川路英哉 (Hideya Kawaji) - マイポータル

基本情報

所属: 公益財団法人東京都医学総合研究所ゲノム医学研究センター副センター長
: 特定国立研究開発法人理化学研究所生命医科学研究センター

J-GLOBAL ID: 201901013468136481
researchmap会員ID: B000367691

研究分野

ライフサイエンス / システムゲノム科学 /

経歴

2023年4月 - 現在

特定国立研究開発法人理化学研究所, 生命医科学研究センター

論文

165

Use of clinical variables for preoperative prediction of lymph node metastasis in endometrial cancer.

Yuta Ueno, Emiko Yoshida, Shuko Nojiri, Tomoyasu Kato, Takashi Ohtsu, Toshiyuki Takeshita, Shunji Suzuki, Hiroshi Yoshida, Ken Kato, Masayoshi Itoh …

Japanese journal of clinical oncology 54(1) 38-46 2024年1月7日
ROR2 expression predicts human induced pluripotent stem cell differentiation into neural stem/progenitor cells and GABAergic neurons.

Takuya Kuroda, Satoshi Yasuda, Satoko Matsuyama, Takumi Miura, Rumi Sawada, Akifumi Matsuyama, Yumiko Yamamoto, Masaki Suimye Morioka, Hideya Kawaji, Takeya Kasukawa …

Scientific reports 14(1) 690-690 2024年1月6日
PLA2G2E-mediated lipid metabolism triggers brain-autonomous neural repair after ischemic stroke.

Akari Nakamura, Seiichiro Sakai, Yoshitaka Taketomi, Jun Tsuyama, Yoshimi Miki, Yuichiro Hara, Nobutaka Arai, Yuki Sugiura, Hideya Kawaji, Makoto Murakami …

Neuron 111(19) 2995-3010 2023年10月4日
Single-Cell RNA-Seq Reveals LRRC75A-Expressing Cell Population Involved in VEGF Secretion of Multipotent Mesenchymal Stromal/Stem Cells Under Ischemia

Takumi Miura, Tsukasa Kouno, Megumi Takano, Takuya Kuroda, Yumiko Yamamoto, Shinji Kusakawa, Masaki Suimye Morioka, Tohru Sugawara, Takamasa Hirai, Satoshi Yasuda …

Stem Cells Translational Medicine 12(6) 379-390 2023年6月1日
Spatial transcriptome of developmental mouse brain reveals temporal dynamics of gene expressions and heterogeneity of the claustrum

Yuichiro Hara, Takuma Kumamoto, Naoko Yoshizawa-Sugata, Kumiko Hirai, Song Xianghe, Hideya Kawaji, Chiaki Ohtaka-Maruyama

2023年4月13日
CALML5 is a novel diagnostic marker for differentiating thymic squamous cell carcinoma from type B3 thymoma.

Koichiro Kanamori, Kentaro Suina, Takehito Shukuya, Fumiyuki Takahashi, Takuo Hayashi, Kieko Hara, Tsuyoshi Saito, Yoichiro Mitsuishi, Shoko Sonobe Shimamura, Wira Winardi …

Thoracic cancer 14(12) 1089-1097 2023年3月16日
Urinary exosomal microRNAs as predictive biomarkers for persistent psychotic-like experiences.

Yasufumi Tomita, Kazuhiro Suzuki, Syudo Yamasaki, Kazuya Toriumi, Mitsuhiro Miyashita, Shuntaro Ando, Kaori Endo, Akane Yoshikawa, Koichi Tabata, Satoshi Usami …

Schizophrenia (Heidelberg, Germany) 9(1) 14-14 2023年3月11日
Application of spatial transcriptomics analysis using the Visium system for the mouse nasal cavity after intranasal vaccination.

Sakiko Toyama, Tomoko Honda, Sadahiro Iwabuchi, Shinichi Hashimoto, Kenzaburo Yamaji, Yuko Tokunaga, Yusuke Matsumoto, Hideya Kawaji, Takashi Miyazaki, Yoshiaki Kikkawa …

Frontiers in immunology 14 1209945-1209945 2023年
Prediction of the cell-type-specific transcription of non-coding RNAs from genome sequences via machine learning

Masaru Koido, Chung-Chau Hon, Satoshi Koyama, Hideya Kawaji, Yasuhiro Murakawa, Kazuyoshi Ishigaki, Kaoru Ito, Jun Sese, Nicholas F. Parrish, Yoichiro Kamatani …

Nature Biomedical Engineering 2022年11月21日
尿中エキソソーム含有miRNAによる精神病様体験の持続の予測

富田康文, 鈴木一浩, 田畑光一, 川路英哉, 宮下光弘, 鳥海和也, 山崎修道, 安藤俊太郎, 笠井清登, 西田淳志 …

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 95回 2P-315 2022年11月
mRNA-based generation of marmoset PGCLCs capable of differentiation into gonocyte-like cells

Musashi Kubiura-Ichimaru, Christopher Penfold, Kazuaki Kojima, Constance Dollet, Haruka Yabukami, Katsunori Semi, Yasuhiro Takashima, Thorsten Boroviak, Hideya Kawaji, Knut Woltjen …

BioRxiv 2022年9月20日
DUX4 is a multifunctional factor priming human embryonic genome activation.

