新宅博文 (Hirofumi Shintaku) - マイポータル

基本情報

所属: 京都大学医生物学研究所教授
: 特定国立研究開発法人理化学研究所開拓研究本部理研白眉研究チームリーダー（兼任）

学位: 博士（工学）(2006年9月京都大学)

ORCID ID: https://orcid.org/0000-0002-9972-4222
J-GLOBAL ID: 201801000938605511
researchmap会員ID: B000330629

外部リンク: https://www.hshintaku.com/

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

2002年4月 - 2006年9月

京都大学工学研究科機械工学科
1998年4月 - 2002年3月

京都大学工学部機械工学科

論文

The mechanosensitive ion channel PIEZO1 promotes satellite cell function in muscle regeneration

Kotaro Hirano, Masaki Tsuchiya, Akifumi Shiomi, Seiji Takabayashi, Miki Suzuki, Yudai Ishikawa, Yuya Kawano, Yutaka Takabayashi, Kaori Nishikawa, Kohjiro Nagao, Eiji Umemoto, Yasuo Kitajima, Yusuke Ono, Keiko Nonomura, Hirofumi Shintaku, Yasuo Mori, Masato Umeda, Yuji Hara

Life Science Alliance 6(2) e202201783-e202201783 2022年11月査読有り
Best practices for reporting throughput in biomedical research.

Maik Herbig, Akihiro Isozaki, Dino Di Carlo, Jochen Guck, Nao Nitta, Robert Damoiseaux, Shogo Kamikawaji, Eigo Suyama, Hirofumi Shintaku, Angela Ruohao Wu, Itoshi Nikaido, Keisuke Goda

Nature methods 19(6) 633-634 2022年6月
Extreme deformability of insect cell membranes is governed by phospholipid scrambling.

Akifumi Shiomi, Kohjiro Nagao, Nobuhiro Yokota, Masaki Tsuchiya, Utako Kato, Naoto Juni, Yuji Hara, Masayuki X Mori, Yasuo Mori, Kumiko Ui-Tei, Motohide Murate, Toshihide Kobayashi, Yuri Nishino, Atsuo Miyazawa, Akihisa Yamamoto, Ryo Suzuki, Stefan Kaufmann, Motomu Tanaka, Kazuya Tatsumi, Kazuyoshi Nakabe, Hirofumi Shintaku, Semen Yesylevsky, Mikhail Bogdanov, Masato Umeda

Cell reports 35(10) 109219-109219 2021年6月8日
NanoSINC-seq dissects the isoform diversity in subcellular compartments of single cells.

Yusuke Oguchi, Yuka Ozaki, Mahmoud N Abdelmoez, Hirofumi Shintaku

Science advances 7(15) 2021年4月
Targeted permeabilization of the cell wall and extraction of charged molecules from single cells in intact plant clusters using a focused electric field.

Sangamithirai Subramanian Parimalam, Mahmoud Nady Abdelmoez, Arata Tsuchida, Naoyuki Sotta, Mayuki Tanaka, Takashi Kuromori, Toru Fujiwara, Masami Yokota Hirai, Ryuji Yokokawa, Yusuke Oguchi, Hirofumi Shintaku

The Analyst 146(5) 1604-1611 2021年3月7日
Development of a sequencing system for spatial decoding of DNA barcode molecules at single-molecule resolution.

Yusuke Oguchi, Hirofumi Shintaku, Sotaro Uemura

Communications biology 3(1) 788-788 2020年12月18日
Distinct Kinetics in Electrophoretic Extraction of Cytoplasmic RNA from Single Cells.

Mahmoud N Abdelmoez, Yusuke Oguchi, Yuka Ozaki, Ryuji Yokokawa, Hidetoshi Kotera, Hirofumi Shintaku

Analytical chemistry 92(1) 1485-1492 2020年1月7日査読有り
Different motilities of microtubules driven by kinesin-1 and kinesin-14 motors patterned on nanopillars.

Taikopaul Kaneko, Ken'ya Furuta, Kazuhiro Oiwa, Hirofumi Shintaku, Hidetoshi Kotera, Ryuji Yokokawa

Science advances 6(4) eaax7413 2020年1月査読有り
Spatial Patterning of Kinesin-1 and Dynein Motor Proteins in an In Vitro Assay using Aqueous Two-Phase Systems (ATPS).

