佐藤玄 (Hajime SATO) - マイポータル

基本情報

所属: JST さきがけ「植物分子」
: 東京大学大学院農学生命科学研究科応用生命工学専攻助教

学位: 博士（薬科学）(2016年3月東京大学)

J-GLOBAL ID: 201901009161765484
researchmap会員ID: B000361195

外部リンク

専門：計算化学、天然物化学、有機化学
MEXT 卓越研究員、JST さきがけ「植物分子」

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 生物有機化学 /

経歴

2025年1月 - 現在

東京大学, 大学院農学生命科学研究科応用生命工学専攻助教
2021年10月 - 2025年3月

JST さきがけ研究員（兼任）
2021年1月 - 2024年12月

山梨大学, 工学部応用化学科, 特任助教（PI）（MEXT 卓越研究員） (MEXT 卓越研究員)
2020年4月 - 2020年12月

千葉大学, 大学院薬学研究院, 学術振興会特別研究員（PD）
2018年4月 - 2020年3月

千葉大学, 大学院薬学研究院, 特任助教
2016年4月 - 2018年3月

千葉大学, 大学院薬学研究院, 特任研究員

学歴

2013年4月 - 2016年3月

東京大学, 大学院薬学系研究科, 博士課程
2011年4月 - 2013年3月

東京大学, 大学院薬学系研究科, 修士課程
2007年4月 - 2011年3月

東京理科大学, 薬学部, 生命創薬科学科

受賞

2023年4月

JAICI 賞, 化学情報協会
2023年3月

奨励賞, 日本薬学会
2021年12月

令和3年度「若手研究者等の表彰」最優秀賞, 山梨大学
2021年6月

令和３年度奨励研究, 計算化学と実験科学の協奏による天然物生合成経路の解明, 日本薬学会生薬天然物部会

佐藤玄

論文

ColabReaction: 誰もが手軽に反応機構解析を行える時代へ

佐藤玄, 唐澤昌之, 寺田透, レオチーシャン, 矢島英明, 荒井秀太, 西崎博光

日本農薬学会誌 2026年2月査読有り招待有り筆頭著者責任著者
ColabReaction：反応の核心に、誰でも飛び込める時代へ

佐藤玄, 唐澤昌之, 寺田透, レオチーシャン, 矢島英明, 荒井秀太, 西﨑博光

酵素工学ニュース第94号 2025年10月査読有り招待有り筆頭著者責任著者
ColabReaction: Accelerating Transition State Searches with Machine Learning Potentials on Google Colaboratory

Masayuki Karasawa, Chee Siang Leow, Hideaki Yajima, Shuta Arai, Hiromitsu Nishizaki, Tohru Terada, Hajime Sato

ChemRxiv 2025年7月16日最終著者責任著者
High-Speed Terpene Pathway Analysis via Double-ended Transition State Search Method Combined with ML Potentials Uncovers the Intricate Rearrangement Reaction in Spiroalbatene Biosynthesis

Moe Nakano, Masayuki Karasawa, Takuto Ohmura, Tohru Terada, Hajime Sato

ChemRxiv 2025年6月12日最終著者責任著者
Seven-Membered Ring Formation in Triterpene Biosynthesis: A Key Cyclopropane Rearrangement in Ilelic Acid Biosynthesis

Moe Nakano, Kazuma Hiasa, Satoko Sato-Shimizu, Hajime Sato

The Journal of Organic Chemistry 90(8) 2907-2914 2025年2月17日査読有り最終著者責任著者
Discovery and Theoretical Studies of Nonenzymatic Polyketide Dimerizations of Chaetophenols

Hiroto Matsui, Yohei Morishita, Takashi Yamamoto, Taro Ozaki, Akihiro Sugawara, Yui Masumoto, Mamoru Watanabe, Ayumi Watanabe, Hajime Sato, Junichiro Kanazawa …

Organic Letters 2025年1月27日査読有り
DFT Study on Retigerane-Type Sesterterpenoid Biosynthesis: Initial Conformation of GFPP Regulates Biosynthetic Pathway, Ring-Construction Order and Stereochemistry

Yuichiro Watanabe, Takahiro Hashishin, Hajime Sato, Taro Matsuyama, Masaya Nakajima, Jun-ichi Haruta, Masanobu Uchiyama

JACS Au 4(9) 3484-3491 2024年7月19日
Theoretical Study of Natural Product Biosynthesis Using Computational Chemistry

