木村宏 (Hiroshi Kimura) - マイポータル

基本情報

所属: 東京工業大学科学技術創成研究院教授

学位: 博士（理学）(北海道大学)

研究者番号: 30241392
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0003-0854-083X
J-GLOBAL ID: 201501053011063391
Researcher ID: B-9524-2015
researchmap会員ID: B000243419

外部リンク: http://kimura-lab.bio.titech.ac.jp/

研究キーワード

研究分野

経歴

2016年4月 - 現在

東京工業大学, 科学技術創成研究院, 教授
2014年7月 - 2016年3月

東京工業大学, 生命理工学研究科, 教授
2007年10月 - 2014年6月

大阪大学, 大学院・生命機能研究科, 准教授
2007年4月 - 2007年9月

情報通信機構未来ICT研究センター, 特任研究員
2003年8月 - 2007年3月

京都大学大学院, 医学研究科先端領域融合医学研究機構, 特任教授
2002年2月 - 2003年7月

東京医科歯科大学, 難治疾患研究所, 助教授
1996年6月 - 2002年1月

オックスフォード大学, サーウィリアムダン病理学部, 博士研究員
1991年11月 - 1996年5月

北海道大学, 遺伝子実験施設, 教務職員

学歴

1987年4月 - 1991年10月

北海道大学, 大学院理学研究科, 化学第二専攻
1984年4月 - 1987年3月

北海道大学, 理学部, 化学第二学科

受賞

2021年4月

科学技術分野の文部科学大臣表彰科学技術賞
2015年8月

Robert Feulgen Prize, 国際組織化学学会

木村宏

論文

299

Comprehensive analysis of A-type lamin tail region for repairing the nuclear lamina

Yohei Kono, Chan-Gi Pack, Takehiko Ichikawa, Arata Komatsubara, Stephen A. Adam, Loïc Rolas, Sussan Nourshargh, Ohad Medalia, Robert D. Goldman, Takeshi Fukuma, Hiroshi Kimura, Takeshi Shimi

2023年9月2日
Organization of transcription and 3D genome as revealed by live-cell imaging.

Hiroshi Ochiai, Hiroaki Ohishi, Yuko Sato, Hiroshi Kimura

Current opinion in structural biology 81 102615-102615 2023年5月29日
Actin filaments accumulated in the nucleus remain in the vicinity of condensing chromosomes in the zebrafish early embryo

Haruka Oda, Yuko Sato, Shigehiro A. Kawashima, Yusuke Fujiwara, Máté Pálfy, Edlyn Wu, Nadine L. Vastenhouw, Motomu Kanai, Hiroshi Kimura

Biology Open 12(5) 2023年5月15日
Live-cell tracking of γ-H2AX kinetics reveals the distinct modes of ATM and DNA-PK in the immediate response to DNA damage

Watanya Trakarnphornsombat, Hiroshi Kimura

Journal of Cell Science 2023年4月15日
Dense and Acidic Organelle-Targeted Visualization in Living Cells: Application of Viscosity-Responsive Fluorescence Utilizing Restricted Access to Minimum Energy Conical Intersection

Junya Adachi, Haruka Oda, Toshiaki Fukushima, Beni Lestari, Hiroshi Kimura, Hiroka Sugai, Kentaro Shiraki, Rei Hamaguchi, Kohei Sato, Kazushi Kinbara

Analytical Chemistry 2023年3月28日
Transient Methionine Deprivation Triggers Histone Modification and Potentiates Differentiation of Induced Pluripotent Stem Cells

Hiroki Ozawa, Azusa Kambe, Kodai Hibi, Satoshi Murakami, Akira Oikawa, Tetsuya Handa, Katsunori Fujiki, Ryuichiro Nakato, Katsuhiko Shirahige, Hiroshi Kimura, Nobuaki Shiraki, Shoen Kume

Stem Cells 2023年3月17日
Two Onnamide Analogs from the Marine Sponge Theonella conica: Evaluation of Geometric Effects in the Polyene Systems on Biological Activity

