井手圭吾 (Keigo Ide) - マイポータル

基本情報

所属: 早稲田大学ナノ・ライフ創新研究機構招聘研究員

学位: 博士（工学）(2022年10月早稲田大学)

ORCID ID: https://orcid.org/0000-0003-3586-6210
J-GLOBAL ID: 202101011884111930
Researcher ID: L-9451-2018
researchmap会員ID: R000024400

外部リンク: https://www.researchgate.net/profile/Keigo-Ide

研究キーワード

研究分野

経歴

2024年2月 - 現在

アステラス製薬株式会社, デジタルX, リサーチX, モダリティインフォマティクスグループ
2023年8月 - 2024年1月

アステラス製薬株式会社, デジタル・アナリティクス＆テクノロジー
2022年4月 - 2023年8月

早稲田大学, ナノ・ライフ創新研究機構, 招聘研究員
2022年4月 - 2023年8月

bitBiome株式会社, 研究開発部, 研究員
2020年4月 - 2022年3月

地方独立行政法人東京都健康長寿医療センター, 健康データ科学研究室, 研究員
2019年4月 - 2022年3月

国立研究開発法人産業技術総合研究所, 産総研・早大生体システムビッグデータ解析オープンイノベーションラボラトリ, 博士リサーチアシスタント
2017年11月 - 2019年3月

国立研究開発法人産業技術総合研究所, 産総研・早大生体システムビッグデータ解析オープンイノベーションラボラトリ, 技術職員

学歴

2019年4月 - 2022年3月

早稲田大学, 大学院先進理工学研究科, 生命医科学専攻

受賞

2019年9月

Springer Poster Award in International Marine Biotechnology Conference

井手圭吾, 西川洋平, 岩本栄介, 小川雅人, 細川正人, 中野義勝, 須田彰一郎, 竹山春子
2019年2月

奨励賞 (バイオインフォマティクス演習の高度TA業務に対して), 高度授業TAカンファレンス, 早稲田大学

井手圭吾

論文

Analysis of microbial dynamics in the soybean root-associated environments from community to single-cell levels

Masako Kifushi, Yohei Nishikawa, Masahito Hosokawa, Keigo Ide, Masato Kogawa, Toyoaki Anai, Haruko Takeyama

Journal of Bioscience and Bioengineering 2024年4月査読有り
A combination of two-enzyme system and enzyme engineering improved the activity of a new PET hydrolase identified from soil bacterial genome

Hideaki Mabashi-Asazuma, Makoto Hirai, Shigeru Sakurai, Keigo Ide, Masato Kogawa, Ai Matsushita, Masahito Hosokawa, Soichiro Tsuda

bioRxiv 2024年2月
Lack of significant associations between single nucleotide polymorphisms in LPAL2-LPA genetic region and all cancer incidence and mortality in Japanese population: The Japan public health center-based prospective study

Makiko Naka Mieno, Maria Yamasaki, Aya Kuchiba, Taiki Yamaji, Keigo Ide, Noriko Tanaka, Norie Sawada, Manami Inoue, Shoichiro Tsugane, Motoji Sawabe …

Cancer Epidemiology 85(102395) 2023年6月査読有り
Genome and Genetic Engineering of the House Cricket (Acheta domesticus): Applications for Sustainable Agriculture

Aaron T. Dossey, Brenda Oppert, Fu-Chyun Chu, Marcé D. Lorenzen, Brian Scheffler, Sheron Simpson, Sergey Koren, J. Spencer Johnston, Kosuke Kataoka, Keigo Ide

biomolecules 13(4) 589-589 2023年3月査読有り
Targeted single-cell genomics reveals novel host adaptation strategies of the symbiotic bacteria Endozoicomonas in Acropora tenuis coral

Keigo Ide, Yohei Nishikawa, Toru Maruyama, Yuko Tsukada, Masato Kogawa, Hiroki Takeda, Haruka Ito, Ryota Wagatsuma, Rimi Miyaoka, Yoshikatsu Nakano …

Microbiome 10(1) 220-220 2022年12月12日査読有り筆頭著者
Reproducible and sensitive micro-tissue RNA sequencing from formalin-fixed paraffin-embedded tissues for spatial gene expression analysis

Hiroko Matsunaga, Koji Arikawa, Miki Yamazaki, Ryota Wagatsuma, Keigo Ide, Ashok Zachariah Samuel, Kazuya Takamochi, Kenji Suzuki, Takuo Hayashi, Masahito Hosokawa …

Scientific Reports 12(1) 19511-19511 2022年11月14日査読有り
Validation of the application of gel beads-based single-cell genome sequencing platform to soil and seawater

Yohei Nishikawa, Masato Kogawa, Masahito Hosokawa, Ryota Wagatsuma, Katsuhiko Mineta, Kai Takahashi, Keigo Ide, Kei Yura, Hayedeh Behzad, Takashi Gojobori …

ISME Communications 2(1) 2022年9月29日査読有り
The Effect of Co-Culture of Two Coral Species on Their Bacterial Composition Under Captive Environments

Keigo Ide, Yoshikatsu Nakano, Michihiro Ito, Yohei Nishikawa, Hiroyuki Fujimura, Haruko Takeyama