Tamanna Ishrat Farhana, Tomohiro Nakagawa, Shumpei Ohara, Hirofumi Shintaku, Hidetoshi Kotera, Ryuji Yokokawa

Langmuir : the ACS journal of surfaces and colloids 35(40) 13003-13010 2019年10月8日査読有り
Transport of microtubules according to the number and spacing of kinesin motors on gold nano-pillars.

Taikopaul Kaneko, Suguru Ando, Ken'ya Furuta, Kazuhiro Oiwa, Hirofumi Shintaku, Hidetoshi Kotera, Ryuji Yokokawa

Nanoscale 11(20) 9879-9887 2019年5月28日査読有り
Simultaneous Observation of Kinesin-Driven Microtubule Motility and Binding of Adenosine Triphosphate Using Linear Zero-Mode Waveguides.

Kazuya Fujimoto, Yuki Morita, Ryota Iino, Michio Tomishige, Hirofumi Shintaku, Hidetoshi Kotera, Ryuji Yokokawa

ACS nano 12(12) 11975-11985 2018年12月26日査読有り
Intelligent Image-Activated Cell Sorting

Nitta Nao, Sugimura Takeaki, Isozaki Akihiro, Mikami Hideharu, Hiraki Kei, Sakuma Shinya, Iino Takanori, Arai Fumihito, Endo Taichiro, Fujiwaki Yasuhiro, Fukuzawa Hideya, Hase Misa, Hayakawa Takeshi, Hiramatsu Kotaro, Hoshino Yu, Inaba Mary, Ito Takuro, Karakawa Hiroshi, Kasai Yusuke, Koizumi Kenichi, Lee SangWook, Lei Cheng, Li Ming, Maeno Takanori, Matsusaka Satoshi, Murakami Daichi, Nakagawa Atsuhiro, Oguchi Yusuke, Oikawa Minoru, Ota Tadataka, Shiba Kiyotaka, Shintaku Hirofumi, Shirasaki Yoshitaka, Suga Kanako, Suzuki Yuta, Suzuki Nobutake, Tanaka Yo, Tezuka Hiroshi, Toyokawa Chihana, Yalikun Yaxiaer, Yamada Makoto, Yamagishi Mai, Yamano Takashi, Yasumoto Atsushi, Yatomi Yutaka, Yazawa Masayuki, Di Carlo Dino, Hosokawa Yoichiroh, Uemura Sotaro, Ozeki Yasuyuki, Goda Keisuke

CELL 175(1) 266-276 2018年9月20日査読有り
SINC-seq: correlation of transient gene expressions between nucleus and cytoplasm reflects single-cell physiology.

Mahmoud N Abdelmoez, Kei Iida, Yusuke Oguchi, Hidekazu Nishikii, Ryuji Yokokawa, Hidetoshi Kotera, Sotaro Uemura, Juan G Santiago, Hirofumi Shintaku

Genome biology 19(1) 66-66 2018年6月6日査読有り
Efficient Production of On-Target Reads for Small RNA Sequencing of Single Cells Using Modified Adapters.

Khnouf R, Shore S, Han CM, Henderson JM, Munro SA, McCaffrey AP, Shintaku H, Santiago JG

Analytical chemistry 90(21) 12609-12615 2018年査読有り
Electrical Lysis and RNA Extraction from Single Cells Fixed by Dithiobis(succinimidyl propionate).

Subramanian Parimalam S, Oguchi Y, Abdelmoez MN, Tsuchida A, Ozaki Y, Yokokawa R, Kotera H, Shintaku H

Analytical chemistry 90(21) 12512-12518 2018年査読有り
SINC-seq: correlation of transient gene expressions between nucleus and cytoplasm reflects single-cell physiology

Abdelmoez Mahmoud N, Iida Kei, Oguchi Yusuke, Nishikii Hidekazu, Yokokawa Ryuji, Kotera Hidetoshi, Uemura Sotaro, Santiago Juan G, Shintaku Hirofumi

GENOME BIOLOGY 19(1) 66-66 2018年査読有り
Control of molecular shuttles by designing electrical and mechanical properties of microtubules

Isozaki Naoto, Shintaku Hirofumi, Kotera Hidetoshi, Hawkins Taviare L, Ross Jennifer L, Yokokawa Ryuji

SCIENCE ROBOTICS 2(10) 2017年9月27日査読有り
Sorting of molecular shuttles by designing electrical and mechanical properties of microtubules

Naoto Isozaki, Hirofumi Shintaku, Hidetoshi Kotera, Taviare L. Hawkins, Jennifer L. Ross, Ryuji Yokokawa

2017年2月査読有り
Design and fabrication of Linear-shaped Zero Mode Waveguides for single molecule observation of kinesin and fluorescent ATP

Fujimoto, K., Morita, Y., Iino, R., Tomishige, M., Shintaku, H., Kotera, H., Yokokawa, R.