Fumiaki Nakamura, Hiroshi Kimura, Nobuhiro Fusetani, Yoichi Nakao

Molecules 2023年3月9日
The role of H3K9me3 in oral squamous cell carcinoma

Misako Tanaka, Hiroyuki Harada, Hiroshi Kimura

Biochemical and Biophysical Research Communications 2023年1月
Nucleoplasmic lamin C rapidly accumulates at sites of nuclear envelope rupture with BAF and cGAS

Yohei Kono, Stephen A. Adam, Yuko Sato, Karen L. Reddy, Yixian Zheng, Ohad Medalia, Robert D. Goldman, Hiroshi Kimura, Takeshi Shimi

Journal of Cell Biology 221(12) 2022年12月5日
Superfluid helium nanoscope insert with millimeter working range

Naoki Kamiya, Kazuki Kuramoto, Kento Takishima, Tatsuya Yumoto, Haruka Oda, Takeshi Shimi, Hiroshi Kimura, Michio Matsushita, Satoru Fujiyoshi

Review of Scientific Instruments 93(10) 103703-103703 2022年10月1日査読有り
MYPT1-PP1β phosphatase negatively regulates both chromatin landscape and co-activator recruitment for beige adipogenesis.

Hiroki Takahashi, Ge Yang, Takeshi Yoneshiro, Yohei Abe, Ryo Ito, Chaoran Yang, Junna Nakazono, Mayumi Okamoto-Katsuyama, Aoi Uchida, Makoto Arai, Hitomi Jin, Hyunmi Choi, Myagmar Tumenjargal, Shiyu Xie, Ji Zhang, Hina Sagae, Yanan Zhao, Rei Yamaguchi, Yu Nomura, Yuichi Shimizu, Kaito Yamada, Satoshi Yasuda, Hiroshi Kimura, Toshiya Tanaka, Youichiro Wada, Tatsuhiko Kodama, Hiroyuki Aburatani, Min-Sheng Zhu, Takeshi Inagaki, Timothy F Osborne, Takeshi Kawamura, Yasushi Ishihama, Yoshihiro Matsumura, Juro Sakai

Nature communications 13(1) 5715-5715 2022年9月29日
Nanog organizes transcription bodies

Ksenia Kuznetsova, Martino Ugolini, Edlyn Wu, Manan Lalit, Haruka Oda, Yuko Sato, Hiroshi Kimura, Florian Jug, Nadine Vastenhouw

Current Biology 33(1) 164-173.e5 2022年6月13日
Live imaging of transcription sites using an elongating RNA polymerase II–specific probe

Satoshi Uchino, Yuma Ito, Yuko Sato, Tetsuya Handa, Yasuyuki Ohkawa, Makio Tokunaga, Hiroshi Kimura

Journal of Cell Biology 221(2) 2022年2月7日
Imaging transcription elongation dynamics by new technologies unveils the organization of initiation and elongation in transcription factories

Hiroshi Kimura, Yuko Sato

Current Opinion in Cell Biology 74 71-79 2022年2月
STREAMING-tag system reveals spatiotemporal relationships between transcriptional regulatory factors and transcriptional activity

Hiroaki Ohishi, Seiru Shimada, Satoshi Uchino, Jieru Li, Yuko Sato, Manabu Shintani, Hitoshi Owada, Yasuyuki Ohkawa, Alexandros Pertsinidis, Takashi Yamamoto, Hiroshi Kimura, Hiroshi Ochiai

Nature Communications 13(1) 2022年1月6日
A Drosophila toolkit for HA-tagged proteins unveils a block in autophagy flux in the last instar larval fat body

Murakawa, T., Nakamura, T., Kawaguchi, K., Murayama, F., Zhao, N., Stasevich, T.J., Kimura, H., Fujita, N.

