古田芳一 (Yoshikazu Furuta) - マイポータル

基本情報

所属: 株式会社豊田中央研究所研究員

学位: 博士（生命科学）(東京大学)

研究者番号: 40613667
J-GLOBAL ID: 201501008178067164
researchmap会員ID: B000243546

外部リンク: http://yfuruta.sakura.ne.jp

研究キーワード

研究分野

経歴

2022年3月 - 現在

株式会社豊田中央研究所, 研究員
2021年4月 - 2022年2月

北海道大学人獣共通感染症国際共同研究所, 講師
2016年9月 - 2021年3月

北海道大学, 人獣共通感染症リサーチセンター, 講師
2014年12月 - 2016年7月

Massachusetts Institute of Technology, Institute for Medical Engineering & Science, Postdoctoral Fellow
2014年4月 - 2014年11月

Boston University, Postdoctoral Fellow
2011年7月 - 2014年3月

東京大学, 新領域創成科学研究科, 特任助教
2011年4月 - 2011年6月

東京大学, 新領域創成科学研究科, 特任研究員

学歴

2008年4月 - 2011年3月

東京大学, 新領域創成科学研究科, メディカルゲノム専攻博士課程修了博士（生命科学）
2006年4月 - 2008年3月

東京大学, 新領域創成科学研究科, メディカルゲノム専攻修士課程修了修士（生命科学）
2002年4月 - 2006年3月

東京大学, 工学部, 化学生命工学科学士（工学）

委員歴

2017年8月 - 2022年2月

日本細菌学会北海道支部, 幹事

論文

Trends, patterns and relationship of antimicrobial use and resistance in bacterial isolates tested between 2015-2020 in a national referral hospital of Zambia.

Misheck Shawa, Atmika Paudel, Herman Chambaro, Harvey Kamboyi, Ruth Nakazwe, Luke Alutuli, Tuvshinzaya Zorigt, Taona Sinyawa, Mulemba Samutela, Joseph Chizimu …

PloS one 19(4) e0302053 2024年
Chlamydia trachomatis Requires Functional Host-Cell Mitochondria and NADPH Oxidase 4/p38MAPK Signaling for Growth in Normoxia

Jeewan Thapa, Gen Yoshiiri, Koki Ito, Torahiko Okubo, Shinji Nakamura, Yoshikazu Furuta, Hideaki Higashi, Hiroyuki Yamaguchi

Frontiers in Cellular and Infection Microbiology 12 2022年5月26日
Complete Genome Sequences of 24 Strains of Bacillus cereus Isolated from Nosocomial Infection and Bacteremia Cases in Japan.

Yoshikazu Furuta, Mai Tsujinouchi, Misheck Shawa, Tuvshinzaya Zorigt, Yuya Miyajima, Atmika Paudel, Satowa Suzuki, Hideaki Higashi

Microbiology resource announcements 11(4) e0120321 2022年4月21日
A GCDGC-specific DNA (cytosine-5) methyltransferase that methylates the GCWGC sequence on both strands and the GCSGC sequence on one strand

Yoshikazu Furuta, Fumihito Miura, Takahiro Ichise, Shouta M. M. Nakayama, Yoshinori Ikenaka, Tuvshinzaya Zorigt, Mai Tsujinouchi, Mayumi Ishizuka, Takashi Ito, Hideaki Higashi

PLOS ONE 17(3) e0265225-e0265225 2022年3月21日
Detection of revertant mosaicism in epidermolysis bullosa through Cas9-targeted long-read sequencing.

Ken Natsuga, Yoshikazu Furuta, Shota Takashima, Takuma Nohara, Hideyuki Kosumi, Yosuke Mai, Hideaki Higashi, Hideyuki Ujiie

Human mutation 43(4) 529-536 2022年1月25日査読有り筆頭著者責任著者
Clonal relationship between multidrug-resistant Escherichia coli ST69 from poultry and humans in Lusaka, Zambia.

