平瀬祥太朗 (Shotaro HIRASE) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学水産実験所助教

研究者番号: 90635559
J-GLOBAL ID: 202001009595887279
researchmap会員ID: R000013981

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 水圏生命科学 / 水圏遺伝生態学

経歴

2015年10月 - 現在

東京大学大学院農学生命科学研究科附属水産実験所助教
2015年4月 - 2015年9月

独立行政法人日本学術振興会（東京大学大学院理学系研究科）特別研究員
2012年4月 - 2015年3月

東京大学大気海洋研究所地球表層圏変動研究センター生物遺伝子変動分野特任研究員

学歴

委員歴

2020年4月 - 現在

John Wiley & Sons Molecular Ecology Resources, Associate Editor
2018年4月 - 現在

John Wiley & Sons Molecular Ecology, Associate Editor

受賞

論文

Repeated translocation of a supergene underlying rapid sex chromosome turnover in Takifugu pufferfish.

Ahammad Kabir, Risa Ieda, Sho Hosoya, Daigaku Fujikawa, Kazufumi Atsumi, Shota Tajima, Aoi Nozawa, Takashi Koyama, Shotaro Hirase, Osamu Nakamura, Mitsutaka Kadota, Osamu Nishimura, Shigehiro Kuraku, Yasukazu Nakamura, Hisato Kobayashi, Atsushi Toyoda, Satoshi Tasumi, Kiyoshi Kikuchi

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 119(23) e2121469119 2022年6月7日
Genomic signatures for latitudinal selection in the tropical eel Anguilla marmorata.

Shotaro Hirase, Yusuke Kumai, Shuya Kato, Seishi Hagihara, Kiyoshi Kikuchi, Mari Kuroki

Journal of evolutionary biology 35(5) 763-771 2022年3月24日
A preliminary deep-sea fish fauna list with new and northernmost records, in the continental shelf to the upper continental slope in the east Enshu-nada Sea, central Japan

Akinori Teramura, Hiroshi Kohno, Hiroshi Senou, Kiyoshi Kikuchi, Shotaro Hirase, Taiga Kunishima

Plankton and Benthos Research 17(1) 95-99 2022年2月22日
Squalomix: shark and ray genome analysis consortium and its data sharing platform.

Osamu Nishimura, John Rozewicki, Kazuaki Yamaguchi, Kaori Tatsumi, Yuta Ohishi, Tazro Ohta, Masaru Yagura, Taiki Niwa, Chiharu Tanegashima, Akinori Teramura, Shotaro Hirase, Akane Kawaguchi, Milton Tan, Salvatore D'Aniello, Filipe Castro, André Machado, Mitsumasa Koyanagi, Akihisa Terakita, Ryo Misawa, Masayuki Horie, Junna Kawasaki, Takashi Asahida, Atsuko Yamaguchi, Kiyomi Murakumo, Rui Matsumoto, Iker Irisarri, Norio Miyamoto, Atsushi Toyoda, Sho Tanaka, Tatsuya Sakamoto, Yasuko Semba, Shinya Yamauchi, Kazuyuki Yamada, Kiyonori Nishida, Itsuki Kiyatake, Keiichi Sato, Susumu Hyodo, Mitsutaka Kadota, Yoshinobu Uno, Shigehiro Kuraku

F1000Research 11 1077-1077 2022年
Genomic evidence for speciation with gene flow in broadcast spawning marine invertebrates.

Shotaro Hirase, Yo Y Yamasaki, Masashi Sekino, Masato Nishisako, Minoru Ikeda, Motoyuki Hara, Juha Merilä, Kiyoshi Kikuchi

Molecular biology and evolution 38(11) 4683-4699 2021年7月26日
Comparative phylogeography of coastal gobies in the Japanese Archipelago: future perspectives for the study of adaptive divergence and speciation

Shotaro Hirase

ICHTHYOLOGICAL RESEARCH 2021年7月
Integrative genomic phylogeography reveals signs of mitonuclear incompatibility in a natural hybrid goby population.

Shotaro Hirase, Ayumi Tezuka, Atsushi J Nagano, Mana Sato, Sho Hosoya, Kiyoshi Kikuchi, Wataru Iwasaki

Evolution 75(1) 176-194 2020年11月9日
Sharing and reporting benefits from biodiversity research.

