Hiroaki Kato
(加藤 太陽)
Modified on: 03/07
Profile Information
- Affiliation
- Faculty of Medicine, Shimane University
- Degree
-
博士(生命科学)(京都大学)
- Researcher number
- 40548418
- ORCID ID
- https://orcid.org/0000-0001-9591-1875
- J-GLOBAL ID
- 201801001537653030
- researchmap Member ID
- B000294087
遺伝情報の変更を伴わない細胞の振舞いの変化、あるいはその説明を試みる学問領域をエピジェネティクス(epigenetics)と言います。エピジェネティクスという用語には、遺伝学を指す「genetics」に、「upon」や「over」などを意味する接頭辞「epi」が添えられています。環境ストレスへの適応や、分化の積み重ねによる個体の形成はエピジェネティックな事象であり、それらはクロマチンのレベルで解明されつつあります。
私はこれまで主に、分裂酵母をモデル生物として、ヘテロクロマチンという不活性なクロマチンが構築される仕組みの研究に携わってきました。独自の経験に培われた高度な判断力を必要とする順遺伝学的スクリーニングによる新規因子同定を得意とします。かつてヘテロクロマチンは、ただ漠然と転写を抑制する不活性なクロマチンと信じられていました。しかし我々の研究によって、転写装置そのものであるRNAポリメラーゼII(Pol2)がヘテロクロマチンの構築に必要であることが判明し、多くのPol2関連因子の関与が明らかとなってきました。同様の仕組みはどうやら種を越えて保存されているらしく、分裂酵母をモデルとした順遺伝学的アプローチの先駆性が評価されています。
次世代シーケンシング技術の台頭により、研究対象因子の役割をゲノムワイドに俯瞰することが当たり前の時代になりました。我々もバイオインフォマティクス的手法を積極的に取り入れています。独自の視点からの研究には独自ソフトウェアの開発が欠かせないことから、必要に応じてソフトウェア開発にも取り組んでいます。最近、ヌクレオソーム配置予測のためのR/Bioconductorパッケージをリリースしました(Works欄参照)。バイオインフォマティクスは対象生物の幅を広げやすいので、このパッケージも3種の生物(出芽酵母、分裂酵母、マウス)に対応しています。こうした取り組みを通してエピジェネティクス研究に貢献できれば嬉しく思います。
私はこれまで主に、分裂酵母をモデル生物として、ヘテロクロマチンという不活性なクロマチンが構築される仕組みの研究に携わってきました。独自の経験に培われた高度な判断力を必要とする順遺伝学的スクリーニングによる新規因子同定を得意とします。かつてヘテロクロマチンは、ただ漠然と転写を抑制する不活性なクロマチンと信じられていました。しかし我々の研究によって、転写装置そのものであるRNAポリメラーゼII(Pol2)がヘテロクロマチンの構築に必要であることが判明し、多くのPol2関連因子の関与が明らかとなってきました。同様の仕組みはどうやら種を越えて保存されているらしく、分裂酵母をモデルとした順遺伝学的アプローチの先駆性が評価されています。
次世代シーケンシング技術の台頭により、研究対象因子の役割をゲノムワイドに俯瞰することが当たり前の時代になりました。我々もバイオインフォマティクス的手法を積極的に取り入れています。独自の視点からの研究には独自ソフトウェアの開発が欠かせないことから、必要に応じてソフトウェア開発にも取り組んでいます。最近、ヌクレオソーム配置予測のためのR/Bioconductorパッケージをリリースしました(Works欄参照)。バイオインフォマティクスは対象生物の幅を広げやすいので、このパッケージも3種の生物(出芽酵母、分裂酵母、マウス)に対応しています。こうした取り組みを通してエピジェネティクス研究に貢献できれば嬉しく思います。
Research Interests
9Research Areas
4Research History
4-
Jun, 2022 - Present
-
Apr, 2009 - Present
-
Oct, 2009 - Mar, 2013
-
Apr, 2006 - Mar, 2009
Education
4-
Apr, 2001 - Mar, 2006
-
Apr, 1999 - Mar, 2001
-
Apr, 1995 - Mar, 1999
-
Apr, 1992 - Mar, 1995
Committee Memberships
1-
Apr, 2014 - Mar, 2017
Awards
3Papers
26-
Genes & Genetic Systems, 2024
-
Apr 18, 2023 Lead authorCorresponding author
-
Infectious Disease Reports, 15(1) 24-33, Dec 26, 2022 Peer-reviewed
-
Biochemical and Biophysical Research Communications, 556 179-184, Jun, 2021 Peer-reviewed
-
BMC Bioinformatics, 22(1) 322, Jun, 2021 Peer-reviewedLead authorCorresponding author
-
Biomedicines, 8(12) 608-608, Dec 14, 2020
-
Nucleic Acids Research, 48(16) 8977-8992, Jul 25, 2020 Peer-reviewedLead author
-
PLoS genetics, 15(6) e1008129, Jun, 2019 Peer-reviewed
-
Archives of biochemistry and biophysics, 663 71-82, Mar 15, 2019 Peer-reviewed
-
Current Genetics, 65(1) 87-91, Jul, 2018 Peer-reviewedInvitedLead authorCorresponding author
-
Oncotarget, 9(47) 28408-28420, Jun 19, 2018 Peer-reviewed
-
Epigenetics and Chromatin, 11(1), Jun 4, 2018 Peer-reviewedCorresponding author
-
PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, 114(52) E11208-E11217, Dec, 2017 Peer-reviewed
-
PLOS ONE, 12(10), Oct, 2017 Peer-reviewed
-
DNA and Histone Methylation as Cancer Targets, 249-277, Sep 4, 2017
-
SCIENTIFIC REPORTS, 7, Mar, 2017 Peer-reviewed
-
ARCHIVES OF BIOCHEMISTRY AND BIOPHYSICS, 606 10-15, Sep, 2016 Peer-reviewed
-
NUCLEIC ACIDS RESEARCH, 44(9) 4147-4162, May, 2016 Peer-reviewed
-
PLOS ONE, 8(11) e80572, Nov, 2013 Peer-reviewedLead author
-
Epigenetics, 8(12) 1249-1253, Oct 9, 2013 Peer-reviewedLead authorCorresponding author
Misc.