Development (Cambridge, England) 149(6) 2022年
Intra Q-body: an antibody-based fluorogenic probe for intracellular proteins that allows live cell imaging and sorting

Yancen Dai, Yuko Sato, Bo Zhu, Tetsuya Kitaguchi, Hiroshi Kimura, Farid J. Ghadessy, Hiroshi Ueda

Chemical Science 2022年
Locus-specific induction of gene expression from heterochromatin loci during cellular senescence

Kosuke Tomimatsu, Dóra Bihary, Ioana Olan, Aled J. Parry, Stefan Schoenfelder, Adelyne S. L. Chan, Guy St. C. Slater, Yoko Ito, Peter J. Rugg-Gunn, Kristina Kirschner, Camino Bermejo-Rodriguez, Tomomi Seko, Hiroyuki Kugoh, Ken Shiraishi, Koji Sayama, Hiroshi Kimura, Peter Fraser, Masako Narita, Shamith A. Samarajiwa, Masashi Narita

Nature Aging 2021年12月23日査読有り
High-throughput single-cell epigenomic profiling by targeted insertion of promoters (TIP-seq)

Daniel A. Bartlett, Vishnu Dileep, Tetsuya Handa, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura, Steven Henikoff, David M. Gilbert

Journal of Cell Biology 220(12) 2021年12月6日
Chromatin loading of MCM hexamers is associated with di-/tri-methylation of histone H4K20 toward S phase entry

Yoko Hayashi-Takanaka, Yuichiro Hayashi, Yasuhiro Hirano, Atsuko Miyawaki-Kuwakado, Yasuyuki Ohkawa, Chikashi Obuse, Hiroshi Kimura, Tokuko Haraguchi, Yasushi Hiraoka

Nucleic Acids Research 49(21) 12152-12166 2021年12月2日

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MISC

核膜損傷修復における核ラミンAおよびCの異なる動態の解明

河野洋平, 木村宏, 志見剛

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 95回 3P-232 2022年11月
クローズアップ実験法(series 320) タンパク質1分子を翻訳過程からイメージング可能なプローブ「HA Frankenbody」

趙寧, 森崎達也, 小田春佳, 佐藤優子, 木村宏, Stasevich Timothy J.

実験医学 38(4) 607-613 2020年3月
ヒストン修飾解析の最前線

半田哲也, 木村宏

遺伝子医学 10(1) 124-129 2020年1月
Mintbody法を用いたマウス着床前胚におけるX染色体不活性化の可視化

植田朱音, 佐藤優子, 大井彰人, 八尾竜馬, 木村宏, 山縣一夫

第42回日本分子生物学会年会 2019年12月
未来を切り拓く先端的な生命科学への挑戦遺伝子発現の理解と制御のための「ヌクレオーム」研究とエピゲノム編集

木村宏, 佐藤優子

JATAFFジャーナル 7(5) 3‐6 2019年5月1日
光学顕微鏡 14.共焦点レーザー走査顕微鏡 iii.FRAP/FLIP―フォトブリーチによる生細胞内分子動態計測

木村宏

実験医学 36(20) 3398‐3399 2018年12月15日
ライブセルイメージングを用いたマウス受精卵におけるDNA損傷の可視化及び定量化

小栗未生奈, 半田哲也, 鈴木由華, 波多野裕, 野老美紀子, 八尾竜馬, 小林昇平, 細井美彦, 野崎直仁, 原口徳子, 木村宏, 山縣一夫

第41回日本分子生物学会年会 2018年11月
染色体はどのような部品からできているのか?5.ヒストンの細胞内ダイナミクス

木村宏

実験医学 36(17) 2890‐2896 2018年11月1日
ヒストン修飾と特異的モノクローナル抗体

木村宏

Dojin News (166) 1‐5 2018年9月21日
受精直後の精子核におけるDNA損傷を生きたまま可視化・定量化する方法の構築

小栗未生奈, 半田哲也, 鈴木由華, 波多野裕, 野老美紀子, 八尾竜馬, 小林昇平, 細井美彦, 野崎直仁, 原口徳子, 木村宏, 山縣一夫

近畿大学院生サミット 2018年9月
細胞核・クロマチン動態の生細胞イメージング

木村宏

バイオイメージング 27(2) 64 2018年8月24日
遺伝子不活性化マークを生細胞で観察できる蛍光プローブ (特集革新的創薬研究への挑戦)

