小田広樹 (Hiroki Oda) - マイポータル - researchmap

基本情報

所属: JT生命誌研究館細胞•発生•進化研究室室長
: 大阪大学大学院理学研究科招聘准教授

学位: 博士（理学）(京都大学)

研究者番号: 50396222
J-GLOBAL ID: 201801005848024872
researchmap会員ID: B000304687

外部リンク: http://www.brh.co.jp/research/lab04/

動物多様化の背景にある細胞システムの進化に興味を持っています。1) 形態形成に重要な役割を果たす細胞間接着構造（アドヘレンスジャンクション）に関わる進化の研究と、2) クモ胚をモデルとした調節的発生メカニズムの研究を行っています。オオヒメグモ (Parasteatoda tepidariorum) のゲノムデータベースを公開しています (www.brh2.jp/)。

研究キーワード

7

研究分野

3

経歴

6

2009年4月 - 現在

大阪大学, 大学院理学研究科, 招聘准教授
2006年4月 - 現在

JT 生命誌研究館, 研究セクター, 主任研究員
2001年10月 - 2006年3月

JT 生命誌研究館, 研究セクター, 研究員
1996年10月 - 2001年9月

科学技術振興事業団（ERATO）, 月田細胞軸プロジェクト
1996年4月 - 1996年9月

京都大学, 日本学術振興会特別研究員（PD）
1993年4月 - 1996年3月

京都大学, 日本学術振興会特別研究員（DC1）

学歴

3

1991年4月 - 1996年3月

京都大学, 大学院理学研究科
1987年4月 - 1991年3月

京都大学, 理学部
1984年4月 - 1987年3月

愛知県立時習館高校

論文

49

Lineage-specific, fast-evolving GATA-like gene regulates zygotic gene activation to promote endoderm specification and pattern formation in the Theridiidae spider

Sawa Iwasaki-Yokozawa, Ryota Nanjo, Yasuko Akiyama-Oda, Hiroki Oda

BMC Biology 20(1) 2022年10月6日査読有り責任著者
Virtual spherical-shaped multicellular platform for simulating the morphogenetic processes of spider-like body axis formation.

Motohiro Fujiwara, Yasuko Akiyama-Oda, Hiroki Oda

Frontiers in cell and developmental biology 10 932814-932814 2022年査読有り責任著者
Reconstruction of the Global Polarity of an Early Spider Embryo by Single-Cell and Single-Nucleus Transcriptome Analysis.

Yasuko Akiyama-Oda, Takanori Akaiwa, Hiroki Oda

Frontiers in cell and developmental biology 10 933220-933220 2022年査読有り
Structural variability and dynamics in the ectodomain of an ancestral-type classical cadherin revealed by AFM imaging.

Shigetaka Nishiguchi, Hiroki Oda

Journal of cell science 134(14) 2021年7月15日査読有り責任著者
The common house spider Parasteatoda tepidariorum

Hiroki Oda, Yasuko Akiyama-Oda

EvoDevo 11(1) 2020年12月査読有り責任著者
Hedgehog signaling controls segmentation dynamics and diversity via msx1 in a spider embryo

Yasuko Akiyama-Oda, Hiroki Oda

Science Advances 6(37) eaba7261-eaba7261 2020年9月査読有り最終著者
Dataset on gene expressions affected by simultaneous knockdown of Hedgehog and Dpp signaling components in embryos of the spider Parasteatoda tepidariorum

Hiroki Oda, Yasuko Akiyama-Oda

Data in Brief 28 105088-105088 2020年2月査読有り責任著者
Microarray data on the comparison of transcript expression between normal and Pt-Delta RNAi embryos in the common house spider Parasteatoda tepidariorum

Hiroki Oda, Yasuko Akiyama-Oda

Data in Brief 25 104350 2019年8月査読有り責任著者
Experimental duplication of bilaterian body axes in spider embryos: Holm’s organizer and self-regulation of embryonic fields

Hiroki Oda, Sawa Iwasaki-Yokozawa, Toshiya Usui, Yasuko Akiyama-Oda

Development Genes and Evolution 2019年4月査読有り責任著者
Genome-scale embryonic developmental profile of gene expression in the common house spider Parasteatoda tepidariorum

Sawa Iwasaki-Yokozawa, Yasuko Akiyama-Oda, Hiroki Oda

Data in Brief 19 865-867 2018年8月1日査読有り責任著者
Homeobox gene duplication and divergence in arachnids.

