鈴木治夫 (Suzuki Haruo) - マイポータル

基本情報

所属: 慶應義塾環境情報学部准教授

ORCID iD: https://orcid.org/0000-0003-1447-6109
J-GLOBAL ID: 201801009218823578
researchmap会員ID: B000308839

研究分野

ライフサイエンス / ゲノム生物学 /

経歴

2017年 - 現在

慶應義塾大学環境情報学部, 准教授
2015年 - 2017年

慶應義塾大学大学院政策・メディア研究科, 特任准教授

学歴

2003年4月 - 2006年3月

慶應義塾大学大学院政策・メディア研究科政策・メディア専攻博士後期課程
2001年4月 - 2003年3月

慶應義塾大学大学院政策・メディア研究科政策・メディア専攻博士前期課程

委員歴

2025年 - 現在

Editorial Board | Microorganisms
2025年 - 現在

Editorial Board | BMC Genomics
2016年 - 現在

Board of Director, MetaSUB International Consortium
2023年 - 2025年

Topic Editor, Frontiers in Microbiology > Systems Microbiology > Research Topics > Resources for Developing Plasmid Databases
2022年 - 2025年

Special Issue Editor, Microorganisms | Special Issue : The Urban Microbiome
2024年9月 - 2024年9月

Committee, International Symposium on Plasmid Biology 2024
2024年8月 - 2024年8月

Organizing Committee, 8th Annual MetaSUB International Conference, Tokyo, Japan

論文

Editorial for the Special Issue “The Urban Microbiome”

Haruo Suzuki, Soojin Jang

Microorganisms 2026年7月15日
A replication-centered phylogeny illuminates the evolutionary landscape of bacterial plasmids

Yosuke Nishimura, Kensei Kaneko, Tatsuya Kamijo, Nanako Isogai, Maho Tokuda, Hui Xie, Yusuke Tsuda, Aki Hirabayashi, Ryota Moriuchi, Hideo Dohra …

bioRxiv 2026年3月30日
Editorial: Resources for developing plasmid databases

Haruo Suzuki, Masato Suzuki, Masaki Shintani

Frontiers in Microbiology 16 2025年11月11日
Enhancing plasmid typing with MOB-typer: resolving IncP and other incompatibility group misclassifications in Pseudomonas.

Masato Suzuki, Haruo Suzuki, Yosuke Nishimura, Hideaki Nojiri, Masaki Shintani

Microbial genomics 11(9) 2025年9月
Insights from public database sequences related to the replication initiation protein TrfA of the IncP-1 plasmid RK2.

Haruo Suzuki, Kazuki Moriguchi, Masaki Shintani, Masato Suzuki, Hideaki Nojiri

Plasmid 134 102756-102756 2025年8月16日
Detection and genetic characterization of multidrug-resistant staphylococci isolated from public areas in an international airport.

Dewa A P Rasmika Dewi, Hazim O Khalifa, Haque Khandar, Junzo Hisatsune, Shoko Kutuno, Liansheng Yu, Wataru Hayashi, Shizuo Kayama, Christopher E Mason, Motoyuki Sugai …

Scientific reports 14(1) 27738-27738 2024年11月12日
Incompatibility groups of Pseudomonas plasmids revisited: comprehensive analysis of R-factors and their replicons

Yosuke Nishimura, Kensei Kaneko, Tatsuya Kamijo, Nanako Isogai, Maho Tokuda, Hui Xie, Yusuke Tsuda, Aki Hirabayashi, Ryota Moriuchi, Hideo Dohra …

bioRxiv 2024年9月3日
Shotgun metagenomic sequencing of swab samples from Japanese university campuses.

Megumu Tsujimoto, Dewa A P Rasmika Dewi, Christopher E Mason, Yuh Shiwa, Haruo Suzuki

Microbiology resource announcements 13(7) e0021024 2024年7月18日
Landscape of global urban environmental resistome and its association with local socioeconomic and medical status.

Jun Wu, Yige Hu, Michael H Perlin, David Danko, Jun Lu, Manuela Oliveira, Johannes Werner, Maria M Zambrano, Maria A Sierra, Olayinka O Osuolale …

Science China. Life sciences 67(6) 1292-1301 2024年6月
Phylogenetic Analysis and Ancestral State Estimation of Incompatibility Group P-1 (Incp-1) Plasmids with Varying Host Ranges

Haruo Suzuki, Yosuke Kawai, Hirokazu Yano, Masato Suzuki, Masaki Shintani, Hideaki Nojiri

2024年
Systematic Analysis of Diverse Polynucleotide Kinase Clp1 Family Proteins in Eukaryotes: Three Unique Clp1 Proteins of Trypanosoma brucei.

Motofumi Saito, Rerina Inose, Asako Sato, Masaru Tomita, Haruo Suzuki, Akio Kanai

Journal of molecular evolution 2023年8月22日
Evaluation of rRNA depletion methods for capturing the RNA virome from environmental surfaces.

Yuh Shiwa, Tomoya Baba, Maria A Sierra, JangKeun Kim, Christopher E Mason, Haruo Suzuki

BMC research notes 16(1) 142-142 2023年7月7日
Prophages and plasmids can display opposite trends in the types of accessory genes they carry.

