坂井寛章 (Hiroaki Sakai) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人農業・食品産業技術総合研究機構基盤技術研究本部・高度分析研究センター・ゲノム情報大規模解析ユニットユニット長

学位: 博士（学術）(慶應義塾大学)

研究者番号: 20455322
J-GLOBAL ID: 201601011487596340
researchmap会員ID: B000262605

アズキや、そのなかまで様々なストレス環境に適応した野生種が含まれるVigna(ビグナ)属植物のゲノム解読や比較ゲノム解析を主なテーマに研究しています。また、Vigna属ゲノムデータベース「Vigna Genome Server (VigGS)」の開発、運用を行っています。その他に、イネなどのゲノム多様性解析やデータベース開発等も行っています。

研究キーワード

研究分野

論文

Domesticating Vigna stipulacea: Chromosome-Level genome assembly reveals VsPSAT1 as a candidate gene decreasing hard-seededness

Yu Takahashi, Hiroaki Sakai, Hirotaka Ariga, Shota Teramoto, Takashi L. Shimada, Heesoo Eun, Chiaki Muto, Ken Naito, Norihiko Tomooka

Frontiers in Plant Science 14 2023年4月17日
スマート育種ツールの利用に関するワークショップ

杉本和彦, 米丸淳一, 坂井寛章, 川原善浩, 鐘ケ江弘美

育種学研究 advpub 2023年
Genetic effects of Red Lettuce Leaf genes on red coloration in leaf lettuce under artificial lighting conditions

Kaede C. Wada, Noritoshi Inagaki, Hiroaki Sakai, Hiroto Yamashita, Yusuke Nakai, Zui Fujimoto, Jun‐ichi Yonemaru, Hironori Itoh

Plant-Environment Interactions 3(4) 179-192 2022年9月2日査読有り
Complete Genome Sequence of Lactococcus cremoris Strain 7-1, a Lactic Acid Bacterium Isolated from a Traditional Mongolian Milk Product Possessing Mucin-Adhesive Ability

Hirotoshi Sushida, Hiroaki Sakai, Naoko Moriya, Kazuma Nakano, Noriko Ashimine, Maiko Minami, Hinako Tamotsu, Tetsuhiro Nakanishi, Shun Ohki, Kuniko Teruya, Takashi Hirano, Seishi Yamasaki, Chise Suzuki, Kazuhito Satou, Hiromi Kimoto-Nira

MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS 11(4) 2022年4月査読有り
Developing core marker sets for effective genomic-assisted selection in wheat and barley breeding programs

Goro Ishikawa, Hiroaki Sakai, Nobuyuki Mizuno, Elena Solovieva, Tsuyoshi Tanaka, Kazuki Matsubara

Breeding Science 72(3) 257-266 2022年査読有り
Investigation of the Genetic Diversity of a Rice Core Collection of Japanese Landraces using Whole-Genome Sequencing

N Tanaka, M Shenton, Y Kawahara, M Kumagai, H Sakai, H Kanamori, J Yonemaru, S Fukuoka, K Sugimoto, M Ishimoto, J Wu, Kaworu Ebana

Plant and Cell Physiology 2020年12月10日査読有り
Same Locus for Non-shattering Seed Pod in Two Independently Domesticated Legumes, Vigna angularis and Vigna unguiculata

Yu Takahashi, Alisa Kongjaimun, Chiaki Muto, Yuki Kobayashi, Masahiko Kumagai, Hiroaki Sakai, Kazuhito Satou, Kuniko Teruya, Akino Shiroma, Makiko Shimoji, Takashi Hirano, Takehisa Isemura, Hiroki Saito, Akiko Baba-Kasai, Akito Kaga, Prakit Somta, Norihiko Tomooka, Ken Naito

Frontiers in Genetics 11 2020年7月23日査読有り
Foreign DNA detection by high-throughput sequencing to regulate genome-edited agricultural products.

