井元宏明 (Hiroaki Imoto) - マイポータル

基本情報

所属: アイルランド国立大学ダブリン校 Systems Biology Ireland 博士研究員

学位: 博士（理学）(2023年3月大阪大学)

ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-6817-642X
J-GLOBAL ID: 202201018996655722
Researcher ID: IIZ-9963-2023
researchmap会員ID: R000033404

外部リンク: https://people.ucd.ie/hiroaki.imoto1

研究キーワード

研究分野

経歴

2023年4月 - 現在

アイルランド国立大学ダブリン校, Systems Biology Ireland, 博士研究員
2023年4月 - 2025年3月

独立行政法人日本学術振興会, 海外特別研究員
2020年4月 - 2023年3月

独立行政法人日本学術振興会, 特別研究員 DC1
2021年9月 - 2022年3月

アイルランド国立大学ダブリン校, Systems Biology Ireland, 客員研究員

学歴

2018年4月 - 2023年3月

大阪大学, 大学院理学研究科, 生物科学専攻
2014年4月 - 2018年3月

大阪大学, 理学部, 生物科学科
2010年4月 - 2013年3月

茨城県立水戸第一高等学校

受賞

論文

Polycomb Repressive Complex 2 drives flow-sensitive endothelial states underlying vascular inflammation and disease

Divyesh Joshi, Oleksii Rukhlenko, Raja Chakraborty, Anna Tuliakova, Zhongwei Sun, Tejas Bhogale, Jessica Furtado, Hanqiang Deng, James G. Traylor, Jr., Hiroaki Imoto …

Proceedings of the National Academy of Sciences 2026年9月8日査読有り
A structure-based modeling approach identifies effective drug combinations for RAS-mutant acute myeloid leukemia

Luke Jones, Oleksii Rukhlenko, Tânia Dias, Hiroaki Imoto, Ciardha Carmody, Kieran Wynne, Boris N. Kholodenko, Jonathan Bond

iScience 29(8) 116875-116875 2026年7月20日査読有り
Dual RAF inhibition outperforms RAF-MEK combinations for suppressing ERK signaling in KRAS mutant cells

Hiroaki Imoto, Nora Rauch, Ayaka Ichikawa Nagasato, Mariko Okada, Walter Kolch, Oleksii S. Rukhlenko, Boris N. Kholodenko

npj Systems Biology and Applications 2026年4月15日査読有り筆頭著者
Cell-specific models reveal conformation-specific RAF inhibitor combinations that synergistically inhibit ERK signaling in pancreatic cancer cells

Thomas Sevrin, Hiroaki Imoto, Sarah Robertson, Nora Rauch, Uscinnia Dyn’ko, Katerina Koubova, Kieran Wynne, Walter Kolch, Oleksii S. Rukhlenko, Boris N. Kholodenko

Cell Reports 43(9) 114710-114710 2024年9月査読有り筆頭著者
Cell State Transition Models Stratify Breast Cancer Cell Phenotypes and Reveal New Therapeutic Targets

Oleksii S. Rukhlenko, Hiroaki Imoto, Ayush Tambde, Amy McGillycuddy, Philipp Junk, Anna Tuliakova, Walter Kolch, Boris N. Kholodenko

Cancers 16(13) 2354-2354 2024年6月27日査読有り筆頭著者
Extending BioMASS to construct mathematical models from external knowledge

Kiwamu Arakane, Hiroaki Imoto, Fabian Ormersbach, Mariko Okada

Bioinformatics Advances 2024年4月4日査読有り筆頭著者
A Combination of Conformation-Specific RAF Inhibitors Overcome Drug Resistance Brought about by RAF Overexpression

Hiroaki Imoto, Nora Rauch, Ashish J. Neve, Fahimeh Khorsand, Martina Kreileder, Leonidas G. Alexopoulos, Jens Rauch, Mariko Okada, Boris N. Kholodenko, Oleksii S. Rukhlenko

Biomolecules 13(8) 1212-1212 2023年8月2日査読有り筆頭著者
患者固有モデリングによるトリプルネガティブ乳がんの層別化

井元宏明

大阪大学 2023年3月23日
Protocol for stratification of triple-negative breast cancer patients using in silico signaling dynamics

