subsite of dipeptidyl peptidase 7 from Stenotrophomonas maltophilia

Yasumitsu Sakamoto, Akihiro Nakamura, Yoshiyuki Suzuki, Saori Roppongi, Chisato Kushibiki, Natsuri Yonezawa, Masato Takahashi, Yosuke Shida, Hiroaki Gouda, Takamasa Nonaka …

Acta Crystallographica Section A Foundations and Advances 79(a2) C672-C672 2023年8月22日
Design, synthesis, structure-activity relationship studies, and evaluation of novel GLS1 inhibitors.

Michiko Jo, Keiichi Koizumi, Mizuho Suzuki, Daisuke Kanayama, Yurie Watanabe, Hiroaki Gouda, Hisashi Mori, Mineyuki Mizuguchi, Takayuki Obita, Yuko Nabeshima …

Bioorganic & medicinal chemistry letters 87 129266-129266 2023年5月1日
Discovery of novel orexin receptor antagonists using a 1,3,5-trioxazatriquinane bearing multiple effective residues (TriMER) library.

Tsuyoshi Saitoh, Mao Amezawa, Jumpei Horiuchi, Yasuyuki Nagumo, Naoshi Yamamoto, Noriki Kutsumura, Ryuichiro Ohshita, Akihisa Tokuda, Yoko Irukayama-Tomobe, Yasuhiro Ogawa …

European journal of medicinal chemistry 240 114505-114505 2022年10月5日
Systematic preparation method of a molecular model explicitly describing electron distributions for halogen bonds

Daichi Hayakawa, Nanako Terauchi, Aika Iwasaki, Yurie Watanabe, Hiroaki Gouda

Chemical Physics Letters 139754-139754 2022年6月
Design and synthesis of pyrido[2,3-d]pyrimidine derivatives for a novel PAC1 receptor antagonist

Ichiro Takasaki, Ai Watanabe, Takuya Okada, Daisuke Kanayama, Ryota Nagashima, Miyu Shudo, Ayaka Shimodaira, Kazuto Nunomura, Bangzhong Lin, Yurie Watanabe …

European Journal of Medicinal Chemistry 231 114160-114160 2022年3月
Morphinan derivatives with an oxabicyclo[3.2.1]octane structure as dual agonists toward δ and κ opioid receptors

Yuka Uenohara, Saori Tsumura, Shigeto Hirayama, Eika Higashi, Yurie Watanabe, Hiroaki Gouda, Hiroshi Nagase, Hideaki Fujii

Bioorganic & Medicinal Chemistry 53 116552-116552 2022年1月
Unpolarizable molecular model describing electron distribution for treating halogen bonds

Daichi Hayakawa, Yurie Watanabe, Hiroaki Gouda

Chemical Physics Letters 779 2021年9月16日
Structural basis for an exceptionally strong preference for asparagine residue at the S2 subsite of Stenotrophomonas maltophilia dipeptidyl peptidase 7.

Akihiro Nakamura, Yoshiyuki Suzuki, Yasumitsu Sakamoto, Saori Roppongi, Chisato Kushibiki, Natsuri Yonezawa, Masato Takahashi, Yosuke Shida, Hiroaki Gouda, Takamasa Nonaka …

Scientific reports 11(1) 7929-7929 2021年4月12日
A pentagonal hydrogen-bond network facilitates an exceptional preference for asparagine in the S2 subsite of Stenotrophomonas maltophilia dipeptidyl peptidase 7

Akihiro Nakamura, Yoshiyuki Suzuki, Yasumitsu Sakamoto, Saori Roppongi, Chisato Kushibiki, Natsuri Yonezawa, Masato Takahashi, Yosuke Shida, Hiroaki Gouda, Takamasa Nonaka …

2021年1月11日
Development of Novel AKR1C3 Inhibitors as New Potential Treatment for Castration-Resistant Prostate Cancer.