Leite DJ, Baudouin-Gonzalez L, Iwasaki-Yokozawa S, Lozano-Fernandez J, Turetzek N, Akiyama-Oda Y, Prpic NM, Pisani D, Oda H, Sharma PP …

Molecular biology and evolution 2018年6月査読有り
A quantitative study of the diversity of stripe-forming processes in an arthropod cell-based field undergoing axis formation and growth

Natsuki Hemmi, Yasuko Akiyama-Oda, Koichi Fujimoto, Hiroki Oda

Developmental Biology 437(2) 84-104 2018年5月15日査読有り責任著者
The house spider genome reveals an ancient whole-genome duplication during arachnid evolution

Evelyn E. Schwager, Prashant P. Sharma, Thomas Clarke, Daniel J. Leite, Torsten Wierschin, Matthias Pechmann, Yasuko Akiyama-Oda, Lauren Esposito, Jesper Bechsgaard, Trine Bilde …

BMC BIOLOGY 15(1) 62 2017年7月査読有り責任著者
Evolutionary origin of type IV classical cadherins in arthropods

Mizuki Sasaki, Yasuko Akiyama-Oda, Hiroki Oda

BMC EVOLUTIONARY BIOLOGY 17(1) 142 2017年6月査読有り責任著者
Imaging of Cell Shape Alteration and Cell Movement in Drosophila Gastrulation Using DE-cadherin Reporter Transgenic Flies

M. Rezaul Karim, Tomohiro Haruta, Taro Matsumoto, Hiroki Oda, Hiroaki Taniguchi

JOVE-JOURNAL OF VISUALIZED EXPERIMENTS (118) 2016年12月査読有り
Divergence of structural strategies for homophilic E-cadherin binding among bilaterians

Shigetaka Nishiguchi, Akira Yagi, Nobuaki Sakai, Hiroki Oda

JOURNAL OF CELL SCIENCE 129(17) 3309-3319 2016年9月査読有り責任著者
Multi-color FISH facilitates analysis of cell-type diversification and developmental gene regulation in the Parasteatoda spider embryo

Yasuko Akiyama-Oda, Hiroki Oda

DEVELOPMENT GROWTH & DIFFERENTIATION 58(2) 215-224 2016年2月査読有り
Evolution of the cadherin–catenin complex

Hiroki Oda

Subcellular Biochemistry 60 9-35 2012年査読有り
Travelling and splitting of a wave of hedgehog expression involved in spider-head segmentation

Masaki Kanayama, Yasuko Akiyama-Oda, Osamu Nishimura, Hiroshi Tarui, Kiyokazu Agata, Hiroki Oda

NATURE COMMUNICATIONS 2 500 2011年10月査読有り責任著者
Evolution Structural and functional diversity of cadherin at the adherens junction

Hiroki Oda, Masatoshi Takeichi

JOURNAL OF CELL BIOLOGY 193(7) 1137-1146 2011年6月査読有り

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MISC

8

Cellular and quantitative characterization of three distinct processes of stripe formation in a growing epithelium of the spider Parasteatoda tepidariorum

Hiroki Oda, Natsuki Hemmi, Koichi Fujimoto, Yasuko Akiyama-Oda

MECHANISMS OF DEVELOPMENT 145 S78-S78 2017年7月
A genome-wide study of Hedgehog signaling identifies a transcription factor gene mediating gene expression dynamics in the early spider embryo

Yasuko Akiyama-oda, Sawa Iwasaki-Yokozawa, Hiroki Oda

MECHANISMS OF DEVELOPMENT 145 S144-S145 2017年7月
オオヒメグモ胚における体軸形成機構--放射相称から左右相称への変換

秋山小田康子, 小田広樹

蛋白質核酸酵素 50(15) 1988-1994 2005年12月
オオヒメグモの中はい葉形成:はい盤の予定尾葉領域でDelta-Notchシグナルによって中はい葉と外はい葉の運命選択が行われる

小田広樹, 秋山(小田)康子, 平尾有日子, 西村理, 樽井寛, 阿形清和

日本発生生物学会大会発表要旨集 38th 2005年
Primitive and derived structures of classic cadherins that constitute adherens junctions in bilaterian epithelia

Hiroki Oda, Yasuko Akiyama-Oda

CELL STRUCTURE AND FUNCTION 29 46-46 2004年5月
Body plans of metazoans and structures of classic cadherins(Taxonomy and Systematics)Proceedings of the Seventy-First Annual Meeting of the Zoological Society of Japan :

Oda H., Tsukita S.

