HIroki Ueda

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Name
HIroki Ueda
E-mail
uedah-tkyumin.ac.jp
Affiliation
The University of Tokyo
Section
Graduate School of Medicine and Faculty of Medicine
Job title
Professor
Other affiliation
Laboratory for Synthetic Biology, RIKEN
Research funding number
20373277

Profile

Dr. Hiroki R. Ueda was born in Fukuoka, Japan, in 1975. He graduated from the Faculty of Medicine, the University of Tokyo in 2000, and obtained his Ph.D in 2004 from the same university. He was appointed as a team leader in RIKEN Center for Developmental Biology (CDB) from 2003 and promoted to be a project leader at RIKEN CDB in 2009, and to be a group director at RIKEN Quantitative Biology Center (QBiC) in 2011. He became a professor of Graduate School of Medicine, the University of Tokyo in 2013. He is currently appointed as a team leader in RIKEN Center for Biosystems Dynamics Research (BDR), an affiliate professor in Graduate School of Information Science and Technology and an principle investigator in IRCN (International Research Center for Neurointelligence) in the University of Tokyo, an invited professor in Osaka University, and a visiting professor in Tokushima University.
He has an expertise in systems biology and focus on chronobiology by investigating mammalian circadian clocks and sleep/wake cycles. He determined a basic structure of a transcriptional circuit of mammalian circadian clocks and identified multiple delayed negative feedback motifs (Ueda et al, 2002, Ueda et al, 2005, Ukai-Tadenuma et al, 2008, Ukai-Tadenuma 2011). He also focused on long-standing and unsolved questions in chronobiology and found that a singularity behavior (i.e. temporal stopping of circadian clocks) is caused by desynchronization of multiple cellular circadian oscillators (Ukai et al, 2007), and that temperature-insensitive biochemical reactions underlie temperature compensation of mammalian circadian clocks (Isojima et al, 2009, Shinohara et al, 2017). He also invented molecular-timetable methods to detect the circadian time of the body by measuring a snapshot information of circadian clocks (Ueda et al, 2004, Minami eet al, 2009, Kasukawa et al, 2012, Narumi et al, 2016). For sleep/wake cycles, he found that Ca2+ and CaMKII-dependent hyperpolarization pathways underlie sleep homeostasis and proposed phosphorylation hypothesis of sleep (Tatsuki et al, 2016, Sunagawa et al, 2016, Tatsuki et al, 2017, Ode et al, 2017, Shi et al, 2017) and that muscarinic receptors, M1 and M3, as essential genes for REM sleep (Niwa et al, 2018). To accelerate these studies, he also invented whole-brain and whole-body clearing and imaging methods called CUBIC (Susaki et al, 2014, Tainaka et al, 2014, Susaki et al, 2015, Susaki et al, 2016, Tainaka et al, 2016, Kubota et al, 2017, Nojima et al, 2017, Murakami et al, 2018, Tainaka et al, 2018), as well as the next-generation mammalian genetics (Susaki et al, 2017) such as Triple-CRISPR(Sunagawa et al, 2016), ES-mice (Ode et al, 2017, Ukai et al, 2017) and SSS methods (Sunagawa et al, 2016) for one-step production and analysis of KO and KI mice without crossing.
He received awards, including Tokyo Techno Forum 21, Gold Medal (Tokyo Techno Forum 21, 2005), Young Investigator Awards (MEXT, 2006) and IBM Science Award (IBM, 2009), a Young Investigator Promotion Awards (Japanese Society for Chronobiology, 2007). He also received Tsukahara Award (Brain Science Foundation, 2012), Japan Innovator Awards (Nikkei Business Publications Inc. 2004), Yamazaki-Teiichi Prize (Foundation for Promotion of Material Science and Technology of Japan, 2015), Innovator of the Year (2017) and The Ichimura Prize in Science for Excellent Achievement (Ichimura Foundation for New Technology, 2018).