IEEJ Transactions on Sensors and Micromachines 137(6) 2017年査読有り
Microtubule density and landing rate as parameters to analyze tau protein in the MT-kinesin "gliding" assay

Parimalam Subhathirai Subramaniyan, Tarhan Mehmet C, Karsten Stanislav L, Fujita Hiroyuki, Shintaku Hirofumi, Kotera Hidetoshi, Yokokawa Ryuji

SENSORS AND ACTUATORS B-CHEMICAL 238 954-961 2017年査読有り

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MISC

Detection of mutations in the binding domain of tau protein by kinesin-microtubule gliding assay

S. P. Subramaniyan, M. C. Tarhan, S. L. Karsten, H. Fujita, H. Shintaku, H. Kotera, R. Yokokawa

Proceedings of the IEEE International Conference on Micro Electro Mechanical Systems (MEMS) 314-317 2014年1月1日
Manipulation of microtubles motility using electrical filed on kiensin/dynein coated surfaces

Nagendra Kumar Kamisetty, Junya Ikuta, Hirofumi Shintaku, Hidetoshi Kotera, Ryuji Yokokawa, Ryuji Yokokawa

17th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences, MicroTAS 2013 2 811-813 2013年1月1日
Microtubule gliding at the boundary of kinesin and dynein patterned surface

Junya Ikuta, Nagendra K. Kamisetty, Hirofumi Shintaku, Hidetoshi Kotera, Ryuji Yokokawa, Ryuji Yokokawa

17th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences, MicroTAS 2013 3 1454-1456 2013年1月1日
Microtubule manipulation by an electric field in a fused silica channel

Tasuku Nakahara, Naoto Isozaki, Suguru Ando, Nagendra K. Kamisetty, Hirofumi Shintaku, Hidetoshi Kotera, Ryuji Yokokawa, Ryuji Yokokawa

17th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences, MicroTAS 2013 1 161-163 2013年1月1日
A low temperature bonding technique for microfluidic chip fabrication using soft-cure SU-8 sheet

Hirofumi Shintaku, Yasutoshi Hirabayashi, Teru Okitsu, Satoyuki Kawano, Takaaki Suzuki, Isaku Kanno, Hidetoshi Kotera

Micro Total Analysis Systems - Proceedings of MicroTAS 2006 Conference: 10th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences 681-683 2006年1月1日
Dielectrophoretic electrode array for optimum cell flowin pressure driven flow

Hirofumi Shintaku, Satoyuki Kawano, Takaaki Suzuki, Isaku Kanno, Hidetoshi Kotera

Micro Total Analysis Systems - Proceedings of MicroTAS 2005 Conference: 9th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences 1 1075-1077 2005年1月1日
Visualization and optimization for fluid flow of travelingwave micropump using micropiv and numerical simulation

Takaaki Suzuki, Hidetoshi Hata, Hirofumi Shintaku, Isaku Kanno, Satoyuki Kawano, Hidetoshi Kotera

Micro Total Analysis Systems - Proceedings of MicroTAS 2005 Conference: 9th International Conference on Miniaturized Systems for Chemistry and Life Sciences 1 1108-1110 2005年1月1日

講演・口頭発表等

ナノメートル精度の画像解析を用いた微小管の曲げ剛性と伸長速度の評価

浮田一輝, 磯崎直人, 新宅博文, 小寺秀俊, Hawkins Taviare L, Ross Jennifer L, 横川隆司

「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム論文集電気学会センサ・マイクロマシン部門 [編] 2017年10月31日
金ナノピラーとSAMによるモータタンパク質パターニング技術の開発

大庭將太郎, 金子泰洸ポール, 新宅博文, 小寺秀俊, 横川隆司

「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム論文集電気学会センサ・マイクロマシン部門 [編] 2017年10月31日
ATPSを用いた異種モータタンパク質の選択的固定とその評価

