山田寛尚 (Hironao Yamada) - マイポータル

基本情報

所属: 東京薬科大学情報教育研究センター助教
: 統計数理研究所ものづくりデータ科学研究センター特任研究員

学位: 生命科学(2017年3月東京薬科大学)

J-GLOBAL ID: 201801016379053280
researchmap会員ID: B000327617

研究分野

経歴

2022年4月 - 現在

東京薬科大学, 情報教育研究センター, 助教
2019年6月 - 現在

統計数理研究所, ものづくりデータ科学研究センター, 特任研究員
2019年4月 - 2022年3月

東京薬科大学, 情報教育研究センター, 嘱託助教
2017年5月 - 2019年3月

統計数理研究所, ものづくりデータ科学研究センター, 特任研究員

論文

Molecular dynamics simulation of structural changes in the LIM2 domain of FHL1 caused by tyrosine mutants

Motokuni Nakajima, Yoh Noguchi, Hironao Yamada, Ryota Morikawa, Yukiko K. Hayashi, Masako Takasu

Molecular Simulation 51(5) 298-310 2025年3月24日
東京薬科大学における電子メールシステムの歴史とWeb 3.0

森河, 良太, 山田, 寛尚, 倉田, 香織

東京薬科大学研究紀要 (26) 66-73 2023年3月31日
Coarse-Grained Molecular Dynamics Simulation of Thermostable Starch Branching Enzyme

Kosuke Nariyama, Yoh Noguchi, Motokuni Nakajima, Hironao Yamada, Ryota Morikawa, Masako Takasu, Shoko Fujiwara

ACM International Conference Proceeding Series 112-119 2023年1月13日
情報教育のための学内LAN環境整備の在り方について

森河, 良太, 山田, 寛尚, 倉田, 香織

東京薬科大学研究紀要 (25) 100-107 2022年3月31日
薬学教育における情報教育の過去・現在・未来

山田 , 寛尚, 倉田 , 香織, 佐藤 , 弘人

東京薬科大学研究紀要 (25) 108-115 2022年3月31日
「マテリアルズインフォマティクスの最前線」[総合報告]材料研究における転移学習の応用

LIU Chang, 山田寛尚, 山田寛尚, WU Stephen, WU Stephen

統計数理 69(1) 2021年
「マテリアルズインフォマテイクスの最前線」[総合報告]高分子インフォマティクスの諸問題

WU Stephen, WU Stephen, 山田寛尚, 山田寛尚, 林慶浩, ZAMENGO Massimiliano

統計数理 69(1) 2021年
Potentials and challenges of polymer informatics: exploiting machine learning for polymer design

Stephen Wu, Hironao Yamada, Yoshihiro Hayashi, Massimiliano Zamengo, Ryo Yoshida

2020年10月15日
学部新入生の情報教育におけるパソコン利活用について ICT環境調査結果報告

倉田香織, 山田寛尚, 宮川毅, 森河良太, 西田洋平, 佐藤弘人, 土橋朗

東京薬科大学研究紀要 (23) 23-32 2020年3月
TYCOON仮想化基盤の構築とアカデミッククラウドへの道

森河良太, 倉田香織, 山田寛尚, 宮川毅, 土橋朗

東京薬科大学研究紀要 (23) 75-82 2020年3月
Analyses of Interaction between Platinum Bonded LARFH and Gold Surface by Molecular Dynamics Simulation

Mao Watabe, Keiichi Nobuoka, Hironao Yamada, Takeshi Miyakawa, Ryota Morikawa, Masako Takasu, Tatsuya Uchida, Akihiko Yamagishi

ACM International Conference Proceeding Series 101-106 2020年1月19日査読有り
Docking Simulation of Chemerin-9 and ChemR23 Receptor

Keiichi Nobuoka, Hironao Yamada, Takeshi Miyakawa, Ryota Morikawa, Takuya Watanabe, Masako Takasu