Hiroaki Imoto

STAR PROTOCOLS 3(3) 101619-101619 2022年9月査読有り筆頭著者
A text-based computational framework for patient -specific modeling for classification of cancers

Hiroaki Imoto, Sawa Yamashiro, Mariko Okada

iScience 25(3) 103944-103944 2022年3月18日査読有り筆頭著者
A Computational Framework for Prediction and Analysis of Cancer Signaling Dynamics from RNA Sequencing Data—Application to the ErbB Receptor Signaling Pathway

Hiroaki Imoto, Suxiang Zhang, Mariko Okada

Cancers 12(10) 2878-2878 2020年10月7日査読有り筆頭著者
The Number of Transcription Factors at an Enhancer Determines Switch-like Gene Expression

Hiroki Michida, Hiroaki Imoto, Hisaaki Shinohara, Noriko Yumoto, Masahide Seki, Mana Umeda, Tetsutaro Hayashi, Itoshi Nikaido, Takeya Kasukawa, Yutaka Suzuki …

Cell Reports 31(9) 107724-107724 2020年6月査読有り
Signal-dependent regulation of early-response genes and cell cycle: a quantitative view

Imoto, H., Okada, M.

Current Opinion in Systems Biology 15 100-108 2019年6月査読有り筆頭著者

MISC

生化学反応過程を記述した文章による実行可能な数理モデルの生成と患者固有モデリングへの応用

井元宏明, 岡田眞里子

生物物理 63(6) 320-324 2023年11月28日査読有り招待有り筆頭著者
細胞制御メカニズム理解のための数理モデル構築とツール開発

岡田眞里子, 井元宏明

京都大学数理解析研究所講究録「第16回生物数学の理論とその応用 -生命現象の定量的理解に向けて-」 2166 7-11 2020年10月
ErbBシグナル伝達経路と細胞周期の統合数理モデルを用いた細胞応答の予測

井元宏明, 岩本一成, 間木重行, 張素香, 岡田眞里子

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 91回 [2P-260] 2018年9月

書籍等出版物

マルチオミクス : データ駆動時代の疾患研究 : がん、老化、生活習慣病 : 最新のオミクス統合で挑む標的探索と病態解明

井元宏明, 岡田眞里子 (担当:分担執筆, 範囲:デジタルツイン構築による乳がんサブタイプの層別化―スナップショットの遺伝子発現データからシグナル伝達動態の再構築へ)

羊土社 2023年9月5日 (ISBN: 9784758104135)

講演・口頭発表等

Can cSTAR Help Us Understand Endothelial and Smooth Muscle Cell Fates in Atherosclerosis?

Hiroaki Imoto

Online meeting 2026年5月18日 Leducq Foundation ARTIST Network
Leveraging cSTAR to decode cell state transitions from Perturb-seq data

Hiroaki Imoto, Thomas Sevrin, Anna Tuliakova, Eugene Kashdan, Louisa Prince, Ciardha Carmody, Oleksii S. Rukhlenko, Boris N. Kholodenko

24th Annual International Conference on Systems Biology 2025年10月8日 International Society for Systems Biology (ISSB)
Building digital cell twins using next generation modeling

Hiroaki Imoto

Cancer and Cell Signalling series seminar 2025年5月22日 University of Leeds 招待有り
Cell-specific models reveal conformation-specific RAF inhibitor combinations that synergistically inhibit ERK signalling in pancreatic cancer cells

Hiroaki Imoto

Ulysses Medal Presentation to Dr Dennis Slamon and Research Talks 2024年9月26日 UCD Health Sciences Centre 招待有り
Engineering breast cancer cell phenotypes using digital cell twins

Hiroaki Imoto, Oleksii S. Rukhlenko, Ayush Tambde, Amy McGillycuddy, Philipp Junk, Anna Tuliakova, Walter Kolch, Boris N. Kholodenko

UCD Cancer Research Symposium 2024年6月7日
Unraveling the mechanisms of drug resistance in the MAPK pathway using structure-based modeling

Hiroaki Imoto, Nora Rauch, Ayaka Ichikawa, Mariko Okada, Oleksii S. Rukhlenko, Boris N. Kholodenko

The 61st Annual Meeting of the Biophysical Society of Japan 2023年11月14日
Using personalized kinetic models to identify predictive prognostic factors in cancer

