西田紘士 (HIROSHI NISHIDA) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学大学院薬学研究科特定助教

学位: 博士（薬科学）(2023年3月京都大学)

連絡先: nishida.hiroshi.6skyoto-u.ac.jp
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0001-8833-1901
J-GLOBAL ID: 202301009976470635
researchmap会員ID: R000052645

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / ゲノム生物学 /

経歴

2025年10月 - 現在

京都大学, 大学院薬学研究科, 特定助教
2023年9月 - 2025年9月

Mayo Clinic, Department of Laboratory Medicine and Pathology, Research fellow
2023年4月 - 2023年8月

京都大学, 大学院薬学研究科, 特定研究員

学歴

2020年4月 - 2023年3月

京都大学, 大学院薬学研究科, 薬科学専攻博士後期課程
2018年4月 - 2020年3月

京都大学, 大学院薬学研究科, 薬科学専攻修士課程
2014年4月 - 2018年3月

京都大学, 薬学部, 薬科学科

論文

Light‐Activated Protein‐Imprinted Hydrogels Capable of Translating Protein Surface Accessibility Into Missing‐Peptide Footprints

Eisuke Kanao, Taichi Nihei, Kankichi Kako, Asato Maeda, Damla Ulker, Hiroshi Nishida, Kosuke Ogata, Mingdi Yan, Sergey Piletsky, Yasushi Ishihama …

Small Structures 2026年6月
Multiplexed Quantitation of Post-Translationally Modified Peptides in Single Cells Using Triggered MS/MS Combined with Super Heavy Tandem Mass Tags.

Dong-Gi Mun, Hiroshi Nishida, Firdous A Bhat, Raghavendra Rao Pasupuleti, Bernard Delanghe, Akhilesh Pandey

Journal of proteome research 25(2) 1184-1190 2026年2月6日筆頭著者
Long-read sequencing for 29 immune cell subsets reveals disease-linked isoforms

Jun Inamo, Akari Suzuki, Mahoko Takahashi Ueda, Kensuke Yamaguchi, Hiroshi Nishida, Katsuya Suzuki, Yuko Kaneko, Tsutomu Takeuchi, Hiroaki Hatano, Kazuyoshi Ishigaki …

Nature Communications 15(1) 4285-4285 2024年5月28日
One-step N-terminomics based on isolation of protein N-terminal peptides from LysargiNase digests by tip-based strong cation exchange chromatography

Kazuya Morikawa, Hiroshi Nishida, Koshi Imami, Yasushi Ishihama

Molecular & cellular proteomics : MCP 23(9) 100820-100820 2024年2月7日
Centrifugal Gel Crushing Tips for Gel-Based Proteome Analysis.

Hiroshi Nishida, Eisuke Kanao, Yasushi Ishihama

Analytical chemistry 95(50) 18311-18315 2023年12月19日筆頭著者
Classification of Extracellular Vesicles Based on Surface Glycan Structures by Spongy-like Separation Media.

Eisuke Kanao, Shuntaro Wada, Hiroshi Nishida, Takuya Kubo, Tetsuya Tanigawa, Koshi Imami, Asako Shimoda, Kaori Umezaki, Yoshihiro Sasaki, Kazunari Akiyoshi …

Analytical chemistry 94(51) 18025-18033 2022年12月27日
Immune Isoform Atlas: Landscape of alternative splicing in human immune cells

Jun Inamo, Akari Suzuki, Mahoko Ueda, Kensuke Yamaguchi, Hiroshi Nishida, Katsuya Suzuki, Yuko Kaneko, Tsutomu Takeuchi, Yasushi Ishihama, Kazuhiko Yamamoto …

2022年9月15日
Protein N-Terminomics Reveals Major Proteases in Regulating Beige Adipocyte Differentiation

Hsin-Yi Chang, Chih-Hsiang Chang, Hiroshi Nishida, Kaho Takamuro, Kosuke Ogata, Kuan-Chieh Peng, Li-Chun Lin, Yii-Jwu Lo, Tsui-Chin Huang, Yasushi Ishihama

2022年8月2日
One-Step Isolation of Protein C-Terminal Peptides from V8 Protease-Digested Proteins by Metal Oxide-Based Ligand-Exchange Chromatography.

Hiroshi Nishida, Yasushi Ishihama

Analytical chemistry 94(2) 944-951 2022年1月18日筆頭著者
プロテオミクスによるエクトドメインシェディング研究:最新技術の応用例として

津曲和哉, 津曲和哉, 西田紘士, Chang Chih-Hsiang, 石濱泰, 石濱泰

日本プロテオーム学会誌(Web) 7(2) 47-52 2022年査読有り
Combinatorial analysis of translation dynamics reveals eIF2 dependence of translation initiation at near-cognate codons.

