緒方英明 (Hideaki Ogata) - マイポータル

基本情報

所属: 兵庫県立大学大学院理学研究科生命科学専攻生体物質構造解析学部門教授

学位: 博士（理学）(京都大学)

研究者番号: 30795935
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-2894-2417
J-GLOBAL ID: 201701006048438970
Researcher ID: J-4975-2013
researchmap会員ID: B000274859

研究キーワード

研究分野

経歴

2022年4月 - 現在

兵庫県立大学, 大学院理学研究科, 教授
2021年10月 - 2022年3月

奈良先端科学技術大学院大学, 特任准教授
2017年4月 - 2021年9月

北海道大学, 低温科学研究所, 特任准教授
2012年7月 - 2017年3月

マックスプランク化学エネルギー変換研究所, グループリーダー
2011年2月 - 2012年6月

マックスプランク生物無機化学研究所, グループリーダー
2006年11月 - 2011年1月

マックスプランク生物無機化学研究所, シニアリサーチャー
2003年11月 - 2006年10月

マックスプランク生物無機化学研究所, ポスドク
2003年4月 - 2003年10月

姫路工業大学, 大学院理学研究科, 博士研究員

学歴

- 2003年

京都大学, 大学院理学研究科化学専攻
- 1998年

京都大学, 理学部

受賞

2020年11月

日本結晶学会学会賞学術賞, 日本結晶学会

緒方英明

論文

Construction of a cyclic regular‐triangle trimer of cytochrome c555 with a central hole using sortase A

Gissi Novientri, Kodai Fujiwara, Tsuyoshi Mashima, Hiroaki Matsuura, Hideaki Ogata, Takayuki Uchihashi, Sotaro Fujii, Yoshihiro Sambongi, Shun Hirota

Chemistry – A European Journal 2025年5月14日査読有り
メタンモノオキシゲナーゼの構造解析

緒方英明, 由里本博也, 坂井康能

SPring-8/SACLA利用研究成果集 12(5) 308-310 2024年10月31日査読有り
フラビンによる電子分岐酵素の構造解析

緒方英明

日本結晶学会誌 65(4) 220-221 2023年12月15日査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Structural and thermodynamic insights into antibody light chain tetramer formation through 3D domain swapping.

Takahiro Sakai, Tsuyoshi Mashima, Naoya Kobayashi, Hideaki Ogata, Lian Duan, Ryo Fujiki, Kowit Hengphasatporn, Taizo Uda, Yasuteru Shigeta, Emi Hifumi …

Nature communications 14(1) 7807-7807 2023年12月8日査読有り
New insights into the oxidation process from neutron and X-ray crystal structures of an O₂-sensitive [NiFe]-hydrogenase

Takeshi Hiromoto, Koji Nishikawa, Seiya Inoue, Hideaki Ogata, Yuta Hori, Katsuhiro Kusaka, Yu Hirano, Kazuo Kurihara, Yasuteru Shigeta, Taro Tamada …

Chemical Science 14(35) 9306-9315 2023年9月21日査読有り
Structure and function relationship of formate dehydrogenases: an overview of recent progress

Ami Kobayashi, Midori Taketa, Keisei Sowa, Kenji Kano, Yoshiki Higuchi, Hideaki Ogata

IUCrJ 10(5) 544-554 2023年9月1日査読有り
Redox tuning of the H-cluster by second coordination sphere amino acids in the sensory [FeFe] hydrogenase from Thermotoga maritima

Nipa Chongdar, Patricia Rodríguez-Maciá, Edward J. Reijerse, Wolfgang Lubitz, Hideaki Ogata, James A. Birrell

Chemical Science 14(13) 3682-3692 2023年4月7日査読有り責任著者
Structural insight on the mechanism of an electron-bifurcating [FeFe] hydrogenase

Chris Furlan, Nipa Chongdar, Pooja Gupta, Wolfgang Lubitz, Hideaki Ogata, James N Blaza, James A Birrell

eLife 11 e79361 2022年8月26日査読有り
Second and Outer Coordination Sphere Effects in Nitrogenase, Hydrogenase, Formate Dehydrogenase, and CO Dehydrogenase

Sven T. Strip, Benjamin R. Duffus, Vincent Fourmond, Christophe Léger, Silke Leimkühler, Shun Hirota, Yilin Hu, Andrew Jasniewski, Hideaki Ogata, Markus W. Ribbe

Chemical Reviews 122(14) 11900-11973 2022年7月27日査読有り
Structural and spectroscopic characterization of CO inhibition of [NiFe]-hydrogenase from Citrobacter sp. S-77