Hiroaki Imoto, Sawa Yamashiro, Ken Murakami, Mariko Okada

Inserm/JSPS Joint Seminar 2022年12月4日
Model-based prediction and analysis of ErbB signaling dynamics from RNA-seq gene expression data

Hiroaki Imoto, Suxiang Zhang, Mariko Okada

EMBL conference - From Functional Genomics to Systems Biology
遺伝子発現レベルの情報からErbBシグナルの動態を予測する数理モデリング基盤の開発

Hiroaki Imoto, Marie Maeda, Suxiang Zhang, Mariko Okada

第58回日本生物物理学会年会
生物学研究を加速する細胞モデリング基盤の紹介

井元宏明

第16回生物数学の理論とその応用～生命現象の定量的理解に向けて～
Model-based identification of ErbB network principles among cell types

Hiroaki Imoto, Kyoichi Ebata, Su xiang Zhang, Shigeyuki Magi, Mariko Okada

The 20th International Conference of Systems Biology
A comprehensive model of heterogeneous cell cycle responses

Hiraoki Imoto, Kyoichi Ebata, Shigeyuki Magi, Suxiang Zhang, Mariko Okada

第57回日本生物物理学会年会
Mathematical modelling of signal-dependent cyclin/cdk network driving mammalian cell cycle

Hiroaki Imoto, Kyoichi Ebata, Shigeyuki Magi, Suxiang Zhang, Mariko Okada

A3 Workshop on Mathematical Life Science
Predictions of cellular responses with a mathematical model integrating ErbB signaling and cell cycle

Hiroaki Imoto, Kazunari Iwamoto, Shigeyuki Magi, Suxiang Zhang, Mariko Okada

第91回日本生化学会大会
Model-based prediction of ErbB signaling activities on cell cycle entry

Hiroaki Imoto, Kazunari Iwamoto, Shigeyuki Magi, Suxiang Zhang, Mariko Okada

第56回日本生物物理学会年会

所属学協会

2017年5月 - 現在

日本生物物理学会

Works(作品等)

Pasmopy – Patient-Specific Modeling in Python

井元宏明

2021年9月 - 2023年3月コンピュータソフト
BioMASS - A Python Framework for Modeling and Analysis of Signaling Systems

井元宏明

2019年11月 - 2023年3月コンピュータソフト

共同研究・競争的資金等の研究課題

熱力学原理が紐解く抗がん剤耐性の分子メカニズム

日本学術振興会海外特別研究員 2023年4月 - 2025年3月
分岐理論に基づいたErbBシグナル伝達系による細胞周期制御の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2020年4月 - 2023年3月

井元宏明
遺伝子発現レベルの情報に基づいたがん細胞の増殖メカニズムの予測と解明

日本学術振興会若手研究者海外挑戦プログラム 2021年9月 - 2022年3月

井元宏明

社会貢献活動

Giggle Fund of Children’s Health Foundation

運営参加・支援

Children’s Health Ireland 2024年10月25日 - 2024年12月13日
Life in School/College in Japan

講師

UCD Japan Gateways to Japan 2024年3月25日 - 2024年3月25日

メディア報道

New Modelling Study Points to More Effective Drug Strategy for KRAS-Mutant Cancers

Systems Biology Ireland Research Spotlight Articles 2026年5月インターネットメディア
“What brought you to Dublin?”

Systems Biology Ireland SBI Blog 2025年11月インターネットメディア
Exploring a new mechanism of drug resistance using next-generation computer modeling

UCD School of Medicine 2023年8月インターネットメディア
阪大、生化学反応過程を説明する文章を数式・数理モデルに自動変換するモデル構築手法「Text2Model」を開発

日本経済新聞 2022年3月11日新聞・雑誌
イン・シリコ患者固有モデルでがんの予後と薬剤応答を予測

大阪大学 ResOU 2022年3月
がんゲノム情報×細胞シミュレーションで個別化医療へ大きく前進

大阪大学 ResOU 2020年10月

その他

甲種危険物取扱者

2016年11月 - 現在

井元宏明

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

所属学協会

Works(作品等)

共同研究・競争的資金等の研究課題

社会貢献活動

メディア報道

その他

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