14-
細胞, 52 503-507, May, 2020
-
島根医学, 38(3) 1-7, 2018
-
GENES & GENETIC SYSTEMS, 91(6) 348-348, Dec, 2016
-
GENES & GENETIC SYSTEMS, 90(6) 360-360, Dec, 2015
-
GENES & GENETIC SYSTEMS, 89(6) 331-331, Dec, 2014
-
日本癌学会総会記事, 71回 80-80, Aug, 2012 Peer-reviewed
-
GENES & GENETIC SYSTEMS, 86(6) 384-384, Dec, 2011
-
日本癌学会総会記事, 70回 40-40, Sep, 2011 Peer-reviewed
-
日本癌学会総会記事, 69回 250-250, Aug, 2010 Peer-reviewed
-
島根医学, 30(2) 89-97, Jun, 2010
-
20 121-121, 2008
-
実験医学, 23(16) 2469-2471, 2005
-
蛋白質核酸酵素, 49(12) 1990-1997, Sep, 2004
Books and Other Publications
1-
Humana Press, Springer International Publishing AG, Sep, 2017 (ISBN: 9783319597867)
Presentations
5-
Training a dHMM with a chemical map improved accuracy of nucleosome positioning prediction in yeastsCold Spring Harbor Laboratory Meeting on Epigenetics & Chromatin, Sep 13, 2018, Cold Spring Harbor Laboratory
-
NCU Global Young Investigator Forum 2018 on "Regulatory Mechanisms of Epigenetic Information and Their Clinical and Applications", Mar, 2018 Invited
-
日本農芸化学会中四国支部第26回若手研究者シンポジウム「農芸化学の新潮流を探る」, Oct 7, 2017 Invited
-
日本生化学会大会プログラム・講演要旨集, Sep, 2016 Invited
-
Message from Yeast to Epigenetics, Sep, 2013 Invited
Teaching Experience
10Professional Memberships
3Works
2-
Sep 30, 2021 - Present Software
-
Aug, 2018 Software
Research Projects
13-
Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research (C), Grant-in-Aid for Scientific Research (C), Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2021 - Mar, 2024
-
Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area), Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area), Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2021 - Mar, 2023
-
Grants-in-Aid for Scientific Research Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area), Grant-in-Aid for Scientific Research on Innovative Areas (Research in a proposed research area), Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2019 - Mar, 2021
-
科研費 基盤研究(C), JSPS, Apr, 2018 - Mar, 2021
-
Grants-in-Aid for Scientific Research, Grant-in-Aid for Scientific Research (C), Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2014 - Mar, 2017
-
Grants-in-Aid for Scientific Research, Grant-in-Aid for Scientific Research (A), Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2013 - Mar, 2016
-
科研費 新学術領域研究(研究領域提案型), JSPS, Apr, 2014 - Mar, 2016
-
科研費 若手研究(B), JSPS, Apr, 2014 - Mar, 2016
-
Grants-in-Aid for Scientific Research, Grant-in-Aid for Challenging Exploratory Research, Japan Society for the Promotion of Science, Apr, 2013 - Mar, 2015
-
科研費 若手研究(B), JSPS, Apr, 2012 - Mar, 2014
-
戦略的創造研究推進事業 さきがけ, JST, Oct, 2009 - Mar, 2012
-
科研費 研究活動スタート支援, JSPS, Apr, 2009 - Mar, 2011
-
科研費 特別研究員奨励費, JSPS, Apr, 2006 - Mar, 2009