中川倫宏, 大原駿平, 新宅博文, 小寺秀俊, 横川隆司

「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム論文集電気学会センサ・マイクロマシン部門 [編] 2017年10月31日
3D血管網を用いた剪断応力の知覚と伝達による血管新生評価システム

寺岡佑佳子, 中山雅宗, 梨本裕司, 中益朗子, 花田三四郎, 有馬勇一郎, 鳥澤勇介, 新宅博文, 小寺秀俊, 西山功一, 三浦岳, 横川隆司

「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム論文集電気学会センサ・マイクロマシン部門 [編] 2017年10月31日
キネシンによる微小管運動における蛍光ATP結合・解離のLZMWsを用いた1分子観察

藤本和也, 飯野亮太, 富重道雄, 新宅博文, 小寺秀俊, 横川隆司

「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム論文集電気学会センサ・マイクロマシン部門 [編] 2017年10月31日
分子パターニングを用いたキネシンの協働性の評価

金子泰洸ポール, 大庭將太郎, 新宅博文, 小寺秀俊, 横川隆司, 古田健也, 大岩和弘

「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム論文集電気学会センサ・マイクロマシン部門 [編] 2017年10月31日
NANO-PATTERNING OF MOTOR PROTEINS TO CONTROL NUMBER OF KINESIN MOLECULES TRANSPORTING A SINGLE MICROTUBULE

Taikopaul Kaneko, Hirofumi Shintaku, Hidetoshi Kotera, Ryuji Yokokawa

30TH IEEE INTERNATIONAL CONFERENCE ON MICRO ELECTRO MECHANICAL SYSTEMS (MEMS 2017) 2017年 IEEE
LINEAR ZERO MODE WAVEGUIDES FOR THE STUDY OF CHEMO-MECHANICAL COUPLING MECHANISM OF KINESIN

Kazuya Fujimoto, Yuki Morita, Ryota Iino, Michio Tomishige, Hirofumi Shintaku, Hidetoshi Kotera, Ryuji Yokokawa

30TH IEEE INTERNATIONAL CONFERENCE ON MICRO ELECTRO MECHANICAL SYSTEMS (MEMS 2017) 2017年 IEEE
圧力駆動流によるオンチップ血管新生の促進

中山雅宗, 梨本裕司, 國田樹, 中益朗子, 鳥澤勇介, 新宅博文, 小寺秀俊, 西山功一, 三浦岳, 横川隆司

「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム論文集電気学会センサ・マイクロマシン部門 [編] 2016年10月2日
電荷と曲げ剛性の同時改変による高精度な微小管分離

磯崎直人, 新宅博文, 小寺秀俊, Hawkins Taviare L, Ross Jennifer L, 横川隆司

「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム論文集電気学会センサ・マイクロマシン部門 [編] 2016年10月2日
LZMWを用いたキネシンによるATP加水分解サイクルの可視化

藤本和也, 森田有貴, 飯野亮太, 富重道雄, 新宅博文, 小寺秀俊, 横川隆司

「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム論文集電気学会センサ・マイクロマシン部門 [編] 2016年10月2日
マルチモータ解析のためのマイクロチャネルを用いた異種モータタンパク質の選択的固定

尾田文恵, 森田充樹, 新宅博文, 小寺秀俊, 横川隆司

「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム論文集電気学会センサ・マイクロマシン部門 [編] 2015年10月28日
ダイナミックマイクロチャネルと数値解析を用いたキネシンによる能動輸送の評価

藤本和也, 新宅博文, 小寺秀俊, 横川隆司

「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム論文集電気学会センサ・マイクロマシン部門 [編] 2015年10月28日
微小管の運動方向制御のための曲げ剛性設計

磯崎直人, 新宅博文, 小寺秀俊, 横川隆司

「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム論文集電気学会センサ・マイクロマシン部門 [編] 2015年10月28日
J0540101 電気穿孔および等速電気泳動を用いた一細胞cytoplasmic RNA抽出法における純度計測

畑翔太, 横川隆司, 小寺秀俊, 新宅博文

年次大会 2015年
動的に形成されるマイクロチャネルによる微小管グライディング制御

藤本和也, 新宅博文, 小寺秀俊

「センサ・マイクロマシンと応用システム」シンポジウム論文集電気学会センサ・マイクロマシン部門 [編] 2014年10月20日
20pm3-PM018 基板上に固定した液滴アレイの電気的結合と分裂