Misheck Shawa, Yoshikazu Furuta, Atmika Paudel, O'Brian Kabunda, Evans Mulenga, Maron Mubanga, Harvey Kamboyi, Tuvshinzaya Zorigt, Herman Chambaro, Manyando Simbotwe …

FEMS microbiology letters 2022年1月14日査読有り
Silkworm model for Bacillus anthracis infection and virulence determination

Atmika Paudel, Yoshikazu Furuta, Hideaki Higashi

Virulence 12(1) 2285-2295 2021年12月31日査読有り
Increased energy demand from anabolic-catabolic processes drives β-lactam antibiotic lethality.

Michael A Lobritz, Ian W Andrews, Dana Braff, Caroline B M Porter, Arnaud Gutierrez, Yoshikazu Furuta, Louis B G Cortes, Thomas Ferrante, Sarah C Bening, Felix Wong …

Cell chemical biology 2021年12月21日査読有り
Risk factors and spatio-temporal patterns of livestock anthrax in Khuvsgul Province, Mongolia

Tuvshinzaya Zorigt, Satoshi Ito, Norikazu Isoda, Yoshikazu Furuta, Misheck Shawa, Natsagdorj Norov, Baasansuren Lkham, Jargalsaikhan Enkhtuya, Hideaki Higashi

PLOS ONE 16(11) e0260299-e0260299 2021年11月19日査読有り
Direct Regulons of AtxA, the Master Virulence Regulator of Bacillus anthracis

Yoshikazu Furuta, Cheng Cheng, Tuvshinzaya Zorigt, Atmika Paudel, Shun Izumi, Mai Tsujinouchi, Tomoko Shimizu, Wim G. Meijer, Hideaki Higashi

mSystems 6(4) 2021年8月31日査読有り筆頭著者責任著者
Novel chromosomal insertions of ISEcp1-blaCTX-M-15 and diverse antimicrobial resistance genes in Zambian clinical isolates of Enterobacter cloacae and Escherichia coli.

Misheck Shawa, Yoshikazu Furuta, Gillan Mulenga, Maron Mubanga, Evans Mulenga, Tuvshinzaya Zorigt, Christone Kaile, Manyando Simbotwe, Atmika Paudel, Bernard Hang'ombe …

Antimicrobial resistance and infection control 10(1) 79-79 2021年5月10日査読有り
Distribution of amoebal endosymbiotic environmental chlamydia Neochlamydia S13 via amoebal cytokinesis.

Miho Okude, Junji Matsuo, Tomohiro Yamazaki, Kentaro Saito, Yoshikazu Furuta, Shinji Nakamura, Jeewan Thapa, Torahiko Okubo, Hideaki Higashi, Hiroyuki Yamaguchi

Microbiology and immunology 65(3) 115-124 2021年3月査読有り
Development of ELISA based on Bacillus anthracis capsule biosynthesis protein CapA for naturally acquired antibodies against anthrax.

Tuvshinzaya Zorigt, Yoshikazu Furuta, Manyando Simbotwe, Akihiro Ochi, Mai Tsujinouchi, Misheck Shawa, Tomoko Shimizu, Norikazu Isoda, Jargalsaikhan Enkhtuya, Hideaki Higashi

PloS one 16(10) e0258317 2021年査読有り
Networking and Specificity-Changing DNA Methyltransferases in Helicobacter pylori.

Hirokazu Yano, Md Zobaidul Alam, Emiko Rimbara, Tomoko F Shibata, Masaki Fukuyo, Yoshikazu Furuta, Tomoaki Nishiyama, Shuji Shigenobu, Mitsuyasu Hasebe, Atsushi Toyoda …

Frontiers in microbiology 11 1628-1628 2020年査読有り
Long-read metagenomic exploration of extrachromosomal mobile genetic elements in the human gut.