Emily Marden, Richard J Abbott, Frédéric Austerlitz, Daniel Ortiz-Barrientos, Regina S Baucom, Pim Bongaerts, Aurélie Bonin, Camille Bonneaud, Luke Browne, C Alex Buerkle, Ana L Caicedo, David W Coltman, Mitchell B Cruzan, Angus Davison, J Andrew DeWoody, Alex J Dumbrell, Brent C Emerson, Nicholas M Fountain-Jones, Rosemary Gillespie, Tatiana Giraud, Michael M Hansen, Kathryn A Hodgins, Myriam Heuertz, Shotaro Hirase, Rebecca Hooper, Paul Hohenlohe, Nolan C Kane, Joanna L Kelley, Andrew P Kinziger, Valerie J McKenzie, Corrie S Moreau, Alison G Nazareno, Tara A Pelletier, Josephine M Pemberton, Yanhua Qu, Sébastien Renaut, Cynthia Riginos, Naiara Rodríguez-Ezpeleta, Sean M Rogers, Jacob A Russell, Sean D Schoville, Suhua Shi, Megan Smith, Victoria L Sork, Graham N Stone, Pierre Taberlet, Elin Videvall, Lisette Waits, Emily Warschefsky, Robert K Wayne, Annabel Whibley, Janna Willoughby, Jeremy B Yoder, Lucie Zinger, Benjamin Sibbett, Shawn Narum, Loren H Rieseberg

Molecular Ecology 30(5) 1103-1107 2020年11月6日
Complex phylogeographic patterns in the intertidal gobyChaenogobius annularisaround Kyushu Island as a boundary zone of three different seas

Shuya Kato, Seiji Arakaki, Kiyoshi Kikuchi, Shotaro Hirase

ICHTHYOLOGICAL RESEARCH 2020年8月
Genetic isolation by distance in the yellowfin goby populations revealed by RAD sequencing

Shotaro Hirase, Ayumi Tezuka, Atsushi J. Nagano, Kiyoshi Kikuchi, Wataru Iwasaki

ICHTHYOLOGICAL RESEARCH 67(1) 98-104 2020年1月
Genomic and phenotypic consequences of two independent secondary contact zones between allopatric lineages of the anadromous ice goby Leucopsarion petersii

Shotaro Hirase, Tomoyuki Kokita, Atsushi J. Nagano, Kiyoshi Kikuchi

HEREDITY 124(1) 223-235 2020年1月
Random PCR-based genotyping by sequencing technology GRAS-Di (genotyping by random amplicon sequencing, direct) reveals genetic structure of mangrove fishes

Sho Hosoya, Shotaro Hirase, Kiyoshi Kikuchi, Kusuto Nanjo, Yohei Nakamura, Hiroyoshi Kohno, Mitsuhiko Sano

MOLECULAR ECOLOGY RESOURCES 19(5) 1153-1163 2019年9月
First discovery of Perkinsus beihaiensis in Mediterranean mussels (Mytilus galloprovincialis) in Tokyo Bay, Japan

Naoki Itoh, Yoshiki Komatsua, Kazuki Maeda, Shotaro Hirase, Tomoyoshi Yoshinaga

JOURNAL OF INVERTEBRATE PATHOLOGY 166 107226-107226 2019年9月
The Pliocene-Pleistocene transition had dual effects on north American migratory bird speciation (vol 462, pg 85, 2016)

Shotaro Hirase, Yusuke Yokoyama, Cin-Ty Lee, Wataru Iwasaki

PALAEOGEOGRAPHY PALAEOCLIMATOLOGY PALAEOECOLOGY 476 192-193 2017年6月
Phylogeography of the yellowfin goby Acanthogobius flavimanus in native and non-native distributions

Shotaro Hirase, Sherrie Chambers, Kathryn Hassell, Melissa Carew, Vincent Pettigrove, Kiyoshi Soyano, Masaki Nagae, Wataru Iwasaki

MARINE BIOLOGY 164(5) 2017年5月
The Pliocene-Pleistocene transition had dual effects on North American migratory bird speciation

Shotaro Hirase, Yusuke Yokoyama, Cin-Ty Lee, Wataru Iwasaki

PALAEOGEOGRAPHY PALAEOCLIMATOLOGY PALAEOECOLOGY 462 85-91 2016年11月
Stability of genetic diversity in an intertidal goby population after exposure to tsunami disturbance

Shotaro Hirase, Minoru Ikeda, Shun Hayasaka, Wataru Iwasaki, Akihiro Kijima

MARINE ECOLOGY-AN EVOLUTIONARY PERSPECTIVE 37(5) 1161-1167 2016年10月
Parallel Mitogenome Sequencing Alleviates Random Rooting Effect in Phylogeography