Hajime Sato

Chemical and Pharmaceutical Bulletin 72(6) 524-528 2024年6月1日査読有り招待有り筆頭著者最終著者責任著者
Structural-model-based genome mining can efficiently discover novel non-canonical terpene synthases hidden in genomes of diverse species

Tohru Abe, Haruna Shiratori, Kosuke Kashiwazaki, Kazuma Hiasa, Daijiro Ueda, Tohru Taniguchi, Hajime Sato, Takashi Abe, Tsutomu Sato

Chemical Science 15(27) 10402-10407 2024年責任著者
Unraveling the role of prenyl side-chain interactions in stabilizing the secondary carbocation in the biosynthesis of variexenol B

Moe Nakano, Rintaro Gemma, Hajime Sato

Beilstein Journal of Organic Chemistry 19 1503-1510 2023年9月28日最終著者責任著者
Mechanistic Investigation of the Degradation Pathways of α–β/α–α Bridged Epipolythiodioxopiperazines (ETPs)

Daiki Kurita, Hajime Sato, Kazunori Miyamoto, Masanobu Uchiyama

The Journal of Organic Chemistry 88(17) 12797-12801 2023年8月14日査読有り責任著者
Theoretical study of the rearrangement reaction in bisorbicillinoid biosynthesis: insights into the molecular mechanisms involved

Moe Nakano, Hajime Sato

Organic & Biomolecular Chemistry 21(26) 5366-5371 2023年6月12日査読有り最終著者責任著者
Revision of the Peniroquesine Biosynthetic Pathway by Retro-Biosynthetic Theoretical Analysis: Ring Strain Controls the Unique Carbocation Rearrangement Cascade

Taro Matsuyama, Ko Togashi, Moe Nakano, Hajime Sato, Masanobu Uchiyama

JACS Au 3(6) 1596-1603 2023年5月15日査読有り責任著者
Concertedness and Activation Energy Control by Distal Methyl Group during Ring Contraction/Expansion in Scalarane‐Type Sesterterpenoid Biosynthesis

Hajime Sato, Moe Nakano

Chemistry – A European Journal 29(11) 2023年1月13日査読有り筆頭著者責任著者
Elucidation of Late-Stage Biosynthesis of Phomoidride: Proposal of Cyclization Mechanism Affording Characteristic Nine-Membered Ring of Fungal Dimeric Anhydride.

Shintaro Yamamoto, Taro Matsuyama, Taro Ozaki, Junya Takino, Hajime Sato, Masanobu Uchiyama, Atsushi Minami, Hideaki Oikawa

Journal of the American Chemical Society 144(46) 20998-21004 2022年11月23日
DFT Study on the Biosynthesis of Asperterpenol and Preasperterpenoid Sesterterpenoids: Exclusion of Secondary Carbocation Intermediates and Origin of Structural Diversification

Kyoka Sakamoto, Hajime Sato, Masanobu Uchiyama

The Journal of Organic Chemistry 87(9) 6432-6437 2022年4月25日査読有り
Molecular and Computational Bases for Spirofuranone Formation in Setosusin Biosynthesis

Xingxing Wei, Taro Matsuyama, Hajime Sato, Dexiu Yan, Pui Man Chan, Kazunori Miyamoto, Masanobu Uchiyama, Yudai Matsuda

Journal of the American Chemical Society 143(42) 17708-17715 2021年10月13日責任著者
Theoretical Study on the Mechanism of Spirocyclization in Spiroviolene Biosynthesis

Hajime Sato, Taisei Takagi, Kazunori Miyamoto, Masanobu Uchiyama

Chemical and Pharmaceutical Bulletin 69(10) 1034-1038 2021年10月1日査読有り筆頭著者責任著者
DFT Study on the Biosynthesis of Verrucosane Diterpenoids and Mangicol Sesterterpenoids: Involvement of Secondary-Carbocation-Free Reaction Cascades

Hajime Sato, Bi-Xiao Li, Taisei Takagi, Chao Wang, Kazunori Miyamoto, Masanobu Uchiyama

JACS Au 2021年7月9日査読有り筆頭著者責任著者
DFT Study of a Missing Piece in Brasilane-Type Structure Biosynthesis: An Unusual Skeletal Rearrangement

Hajime Sato, Takahiro Hashishin, Junichiro Kanazawa, Kazunori Miyamoto, Masanobu Uchiyama