Nobuto Takeuchi, Sophia Hamada-Zhu, Haruo Suzuki

Proceedings. Biological sciences 290(2001) 20231088-20231088 2023年6月28日
Transconjugant range of PromA plasmids in microbial communities is predicted by sequence similarity with the bacterial host chromosome.

Maho Tokuda, Masahiro Yuki, Moriya Ohkuma, Kazuhide Kimbara, Haruo Suzuki, Masaki Shintani

Microbial genomics 9(6) 2023年6月
Reconsideration of the previously classified incompatibility groups of plasmids, <scp>IncP</scp> ‐1 and <scp>IncP</scp> ‐11

Masaki Shintani, Haruo Suzuki, Hideaki Nojiri, Masato Suzuki

Environmental Microbiology 2023年2月6日
Urban Microbiomes in Narita, Chiba, Japan: Shotgun Metagenome Sequences of a Train Station.

Dewa A P Rasmika Dewi, Yuh Shiwa, Krista Ryon, Christopher E Mason, Tetsuya Matsumoto, Haruo Suzuki

Microbiology resource announcements 12(1) e0109222 2023年1月24日
A history of the MetaSUB consortium: Tracking urban microbes around the globe.

Krista A Ryon, Braden T Tierney, Alina Frolova, Andre Kahles, Christelle Desnues, Christos Ouzounis, Cynthis Gibas, Daniela Bezdan, Youping Deng, Ding He …

iScience 25(11) 104993-104993 2022年11月18日
Annotating unknown species of urban microorganisms on a global scale unveils novel functional diversity and local environment association.

Jun Wu, David Danko, Ebrahim Afshinnekoo, Daniela Bezdan, Malay Bhattacharyya, Eduardo Castro-Nallar, Agnieszka Chmielarczyk, Nur Hazlin Hazrin-Chong, Youping Deng, Emmanuel Dias-Neto …

Environmental research 207 112183-112183 2022年5月1日
Precise classification of antimicrobial resistance-associated IncP-2 megaplasmids for molecular epidemiological studies on Pseudomonas species

Masaki Shintani, Haruo Suzuki, Hideaki Nojiri, Masato Suzuki

Journal of Antimicrobial Chemotherapy 2022年3月31日査読有り
A global metagenomic map of urban microbiomes and antimicrobial resistance.

David Danko, Daniela Bezdan, Evan E Afshin, Sofia Ahsanuddin, Chandrima Bhattacharya, Daniel J Butler, Kern Rei Chng, Daisy Donnellan, Jochen Hecht, Katelyn Jackson …

Cell 184(13) 3376-3393 2021年6月24日査読有り

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MISC

Pseudomonas属細菌由来のプラスミドの再分類

XIE Hui, 徳田真穂, 磯貝菜々子, 水口千穂, 水口千穂, 西村陽介, 鈴木治夫, 鈴木治夫, 森脇由隆, 森脇由隆 …

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2025 2025年
複製開始タンパク質に基づくPseudomonas属細菌由来プラスミドの再分類

HUI Xie, 徳田真穂, 磯貝菜々子, 水口千穂, 水口千穂, 西村陽介, 鈴木治夫, 鈴木治夫, 森脇由隆, 森脇由隆 …

環境バイオテクノロジー学会大会プログラム講演要旨集 2025 2025年
プラスミド学の発展のための新しいデータベース作成

野尻秀昭, 野尻秀昭, 水口千穂, 水口千穂, 西村陽介, 鈴木治夫, 鈴木治夫, 森脇由隆, 森脇由隆, 森脇由隆 …

極限環境生物学会誌(Web) 23 2024年
同一不和合性群に属する塩基組成の異なるプラスミドの宿主域比較

徳田真穂, 鈴木治夫, 雪真弘, 大熊盛也, 水口千穂, 野尻秀昭, 金原和秀, 新谷政己, 新谷政己, 新谷政己

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 22nd 2020年
異なる個人由来のBifidobacterium longum菌株の比較ゲノム解析

渡部翔, 渡部翔, 吉田祐貴, 吉田祐貴, 鈴木治夫, 鈴木治夫, 冨田勝, 冨田勝, 冨田勝, 荒川和晴 …

日本生化学会大会(Web) 90th ROMBUNNO.2P‐1310 (WEB ONLY)-1310] 2017年12月
ゲノム情報を用いたアプローチによる酢酸菌Komagataeibacter属の分類学的位置付けの検証

新村梨恵, 松谷峰之介, 石川森夫, 矢吹岳, 海野祥子, 志波優, 鈴木治夫, 平川英樹, 吉川博文, 吉川博文 …

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2016 3F013 (WEB ONLY) 2016年3月5日
次世代シークエンサーを用いたゲノムスケールでの酢酸菌分類の試み(第二報)

貝沼(岡本)章子, 松谷峰之介, 石川森夫, 矢吹岳, 志波優, 鈴木治夫, 吉川博文, 松下一信, 小泉幸道

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2014 2A08P09 (WEB ONLY) 2014年3月5日
酢酸菌Acetobacter pasteurianus12株におけるゲノム情報と耐熱性との比較解析