Yoshihiko Suzuki, Suguru Nishijima, Yoshikazu Furuta, Jun Yoshimura, Wataru Suda, Kenshiro Oshima, Masahira Hattori, Shinichi Morishita

Microbiome 7(1) 119-119 2019年8月27日査読有り
Geographic distribution of cattle anthrax in Western Zambia

Manyando Simbotwe, Evans Mulenga, Yoshikazu Furuta, Geoffrey Munkombwe Muuka, Bernar, Mudenda Hang'ombe, Hideaki Higashi

Japanese Journal of Veterinary Research 67(2) 195-202 2019年5月査読有り
Novel Sequence Type in Bacillus cereus Strains Associated with Nosocomial Infections and Bacteremia, Japan.

Reiko Akamatsu, Masato Suzuki, Keiji Okinaka, Teppei Sasahara, Kunikazu Yamane, Satowa Suzuki, Daisuke Fujikura, Yoshikazu Furuta, Naomi Ohnishi, Minoru Esaki …

Emerging infectious diseases 25(5) 883-890 2019年5月査読有り
Enhanced infectivity of strains of Helicobacter pylori isolated from children compared with parental strains.

Zaman C, Osaki T, Furuta Y, Hojo F, Yonezawa H, Konno M, Kurata S, Hanawa T, Kamiya S

Journal of medical microbiology 68(4) 633-641 2019年4月査読有り
長鎖型シークエンサーが切り拓く新たな細菌学研究ロングリードシークエンサーを用いたヒト腸内細菌叢のメタゲノム解析

西嶋傑, 鈴木慶彦, 古田芳一, 吉村淳, 大島健志朗, 須田亙, 森下真一, 服部正平

日本細菌学雑誌 74(1) 28-28 2019年3月
Upstream sequence-dependent suppression and AtxA-dependent activation of protective antigens in Bacillus anthracis.

Toyomane K, Furuta Y, Fujikura D, Higashi H

PeerJ 7 e6718 2019年査読有り

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MISC

バクテリアの修飾塩基

古田芳一

生物工学会誌 98(8) 439 2020年8月筆頭著者
ネットワークを作り配列特異性を変換するピロリ菌のDNAメチル化酵素群

矢野大和, 矢野大和, アラムモハメッド, 林原絵美子, 柴田朋子, 福世真樹, 古田芳一, 古田芳一, 西山智明, 重信秀治 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
長鎖型シークエンサーを用いた炭疽菌のゲノム欠失およびDNAメチル化の解析

古田芳一, 播磨勇人, 伊藤絵美子, 丸山史人, 大西なおみ, 大崎研, 小川寛人, SQUARRE David, OMBE Bernard Hang, 東秀明

日本細菌学雑誌(Web) 74(1) 2019年
ピロリ菌におけるゲノムとエピゲノムの独立な進化

古田芳一, 小島健司, 矢原耕史, 福世真樹, 志波優, 西海信, 吉田優, 東健, 吉川博文, 小林一三

日本細菌学雑誌 72(1) 125-125 2017年2月
ピロリ菌の適応形質を支配するDNAメチル化系ネットワークの発見

矢野大和, Alam Zobaidul, 林原絵美子, 古田芳一, 鈴木穣, 菅野純夫, 柴山恵吾, 小林一三

日本生化学会大会・日本分子生物学会年会合同大会講演要旨集 88回・38回 [3P0588]-[3P0588] 2015年12月
ピロリ菌のゲノム・エピゲノムの多様性

古田芳一

日本細菌学雑誌 70(4) 383-389 2015年12月
特定のエピゲノム状態がピロリ菌ストレス耐性を支配する

矢野大和, 矢野大和, ALAM Zobaidu M., 林原絵美子, 古田芳一, 古田芳一, 鈴木穣, 菅野純夫, 菅野純夫, 柴山恵吾 …

日本ゲノム微生物学会年会要旨集 9th 2015年
日本のピロリ菌発癌細菌の素顔がいま明らかに(最終回) タンパク質のドメイン間での配列の移動(DoMo) 新しい遺伝子多様化機構とエピゲノム単位の進化