Sanna Vuoristo, Shruti Bhagat, Christel Hydén-Granskog, Masahito Yoshihara, Lisa Gawriyski, Eeva-Mari Jouhilahti, Vipin Ranga, Mahlet Tamirat, Mikko Huhtala, Ida Kirjanov …

iScience 25(4) 104137-104137 2022年4月15日
Two ovarian candidate enhancers, identified by time series enhancer RNA analyses, harbor rare genetic variations identified in ovarian insufficiency.

Ryuichi Nakagawa, Kei Takasawa, Maki Gau, Atsumi Tsuji-Hosokawa, Hideya Kawaji, Yasuhiro Murakawa, Shuji Takada, Masashi Mikami, Satoshi Narumi, Maki Fukami …

Human molecular genetics 2022年2月3日
Exonic deletions in IMMP2L in schizophrenia with enhanced glycation stress subtype.

Akane Yoshikawa, Itaru Kushima, Mitsuhiro Miyashita, Kazuhiro Suzuki, Kyoka Iino, Kazuya Toriumi, Yasue Horiuchi, Hideya Kawaji, Norio Ozaki, Masanari Itokawa …

PloS one 17(7) e0270506 2022年
糖化ストレスを伴う統合失調症におけるIMMP2L遺伝子欠失-臨床特徴と新規治療法開発の可能性

吉川茜, 久島周, 宮下光弘, 鈴木浩一, 鳥海和也, 堀内泰江, 川路英哉, 瀧澤俊也, 尾崎紀夫, 糸川昌成 …

精神神経学雑誌 (2021特別号) S573-S573 2021年9月
Chromosomal-scale de novo genome assemblies of Cynomolgus Macaque and Common Marmoset.

Vasanthan Jayakumar, Osamu Nishimura, Mitsutaka Kadota, Naoki Hirose, Hiromi Sano, Yasuhiro Murakawa, Yumiko Yamamoto, Masataka Nakaya, Tomoyuki Tsukiyama, Yasunari Seita …

Scientific data 8(1) 159-159 2021年6月28日
Ex vivo conditioning of peripheral blood mononuclear cells of diabetic patients promotes vasculogenic wound healing.

Rica Tanaka, Rie Ito-Hirano, Satoshi Fujimura, Kayo Arita, Hiroko Hagiwara, Tomoya Mita, Masayoshi Itoh, Hideya Kawaji, Takasuke Ogawa, Hirotaka Watada …

Stem cells translational medicine 10(6) 895-909 2021年6月
Dysregulation of post-transcriptional modification by copy number variable microRNAs in schizophrenia with enhanced glycation stress.

Akane Yoshikawa, Itaru Kushima, Mitsuhiro Miyashita, Kazuya Toriumi, Kazuhiro Suzuki, Yasue Horiuchi, Hideya Kawaji, Shunya Takizawa, Norio Ozaki, Masanari Itokawa …

Translational psychiatry 11(1) 331-331 2021年5月28日
Cancer-associated fibroblast migration in non-small cell lung cancers is modulated by increased integrin α11 expression.

Moe Iwai, Miniwan Tulafu, Shinsaku Togo, Hideya Kawaji, Kotaro Kadoya, Yukiko Namba, Jin Jin, Junko Watanabe, Takahiro Okabe, Moulid Hidayat …

Molecular oncology 15(5) 1507-1527 2021年5月
Nanopore sequencing reveals TACC2 locus complexity and diversity of isoforms transcribed from an intronic promoter.