Satoshi Endo, Hiroaki Oguri, Jin Segawa, Mina Kawai, Dawei Hu, Shuang Xia, Takuya Okada, Katsumasa Irie, Shinya Fujii, Hiroaki Gouda …

Journal of medicinal chemistry 63(18) 10396-10411 2020年9月24日
Effects of N-Substituents on the Functional Activities of Naltrindole Derivatives for the δ Opioid Receptor: Synthesis and Evaluation of Sulfonamide Derivatives

Chiharu Iwamatsu, Daichi Hayakawa, Tomomi Kono, Ayaka Honjo, Saki Ishizaki, Shigeto Hirayama, Hiroaki Gouda, Hideaki Fujii

Molecules 25(17) 3792-3792 2020年8月20日査読有り
A molecular interaction field describing nonconventional intermolecular interactions and its application to protein–ligand interaction prediction

Daichi Hayakawa, Nahoko Sawada, Yurie Watanabe, Hiroaki Gouda

Journal of Molecular Graphics and Modelling 96 2020年5月1日
Synthesis of a novel and potent small-molecule antagonist of PAC1 receptor for the treatment of neuropathic pain

Ichiro Takasaki, Haruna Ogashi, Takuya Okada, Ayaka Shimodaira, Daichi Hayakawa, Ai Watanabe, Atsuro Miyata, Takashi Kurihara, Hiroaki Gouda, Naoki Toyooka

European Journal of Medicinal Chemistry 111902 2019年11月査読有り
Fragment-based discovery of the first nonpeptidyl inhibitor of an S46 family peptidase.

Sakamoto Y, Suzuki Y, Nakamura A, Watanabe Y, Sekiya M, Roppongi S, Kushibiki C, Iizuka I, Tani O, Sakashita H …

Scientific Reports 9(1) 2019年9月査読有り
ニトログリセリン誘発片頭痛モデルマウスの疼痛関連行動におよぼす新規PAC1受容体アンタゴニストの効果

高崎一朗, 岡田健斗, 柴崎千華, 下平文香, 岡田卓哉, 豊岡尚樹, 合田浩明, 宮田篤郎, 栗原崇

PAIN RESEARCH 34(2) 166-166 2019年7月
Formal Syntheses of (-)-Lepadiformines A, C, and (-)-Fasicularin

Katsuki Takashima, Daichi Hayakawa, Hiroaki Gouda, Naoki Toyooka

Journal of Organic Chemistry 84 5222-5229 2019年5月3日
Essential structure of orexin 1 receptor antagonist YNT-707, part III: Role of the 14-hydroxy and the 3-methoxy groups in antagonistic activity toward the orexin 1 receptor in YNT-707 derivatives lacking the 4,5-epoxy ring

Naoshi Yamamoto, Sayaka Ohrui, Takahiro Okada, Tsuyoshi Saitoh, Noriki Kutsumura, Yasuyuki Nagumo, Yoko Irukayama-Tomobe, Yasuhiro Ogawa, Yukiko Ishikawa, Yurie Watanabe …

Bioorganic and Medicinal Chemistry 27(8) 1747-1758 2019年4月15日
Essential structure of orexin 1 receptor antagonist YNT-707, part III: Role of the 14-hydroxy and the 3-methoxy groups in antagonistic activity toward the orexin 1 receptor in YNT-707 derivatives lacking the 4,5-epoxy ring

Yamamoto, Naoshi, Ohrui, Sayaka, Okada, Takahiro, Saitoh, Tsuyoshi, Kutsumura, Noriki, Nagumo, Yasuyuki, Irukayama-Tomobe, Yoko, Ogawa, Yasuhiro, Ishikawa, Yukiko, Watanabe, Yurie …

Bioorganic & medicinal chemistry 27(8) 1747-1758 2019年4月

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MISC

δオピオイド受容体とκオピオイド受容体作動活性を示すオキサビシクロ[3.2.1]オクタン構造を有するモルヒナン誘導体の合成

平山重人, 上之原由佳, 津村沙織, 東永華, 渡邉友里江, 合田浩明, 長瀬博, 藤井秀明

日本薬学会年会要旨集(Web) 142nd 2022年
分子ドッキングと分子動力学計算による,PgDPP11と阻害剤NPPBの相互作用解析

渡邉友里江, 早川大地, 合田浩明

日本薬学会年会要旨集(Web) 142nd 2022年
電子密度フィッティング法による電荷分布を明示的に記述する分子モデルの構築

早川大地, 渡邉友里江, 合田浩明

日本薬学会年会要旨集(Web) 142nd 2022年
多剤耐性菌Stenotrophomonas maltophilia DPP7に対する抗菌薬開発に向けた阻害剤開発の構造基盤