Takahiro Imanishi, Koji Nishikawa, Midori Taketa, Katsuhiro Higuchi, Hulin Tai, Shun Hirota, Hironobu Hojo, Toru Kawakami, Kiriko Hataguchi, Kayoko Matsumoto …

Acta Crystallographica Section F Structural Biology Communications 78(2) 66-74 2022年2月1日査読有り
Bioenergetics theory and components: Hydrogenases structure and function

Hideaki Ogata, Wolfgang Lubitz

Encyclopedia of Biological Chemistry: Third Edition 2 66-73 2021年7月29日
金属酵素の結晶構造化学的研究:ヒドロゲナーゼの反応機構について

緒方英明

日本結晶学会誌 63(2) 97-104 2021年6月査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Spectroscopic and biochemical insight into an electron bifurcating [FeFe] hydrogenase

Nipa Chongdar, Krzysztof Pawlak, Olaf Rudiger, Edward J. Reijerse, Patricia Rodriguez-Macia, Wolfgang Lubitz, James A. Birrell, Hideaki Ogata

Journal of Biological Inorganic Chemistry 25(1) 135-149 2020年2月査読有り最終著者責任著者
Structural basis of the function of [NiFe]-hydrogenases

Koji Nishikawa, Hideaki Ogata, Yoshiki Higuchi

Chemistry Letters 49(2) 164-173 2020年2月査読有り責任著者
Role of APS reductase in biogeochemical sulfur isotope fractionation.

Min Sub Sim, Hideaki Ogata, Wolfgang Lubitz, Jess F Adkins, Alex L Sessions, Victoria J Orphan, Shawn E McGlynn

Nature communications 10(1) 44-44 2019年1月9日査読有り
Electrostatic Tuning of the Ligand Binding Mechanism by Glu27 in Nitrophorin 7

Stefania Abbruzzetti, Alessandro Allegri, Axel Bidon-Chanal, Hideaki Ogata, Giancarlo Soavi, Giulio Cerullo, Stefano Bruno, Chiara Montali, F. Javier Luque, Cristiano Viappiani

Scientific Reports 8(10855) 2018年7月査読有り
Unique Spectroscopic Properties of the H-Cluster in a Putative Sensory [FeFe] Hydrogenase

Nipa Chongdar, James A. Birrell, Krzysztof Pawlak, Constanze Sommer, Edward J. Reijerse, Olaf Rüdiger, Wolfgang Lubitz, Hideaki Ogata

Journal of the American Chemical Society 140(3) 1057-1068 2018年1月24日査読有り最終著者責任著者
Solvent water interactions within the active site of the membrane type I matrix metalloproteinase

Elena Decaneto, Tatiana Vasilevskaya, Yuri Kutin, Hideaki Ogata, Moran Grossman, Irit Sagi, Martina Havenith, Wolfgang Lubitz, Walter Thiel, Nicholas Cox

PHYSICAL CHEMISTRY CHEMICAL PHYSICS 19(45) 30316-30331 2017年12月査読有り筆頭著者
X線によるヒドロゲナーゼ中の水素位置の特定

緒方英明

触媒 59(5) 274-278 2017年10月招待有り責任著者
Nuclear Resonance Vibrational Spectroscopy for Observation of Fe-H/D Bending Modes in Hydrogenases and Nitrogenases

Stephen P. Cramer, Cindy Pham, Hongxin Wang, Nakul Mishra, Leland Gee, Yoshitaka Yoda, Thomas B. Rauchfuss, Vladimir Pelmenschikov, Hideaki Ogata, Edward J. Reijerse …

SPring-8/SACLA Information 22(2) 104-109 2017年5月

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MISC

水素分解を伴う不活性酸化型[NiFe]ヒドロゲナーゼの再活性化

廣本武史, 西川幸志, 緒方英明, 樋口芳樹

日本結晶学会年会講演要旨集 2018 2018年
Nuclear resonant vibrational spectroscopy in studying extremely weak features in hydrogenases and nitrogenases

Hongxin Wang, Stephen Cramer, Leland B. Gee, Aubrey D. Scott, Hideaki Ogata, Tobias Kraemer, Frank Neese, Wolfgang Lubitz, William Newton, Christie Dapper …

ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 248 2014年8月
Protein-solvent interaction and metal substitution of membrane type I matrix metalloproteinase