ACM International Conference Proceeding Series 22-27 2020年1月19日査読有り
機械学習と量子化学計算を組み合わせた有機分子の探索

山田寛尚, 野口瑶, 吉田亮

日本物理学会講演概要集 75.1 2625-2625 2020年
学部新入生の情報教育におけるパソコン利活用について ICT環境調査結果報告

倉田香織, 山田寛尚, 宮川毅, 森河良太, 西田洋平, 佐藤弘人, 土橋朗

東京薬科大学研究紀要 (23) 23-32 2020年
TYCOON仮想化基盤の構築とアカデミッククラウドへの道

森河良太, 倉田香織, 山田寛尚, 宮川毅, 土橋朗

東京薬科大学研究紀要 (23) 75-82 2020年
Molecular dynamics simulation of myopathy-related mutant FHL1 in water and analysis of structure stabilization

H. Takeuchi, H. Okajima, H. Itoga, K. Nobuoka, H. Yamada, T. Miyakawa, R. Morikawa, Y. K. Hayashi, M. Takasu

AIP Conference Proceedings 2186 2019年12月10日査読有り
Machine-learning-assisted discovery of polymers with high thermal conductivity using a molecular design algorithm

Stephen Wu, Yukiko Kondo, Masa-aki Kakimoto, Bin Yang, Hironao Yamada, Isao Kuwajima, Guillaume Lambard, Kenta Hongo, Yibin Xu, Junichiro Shiomi …

npj Computational Materials 5(1) 2019年12月査読有り
iQSPR in XenonPy: A Bayesian Molecular Design Algorithm.

Wu S, Lambard G, Liu C, Yamada H, Yoshida R

Molecular informatics 39(1-2) 2019年11月査読有り
Predicting Materials Properties with Little Data Using Shotgun Transfer Learning

Yamada H, Liu C, Wu S, Koyama Y, Ju S, Shiomi J, Morikawa J, Yoshida R

ACS Central Science 5(10) 1717-1730 2019年9月査読有り
量子化学計算とベイズ推論を組み合わせた物質探索

山田寛尚, 野口瑶, 吉田亮

日本物理学会講演概要集 74.2 2722-2722 2019年

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MISC

105

耐熱化Branching EnzymeのMDシミュレーションによる構造解析

成山幸助, 野口瑶, 野口瑶, 中島基邦, 山田寛尚, 山田寛尚, 森河良太, 高須昌子, 藤原祥子

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 77(1) 2022年
ジンクフィンガーを2つ持つLIM2ドメインのMDシミュレーションによる動的性質の解析

中島基邦, 野口瑶, 野口瑶, 山田寛尚, 山田寛尚, 森河良太, 高須昌子, 林由起子

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 77(1) 2022年
FHL1タンパク質のLIM2ドメインにある亜鉛配位残基が変異することによる構造変化に関するMDシミュレーション

中島基邦, 野口瑶, 野口瑶, 山田寛尚, 山田寛尚, 森河良太, 高須昌子, 林由起子

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 77(2) 2022年
高温条件下におけるシアニディオシゾン由来Starch Branching EnzymeのMDシミュレーション

成山幸助, 野口瑶, 野口瑶, 中島基邦, 山田寛尚, 山田寛尚, 森河良太, 高須昌子, 藤原祥子

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 77(2) 2022年
分子動力学法シミュレーションによるHSPB8タンパク質の立体構造探索

高橋昌大, 野口瑶, 山田寛尚, 山田寛尚, 森河良太, 高須昌子, 林由起子

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 76(1) 2021年
FHL1タンパク質におけるLIM2ドメイン変異体の動的な解析

中島基邦, 野口瑶, 山田寛尚, 山田寛尚, 森河良太, 高須昌子, 林由起子

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 76(1) 2021年
分子シミュレーションによる筋疾患関連タンパク質FHL1の野生型とLIM2ドメインにおける変異型の構造とダイナミクスの解析