阪本泰光, 中村彰宏, 鈴木義之, 六本木沙織, 櫛引千里, 米澤夏里, 高橋聖人, 志田洋介, 合田浩明, 野中孝昌 …

日本薬学会年会要旨集(Web) 142nd 2022年
物理化学的性質を表す特性球に基づいたHLA-抗原ペプチド相互作用のデータベース構築と解析

早川大地, 渡邉友里江, 合田浩明

日本薬学会年会要旨集(Web) 141st 2021年
電荷分布を明示的に記述する分子モデル構築のための電子密度フィッティング法

早川大地, 渡邉友里江, 合田浩明

構造活性相関シンポジウム講演要旨集 49th (CD-ROM) 2021年
キモトリプシン様ペプチダーゼを標的とするフラグメント創薬による非ペプチド系阻害剤の探索

阪本泰光, 鈴木義之, 中村彰宏, 關谷瑞樹, 六本木沙織, 櫛引千里, 谷修, 山田貢, 本間宣行, 志田洋介 …

日本薬学会年会要旨集(Web) 141st 2021年
Probe-based QM modelingによるタンパク質/リガンド相互作用計算法の検証

早川大地, 渡邉友里江, 合田浩明

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 140th 2020年
抗菌薬開発に資するPorphyromonas gingivalis由来Dipeptidyl peptidase11の構造解析と阻害化合物探索

中村彰宏, 阪本泰光, 鈴木義之, 鈴木義之, 渡邉友里江, 關谷瑞樹, 六本木沙織, 櫛引千里, 飯塚一平, 谷修 …

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2020 2020年
Non-conventional相互作用を記述可能な分子相互作用場計算法の構築とタンパク質-リガンド相互作用解析への応用

早川大地, 渡邉友里江, 合田浩明

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 139th 2019年
高精度タンパク質-リガンド相互作用解析を目指したprobe-based QM modeling法の考案と検証

早川大地, 渡邉友里江, 合田浩明

構造活性相関シンポジウム講演要旨集 47th (CD-ROM) 2019年
部位特異的変異導入解析によるFamily S46ペプチダーゼの基質認識残基の同定

本間宣行, 中村彰宏, 六本木沙織, 鈴木義之, 志田洋介, 阪本泰光, 飯塚一平, 伊中浩治, 田仲広明, 木平清人 …

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2018 ROMBUNNO.3A25a05 (WEB ONLY) 2018年3月5日
グラム陰性細菌Pseudoxanthomonas mexicana WO24由来Dipeptidyl aminopeptidase IVの構造・機能解析

中村彰宏, 本間宣行, 六本木沙織, 鈴木義之, 志田洋介, 阪本泰光, 飯塚一平, 伊中浩治, 田中広明, 木平清人 …

日本ゲノム微生物学会年会要旨集 12th 85 2018年3月5日
Pseudoxanthomonas mexicana WO24由来Dipeptidyl aminopeptidase IVの基質認識機構の解明

中村彰宏, 本間宣行, 六本木沙織, 鈴木義之, 志田洋介, 阪本泰光, 飯塚一平, 伊中浩治, 田仲広明, 木平清人 …

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2018 ROMBUNNO.3A25a04 (WEB ONLY) 2018年3月5日
分子動力学計算を用いたアルドケト還元酵素AKR1C3のC154Y及びL159V変異体の溶液構造解析

渡邉友里江, 早川大地, 遠藤智史, 合田浩明

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 138th 2018年
歯周病治療薬の開発を目指したPgDPP11阻害剤の探索研究

渡邉(小田)友里江, 合田浩明

昭和学士会雑誌 78(4) 2018年
ハロゲン結合や弱い水素結合を記述可能な分子相互作用場計算法の構築

早川大地, 渡邉友里江, 合田浩明

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 138th 2018年
量子化学計算とプローブ分子に基づいた分子相互作用場の算出とタンパク質-リガンド相互作用解析への応用