Journal of the American Chemical Society 142(47) 19830-19834 2020年11月25日筆頭著者責任著者

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MISC

理論計算と実験科学の融合によるSetosusin生合成機構の解明

松山太郎, 佐藤玄, 松田侑大, 内山真伸, 内山真伸

反応と合成の進歩シンポジウム講演要旨集 48th 2022年
L/ODCの機能改変によるADC,DapDC活性の獲得

佐藤玄, 佐藤玄, 岩崎わかな, 栗原陽平, 村上実月, 白水美香子, 内山真伸, 内山真伸, 斉藤和季, 斉藤和季 …

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 139th 2019年
Lysine/Ornithine Decarboxylaseの理論解析

佐藤玄, 佐藤玄, 岩崎わかな, 白水美香子, 内山真伸, 内山真伸, 斉藤和季, 斉藤和季, 山崎真巳

日本薬学会年会要旨集(CD-ROM) 138th 2018年
キノリチジンアルカロイド生合成経路の理論解析

佐藤玄, 内山真伸, 斉藤和季, 山崎真巳

日本薬学会年会要旨集 137年会(2) 61-61 2017年3月
Anthocyanin生合成経路の理論解析

佐藤玄, 王超, 山崎真巳, 斉藤和季, 内山真伸

日本生薬学会年会講演要旨集 63回 101-101 2016年8月

講演・口頭発表等

AI を活用したテルペン環化反応機構解析

佐藤玄

第一回日豪生合成シンポジウム 2025年8月29日招待有り
AI を活用したテルペン環化反応機構解析研究

佐藤玄

TERPNET2025 2025年8月6日招待有り
計算化学を⽤いたテルペン環化酵素の解析

佐藤玄

令和7年変革Aデジタル有機合成若手セミナー 2025年6月5日招待有り
分子の舞台裏を解き明かす - 計算化学が導く新発見

佐藤玄

令和6年度日本化学会関東支部講演会 2024年12月9日招待有り
計算化学が挑むテルペン生合成の研究

佐藤玄

先魁プロジェクト2024セミナー新規ケミカルモダリティがつなぐ光生命科学拠点 2024年11月25日招待有り
計算化学を基軸とした分子設計・反応解析

佐藤玄

横浜国立大学招待公演 2024年6月13日招待有り
理論計算を基軸とした天然物の生合成機構研究

佐藤玄

日本薬学会関東支部オンラインシンポジウム 2023年12月20日招待有り
理論計算を基軸とした天然物の生合成研究

佐藤玄

東京理科大学薬学部招待講演 2023年10月19日招待有り
計算化学を⽤いたテルペン環化酵素の研究

佐藤玄

山梨県立甲府南高校 SSH 事業招待講演 2023年10月13日招待有り
量子化学計算ワークショップ

佐藤玄

量子化学計算ワークショップ講師 2023年9月16日招待有り
計算化学を⽤いたテルペン環化酵素の解析研究

佐藤玄

千葉工業大学・原口研招待講演 2023年6月13日招待有り
テルペン生合成におけるカルボカチオン転位反応の理論研究

佐藤玄

日独生合成シンポジウム 2023年4月2日招待有り
計算化学を基軸とした天然物の生合成研究

佐藤玄

日本農芸化学会2023年度大会 2023年3月15日招待有り
実験科学と計算化学の協奏による天然物生合成経路の解明

佐藤玄

GTR Chemistry Workshop 2021 2021年11月29日招待有り

共同研究・競争的資金等の研究課題

計算化学を利活用したVariexenol生合成の反応制御機構の解析と合理的改変

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2024年4月 - 2027年3月

佐藤玄
計算科学の利活用による未知生合成経路の解明と未踏天然物の創出

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2022年6月 - 2027年3月

内山真伸, 佐藤玄
理論と実験の協奏による未踏天然物化学の開拓

MEXT 卓越研究員 2021年1月 - 2024年12月

佐藤玄
計算化学・有機合成化学・生化学を基盤としたテルペン環化反応の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2022年4月 - 2024年3月

佐藤玄
計算化学を用いたテルペン環化酵素と酸化酵素の反応機構解析と機能改変

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進戦略的創造研究推進事業さきがけ 2021年 - 2024年

佐藤玄

佐藤玄

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共同研究・競争的資金等の研究課題

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