川井俊祐, 野口瑶, 野口瑶, 山田寛尚, 山田寛尚, 宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 林由起子

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 76(1) 2021年
亜鉛配位残基が変異したLIM2ドメインのMDシミュレーション

中島基邦, 野口瑶, 山田寛尚, 山田寛尚, 森河良太, 高須昌子, 林由起子

分子シミュレーション討論会講演要旨集 35th (CD-ROM) 2021年
LIM2ドメインの亜鉛配位残基の変異による構造と動的性質の変化

中島基邦, 野口瑶, 山田寛尚, 山田寛尚, 森河良太, 高須昌子, 林由起子

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 76(2) 2021年
シアニディオシゾン由来Branching Enzymeの粗視化MDシミュレーションによる構造解析

成山幸助, 野口瑶, 野口瑶, 山田寛尚, 山田寛尚, 森河良太, 高須昌子, 藤原祥子

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 76(2) 2021年
東京薬科大学におけるICT環境に関する実態調査-オンライン授業前夜の薬学部学生のBYOD機活用に関する報告-

倉田香織, 山田寛尚, 森河良太, 土橋朗

東京薬科大学研究紀要 (24) 2021年
TYCOONにおけるインターネット回線の歴史とコロナ禍における利用形態の変化について

森河良太, 倉田香織, 山田寛尚, 土橋朗

東京薬科大学研究紀要 (24) 2021年
分子動力学シミュレーションによるFHL1タンパク質の構造とダイナミクスの研究

川井俊祐, 山田寛尚, 山田寛尚, 野口瑶, 宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 林由起子

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 75(2) 2020年
分子動力学シミュレーションで示す筋疾患関連タンパク質FHL1のダイナミクス

川井俊祐, 山田寛尚, 山田寛尚, 野口瑶, 野口瑶, 宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 林由起子

分子シミュレーション討論会講演要旨集 34th (CD-ROM) 2020年
機械学習を用いた有機分子の物性値予測モデルライブラリの作成とその予測

山田寛尚, WU Stephen, CHANG Liu, 吉田亮

統計関連学会連合大会講演報告集 2018 365 2018年9月
筋疾患関連タンパク質FHL1の水溶液条件下における分子動力学シミュレーション

竹内裕紀, 岡嶋大樹, 山田寛尚, 山田寛尚, 宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 林由起子

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 73(1) ROMBUNNO.25aPS‐122 2018年3月23日
粗視化モデルを用いたスレリスリンとLARFHの結合過程の分子動力学シミュレーション

小澤尚史, 山田寛尚, 山田寛尚, 宮川毅, 森河良太, 八木創太, 赤沼哲史, 山岸明彦, 高須昌子

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 73(1) ROMBUNNO.25aPS‐119 2018年3月23日
αDG結合活性を持つラミニンα2鎖由来ペプチドA2G80の分子動力学法を用いた構造解析

山田寛尚, 山田寛尚, 深澤由佳, 宮川毅, 森河良太, 片桐文彦, 保住建太郎, 吉川大和, 野水基義, 高須昌子

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 73(1) ROMBUNNO.25aPS‐123 2018年3月23日
水溶液中および金表面上における金属結合型タンパク質の分子動力学法を用いた研究

渡部真央, 山田寛尚, 山田寛尚, 宮川毅, 森河良太, 高須昌子, 内田達也, 山岸明彦

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 73(1) ROMBUNNO.25aPS‐121 2018年3月23日
高校生の化学の理解における立体模型とコンピュータの役割-夏休み研究実習から-

渡部真央, 野口瑶, 山田寛尚, 宮川毅, 森河良太, 高須昌子

東京薬科大学教職課程年報 = Annual report of Teacher-Training Course in Tokyo University of Pharmacy and Life Sciences School of Life Sciences 2(2) 9-12 2018年1月31日

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