早川大地, 渡邉友里江, 合田浩明

構造活性相関シンポジウム講演要旨集 46th 2018年
1,3,5-Trioxazatriquinane骨格を有するトリマーの合成とオレキシン受容体拮抗活性評価

雨澤真櫻, 堀内惇平, 斉藤毅, 大下隆一郎, 小川靖裕, 石川有紀子, 入鹿山容子, 長谷川恵美, 南雲康行, 山本直司 …

日本薬学会関東支部大会講演要旨集 62nd 2018年
神経細胞の過剰活性を抑制する新規セリンラセマーゼ阻害薬の創製

高原理行, 森寿, 森寿, 和田亮吾, 堀野良和, 和泉宏謙, 石本哲也, 吉田知之, 吉田知之, 水口峰之, 水口峰之 …

メディシナルケミストリーシンポジウム講演要旨集 35th 115 2017年10月4日

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

量子化学計算に基づいたリガンド結合部位の分子相互作用場算出法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2026年3月

合田浩明
知識ベースを活用したHLA提示抗原ペプチド予測法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2019年4月 - 2023年3月

合田浩明
アルツハイマー型認知症の改善作用を伴った新規糖尿病治療薬のイン・シリコ分子設計

文部科学省科学研究費補助金（基盤研究(C)） 2015年4月 - 2018年3月

合田浩明
癌細胞の生存戦略破綻を作用点とする抗癌剤の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2014年4月 - 2017年3月

遠藤智史, 豊岡直樹, 合田浩明, 田中信忠, 桑田一夫
PAC1受容体シグナリングによる疼痛慢性化機構の解明と創薬

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2014年4月 - 2017年3月

高崎一朗, 栗原崇, 豊岡尚樹, 合田浩明
新規な２型糖尿病治療薬の開発を目指したＳＨＩＰ２阻害剤のイン・シリコ分子設計

文部科学省科学研究費補助金（基盤研究(C)） 2012年4月 - 2015年3月

合田浩明
計算創薬技術を用いたマクロライド骨格を持つ新規キチナーゼ阻害剤の構造最適化

文部科学省科学研究費補助金（基盤研究(C)） 2009年4月 - 2012年3月

合田浩明
新規抗ガン剤の創製を目指したCRK-C3G相互作用阻害剤のイン・シリコ分子設計

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2009年 - 2011年

広野修一, 合田浩明, 山乙教之, 中込泉
In silico創薬技術を用いた新規キチナーゼ阻害剤の分子設計

文部科学省科学研究費補助金（基盤研究(C)） 2007年4月 - 2009年3月

合田浩明
動態を考慮した創薬研究のためのトランスポータリガンドの三次元ファーマコフォア解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2006年 - 2007年

広野修一, 合田浩明, 松下泰雄, 山乙教之, 中込泉
心臓血管系副作用(QT延長作用)を有する薬物の3次元定量的構造活性相関解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2003年 - 2004年

広野修一, 合田浩明, 松下泰雄, 山乙教之, 中込泉
ヒト血清アルブミンに対する薬物の結合配座決定と薬物―アルブミン複合体の構造構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2000年 - 2001年

広野修一, 山乙教之, 合田浩明, 松下泰雄, 中込泉
NMR測定と計算化学習法による薬物の血清アルブミンに対するサイト別結合様式の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 1998年 - 1999年

広野修一, 合田浩明, 山乙教之, 松下泰雄, 中込泉
分子動力学シミュレーションによるカルモデュリン-阻害剤複合体の溶液構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究(A) 1998年 - 1999年

広野修一, 山乙教之, 合田浩明
水溶液中の分子動力学計算に基づくα-コノトキシン類の立体構造決定

日本学術振興会科学研究費助成事業奨励研究(A) 1996年 - 1996年

合田浩明
分子動力学計算とTRNOE測定による血清アルブミン結合薬物の配座解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 1995年 - 1996年

広野修一, 中込泉, 山乙教之, 合田浩明, 松下康雄
Structure-based drug design
Computer-aided drug design
Study on Structure and Function of protein by Nuclear Magnetic Resonance

合田浩明

基本情報

研究キーワード

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論文

MISC

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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