Shotaro Hirase, Hirohiko Takeshima, Mutsumi Nishida, Wataru Iwasaki

GENOME BIOLOGY AND EVOLUTION 8(4) 1267-1278 2016年4月
II-6. Evaluation for genetic diversity of marine fisheries resources after the tsunami caused by the 2011 off the pacific coast of Tohoku Earthquake

Minoru Ikeda, Yuki Minegishi, Daiki Ando, Manami Kanno, Akihiro Kijima, Shotaro Hirase, Sei-Ichi Okumura, Shunduke Moriyama, Kenta Adachi, Masakado Kawata, Ayako Suda, Sakiko Orui, Kiyotaka Takishita, Katsunori Fujikura

Nippon Suisan Gakkaishi (Japanese Edition) 82(2) 149 2016年査読有り
Hybrid population of highly divergent groups of the intertidal goby Chaenogobius annularis

Shotaro Hirase, Minoru Ikeda

JOURNAL OF EXPERIMENTAL MARINE BIOLOGY AND ECOLOGY 473 121-128 2015年12月

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MISC

九州沿岸に着目したドロメとアゴハゼの比較集団ゲノミクス解析

加藤柊也, 新垣誠司, 永野惇, 菊池潔, 平瀬祥太朗

日本魚類学会年会講演要旨 54th (CD-ROM) 2020年
シロウオ日本海系統における遺伝子流動下での局所適応

平瀬祥太朗, 菊池潔, 永野惇, 小北智之

日本魚類学会年会講演要旨 54th (CD-ROM) 2020年
シロウオの五島集団の高い遺伝的固有性

佐藤耕平, 小北智之, 永野惇, 菊池潔, 平瀬祥太朗

日本水産学会大会講演要旨集 2019 2019年
主成分分析による地域適応遺伝子の探索

平瀬祥太朗, 手塚あゆみ, 永野惇, 菊池潔, 岩崎渉

日本水産学会大会講演要旨集 2018 2018年
RAD-seqによるシロウオ太平洋型と日本海型の交雑集団の遺伝解析

平瀬祥太朗, 小北智之, 永野惇, 菊池潔

日本水産学会大会講演要旨集 2017 2017年
学部生に伝える研究最前線

大塚孝治, 平瀬祥太朗, 岩崎渉

東京大学理学系研究科・理学部ニュース 48(2) 4-5 2016年7月20日
ミトコンドリア全ゲノム情報に基づく琵琶湖産魚類の高精度な人口学的歴史の推定

田畑諒一, 武島弘彦, 平瀬祥太朗, 西田睦, 渡辺勝敏

日本魚類学会年会講演要旨 49th 2016年
更新世の日本海隔離で生じたアゴハゼ2グループの交雑帯のRAD-seq解析

平瀬祥太朗, 手塚あゆみ, 永野惇, 永野惇, 永野惇, 岩崎渉

日本生態学会大会講演要旨(Web) 63th 2016年
新たなゲノム構成を有する交雑集団の形成:アゴハゼのRAD-seq解析

平瀬祥太朗, 手塚あゆみ, 永野惇, 永野惇, 永野惇, 岩崎渉

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 18th 2016年
次世代シーケンシングによる魚類の大量ミトコンドリアゲノム分析法の確立

武島弘彦, 平瀬祥太朗, 岩崎渉, 田畑諒一, 渡辺勝敏, 西田睦

日本魚類学会年会講演要旨 46th 2013年
琵琶湖固有魚類の起源と進化:ミトコンドリアゲノムにおける適応進化の可能性

田畑諒一, 武島弘彦, 平瀬祥太朗, 西田睦, 柿岡諒, 小宮竹史, 渡辺勝敏

日本魚類学会年会講演要旨 46th 2013年

共同研究・競争的資金等の研究課題

交雑起源の新規集団のゲノム進化に関する包括的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2018年4月 - 2021年3月

平瀬祥太朗, 岩崎渉, 小北智之
日本列島のアワビ類における種分化遺伝子の探索

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2017年6月 - 2020年3月

平瀬祥太朗, 關野正志
全ゲノムリシーケンスによる高効率な海産魚遺伝資源管理技術の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2016年4月 - 2018年3月

菊池潔, 片町太輔, 鈴木重則, 細谷将, 平瀬祥太朗
沿岸生物種において遺伝的撹乱は起こっているか：マハゼの大規模DNA分析からの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2014年4月 - 2017年3月

平瀬祥太朗
交雑によるゲノム不和合回避と適応進化の分子機構：アゴハゼの交雑集団をモデルとして

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2015年4月 - 2016年3月

平瀬祥太朗

平瀬祥太朗

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