Zoological science 17 43-43 2000年
形態形成とカドヘリン : ショウジョウバエの卵形成

小田広樹, 上村匡, 竹市雅俊

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 19 835-835 1996年8月1日
成虫原基のパターン形成におけるDE-カドヘリンの機能

片岡陽平, 小田広樹, 竹市雅俊, 上村匡

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 19 834-834 1996年8月1日

講演・口頭発表等

17

Evolution of structural mechanisms of homophilic adhesion at the adherens junction in metazoans

Oda, H, Nishiguchi, S

Joint meeting of JSCB 70th & JSDB 51st 2018年6月8日
Metazoan Cell-cell Junctions: Molecules, Structures, Mechanics and Evolution

Oda, H, Izumi, Y

Joint meeting of JSCB 70th & JSDB 51st 2018年6月8日招待有り
Evolution of structural mechanisms for homophilic E-cadherin binding

Nishiguchi, S, Sasaki, M, Akiyama-Oda, Y, Yagi, A, Sakai, N, Oda, H

4th Asia-Pacific Drosophila Research Conference 2017年5月9日
Stripe-forming waves of gene expression in a dynamic epithelial cell field of early spider embryo

Oda, H

Join meeting of the German and Japanese societies of developmental biology 2017年3月16日招待有り
A spider model to study mechanisms behind the capacity for self-regulation in axis formation

Oda, H, Iwasaki, S, Akiyama-Oda, Y

The 6th Meeting, European Society for Evolutionary Developmental Biology 2016年7月27日
Regulatory capacity in early embryos and axis formation: self-regulation or self-organization in axis formation

Hiroki Oda

The 6th Meeting, European Society for Evolutionary Developmental Biology 2016年7月27日
The spider Parasteatoda tepidariorum as a model for a better reconstruction of ancestral states for Bilaterians

Oda, H

Second International SpiderWeb meeting 2014年9月16日
Background of our research on the spider Parasteatoda tepidariorum

Hiroki Oda

First International SpiderWeb meeting 2013年2月23日
Three distinct modes of segmentation in an arthropod embryo

Hiroki Oda

Swiss-Japan Developmental Biology Meeting 2012年11月6日招待有り
Three distinct modes of stripe pattern formation for embryonic segmentation in an arthropod

Oda, H, Akiyama-Oda, Y

Evo-Devo Satellite Meeting, Asia-Pacific Developmental Biology Conference 2012年10月5日招待有り
Contrasting mechanisms of axis formation in the phylum Arthropoda: Rapid versus slow development

Oda, H, Kanayama, M, Akiyama-Oda, Y

43th Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists (Co-sponsor: Asia-Pacific Developmental Biology Network) 2010年6月21日
EcoEvoDevo & Comparative Genomics

Ogino, H, Oda, H

Annual Meeting of the Japanese Society of Developmental Biologists (Co-sponsor: Asia-Pacific Developmental Biology Network) 2010年6月21日
The spider Achaearanea tepidariorum is an emerging model for the study of cell and developmental biology

Hiroki Oda

The third meeting of insect genome 2009年3月11日招待有り
hedgehog- and patched-dependent mechanisms generate two orthogonal axes in a spider embryo

Akiyama-Oda, Y, Oda, H

The 2nd Meeting, European Society for Evolutionary Developmental Biology 2008年7月31日
Cell-cell communication required for normal development of axis, mesoderm and caudal ectoderm in the spider embryo

Akiyama-Oda, Y, Oda, H

The First and Founding Meeting, European Society for Evolutionary Developmental Biology 2006年8月17日
Formation of the dorsal-ventral axis and the mesoderm in spiders

Hiroki Oda

The 12th RIKEN CDB Meeting: Diversity of Developmental Mechanisms in Invertebrates 2005年2月3日招待有り
Invertebrate-specific aspects of the cadherin-catenin system and its function in the Drosophila epithelial development

Oda, H, Tsukita, S

The Third Congress of the Asian-Pacific Organization for Cell Biology 1998年8月24日招待有り

Works(作品等)

1

クモ、昆虫、他節足動物に関するゲノム研究のデータベース

小田広樹

データベース

共同研究・競争的資金等の研究課題

8

昆虫系統を特徴づける細胞間接着構造の解明と機能分子デザインへの応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

小田広樹, 鈴木勇輝, 西口茂孝
シングルセル解析による体節形成の多様性を統合する分子基盤の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

小田康子, 小田広樹
体節形成における遺伝子発現振動の開始機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2017年4月 - 2021年3月

小田康子, 小田広樹
上皮の伸長成長と縞パターン形成を連携するメカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(Ｃ) 2015年10月 - 2019年3月

小田広樹, 秋山康子, 野田彰子, 逸見なつき, 岩﨑佐和
モルフォゲンヘッジホッグによる初期胚の細胞動態制御機構の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2014年4月 - 2018年3月

小田康子, 小田広樹
縞パターンの移動と分裂を制御する仕組みの解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2011年4月 - 2014年3月

小田広樹
オオヒメグモの尾葉形成を制御する遺伝子の網羅的探索

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2008年 - 2010年

小田広樹
節足動物門のボディープランを形作る仕組みの究明:クモの尾葉の発生に着目して

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2006年 - 2007年

小田広樹