Awards & Honors

 
2017
イノベーター・オブ・ザ・イヤー, 第4回イノベーター・オブ・ザ・イヤー
Winner: Hiroki Ueda
 
2015
山崎貞一賞, 第15回山崎貞一賞
Winner: Hiroki Ueda
 
2012
塚原仲晃記念賞, 塚原仲晃記念賞
Winner: Hiroki Ueda
 
2011
永瀬賞(フロンティアサロン), 永瀬賞(フロンティアサロン)
Winner: Hiroki Ueda
 
2011
Changemakers of the year 2011, Changemakers of the year 2011
Winner: Hiroki Ueda
 

Published Papers

 
Ukai H, Sumiyama K, Ueda HR
Current opinion in biotechnology   58(August) 137-145   Apr 2019   [Refereed]
Hasegawa S, Susaki EA, Tanaka T, Komaba H, Wada T, Fukagawa M, Ueda HR, Nangaku M
Kidney international      Apr 2019   [Refereed]
Puelles VG, Fleck D, Ortz L, Papadouri S, Strieder T, Boehner A, van der Wolde JW, Vogt M, Saritas T, Kuppe C, Fuss A, Menzel S, Klinkhammer BM, Müller-Newen G, Heymann F, Decker L, Braun F, Kretz O, Huber TB, Susaki EA, Ueda HR, Boor P, Floege J, Kramann R, Kurts C, Bertram JF, Spehr M, Nikolic-Paterson DJ, Moeller MJ
Kidney international      Mar 2019   [Refereed]
Watanabe T, Nakamura R, Takase Y, Susaki EA, Ueda HR, Tadokoro R, Takahashi Y
Developmental biology   444(Suppl 1) S325-S336   Dec 2018   [Refereed]