Takeshi Itoh, Ritsuko Onuki, Mai Tsuda, Masao Oshima, Masaki Endo, Hiroaki Sakai, Tsuyoshi Tanaka, Ryo Ohsawa, Yutaka Tabei

Scientific reports 10(1) 4914-4914 2020年3月18日査読有り
Whole-genome sequencing of the NARO World Rice Core Collection (WRC) as the basis for diversity and association studies

N Tanaka, M Shenton, Y Kawahara, M Kumagai, H Sakai, H Kanamori, J Yonemaru, S Fukuoka, K Sugimoto, M Ishimoto, J Wu, K Ebana

Plant and Cell Physiology doi.org/10.1093/pcp/pcaa019 2020年2月査読有り
Genetic factor for twisting legume pods identified by fine-mapping of shattering-related traits in azuki bean and yard-long bean

Yu Takahashi, Alisa Kongjaimun, Chiaki Muto, Yuki Kobayashi, Masahiko Kumagai, Hiroaki Sakai, Kazuhito Satou, Kuniko Teruya, Akino Shiroma, Makiko Shimoji, Takashi Hirano, Takehisa Isemura, Hiroki Saito, Akiko Baba-Kasai, Akito Kaga, Prakit Somta, Norihiko Tomooka, Ken Naito

2019年9月28日
Domesticating Vigna Stipulacea: A Potential Legume Crop With Broad Resistance to Biotic Stresses.

Yu Takahashi, Hiroaki Sakai, Yuki Yoshitsu, Chiaki Muto, Toyoaki Anai, Muthaiyan Pandiyan, Natesan Senthil, Norihiko Tomooka, Ken Naito

Frontiers in plant science 10 1607-1607 2019年査読有り
Genomic adaptation of flowering-time genes during the expansion of rice cultivation area

Hironori Itoh, Kaede C. Wada, Hiroaki Sakai, Kyohei Shibasaki, Shuichi Fukuoka, Jianzhong Wu, Jun-Ichi Yonemaru, Masahiro Yano, Takeshi Izawa

Plant Journal 94(5) 895-909 2018年6月1日査読有り
De novo assembly of whole genome sequences of the wild species of genus Vigna by PacBio sequencer

Naito Ken, Sakai Hiroaki, Takahashi Yu, Iseki Kohtaro, Muto Chiaki, Kaga Akito, Tomooka Norihiko

GENES & GENETIC SYSTEMS 91(6) 378-378 2016年12月査読有り
Identification and molecular mapping of Flowering Date1 (FD1), a major photoperiod insensitivity gene in the adzuki bean (Vigna angularis)

Hiroki Yamamoto, Yuki Horiuchi, Reina Ogura, Hiroaki Sakai, Hitoshi Sato, Kiyoaki Kato

PLANT BREEDING 135(6) 714-720 2016年12月査読有り
The Vigna Genome Server, 'VigGS': A Genomic Knowledge Base of the Genus Vigna Based on High-Quality, Annotated Genome Sequence of the Azuki Bean, Vigna angularis (Willd.) Ohwi & Ohashi

Hiroaki Sakai, Ken Naito, Yu Takahashi, Toshiyuki Sato, Toshiya Yamamoto, Isamu Muto, Takeshi Itoh, Norihiko Tomooka

PLANT AND CELL PHYSIOLOGY 57(1) e2 2016年1月査読有り
The power of single molecule real-time sequencing technology in the de novo assembly of a eukaryotic genome

Hiroaki Sakai, Ken Naito, Eri Ogiso-Tanaka, Yu Takahashi, Kohtaro Iseki, Chiaki Muto, Kazuhito Satou, Kuniko Teruya, Akino Shiroma, Makiko Shimoji, Takashi Hirano, Takeshi Itoh, Akito Kaga, Norihiko Tomooka

SCIENTIFIC REPORTS 5 16780 2015年11月査読有り
Loss of function mutations in the rice chromomethylase OsCMT3a cause a burst of transposition

Chaoyang Cheng, Yoshiaki Tarutani, Akio Miyao, Tasuku Ito, Muneo Yamazaki, Hiroaki Sakai, Eigo Fukai, Hirohiko Hirochika

PLANT JOURNAL 83(6) 1069-1081 2015年9月査読有り
Genome-wide indel markers shared by diverse Asian rice cultivars compared to Japanese rice cultivar 'Koshihikari'

Jun-ichi Yonemaru, Sun Hee Choi, Hiroaki Sakai, Tsuyu Ando, Ayahiko Shomura, Masahiro Yano, Jianzhong Wu, Shuichi Fukuoka

BREEDING SCIENCE 65(3) 249-256 2015年6月査読有り
Construction of Pseudomolecule Sequences of the aus Rice Cultivar Kasalath for Comparative Genomics of Asian Cultivated Rice