佐藤優子, 木村宏

化學工業 69(8) 589-594 2018年8月
CENP-Bは,その酸性ドメインを介してCENP-Aまたはヘテロクロマチン集合に許容的なクロマチン状態を促進する

大竹興一郎, 大関淳一郎, 庄野暢晃, 久郷和人, 岡崎孝映, 長瀬隆弘, 山川央, KOUPRINA Natalay, LARIONOV Vladimir, 木村宏, EARNSHAW William C, 舛本寛

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st 2018年
ヌクレオームコンソーシアム

田代聡, 木村宏

生物物理 58(4) 221-222 2018年
受精直後の精子核DNA二本鎖切断を生きたまま可視化・定量化する方法の開発

小栗未生奈, 半田哲也, 杉本瑞紀, 鈴木由華, 波多野裕, 野老美紀子, 八尾竜馬, 細井美彦, 野崎直仁, 木村宏, 山縣一夫

第40回日本分子生物学会 2017年12月
ヒストンメチル化酵素G9aはマウス歯胚の増殖と分化を制御する

出野尚, 上運天太一, 島田明美, 寺島達夫, 中島和久, 友岡康弘, 中村芳樹, 木村宏, 立花誠, 二藤彰

日本骨代謝学会学術集会プログラム抄録集 35th 172-172 2017年7月
エピゲノム解析 : ヒストン修飾データの取得と意味 (特集核内イベントの時空間制御) -- (ゲノム解析)

木村宏

生体の科学 68(3) 199-203 2017年5月
ゲノム，エピゲノムからヌクレオームへ：遺伝情報発現制御機構の包括的理解に向けて

木村宏, 佐藤優子

情報管理 60(8) 555-563 2017年
Constitution of Higher Order Heterochromatin Structure Based on Epigenetic Code

Koji Nagao, Shin-Ya Isobe, Yoshi-Nobu Ohkubo, Yoko Hayashi-Takanaka, Hiroshi Kimura, Takashi Sado, Chikashi Obuse

GENES & GENETIC SYSTEMS 91(6) 318-318 2016年12月
Phosphorylation at Ser7 of RNA polymerase II CTD limits transcription speed and transcription elongation

Takuya Kajitani, Hiroaki Kato, Yuji Chikashige, Hiroshi Kimura, Yasuyuki Ohkawa, Damien Herand, Yota Murakami

GENES & GENETIC SYSTEMS 91(6) 348-348 2016年12月

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書籍等出版物

新・生細胞蛍光イメージング

原口, 徳子, 木村, 宏(生物学), 平岡, 泰

共立出版 2015年11月 (ISBN: 9784320057791)
細胞核 : 遺伝情報制御と疾患 : 染色体・核輸送のダイナミクスと細胞分化から個体発生, 破綻による疾患まで

平岡, 泰, 原田, 昌彦, 木村, 宏(生物学), 田代, 聡

羊土社 2009年11月 (ISBN: 9784758103022)
生細胞蛍光イメージング : 講義と実習 : 阪大・北大顕微鏡コースブック

原口, 徳子, 木村, 宏(生物学), 平岡, 泰

共立出版 2007年10月 (ISBN: 9784320056602)
細胞核の世界 : ダイナミクスから病態まで

米田, 悦啓, 木村, 宏(生物学), 五十嵐, 和彦, 中尾, 光善

共立出版 2007年 (ISBN: 9784320056558)
生細胞におけるクロマチンの可視化

実験医学別冊「クローズアップ実験法総集編」（羊土社） 2002年
転写ファクトリーと核内構造

わかる実験医学シリーズ「転写がわかる−基本転写から発生、再生、先端医療まで−」（羊土社） 2002年

講演・口頭発表等

ヒストン修飾と転写の生細胞動態から捉えるクロマチンポテンシャル

木村宏

第41回日本分子生物学会年会 2018年11月28日
A chromatin integration labeling method enables epigenomic profiling with lower input