古田芳一, 小林一三

細胞工学 31(4) 474-479 2012年3月
日本のピロリ菌発癌細菌の素顔がいま明らかに(第3回) cagA発癌遺伝子の構造多様性と進化

古田芳一

細胞工学 31(3) 364-369 2012年2月
ピロリ菌エピジェネティックス遺伝子の東西比較から発見された「遺伝子内ドメイン移動によるタンパク多様化」

古田芳一, 河合幹彦, 内山郁夫, 小林一三

日本ヘリコバクター学会誌 13(2) 36-39 2012年1月15日
相同組換えから見た種

矢原耕史, 河合幹彦, 古田芳一, 高橋規子, 半田直史, 鶴剛史, 大島健志朗, 吉田優, 東健, 服部正平 …

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 14th 2012年
日本のピロリ菌発癌細菌の素顔がいま明らかに遺伝子の誕生と崩壊の新しい仕組み逆位を伴う重複

小林一三, 古田芳一, 河合幹彦

細胞工学 31(1) 90-97 2011年12月
日本分離ピロリ菌4株の全ゲノム解読と種内比較解析についてのプログレス・レポート

小林一三, 河合幹彦, 矢原耕史, 古田芳一, 鶴剛史, 高橋規子, 半田直史, 吉田優, 大嶋健志朗, 内山郁夫 …

日本ヘリコバクター学会誌 11(2) 31-38 2010年1月15日

共同研究・競争的資金等の研究課題

バクテリアのメチロームによる表現型多様化メカニズムの解明

文部科学省科学研究費補助金（若手研究） 2018年4月 - 2021年3月

古田芳一
簡便・柔軟・ポータブルな特定 DNA 配列検出システムの開発

北海道科学技術総合振興センター（ノーステック財団）研究シーズ発掘補助金 2017年7月 - 2018年3月

古田芳一
TALE-RNAポリメラーゼ複合体によるDNA配列検出系の開発

秋山記念生命科学振興財団研究助成〈奨励〉 2017年7月 - 2018年3月

古田芳一
バクテリアのゲノム修飾による遺伝子発現制御メカニズムの網羅的解析

国際科学技術財団研究助成 2017年4月 - 2018年3月

古田芳一
メチローム選択系による複雑な形質のメカニズム解析

上原記念生命科学財団リサーチフェローシップ 2016年4月 - 2016年7月

古田芳一
エピゲノムのデジタル変換による適応進化：オーミクスと実験進化による検証

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2013年4月 - 2016年3月

小林一三, 古田芳一, 矢野大和, 長谷部光泰, 大槻久
ランダムメチローム選択系を用いた適応進化機構のマルチオーミクス解析とその応用

日本学術振興会海外特別研究員 2014年4月 - 2016年3月

古田芳一
配列特異的DNAメチル化酵素によるエピゲノム工学：合成生物学・ゲノム工学の拡張へ

文部科学省科学研究費補助金(新学術領域研究(研究領域提案型)) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2012年 - 2013年

古田芳一
ゲノム比較による細菌病原性の進化の解明

文部科学省科学研究費補助金(若手研究(B)) 若手研究(B) 2012年 - 2013年

古田芳一
多様な利己的DNaseがゲノム切断で作り出す生・死・進化の分岐点

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2009年 - 2011年

小林一三, 半田直史, 高橋規子, 河合幹彦, 古田芳一, 内山郁夫, 矢原耕史, 福世真樹
パーソナルピロリ菌ゲノム解析のためのフレームワーク構築

武田科学振興財団ライフサイエンス研究助成 2011年

古田芳一

受賞

2015年3月

日本細菌学会黒屋奨学賞

古田芳一
2011年9月

上原H.pylori〜優秀賞〜, 第17回日本ヘリコバクター学会

古田芳一
2011年3月

学生最優秀論文賞, 東京大学医科学研究所

古田芳一
2010年11月

Excellent Young Scientist Oral Presentation Honorable Mention, 東京大学・新領域創成科学研究科・メディカルゲノム専攻・第3回英語論文発表会

古田芳一
2010年3月

優秀ポスター賞, 第83回日本細菌学会総会

古田芳一
2009年11月

Young Scientist Superior Oral Presentation Award, 東京大学・新領域創成科学研究科・メディカルゲノム専攻・第2回英語論文発表会

古田芳一