Elena Decaneto, Markus Knipp, Hideaki Ogata, Martina Havenith, Wolfgang Lubitz

JOURNAL OF BIOLOGICAL INORGANIC CHEMISTRY 19 S849-S850 2014年8月
Nitrite dismutase - A "nitrite-only" source for NO

Markus Knipp, Chunmao He, Hideaki Ogata

NITRIC OXIDE-BIOLOGY AND CHEMISTRY 31 S36-S36 2013年4月
Nitrite disproportionation reaction: Investigations on the mechanism of the conversion of nitrite into nitric oxide at the ferriheme center of nitrophorins at blood plasma pH

Markus Knipp, Chunmao He, Hideaki Ogata

NITRIC OXIDE-BIOLOGY AND CHEMISTRY 24 S33-S34 2011年5月
Transition from Ni-B to Ni-A State in [NiFe]-Hydrogenase from D. vulgaris Miyazaki F and Their Structural Characterization

Hirota, S, Ogata, H, Nakahara, A, Komori, H, Shibata, N, Funasaki, N, Higuchi, Y

12th International Conference on Biological Chemistry 2005年4月1日
Role of the non-protein ligand at the Ni-Fe active site of [NiFe] hydrogenase

Ogata, H, Hirota, S, Nakahara, A, Komori, H, Shibata, N, Higuchi, Y

XX Congress of the International Union of Crystallography 2005年4月1日
2P087 硫酸還元菌シトクロムc_3と[NiFe]ヒドロゲナーゼとの相互作用の解析(ヘム蛋白質)

八幡直樹, 高山裕生, 斉藤貴士, 小澤潔, 中原明香, 緒方英明, 樋口芳樹, 阿久津秀雄

生物物理 44(1) S131 2004年11月10日
［NiFe］ヒドロゲナーゼにおける2種の酸化型（Ni-A型とNi-B型）の構造化学的研究

中原明香, 緒方英明, 柴田直樹, 廣田俊, 樋口芳樹

理研構造生物ポスターセッション 2003年8月4日
2A09-5 Ralstonia eutropha 由来膜結合型ヒドロゲナーゼへの He 残基導入による安定化効果の解析

福田景一, 寺下麻美, 井上美帆, 緒方英明, 樋口芳樹, 尹基石, 西原宏史

日本生物工学会大会講演要旨集 15 50-50 2003年
Carbon Monoxide Complex of [NiFe]hydrogenase from Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F

Hirota, S, Ogata, H, Mizoguchi, Y, Mizuno, N, Miki, K, Adachi, S, Yasuoka, N, Yagi, T, Yamauchi, O, Higuchi, Y

6th European Biological Inorganic Chemistry Conference 61 2002年4月1日
New crystallographic and chemical insights into the activation of NiFe-hydrogenase by H-2

H Ogata, K Miki, N Yasuoka, T Yagi, Y Higuchi

JOURNAL OF INORGANIC BIOCHEMISTRY 74(1-4) 31-31 1999年4月

書籍等出版物

独立栄養微生物によるCO2資源化技術

西川幸志, 緒方英明 (担当:分担執筆, 範囲:第II編第４章ヒドロゲナーゼの反応機構と産業利用に向けた構造化学)

シーエムシー出版 2023年12月13日 (ISBN: 9784781317564)
Encyclopedia of Biological Chemistry 3rd Edition

Hideaki Ogata, Wolfgang Lubitz (担当:分担執筆, 範囲:Hydrogenases Structure and Function)

Elsevier 2021年8月
生命金属ダイナミクス（第4章第6節水素酸化還元酵素ヒドロゲナーゼ）

緒方英明, 樋口芳樹 (担当:共著, 範囲:水素酸化還元酵素ヒドロゲナーゼ)

NTS 2021年1月
Encyclopedia of Biological Chemistry 2nd edition (Hydrogenases, Structure and Function)

Wolfgang Lubitz, Hideaki Ogata (担当:分担執筆, 範囲:Hydrogenases, Structure and Function)

Elsevier Academic Press 2013年3月
Molecular Solar Fuels (Functional Features of hydrogenase enzymes)

Wolfgang Lubitz, Hideaki Ogata, Edward Reijerse, Yoshiki Higuchi (担当:分担執筆, 範囲:Functional Features of hydrogenase enzymes)

The Royal Society of Chemistry 2012年
バイオ電気化学の実際バイオセンサ・バイオ電池の実用展開 (ヒドロゲナーゼ)

緒方英明, 樋口芳樹 (担当:分担執筆, 範囲:ヒドロゲナーゼ)