Yosuke Ito, Yasuhisa Terao, Shohei Noma, Michihira Tagami, Emiko Yoshida, Yoshihide Hayashizaki, Masayoshi Itoh, Hideya Kawaji

Scientific reports 11(1) 9355-9355 2021年4月30日

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MISC

遺伝子モデルと核酸医薬創薬に資するゲノム・RNAデータベース

廣瀬直毅, 川路英哉

バイオサイエンスとインダストリー（Ｂ＆Ｉ） 78(2) 2020年3月
非ヒト霊長類のトランスクリプトーム・アトラス

廣瀬直毅, 廣瀬直毅, 依馬正次, 佐々木えりか, GUSEV Oleg, GUSEV Oleg, 河合純, 村川泰裕, 村川泰裕, 川路英哉 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
腫瘍免疫と微小環境非小細胞肺癌における免疫関連分子の包括的遺伝子発現解析

高持一矢, 茂櫛薫, 林大久生, 川路英哉, 伊藤昌可, 林崎良英, 鈴木健司

肺癌 59(6) 576-576 2019年11月
腫瘍免疫と微小環境非小細胞肺癌における免疫関連分子の包括的遺伝子発現解析

高持一矢, 茂櫛薫, 林大久生, 川路英哉, 伊藤昌可, 林崎良英, 鈴木健司

肺癌 59(6) 576-576 2019年11月
心筋細胞に分化指向性を有するiPS細胞株を選択するためのバイオマーカーの探索

大橋文哉, 大橋文哉, 大橋文哉, 宮川繁, 安田智, 三浦巧, 黒田拓也, 伊藤昌可, 川路英哉, 伊東絵望子 …

日本再生医療学会総会(Web) 18th 2019年
核酸医薬創薬に資する霊長類オミックスデータベースの構築

廣瀬直毅, 村川泰裕, 川路英哉, 川路英哉, 川路英哉, 河合純

日本核酸医薬学会年会講演要旨集 5th 2019年
非ヒト霊長類ゲノムの非コード領域の機能解析

廣瀬直毅, 依馬正次, 佐々木えりか, 河合純, 村川泰裕, 川路英哉, 川路英哉, 川路英哉

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年
Hi-Cを用いたカニクイザルとマーモセットの染色体スケールゲノムスキャフォールディング

門田満隆, 西村理, JAYAKUMAR Vasanthan, 榊原康文, 井上貴史, 佐々木えりか, 依馬正次, 佐野浩美, 廣瀬直毅, 村川泰裕 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年
【なぜ、いま核酸医薬なのか次なる創薬モダリティの本命】核酸医薬品開発とRNAデータベース

廣瀬直毅, 河合純, 川路英哉

実験医学 37(1) 40-46 2019年1月招待有り
霊長類DNA/RNAデータベースの構築と医療への応用

河合純, 中家雅隆, 佐々木えりか, 井上貴史, 渡部聡朗, 榊原康文, Vasanthan JAYAKUMAR, 内藤雄樹, 村川泰裕, 川路英哉 …

日本毒性学会学術年会 46 S15-4 2019年
非コードRNAの一次構造・発現量データベース (特集 ncRNAの医科学と医療(1))

廣瀬直毅, 川路英哉

医学のあゆみ 267(8) 603-608 2018年11月24日
肺腺癌における免疫関連分子の包括的遺伝子発現解析

高持一矢, 細谷理樹, 茂櫛薫, 林大久生, 川路英哉, 伊藤昌可, 林崎良英, 鈴木健司

肺癌 58(6) 579-579 2018年10月
次世代ヒト科学を推進するゲノム基盤の構築

村川泰裕, 廣瀬直毅, 佐野浩美, 川路英哉, 川路英哉, 河合純

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st 2018年
非ヒト霊長類のトランスクリプトーム解析

廣瀬直毅, 佐野浩美, 八木研, 岡崎康司, 渡部聡朗, 井上貴史, 佐々木えりか, 中家雅隆, 築山智之, 清田弥寿成 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 41st 2018年
ヒトmRNA/pre-mRNA/lncRNA/pre-lncRNAデータベースの構築

廣瀬直毅, 内藤雄樹, 村川泰裕, 河合純, 川路英哉, 川路英哉

日本核酸医薬学会年会講演要旨集 4th 2018年
心筋細胞への高い分化指向性を有するiPS細胞株のスクリーニング法の開発

大橋文哉, 大橋文哉, 大橋文哉, 宮川繁, 安田智, 三浦巧, 黒田拓也, 齋藤充弘, 八代健太, 増田茂夫 …

日本再生医療学会総会(Web) 17th 2018年
JAPANESE AUTHOR : FANTOM5データを誰でも活用できる形に

川路英哉, 坊農秀雅, 小野浩雅, 粕川雄也

Natureダイジェスト 14(12) 24-27 2017年12月
FANTOMプロジェクト : 国際共同研究を通じたRNA網羅的解析 (特集核内イベントの時空間制御) -- (トランスクリプトーム解析,転写後制御)