Kazuya Ichihara, Akinobu Matsumoto, Hiroshi Nishida, Yuki Kito, Hideyuki Shimizu, Yuichi Shichino, Shintaro Iwasaki, Koshi Imami, Yasushi Ishihama, Keiichi I Nakayama

Nucleic acids research 49(13) 7298-7317 2021年7月21日

MISC

タンパク質ターミノミクスによる非小細胞肺がん細胞株におけるプロテオリシス大規模解析

千坂理佐, 谷口優斗, 佐川達也, 高室花歩, 富岡郁那, 西田紘士, 奥田修二郎, 石濱泰

日本薬学会年会要旨集(Web) 145th 2025年
非小細胞肺がん細胞株のプロテオリシス解析

千坂理佐, 谷口優斗, 富岡郁那, 西田紘士, 石濱泰, 石濱泰

次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム講演要旨集 22nd 2025年
プロテインターミノミクスを用いた非典型タンパク質大規模解析

榮川理子, 西田紘士, 高地雄太, 小形公亮, 石濱泰, 石濱泰

日本生化学会大会(Web) 98th 2025年
プロテインターミノミクスを用いた非典型タンパク質大規模解析

榮川理子, 西田紘士, 高地雄太, 小形公亮, 石濱泰, 石濱泰

日本生化学会大会(Web) 98th 3P-282 2025年
タンパク質末端大規模解析によるマクロファージ分化におけるプロテオリシス制御機構の解明

高室花歩, 西田紘士, 谷口優斗, 小形公亮, 石濱泰, 石濱泰

日本プロテオーム学会大会プログラム・抄録集 2024 (Web) 2024年
最終翻訳産物の同定に基づく非典型翻訳プロテオーム計測

榮川理子, 西田紘士, 高地雄太, 小形公亮, 石濱泰, 石濱泰

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 47th 2024年
タンパク質末端ペプチド濃縮法を用いた非小細胞肺がん細胞株のプロテオフォーム解析

谷口優斗, 西田紘士, 奥田修二郎, 石濱泰

日本プロテオーム学会大会プログラム・抄録集 2023 (CD-ROM) 2023年
がん細胞のプロテアーゼ制御機構解明に向けたタンパク質ターミノーム解析

谷口優斗, 西田紘士, 奥田修二郎, 石濱泰, 石濱泰

次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム講演要旨集 20th 2023年
ベージュ脂肪細胞誘導におけるPmpcb基質タンパク質の切断活性評価

高室花歩, CHANG Chih-Hsiang, 西田紘士, 小形公亮, CHANG Hsin-Yi, 石濱泰, 石濱泰

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 46th 2023年
高速菌叢解析に向けたリボソームタンパク質濃縮

工藤拓実, 西田紘士, WU Pei-Shan, 山下蓮太郎, 杉山直幸, 石濱泰, 石濱泰

キャピラリー電気泳動シンポジウム講演要旨集(CD-ROM) 43rd 2023年
ピペットチップ型カラムを用いたワンステップタンパク質末端ペプチド濃縮法

森川和哉, 西田紘士, 今見考志, 今見考志, 石濱泰, 石濱泰

質量分析総合討論会講演要旨集 71st 2023年
ワンステップタンパク質N末端ペプチド単離法による包括的タンパク質N末端解析

森川和哉, 西田紘士, 今見考志, 石濱泰, 石濱泰

バイオメディカル分析科学シンポジウム講演要旨集 35th 2023年
スポンジ状酵素リアクターを用いる超高速プロテオミクスプラットフォームの開発

田中俊輔, 中井郁那, 西田紘士, 金尾英佑, 金尾英佑, 金尾英佑, 今見考志, 今見考志, 石濱泰, 石濱泰 …

日本薬学会年会要旨集(Web) 143rd 2023年
新生ポリペプチド鎖N末端アセチル化の大規模解析法の開発

森川和哉, 内山純貴, 西田紘士, 今見考志, 石濱泰

日本薬学会年会要旨集 142年会 28L-am12S 2022年3月
タンパク質末端解析データを用いたノンカノニカルタンパク質の同定

西田紘士, 今見考志, 今見考志, 高地雄太, 石濱泰, 石濱泰

日本プロテオーム学会大会プログラム・抄録集 2022 (Web) 2S52P45A-2S52P45A 2022年
新生ポリペプチド鎖N末端解析によるノンカノニカルタンパク質の同定

森川和哉, 西田紘士, 今見考志, 今見考志, 石濱泰, 石濱泰

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 45th 2022年
配位子交換クロマトグラフィーによるワンステップタンパク質C末端ペプチド濃縮法の開発

西田紘士, 石濱泰

バイオメディカル分析科学シンポジウム講演要旨集 33rd 2021年
TranslatomeとProteomeの融合が切り開く未踏ORFの生物学

松本有樹修, 市原知哉, 西田紘士, 今見考志, 石濱泰, 中山敬一

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 44th 2021年
精密な翻訳開始点の同定により明らかとなったNon-AUG翻訳開始の分子機構と生物学的意義

市原知哉, 松本有樹修, 西田紘士, 今見孝志, 石濱泰, 中山敬一

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 44th 2021年
N末端プロテオミクスによる新規翻訳開始点の同定

西田紘士, 今見考志, 石濱泰

日本プロテオーム学会大会プログラム・抄録集 2021 (CD-ROM) 2021年

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共同研究・競争的資金等の研究課題

超高深度アイソフォミクス手法の構築および時空間プロテインアトラスの作成

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2021年4月 - 2023年3月

西田紘士

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MISC

共同研究・競争的資金等の研究課題

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