Misc

 
黒田真史, 真野智之, 上田泰己, 上田泰己
Lipid   30(1) 6‐12   Jan 2019
水巻登志樹, 湯川博, 湯川博, 小野島大介, 小野島大介, 洲崎悦生, 上田泰己, 馬場嘉信, 馬場嘉信, 馬場嘉信, 馬場嘉信
日本再生医療学会総会(Web)   18th ROMBUNNO.P‐03‐121 (WEB ONLY)   2019
村上達哉, 上田泰己
実験医学   36(20) 3567‐3568   Dec 2018
吉田将太, 松本桂彦, 野島聡, 上田泰己, 上田泰己
月刊細胞   50(13) 708‐709   Nov 2018
水巻登志樹, 湯川博, 小野島大介, 洲崎悦生, 上田泰己, 馬場嘉信
中部化学関係学協会支部連合秋季大会講演予稿集   49th 82   Nov 2018
水巻登志樹, 湯川博, 小野島大介, 洲崎悦生, 上田泰己, 馬場嘉信
Organ Biology   25(3) 46   Oct 2018
野島聡, 洲崎悦生, 洲崎悦生, 洲崎悦生, 森井英一, 森井英一, 上田泰己, 上田泰己
Lipid   29(4) 340‐345   Oct 2018
上田泰己, 上田泰己
Dementia Japan   32(3) 392   Sep 2018
上田泰己, 上田泰己
日本獣医学会学術集会講演要旨集   161st 251   Aug 2018
真野智之, 真野智之, 上田泰己, 上田泰己, 上田泰己
実験医学   36(12) 2112‐2119   Aug 2018
久保田晋平, 高橋恵生, 上田泰己, 宮園浩平
Lipid   29(3) 240‐244   Jul 2018
野島聡, 州崎悦生, 州崎悦生, 州崎悦生, 森井英一, 上田泰己, 上田泰己
Lisa   25(7) 789‐797   Jul 2018
上田泰己, 上田泰己
日本内分泌学会雑誌   94(1) 189   Apr 2018
小野宏晃, 史蕭逸, 上田泰己, 上田泰己
睡眠医療   12(1) 91‐96   Mar 2018
水巻登志樹, 湯川博, 小野島大介, 洲崎悦生, 上田泰己, 馬場嘉信
日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM)   98th ROMBUNNO.2PB‐170   Mar 2018
黒田 真史, 上田 泰己
Optronics : 光技術コーディネートジャーナル   37(3) 100-103   Mar 2018
野島聡, 州崎悦生, 州崎悦生, 州崎悦生, 森井英一, 上田泰己, 上田泰己
医学のあゆみ   264(8) 688‐690   Feb 2018
高橋恵生, 久保田晋平, 上田泰己, 宮園浩平
Lung Perspectives   26(1) 72‐76,8   Feb 2018
太田悦朗, 太田悦朗, 太田悦朗, 太田悦朗, 曽根岳史, 大日方友理, 鵜飼英樹, 久松知子, 北川季子, 石川充, 駒野肇, 上田泰己, 上田泰己, 上田泰己, 小幡文弥, 小幡文弥, 小幡文弥, 川村俊彦, 川村俊彦, 岡野栄之
日本再生医療学会総会(Web)   17th ROMBUNNO.O‐41‐5 (WEB ONLY)   2018
山本真理, 鵜飼英樹, 上田泰己, 上田泰己
日本再生医療学会総会(Web)   17th ROMBUNNO.P‐01‐066 (WEB ONLY)   2018
須貝秀平, 上田泰己
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   41st ROMBUNNO.2P‐0705 (WEB ONLY)   2018
上田泰己, 上田泰己
日本抗加齢医学会総会プログラム・抄録集   18th 84   2018
栗川義峻, 大出晃士, 上田泰己, 上田泰己, 水島昇
日本生化学会大会(Web)   91st ROMBUNNO.3T12m‐03(3P‐004) (WEB ONLY)   2018
永島良樹, 永島良樹, 小川真貴子, 大出晃士, 堂本裕加子, 清水義宏, 深山正久, 上田泰己, 上田泰己
日本血管生物医学会学術集会プログラム・抄録集   26th 117   2018
大出晃士, 大出晃士, 須貝秀平, 上田泰己, 上田泰己
実験医学   35(19) 3229‐3235   Dec 2017
小野宏晃, 洲崎悦生, 洲崎悦生, 洲崎悦生, 上田泰己, 上田泰己
生体の科学   68(5) 414‐415   Oct 2017
上田泰己, 上田泰己
CBI学会大会   2017 25   Oct 2017
上田泰己, 上田泰己
時間生物学   23(2) 140   Oct 2017
大出晃士, 大出晃士, 上田泰己, 上田泰己
時間生物学   23(2) 144   Oct 2017
上田泰己, 上田泰己
バイオメディカル分析科学シンポジウム講演要旨集   30th 24   Aug 2017
隅山健太, 砂川玄志郎, 鵜飼(蓼沼)磨貴, ディミトリー ペリン, 上田泰己
日本実験動物学会総会講演要旨集   64th 228   Apr 2017
上田泰己, 上田泰己
日本歯周病学会会誌(Web)   59 74   Apr 2017
吉田健祐, 大出晃士, 大出晃士, 上田泰己, 上田泰己
実験医学   35(5) 879‐882   Mar 2017
昆一弘, 大出晃士, 大出晃士, 上田泰己, 上田泰己
Brain and Nerve   69(3) 0257‐0264   Mar 2017
太田悦朗, 太田悦朗, 太田悦朗, 太田悦朗, 曽根岳史, 大日方友理, 鵜飼英樹, 久松知子, 北川季子, 石川充, 石川充, 石川充, 駒野肇, 上田泰己, 上田泰己, 上田泰己, 小幡文弥, 小幡文弥, 小幡文弥, 岡野栄之