吉田惠美子, 川路英哉, Carninci Piero

生体の科学 68(3) 225-228 2017年5月
iPS細胞ゲノムにおける点変異のホットスポットの同定

吉原正仁, 吉原正仁, 荒木良子, 砂山美里, 安倍真澄, 西田幸二, 川路英哉, 川路英哉, 川路英哉, 林崎良英 …

再生医療 16 2017年
Recurrent transcriptome alterations across multiple cancer types

Bogumil Kaczkowski, Yuji Tanaka, Hideya Kawaji, Albin Sandelin, Robin Andersson, Masayoshi Itot, Timo Lassmann, Yoshihide Hayashizaki, Piero Carninci, Alistair R. R. Forrest

CANCER RESEARCH 76 2016年7月

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書籍等出版物

RとBioconductorを用いたバイオインフォマティクス

Gentleman Robert, Carey Vincent J, Huber Wolfgang, Irizarry Rafael A, Dudoit Sandrine, 荒川和晴, 粕川雄也, 川路英哉, 河野信, 神田将和, 鈴木治夫, 田中伸也, 中尾光輝, 長嶋剛史, 二階堂愛, 宮本真理

丸善出版 2012年 (ISBN: 9784621062500)

講演・口頭発表等

非ヒト霊長類ゲノミクスデータに関する近年の進展と将来展望

川路英哉

第43回日本分子生物学会年会 2020年12月招待有り
Functional Annotation of Non-Coding Genomic Regions of Non-Human Primates

International Plant & Animal Genome XXVIII 2020年招待有り
Learn genomics from AI for interpreting GWAS findings, The 6th RIKEN-KI-SciLifeLab Symposium

Biomedical Data for Artificial Intelligence 2019年
Intratumoral heterogeneity of multiple myeloma revealed by single-cell RNA sequencing, EMBO Workshop

Single cell biology 2019年
転写開始点リファレンスデータセットの構築

第42会MBSJ 2019年
Chromosome-scale genome scaffolding of crab-eating macaque and common marmoset by Hi-C

第42会MBSJ 2019年
Long-read sequencing and assembly of Common Marmoset and Crab-eating Macaque results in high-quality, chromosome-scale genome assemblies with over 100 fold improvements in contiguity

第42会MBSJ 2019年
核酸医薬創薬に資する霊長類オミックスデータベースの構築

第51回核酸医薬学会 2019年
Intratumoral heterogeneity of multiple myeloma revealed by single-cell RNA sequencing

The 81st Annual Meeting of the Japanese Society of Hematology 2019年
"Transcribed cis-regulatory elements across primates

American Society of Human Genetics 2019年
Machine learning using nonlinear stacking method for predicting long non-coding RNA and enhancer transcription from genome sequence

American Society of Human Genetics 2019年
refTSS: a reference dataset of human and mouse transcription start sites

Genome Informatics 2019年
Functional annotation of non-coding regions in the genome of non-human primates,

The Non-Coding Genome 2019年
Functional annotation of non-coding genomic regions in non-human primates

The 31st annual meeting on The Biology of Genomes 2019年
核酸医薬創薬に資する霊長類ゲノム・RNAデータベースの構築と活用

川路英哉

第５回核酸医薬学会 2019年招待有り

共同研究・競争的資金等の研究課題

Evaluating the role of cis-regulatory tandem DNA repeats in human disease and evolution

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2021年4月 - 2024年3月

ウォルツェンクヌート, 川路英哉, 依馬正次, 井上詞貴
エンハンサーの遺伝的発現制御の解明による免疫疾患解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2020年4月 - 2024年3月

寺尾知可史, 鎌谷洋一郎, 川路英哉, 小井土大, 村川泰裕
ゲノムDNA転写開始活性の数理的構造を用いた制御領域リバースエンジニアリング

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2016年4月 - 2021年3月

川路英哉
多階層ゲノミクスデータ流通におけるアジア拠点の構築

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2016年4月 - 2018年3月

川路英哉
CAGE法を用いた子宮体癌におけるリンパ節転移予測マーカーの同定

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2015年4月 - 2018年3月

寺尾泰久, 向後泰司, 河合純, 伊藤昌可, 川路英哉, 竹田省, 林崎良英
緑内障早期個別化医療の実現を見据えた進行速度を予測する血液RNAマーカー探索

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2014年4月 - 2017年3月

中澤徹, 丸山和一, 河合純, 西口康二, 國方彦志, 田中佑治, 伊藤昌可, 川路英哉
マイクロRNAプロモータの網羅的プロファイリング

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2010年 - 2011年

川路英哉

川路英哉

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共同研究・競争的資金等の研究課題

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