基本情報

所属
東京大学 大学院農学生命科学研究科 育種学研究室
日本学術振興会 特別研究員PD
学位
博士(農学)(2022年3月 名古屋大学)

研究者番号
01034842
ORCID iD
 https://orcid.org/0009-0000-5629-8668
J-GLOBAL ID
202101020701119490
researchmap会員ID
R000024593

鉛筆自己紹介

これまで、主に分子生物学と遺伝学の手法を用いて、イネやソルガムの有用農業形質に関する研究を行ってきました。有用農業形質の中でも、特に、開花(出穂)、雑種強勢、節間伸長など、目に見えるドラスティックな形態変化を伴う形質に惹かれています。環境問題や食糧問題に対して育種学がどう貢献できるのかを考え、実効性のある研究がしたいと考えていますが、同時に、設定したテーマへの生物学的な興味(メカニズム解明)も大切にしたいというのが基本的な姿勢です。博士課程の学生として、現在の研究室に来てから「育種学研究のパラダイムシフトはバイオインフォマティクスから来る」ことを肌で感じ、バイオインフォマティクスやプログラミングの勉強を始めました。 ”DRY”(バイオインフォ)、"WET"(分子生物・植物生理)、"SWEAT"(フィールドワーク)の3つのアプローチをバランスよく行き来し、イネ科作物の役に立つ”なぜ?”を1つでも多く解き明かしたいと考えています。

 

NEW Official Sitehttps://hashimotoshumpei.github.io/

ひらめき GitHub: https://github.com/hashimotoshumpei

ひらめき Qiita: https://qiita.com/Shumpei_Hashimoto

 

鉛筆研究テーマの変遷

学部時代には生化学的手法を用いて、HypSysというタバコのペプチドホルモンの受容体単離に関する研究を行なっていました。農学系の学部で研究する意義や研究のあり方について考えた結果、きちんと社会貢献ができる研究がしたい!と思うに至り、学部卒業を期に育種の研究室の門を叩きました。博士前期課程ではイネを使って塩ストレス応答と開花経路のクロストークに関する研究を行いました。博士前期課程2年の初めにソルガムと出会い、この作物の可能性に惹かれ、ソルガムの温度感受性開花の仕組みを研究しました。もう少し研究を続けたいなと思っていた頃、日本のソルガム研究の本拠地?の一つである名古屋大学とご縁があり、博士後期課程からは名古屋でソルガム研究を本格始動し、雑種強勢や胚乳高糖性をテーマに学位を取得しました。2023年度からは東京大学の育種学研究室に学振PDとして着任し、フロリゲン二重変異体(通称:咲かないイネ)のバイオマス研究をはじめとした作物学・分子遺伝学的研究を行っています。

鉛筆キャリアチャート

https://career-chart.yukimat.jp/ により作成

鉛筆経験・スキルなど

  • 屋内・フィールドでのイネ科作物の栽培管理
  • 基本的な分子生物学実験
  • 形質転換実験 (タバコ・イネ・ソルガム)
  • GWAS
  • RNA-seq
  • de novo assembly(勉強中)

 

鉛筆使用言語

  • Python
  • R
  • Go(はじめました)
  • React(はじめたい)

 

ノート・レポート直近の論文準備状況鉛筆責任著者)2026年1月26日 現在

  • Hashimoto and Itoh, minor revision. [植物の撥水性に関する総説]
  • Hashimoto鉛筆 and Yamada, preparing. [遺伝子構造可視化ツール"geneSTRUCTURE"の開発]
  • Hashimoto鉛筆, preparing. [マンハッタンプロットの3D可視化ツール”3D-Manhattan”の開発]
  • Kawauchi, Hashimoto et al., preparing. [HRMによるゲノム編集個体の迅速スクリーニング]
  • Kawahigashi et al., preparing. [ソルガムデータベースの整備と公開]

 

イベント 取得資格・検定試験など

右プログラミング関連

  • Python3 認定エンジニア基礎試験
  • Python3 エンジニア認定データ分析試験
  • 無人航空従事者試験

右フィールド関連

  • 小型車両系建設機械(3t未満)運転特別教育修了
  • 刈払機取扱作業者安全衛生教育修了

右その他

  • 第四級アマチュア無線技能士

 

 


受賞

  7

論文

  6

MISC

  4

講演・口頭発表等

  43

所属学協会

  5

Works(作品等)

  4
  • 2026年2月5日 コンピュータソフト
  • Shumpei Hashimoto
    2025年8月28日 コンピュータソフト
  • Shumpei Hashimoto
    2024年6月21日 コンピュータソフト
  • Shumpei Hashimoto
    2022年3月29日 コンピュータソフト

共同研究・競争的資金等の研究課題

  4

学術貢献活動

  3

社会貢献活動

  1