Hiroaki Sakai, Hiroyuki Kanamori, Yuko Arai-Kichise, Mari Shibata-Hatta, Kaworu Ebana, Youko Oono, Kanako Kurita, Hiroko Fujisawa, Satoshi Katagiri, Yoshiyuki Mukai, Masao Hamada, Takeshi Itoh, Takashi Matsumoto, Yuichi Katayose, Kyo Wakasa, Masahiro Yano, Jianzhong Wu

DNA RESEARCH 21(4) 397-405 2014年8月査読有り
A chromosome-based draft sequence of the hexaploid bread wheat (Triticum aestivum) genome

Klaus F. X. Mayer, Jane Rogers, Jaroslav Dolezel, Curtis Pozniak, Kellye Eversole, Catherine Feuillet, Bikram Gill, Bernd Friebe, Adam J. Lukaszewski, Pierre Sourdille, Takashi R. Endo, Jaroslav Dolezel, Marie Kubalakova, Jarmila Cihalikova, Zdenka Dubska, Jan Vrana, Romana Sperkova, Hana Simkova, Jane Rogers, Melanie Febrer, Leah Clissold, Kirsten McLay, Kuldeep Singh, Parveen Chhuneja, Nagendra K. Singh, Jitendra Khurana, Eduard Akhunov, Frederic Choulet, Pierre Sourdille, Catherine Feuillet, Adriana Alberti, Valerie Barbe, Patrick Wincker, Hiroyuki Kanamori, Fuminori Kobayashi, Takeshi Itoh, Takashi Matsumoto, Hiroaki Sakai, Tsuyoshi Tanaka, Jianzhong Wu, Yasunari Ogihara, Hirokazu Handa, Curtis Pozniak, P. Ron Maclachlan, Andrew Sharpe, Darrin Klassen, David Edwards, Jacqueline Batley, Odd-Arne Olsen, Simen Rod Sandve, Sigbjorn Lien, Burkhard Steuernagel, Brande Wulff, Mario Caccamo, Sarah Ayling, Ricardo H. Ramirez-Gonzalez, Bernardo J. Clavijo, Burkhard Steuernagel, Jonathan Wright, Matthias Pfeifer, Manuel Spannagl, Klaus F. X. Mayer, Mihaela M. Martis, Eduard Akhunov, Frederic Choulet, Klaus F. X. Mayer, Martin Mascher, Jarrod Chapman, Jesse A. Poland, Uwe Scholz, Kerrie Barry, Robbie Waugh, Daniel S. Rokhsar, Gary J. Muehlbauer, Nils Stein, Heidrun Gundlach, Matthias Zytnicki, Veronique Jamilloux, Hadi Quesneville, Thomas Wicker, Klaus F. X. Mayer, Primetta Faccioli, Moreno Colaiacovo, Matthias Pfeifer, Antonio Michele Stanca, Hikmet Budak, Luigi Cattivelli, Natasha Glover, Mihaela M. Martis, Frederic Choulet, Catherine Feuillet, Klaus F. X. Mayer, Matthias Pfeifer, Lise Pingault, Klaus F. X. Mayer, Etienne Paux, Manuel Spannagl, Sapna Sharma, Klaus F. X. Mayer, Curtis Pozniak, Rudi Appels, Matthew Bellgard, Brett Chapman, Matthias Pfeifer, Matthias Pfeifer, Simen Rod Sandve, Thomas Nussbaumer, Kai Christian Bader, Frederic Choulet, Catherine Feuillet, Klaus F. X. Mayer, Eduard Akhunov, Etienne Paux, Helene Rimbert, Shichen Wang, Jesse A. Poland, Ron Knox, Andrzej Kilian, Curtis Pozniak, Michael Alaux, Francoise Alfama, Loic Couderc, Veronique Jamilloux, Nicolas Guilhot, Claire Viseux, Mikael Loaec, Hadi Quesneville, Jane Rogers, Jaroslav Dolezel, Kellye Eversole, Catherine Feuillet, Beat Keller, Klaus F. X. Mayer, Odd-Arne Olsen, Sebastien Praud

SCIENCE 345(6194) 2014年7月査読有り

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MISC

ミニレビュー大規模ゲノム情報を活かすプラットフォームTASUKE の開発と活用の現状

熊谷真彦, 坂井寛章

農研機構研究報告 2023(13) 89-97 2023年3月
スマート育種を実現する3種の育種情報ツール "Pedigree Finder", "BRIMASS"および"有用遺伝子カタログとアリルグラフ"—Breeding information tools for "Smart Breeding" : "Pedigree Finder", "BRIMASS" and "Allele graph with catalog of useful genes in agriculture"—特集スマート育種の展開 : 現状と将来展望