岡洸佑, 横川隆司, 小寺秀俊, 新宅博文

マイクロナノ工学シンポ 2014年
6AM2-D-3 分子濃縮によるオンチップ電気穿孔法の効率化(6AM2-D OS3 マイクロ・ナノ生体医工学)

重里優子, 横川隆司, 小寺秀俊, 新宅博文

マイクロナノ工学シンポ 2013年
J026023 微小管の電気泳動移動度の測定に基づいた運動軌跡の予測([J026-02]細胞および分子のマイクロ・ナノスケール解析(2))

安藤駿, 磯崎直人, 中原佐, 新宅博文, 小寺秀俊, 横川隆司

年次大会 2013年
J026022 電場集中を用いた電気穿孔法における細胞内小器官への分子輸送の可視化計測([J026-02]細胞および分子のマイクロ・ナノスケール解析(2))

梶本剛生, 岡洸佑, 新宅博文, 横川隆司, 小寺秀俊

年次大会 2013年

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

ナノ電気穿孔を用いた1細胞ダイナミクス計測法の創成

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(開拓) 2021年7月 - 2024年3月

新宅博文
マイクロ流体分画技術を用いた1細胞内構造体の泳動解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2019年4月 - 2022年3月

新宅博文
1細胞RNA輸送ダイナミクス

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2019年6月 - 2021年3月

新宅博文
マイクロ・ナノ電気穿孔法による細胞核への分子導入法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2014年4月 - 2019年3月

新宅博文, 小寺秀俊
iPS細胞から誘導した肺胞上皮細胞利用への応用展開：表裏一体型培養システムの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2014年4月 - 2017年3月

伊藤功朗, 半田知宏, 小寺秀俊, 平井豊博, 劉莉, 三嶋理晃, 室繁郎, 新宅博文, 長船健二
単一細胞のRNAおよびDNA同時抽出・解析技術の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2014年4月 - 2017年3月

新宅博文, 錦井秀和, 小寺秀俊
制限ナノ空間における量子・分子流動ダイナミクスの学理構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2010年4月 - 2015年3月

川野聡恭, 土井謙太郎, 花﨑逸雄, 辻徹郎, 新宅博文, 谷口正輝, 日比野浩, 立川仁典
ナノ制限空間における界面動電現象の極限可視化技術

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 2010年4月 - 2014年3月

新宅博文
QMDの高速化に向けた相互作用積分の数値解法に関する研究

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2011年 - 2012年

土井謙太郎, 川野聡恭, 新宅博文
超微細 U 字管の創製と極限流体計測

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2011年 - 2012年

新宅博文, 川野聡恭, 土井健太郎, 日比野浩
ナノテクノロジーを利用した組織障害を最小化する臨床用膵島分離技術の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2007年 - 2009年

興津輝, 小寺秀俊, 川野聡恭, 新宅博文
壁面近傍を流動する生体高分子の一分子計測と数理モデルの構築

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2007年 - 2009年

新宅博文
μTASを実現化するマイクロ流体デバイスの好適原理及び構造の創成

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2004年 - 2006年

新宅博文

産業財産権

特許第6288778号ポンプおよび送液方法

川野聡恭, 新宅博文, モサオスマン, オムランオスマン, 平田基徳
WO2017-131216 生体高分子分画用チップ、それを用いた生体高分子の分画方法、および生体高分子の分析方法

新宅博文, 藁谷卓哉, 上村想太郎, 小口祐伴
特表2017-505610 電気泳動技術を用いた単一細胞からのRNA及びDNAの同時抽出及び分離

サンティアゴ, ファン、ジー, 新宅博文
特許第6029056号人工感覚上皮

川野聡恭, 伊藤壽一, 中川隆之, 新宅博文
WO2014-073638 ポンプおよび送液方法

川野聡恭, 新宅博文, モサオスマン, オムランオスマン, 平田基徳
特開2014-068612 高分子の伸長方法および高分子伸長装置

川野聡恭, 新宅博文, 雪本直哉, 上原聡司, 谷口正輝, 川合知二
特開2014-045937 人工感覚上皮

川野聡恭, 伊藤壽一, 中川隆之, 新宅博文

新宅博文

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