Tetsuya Handa, Akihito Harada, Kazumitsu Maehara, Yasuhiro Arimura, Jumpei Nogami, Yoko Hayashi-Takanaka, Katsuhiko Shirahige, Hitoshi Kurumizaka, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Kimura

3R&3C Symposium 2018年11月12日
Sensing Histone Modification and Transcription Dynamics in Living Cells

木村宏

2nd Epigenetics and Bioengineering Conference 2018年10月6日招待有り
クロマチン修飾ダイナミクス生細胞イメージングとエピゲノム解析の融合に向けて

木村宏

第91回日本生化学会大会 2018年9月24日招待有り
Chromatin Modification Dynamics in Living Cells

木村宏

Gordon Research Conference "Chromatin Structure and Function" 2018年7月22日招待有り
Chromatin modification dynamics

木村宏

Joint Annual Meeting of JSDB 51st and JSCB 70th 2018年6月5日招待有り
Chromatin modification dynamics during gene activation and inactivation in living cells

木村宏

CSHL Meeting "Nuclear Organization & Function" 2018年5月1日招待有り
ヒストン修飾翻訳後修飾と転写の生細胞動態

木村宏

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 2014年5月26日
ヒストン3リジン9メチル化酵素群(G9a,Glp,Suv39h1,Prdm2)のマウス歯牙発生における発現と機能

上運天太一, 島田明美, 出野尚, 中村芳樹, 木村宏, 立花誠, 中島和久, 二藤彰

日本骨代謝学会学術集会プログラム抄録集 2014年
細胞内抗体プローブを用いたヒストン修飾動態の生体イメージング

佐藤優子, 木村宏

がん研究分野の特性等を踏まえた支援活動公開シンポジウムプログラム・抄録集平成25年度 2014年
2SDA-04 ヒストンとRNAポリメラーゼの翻訳後修飾の生細胞・生体内計測(2SDA 生命現象の基本に迫る動的クロマチン構造・機能研究の最前線,新学術領域研究「動的クロマチン構造と機能」共催,シンポジウム,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

木村宏

生物物理 2014年
がんの悪性進展過程におけるヒストンの翻訳後修飾変化の解析

木村宏

金沢大学がん進展制御研究所がんの転移・薬剤耐性に関わる先導的研究拠点 2014年
2SDA-02 統合的イメージングアプローチによる動的クロマチン構造・機能研究(2SDA 生命現象の基本に迫る動的クロマチン構造・機能研究の最前線,新学術領域研究「動的クロマチン構造と機能」共催,シンポジウム,第52回日本生物物理学会年会(2014年度))

十川久美子, 伊藤由馬, 深川暁弘, 原田昌彦, 木村宏, 徳永万喜洋

生物物理 2014年
生細胞解析により明らかとなったヒストン修飾による転写活性化の二段階制御

木村宏, STASEVICH Timothy J

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 2013年8月31日
次世代シークエンサーを用いた新規ヒストン修飾の研究

貝森淳哉, 木村宏, 大川恭行, 高原史郎, 楽木宏実, 猪阪善隆

日本腎臓学会誌 2013年4月25日
生細胞におけるヒストンH3アセチル化による転写活性化の二段階制御

木村宏

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 2013年
ヒト精巣特異的に高発現するヒストンバリアントH3.5を含むヌクレオソームの構造解析および機能解析

浦浜嵩, 越阪部晃永, 堀越直樹, 佐藤浩一, 立和名博昭, 香川亘, 大川恭行, 木村宏, 胡桃坂仁志

日本生化学会大会(Web) 2013年
ヒストンバリアントによるエピジェネティクスの構造基盤

胡桃坂仁志, 大川恭行, 木村宏

日本生化学会大会(Web) 2013年
ショウジョウバエ卵巣においてヒストン修飾を介した転写活性化機構が生殖細胞の分化を促進する

向正則, 平誠司, 新谷恵魅, 木村宏, 小林悟

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 2013年
ヒトヒストンバリアントH2A.Bの機能解析