米丸淳一, 坂井寛章, 鐘ヶ江弘美, 川原善浩

JATAFFジャーナル = JATAFF journal : 農林水産技術 10(12) 12-16 2022年12月
ストレスに強いマメ科野生種の栽培化に向けた突然変異体

高橋有, 武藤千秋, 友岡憲彦, 内藤健, 坂井寛章, 吉津祐貴, 穴井豊昭, PANDIYAN Muthaiyan, SENTHIL Natesan

農研機構遺伝資源センター成果情報(Web) 2019 2019年
PacBioシーケンサーによるVigna属10種の全ゲノム解読

内藤健, 坂井寛章, 高橋有, 井関洸太朗, 武藤千秋, 加賀秋人, 友岡憲彦

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 88th 2016年
一分子シーケンサーによるアズキの全ゲノム解読

内藤健, 坂井寛章, 小木曽映里, 高橋有, 井関洸太朗, 武藤千秋, 佐藤万仁, 照屋邦子, 城間安紀乃, 下地真紀子, 平野隆, 伊藤剛, 友岡憲彦

育種学研究 17 2015年
アズキ近縁野生種Vigna nakashimaeにおける耐塩性系統の特定とRADseqを用いた遺伝的多様性解析

小木曽映里, SOMPONG Chankaew, RUSAMA Marubodee, 坂井寛章, 内藤健, 馬場晶子, 井関洸太郎, 高橋有, 高橋有, 友岡憲彦

育種学研究 17 2015年
南アジアに自生するVigna属野生種の集団間にみられる耐塩性の遺伝的変異

井関洸太郎, 小木曽映里, 高橋有, 高橋有, 武藤千秋, 坂井寛章, 内藤健, 友岡憲彦

育種学研究 17 2015年
コムギのゲノム配列の概要解読

半田裕一, 小林史典, 呉健忠, 伊藤剛, 田中剛, 坂井寛章, 松本隆

農業生物資源研究所主な研究成果 2014 2015年
vigna属野生種のNeo‐domestication

高橋有, 内藤健, 伊勢村武久, 武藤千秋, 坂井寛章, 加賀秋人, SENTHIL Natesan, PANDIYAN Muthaiyan, 友岡憲彦

育種学研究 15 36 2013年10月12日
ISBP(Insertion Site Based Polymorphism)を用いたコムギ6B染色体特異的マーカー開発と評価

金子聡子, 阿部千香子, 早川克志, 小林史典, 半田裕一, 田中剛, 坂井寛章, 伊藤剛, 大野良子, 宅見薫雄, 那須田周平

育種学研究 14 2012年
22,651のオオムギ完全長cDNA配列の作成と機能解析

田中剛, 松本隆, 坂井寛章, 天野直己, 金森裕之, 栗田加奈子, 菊田有里, 神谷梢, 山本麻裕, 伊川浩司, 藤井信之, 堀清純, 伊藤剛, 佐藤和広

日本植物生理学会年会要旨集 52nd 250 2011年3月11日
イネレトロ遺伝子の網羅的発現解析

坂井寛章, 坂井寛章, 水野浩志, 川原善浩, 脇本泰暢, 脇本泰暢, 伊川浩司, 川東広幸, 金森裕之, 松本隆, 伊藤剛, ガウトブランドン

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 83rd 2011年
IRGSP/RAP build 5アノテーションとRAP‐DB新規機能

田中剛, 坂井寛章, 沼寿隆, 天野直己, 伊川浩司, 松本隆, 伊藤剛

日本植物生理学会年会要旨集 51st 173 2010年3月12日
ヒトとマウスゲノムにおける発現するプロセス型偽遺伝子の予測

坂井寛章, 坂井寛章, 坂井寛章, 坂井寛章, 小柳香奈子, 今西規, 今西規, 伊藤剛, 伊藤剛, 五条堀孝, 五条堀孝

日本分子生物学会年会講演要旨集 28th 2005年
ヒトとマウスゲノムにおけるプロセス型偽遺伝子の予測

坂井寛章, 小柳香奈子, 藤井康之, 今西規, 伊藤剛

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 27th 2004年
ヒトゲノムへのヒト完全長cDNAのマッピングによるヒト遺伝子の同定

小柳香奈子, 藤井康之, 坂井寛章, 羽原拓哉, 佐藤慶治, 伊藤剛, 今西規, 五条堀孝

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 27th 2004年

坂井寛章

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