再生医療   16 312   Feb 2017
金子みずほ, 茂田大地, 洲崎悦生, 洲崎悦生, 洲崎悦生, 上田泰己, 上田泰己
感染・炎症・免疫   46(4) 299‐307   Jan 2017
山本真理, 鵜飼英樹, 上田泰己, 上田泰己
日本生化学会大会(Web)   90th ROMBUNNO.3P‐0852 (WEB ONLY)   2017
上田泰己, 上田泰己
俯瞰ワークショップ報告書 ナノテクノロジー・材料分野 領域別分科会 「バイオ・ライフとナノテク・材料の融合領域」 平成28年   53‐58   2017
栗川義峻, 大出晃士, 上田泰己, 上田泰己, 水島昇
日本生化学会大会(Web)   90th ROMBUNNO.3PT19‐04(3P‐0319) (WEB ONLY)   2017
大出晃士, 上田泰己, 大出晃士, 上田泰己
日本生化学会大会(Web)   90th ROMBUNNO.4PS04‐2 (WEB ONLY)   2017
新藤尚吾, 桑鶴哲理, 中川桂一, 塚本哲, 松井和洋, 村上達哉, 洲崎悦生, 上田泰己, 東隆, 高木周
衝撃波シンポジウム講演論文集(CD-ROM)   2016 ROMBUNNO.1D1‐3   2017
茂田大地, 洲崎悦生, 洲崎悦生, 洲崎悦生, 上田泰己, 上田泰己
比較内分泌学   43(161) 74‐76(J‐STAGE)   2017
上田泰己, 上田泰己
日本生化学会大会(Web)   90th ROMBUNNO.2PS14‐5 (WEB ONLY)   2017
鳴海良平, 鳴海良平, 清水義宏, 鵜飼磨貴, 大出晃士, 大出晃士, 神田元紀, 篠原雄太, 佐藤文, 松本桂彦, 上田泰己, 上田泰己
日本プロテオーム学会大会プログラム・抄録集   2017 167   2017
上田泰己
戦略的創造研究推進事業におけるさきがけ採択研究課題別事後評価について(Web)   2017 WEB ONLY   2017
Narumi Ryohei, Shimizu Yoshihiro, R. Ueda Hiroki
Proteome Letters   2(2) 75-82   2017
<p>Accurate measurements of absolute protein abundance can be achieved by emerging targeted proteomics approaches, in which target peptides of enzymatic digests of proteins are analyzed by selected reaction monitoring (SRM) using the stable isotop...
Narumi R., Shimizu Y., Ukai-Tadenuma M., Ode K.L., Kanda G.N., Shinohara Y., Sato A., Matsumoto K., R.Ueda H.
Abstracts for Annual Meeting of Japanese Proteomics Society   2017(0) 167-167   2017
桑島謙, 桑島謙, 大出晃士, 大出晃士, 上田泰己, 上田泰己
生体の科学   67(6) 541‐545   Dec 2016
桑島 謙, 大出 晃士, 上田 泰己
生体の科学   67(6) 541-545   Nov 2016
大野怜一朗, 史蕭逸, 戸根大輔, 大出晃士, 洲崎悦生, 洲崎悦生, 上田泰己, 上田泰己
日本実験動物技術者協会総会講演要旨集   50th 131   Sep 2016
清水義宏, 鳴海良平, 上田泰己
日本生物工学会大会講演要旨集   68th 277   Aug 2016
隅山健太, 砂川玄志郎, 鵜飼(蓼沼)磨貴, PERRIN Dimitri, 上田泰己
日本遺伝学会大会プログラム・予稿集   88th 111   Aug 2016
小野宏晃, 洲崎悦生, 上田泰己
整形・災害外科   59(9) 1235‐1240   Aug 2016
小野 宏晃, 洲崎 悦生, 上田 泰己
整形・災害外科   59(9) 1235-1240   Aug 2016
茂田大地, 金子みずほ, 洲崎悦生, 洲崎悦生, 洲崎悦生, 上田泰己, 上田泰己
医学のあゆみ   258(4) 311‐316   Jul 2016
茂田 大地, 金子 みずほ, 洲﨑 悦生, 上田 泰己
医学のあゆみ   258(4) 311-316   Jul 2016
史蕭逸, 大出晃士, 上田泰己, 上田泰己
アニムス   21(3) 11‐17   Jul 2016
上田泰己, 上田泰己
Journal of Toxicological Sciences   41(Supplement) S95   Jun 2016
勝俣敬寛, 洲崎悦生, 洲崎悦生, 洲崎悦生, 上田泰己, 上田泰己
月刊内分泌・糖尿病・代謝内科   42(5) 362‐368   May 2016
上田泰己, 上田泰己
遺伝子・デリバリー研究会シンポジウム要旨集   16th 17   May 2016
勝俣 敬寛, 洲﨑 悦生, 上田 泰己
内分泌・糖尿病・代謝内科 = Endocrinology, diabetology & metabolism   42(5) 362-368   May 2016
上田泰己, 上田泰己
日本耳鼻咽喉科学会会報   119(4) 373‐374   Apr 2016
新谷裕加子, 大出晃士, 木下修, 阿部浩幸, 小野稔, 上田泰己, 深山正久