有村泰宏, 小田隆, 佐藤浩一, 藤田理紗, 松本亮平, 田口裕之, 堀越直樹, 越阪部晃永, 立和名博昭, 杉山正明, 佐藤衛, 木村宏, 胡桃坂仁志

日本生化学会大会(Web) 2013年

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共同研究・競争的資金等の研究課題

遺伝子制御の基盤となるクロマチンポテンシャル

日本学術振興会科学研究費補助金（新学術領域研究） 2018年6月 - 2023年3月

木村宏
細胞核・クロマチン構造のダイナミクスと遺伝子制御

日本学術振興会科学研究費補助金（新学術領域研究） 2018年6月 - 2023年3月

木村宏
生細胞解析による転写制御におけるクロマチン修飾の意義の解明

日本学術振興会科学研究費補助金（基盤研究（A）） 2017年4月 - 2021年3月

木村宏
計測と再構築による生細胞内クロマチンダイナミクスの高次元的理解

文部科学省科学研究費補助金(新学術領域研究(研究領域提案型)) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2013年 - 2017年

木村宏
多機能抗体を用いたエピジェネティクス操作によるヒストン修飾の意義の解明

日本学術振興会科学研究費補助金(基盤研究(B)) 基盤研究(B) 2014年 - 2016年

木村宏
生体内蛋白質翻訳後修飾イメージング

文部科学省科学研究費補助金(新学術領域研究(研究領域提案型)) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2013年 - 2014年

木村宏
DNA損傷修復過程におけるヒストン修飾の生細胞動態

文部科学省科学研究費補助金(新学術領域研究(研究領域提案型)) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2013年 - 2014年

木村宏
蛍光相互相関分光法を用いたヒストン修飾クロストークの計測

文部科学省科学研究費補助金(挑戦的萌芽研究) 挑戦的萌芽研究 2012年 - 2013年

木村宏
RNAポリメラーゼIIによる転写の場のダイナミクス

文部科学省科学研究費補助金(新学術領域研究(研究領域提案型)) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2011年 - 2012年

木村宏
生細胞内ヒストンメチル化可視化による不活性X染色体動態の解析

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(B)) 基盤研究(B) 2010年 - 2012年

木村宏
G2期におけるauroraBによるヒストンリン酸化の意義

文部科学省科学研究費補助金(特定領域研究) 特定領域研究 2010年 - 2012年

木村宏
RNAポリメラーゼIIによる転写の時空間場

文部科学省科学研究費補助金(新学術領域研究(研究領域提案型)) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2009年 - 2010年

木村宏
特異的ヒストン修飾を持つクロマチンの構造と動態の解明

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(B)) 基盤研究(B) 2007年 - 2009年

木村宏
抗体エンジニアリングによるヒストン修飾シグナル可視化システムの開発

文部科学省科学研究費補助金(萌芽研究) 萌芽研究 2007年 - 2008年

木村宏
クロマチン構造構築とダイナミクスの分子制御機構

文部科学省科学研究費補助金(特定領域研究) 特定領域研究 2004年 - 2008年

木村宏, 大隅圭太
セミインタクト細胞核を用いた第三世代試験管内転写系の開発

文部科学省科学研究費補助金(萌芽研究) 萌芽研究 2004年 - 2005年

木村宏
高等真核生物生細胞におけるクロマチン構造変換と遺伝子発現制御

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(B)) 基盤研究(B) 2003年 - 2005年

木村宏
マウスMCMタンパク質の機能とその制御機構

文部科学省科学研究費補助金(重点領域研究) 重点領域研究 1995年 - 1995年

木村宏
マウスP1タンパク質のリン酸化制御

文部科学省科学研究費補助金(奨励研究(A)) 奨励研究(A) 1995年 - 1995年

木村宏
マウスMCM関連タンパク質の解析

文部科学省科学研究費補助金(重点領域研究) 重点領域研究 1994年 - 1994年

木村宏

木村宏

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学歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

共同研究・競争的資金等の研究課題

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