松谷峰之介, 貝沼(岡本)章子, 山下隆司, 志波優, 鈴木治夫, 平川英樹, 石川森夫, 小泉幸道, 吉川博文, 吉川博文 …

日本ゲノム微生物学会年会要旨集 7th 2013年

書籍等出版物

バイオDBとウェブツール : ラボで使える最新70選 : 知る・学ぶ・使う、バイオDX時代の羅針盤

小野, 浩雅

羊土社 2022年11月 (ISBN: 9784758104067)
バイオインフォマティクスデータスキル : オープンソースツールを使ったロバストで再現性のある研究

Buffalo, Vince, 酒匂, 寛, 山村, 吉信, 片山, 俊明, 川島, 秀一, 鈴木, 治夫, 山本, 泰智

オライリー・ジャパン,オーム社 (発売) 2020年9月 (ISBN: 9784873118635)
RとBioconductorを用いたバイオインフォマティクス

Gentleman, Robert, Carey, Vincent J, Huber, Wolfgang, Irizarry, Rafael A, Dudoit, Sandrine, 荒川, 和晴, 粕川, 雄也, 川路, 英哉, 河野, 信, 神田, 将和, 鈴木, 治夫, 田中, 伸也, 中尾, 光輝, 長嶋, 剛史, 二階堂, 愛, 宮本, 真理

丸善出版 2012年1月 (ISBN: 9784621062500)

担当経験のある科目(授業)

109

2026年4月 - 2027年3月

研究会Ｂ (慶應義塾)
2026年4月 - 2027年3月

卒業プロジェクト２ (慶應義塾)
2026年4月 - 2027年3月

アカデミックプロジェクト（先端生命科学Ｂ） (慶應義塾)
2026年4月 - 2027年3月

環境情報学 (慶應義塾)
2026年4月 - 2027年3月

バイオインフォマティクスのデータサイエンス (慶應義塾)
2026年4月 - 2027年3月

卒業プロジェクト１ (慶應義塾)
2026年4月 - 2027年3月

修士研究会 (慶應義塾)
2026年4月 - 2027年3月

特別研究 (慶應義塾)
2026年4月 - 2027年3月

生命動態のデータサイエンス (慶應義塾)
2026年4月 - 2027年3月

特別研究プロジェクトＢ (慶應義塾)
2026年4月 - 2027年3月

アカデミックプロジェクト（先端生命科学Ａ） (慶應義塾)
2025年4月 - 2026年3月

特別研究プロジェクトＢ (慶應義塾)
2025年4月 - 2026年3月

研究会Ｂ (慶應義塾)
2025年4月 - 2026年3月

卒業プロジェクト２ (慶應義塾)
2025年4月 - 2026年3月

卒業プロジェクト１ (慶應義塾)
2025年4月 - 2026年3月

生命動態のデータサイエンス (慶應義塾)
2025年4月 - 2026年3月

修士研究会 (慶應義塾)
2025年4月 - 2026年3月

特別研究 (慶應義塾)
2025年4月 - 2026年3月

環境情報学 (慶應義塾)
2025年4月 - 2026年3月

バイオインフォマティクスのデータサイエンス (慶應義塾)

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共同研究・競争的資金等の研究課題

大阪・関西万博とアジア競技大会における都市環境マイクロバイオームの変動調査

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2025年4月 - 2029年3月

鈴木治夫, 志波優, 本多了, 鈴木留美子, クリュコフキリル, 阿部貴志, 岩埼裕貴
プラスミドと細菌の共存機構に関する基盤研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2026年3月

新谷政己, 鈴木治夫
プラスミドと細菌の共存機構に関する基盤研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2026年3月

新谷政己, 鈴木治夫
2020年東京オリンピック前後の都市マイクロバイオームの変動調査

文部科学省・日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

鈴木治夫
超高感度ウイルス計測に基づく感染症対策データ基盤

科学技術振興機構戦略的な研究開発の推進戦略的創造研究推進事業 CREST 2020年 - 2023年

有田正規
異分野融合による新型コロナウイルスをはじめとした感染症との共生に資する技術基盤の創生

戦略的な研究開発の推進戦略的創造研究推進事業 CREST 2020年 - 2023年

岩本愛吉
環境細菌の新規病原性獲得における原生生物の関与についての解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2015年4月 - 2018年3月

渡邉健太, 鈴木治夫
二次共生成立機構解明のためのミドリゾウリムシの全ゲノム塩基配列の解読

自然科学研究機構基礎生物学研究所平成２４年度(2012)自然科学研究機構基礎生物学研究所共同利用研究次世代DNAシーケンサ共同利用実験 2012年4月 - 2013年3月

藤島政博, 児玉有紀, 道羅英夫, 重信秀治, 杉井学, 鈴木治夫

学術貢献活動

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査読

鈴木治夫

基本情報

研究分野

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学歴

委員歴

論文

MISC

書籍等出版物

担当経験のある科目(授業)

共同研究・競争的資金等の研究課題

学術貢献活動

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