CMC出版 2007年

講演・口頭発表等

分光法と高分解能構造解析が明らかにする水素酸化還元酵素ヒドロゲナーゼの反応機構

緒方英明

第72回日本生化学会近畿支部例会 2026年5月16日招待有り
水素酸化還元酵素ヒドロゲナーゼの構造と反応機構

緒方英明

京都大学大学院理学研究科化学専攻特別講義 2023年12月21日招待有り
Spectroscopic characterization of a sensory [FeFe] hydrogenase

Hideaki Ogata

13th International Conference on Hydrogenases 2023年6月27日招待有り
Structure of an Electron-Bifurcating [FeFe] Hydrogenase

C. Furlan, N. Chongdar, P. Gupta, W. Lubitz, H. Ogata, J. N. Blaza, J. A. Birrell

10th Asian Biological Inorganic Chemistry Conference 2022年12月2日招待有り
金属酵素の結晶構造化学的研究

緒方英明

日本結晶学会令和2年度年会および会員総会70周年記念大会 2020年11月27日招待有り
ヒドロゲナーゼの構造解析と水素触媒反応機構

緒方英明

2018年度日本生物物理学会北海道支部例会, 日本学術振興会回折構造生物第169委員会中性子・放射光連携小委員会合同研究会 2019年3月14日招待有り
Spectroscopic properties of the di-iron active site of a sensory [FeFe] hydrogenase

緒方英明

International Congress on Pure & Applied Chemistry Langkawi 2018 2018年11月2日招待有り
Unique spectroscopic properties of a sensory [FeFe] hydrogenase

緒方英明

43rd International Conference on Coordination Chemistry 2018年8月3日招待有り
Hydrogen activation by hydrogenases

緒方英明

I2CNER International Workshop 2018 2018年2月2日招待有り
人工的成熟化による[FeFe]ヒドロゲナーゼの分光学的解析

緒方英明

Seminar at University of Hyogo 2017年5月18日招待有り
水素酸化還元酵素ヒドロゲナーゼの反応機構

緒方英明

第35回低温研セミナー 2016年11月4日招待有り
Catalytic reaction mechanism of [NiFe] hydrogenase

緒方英明

Gordon Research Conference, Enzymes, Coenzymes & Metabolic Pathways 2016年7月26日招待有り
Catalytic reaction mechanism of [NiFe] hydrogenase from Desulfovibrio vulgaris Miyazaki F

緒方英明

Seminar at Nara Institute of Science and Technology 2016年1月19日招待有り
Hydrogens detected by subatomic resolution protein crystallography in a [NiFe] hydrogenase

緒方英明

The 7th joint BER II and BESSY II User Meeting 2015 2015年12月10日招待有り
Catalytic reaction mechanism of the O2-sensitive [NiFe] hydrogenase

緒方英明

1st International Symposium on High Quality Protein Crystallization Technology 2015年10月26日招待有り
Structure and function of the O2-sensitive [NiFe] hydrogenase

緒方英明

Seminar Series in Molecular, Celluar, and Environmental Microbiology at MPI für terrestrische Mikrobiologie 2015年4月27日招待有り
ヒドロゲナーゼ：構造と機能

緒方英明

平成23年度大阪市立大学複合先端研究機構年次総会 2011年3月招待有り
Crystal structure of membrane-bound [NiFe] hydrogenase from Allochromatium vinosum

緒方英明

14th International Conference on Biological Inorganic Chemistry 2009年7月招待有り
Crystal Structure of [NiFe]hydrogenase of D. vulgaris Miyazaki F: The Ni-A, Ni-B and Ni-CO state

緒方英明

Seminar at Ruhr-Universität Bochum 2005年6月招待有り
[NiFe]ヒドロゲナーゼの構造化学的および分光学的研究

緒方英明, 広田俊, 八木達彦, 安岡則武, 樋口芳樹

日本生物物理学会年会講演予稿集 2002年11月

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担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

[FeFe]ヒドロゲナーゼの電子伝達機構とプロトン輸送機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2025年4月 - 2028年3月

緒方英明
異化的硫酸還元酵素の構造解析による硫酸代謝機構の解明

公益財団法人ひょうご科学技術協会学術研究助成 2024年4月 - 2025年3月

緒方英明
[FeFe]ヒドロゲナーゼの構造基盤と反応機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2020年4月 - 2023年3月

緒方英明
水素生成[FeFe]ヒドロゲナーゼの反応機構

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(帰国発展研究) 国際共同研究加速基金(帰国発展研究) 2017年 - 2019年

緒方英明

緒方英明

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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