日本病理学会会誌   105(1) 475   Apr 2016
上田泰己, 上田泰己
日本呼吸器学会誌   5 31   Mar 2016
原田頌子, 原田頌子, 松本桂彦, 上田泰己
日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM)   96th ROMBUNNO.2C5‐38   Mar 2016
原田頌子, 原田頌子, 松本桂彦, 上田泰己
日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM)   96th ROMBUNNO.1PC‐148   Mar 2016
張千惠, 洲崎悦生, 上田泰己
臨床整形外科   51(2) 180‐183   Feb 2016
上田泰己, 上田泰己
日本がん看護学会誌   30 99   Jan 2016
隅山健太, 砂川玄志郎, 鵜飼(蓼沼)磨貴, DIMITRI Perrin, DIMITRI Perrin, 上田泰己
日本細胞生物学会大会(Web)   68th ROMBUNNO.T3‐1 (WEB ONLY)   2016
上田泰己, 上田泰己
JST成果集   2016 31‐32   2016
大出晃士, 大出晃士, 上田泰己, 上田泰己
日本抗加齢医学会総会プログラム・抄録集   16th 100   2016
上田泰己
千里ライフサイエンスセミナー講演要旨集   2016 18‐22   2016
上田泰己, 上田泰己
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   39th ROMBUNNO.2PS1‐5 (WEB ONLY)   2016
渡邉忠由, 清元貴大, 田所竜介, 洲崎悦生, 洲崎悦生, 上田泰己, 上田泰己, 高瀬悠太, 高橋淑子
日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web)   39th ROMBUNNO.3PS15‐2 (WEB ONLY)   2016
高橋啓範, 今井淳太, 井泉知仁, 山本淳平, 川名洋平, 遠藤彰, 菅原裕人, 洲崎悦生, 畠山裕康, 澤田正二郎, 山田哲也, 上田泰己, 神崎展, 片桐秀樹
糖尿病(Web)   59(Suppl) S.158(J‐STAGE)   2016
上田泰己
戦略的創造研究推進事業におけるさきがけ採択研究課題別事後評価について(Web)   2016 WEB ONLY   2016
UEDA Hiroki R.
Annual Meeting of the Japanese Society of Toxicology   43(0) S14-1   2016
2000年前後の大規模なゲノム配列決定を契機に分子から細胞への階層における生命科学・基礎医学研究が変革した。ゲノムに基づくシステム科学的アプローチは分子から細胞への階層の生命現象の理解に有効であるものの細胞から個体への階層の生命現象への応用は難しい。細胞から個体の階層におけるシステム科学的アプローチを実現するためには、細胞階層での基幹技術の確立が必要不可欠である。そこで我々は、成体組織を丸ごと透明化し1細胞解像度で観察できる技術の開発に取り組んだ。我々が開発したCUBIC法は、透明化が困難...
上田泰己, 上田泰己
Anti-Aging Science   7(3) 171   Nov 2015
久野朗広, 久野朗広, 久野朗広, 洲崎悦生, 洲崎悦生, 田井中一貴, 田井中一貴, 上田泰己, 上田泰己
化学と生物   53(11) 737-740   Oct 2015
上田泰己, 上田泰己
バイオイメージング   24(2) 54   Sep 2015
上田泰己, 上田泰己
日本動脈硬化学会総会・学術集会プログラム・抄録集(Web)   47th 99 (WEB ONLY)   Jun 2015
西村多喜, 田村律人, 大出晃士, 上田泰己, 水島昇
日本細胞生物学会大会要旨集   67th 107   Jun 2015
史蕭逸, 洲崎悦生, 上田泰己
Clinical Neuroscience   33(6) 639-642   Jun 2015
上田泰己, 田井中一貴
JSI Newsletter   23(2) 22-23   Apr 2015
上田泰己
日本内分泌学会雑誌   91(1) 149   Apr 2015
久保田晋平, 田井中一貴, 上田泰己
細胞工学   34(3) 278-282   Feb 2015
須山孟, 田井中一貴, 上田泰己
心臓   47(2) 285-291   Feb 2015
岸野文昭, 洲崎悦生, 上田泰己
生物物理   55(3) 145-147 (J-STAGE)   2015
上田泰己, 上田泰己
日本生化学会大会(Web)   88th 2W3-P-7 (WEB ONLY)   2015
大出晃士, 大出晃士, 上田泰己, 上田泰己
日本生化学会大会(Web)   88th 1W19-5 (WEB ONLY)   2015
上田泰己
戦略的創造研究推進事業におけるさきがけ採択研究課題別事後評価について(Web)   2015 WEB ONLY   2015
KISHINO Fumiaki, A. SUSAKI Etsuo, R. UEDA Hiroki
Seibutsu Butsuri   55(3) 145-147   2015
久保田 晋平, 田井中 一貴, 上田 泰己
細胞工学   34(3) 278-282   2015
森口裕之, 川井隆之, 神田元紀, 山田陸裕, 上田泰己, 田中陽
化学とマイクロ・ナノシステム学会研究会講演要旨集   30th 89   Oct 2014