Marine Biotechnology 2022年8月23日査読有り筆頭著者
Exploring strain diversity of dominant human skin bacterial species using single-cell genome sequencing

Keigo ide, Tatsuya Saeki, Koji Arikawa, Takuya Yoda, Taruho Endoh, Ayumi Matsuhashi, Haruko Takeyama, Masahito Hosokawa

Frontiers in Microbiology 13 955404-955404 2022年8月5日査読有り筆頭著者
Targeted single-cell genomics reveals novel host adaptation strategies of the symbiotic bacteria Endozoicomonas in Acropora tenuis coral

Keigo Ide, Yohei Nishikawa, Toru Maruyama, Yuko Tsukada, Masato Kogawa, Hiroki Takeda, Ryota Wagatsuma, Rimi Miyaoka, Yoshikatsu Nakano, Koji Kinjo …

Biorxiv 2022年4月23日筆頭著者
Single-cell metabolite detection and genomics reveals uncultivated talented producer

Masato Kogawa, Rimi Miyaoka, Franziska Hemmerling, Masahiro Ando, Kei Yura, Keigo Ide, Yohei Nishikawa, Masahito Hosokawa, Yuji Ise, Jackson K B Cahn …

PNAS Nexus 1(1) pgab007 2022年3月2日査読有り
Recovery of strain-resolved genomes from human microbiome through an integration framework of single-cell genomics and metagenomics

Koji Arikawa, Keigo Ide, Masato Kogawa, Tatsuya Saeki, Takuya Yoda, Taruho Endoh, Ayumi Matsuhashi, Haruko Takeyama, Masahito Hosokawa

Microbiome 9(1) 202-202 2021年12月査読有り
Multi-omics analysis reveals cross-organism interactions in coral holobiont

Toru Maruyama, Michihiro Ito, Satoshi Wakaoji, Yusuke Okubo, Keigo Ide, Yohei Nishikawa, Hiroyuki Fujimura, Shoichiro Suda, Yoshikatsu Nakano, Noriyuki Satoh …

2021年10月26日
Comparative Analysis of Mitochondrial Genomes in Gryllidea (Insecta: Orthoptera): Implications for Adaptive Evolution in Ant-loving Crickets

Ryuto Sanno, Kosuke Kataoka, Shota Hayakawa, Keigo Ide, Chuong N Nguyen, Thao P Nguyen, Binh T N Le, Oanh T P Kim, Katsuhiko Mineta, Haruko Takeyama …

Genome Biology and Evolution 13(10) 2021年9月23日査読有り
Development of an Inflammatory CD14+ Dendritic Cell Subset in Humanized Mice

Ryutaro Iwabuchi, Keigo Ide, Kazutaka Terahara, Ryota Wagatsuma, Rieko Iwaki, Hiroko Matsunaga, Yasuko Tsunetsugu-Yokota, Haruko Takeyama, Yoshimasa Takahashi

Frontiers in Immunology 12 643040-643040 2021年3月15日査読有り
Evaluation of the effects of cell-dispensing using an inkjet-based bioprinter on cell integrity by RNA-seq analysis

Masayuki Yumoto, Natsuko Hemmi, Naoki Sato, Yudai Kawashima, Koji Arikawa, Keigo Ide, Masahito Hosokawa, Manabu Seo, Haruko Takeyama

Scientific Reports 10(1) 7158-7158 2020年12月査読有り
Single-cell genomics of uncultured bacteria reveals dietary fiber responders in the mouse gut microbiota

Rieka Chijiiwa, Masahito Hosokawa, Masato Kogawa, Yohei Nishikawa, Keigo Ide, Chikako Sakanashi, Kai Takahashi, Haruko Takeyama

Microbiome 8(1) 2020年12月査読有り
High-Quality Draft Genome Sequence of a Rickettsiales Bacterium Found in Acropora tenuis Coral from Okinawa, Japan

Keigo Ide, Yohei Nishikawa, Masato Kogawa, Eisuke Iwamoto, Ashok Zachariah Samuel, Yoshikatsu Nakano, Haruko Takeyama

Microbiology Resource Announcements 9(48) 2020年11月25日査読有り筆頭著者
Draft Genome Sequence of Okeania sp. Strain KiyG1, Assembled from Single-Amplified Genomes Collected from Cape Kiyan, Okinawa, Japan.

Muhammad Wahyudin Lewaru, Yohei Nishikawa, Keigo Ide, Masato Kogawa, Masahito Hosokawa, Ashok Zachariah Samuel, Shinpei Sumimoto, Handung Nuryadi, Shoichiro Suda, Haruko Takeyama

Microbiology resource announcements 9(46) 2020年11月12日査読有り
Stereotyped B-cell response that counteracts antigenic variation of influenza viruses

Keisuke Tonouchi, Yu Adachi, Saya Moriyama, Kaori Sano, Koshiro Tabata, Keigo Ide, Haruko Takeyama, Tadaki Suzuki, Yoshimasa Takahashi

International Immunology 32(9) 613-621 2020年9月8日査読有り

もっとみる

講演・口頭発表等

新規PET分解酵素の同定と表面特徴量解析を用いた酵素改変

馬橋英章, 平井洵, 桜井滋, 井手圭吾, 小川雅人, 細川正人, 津田宗一郎

日本農芸学会 2024年度大会 2024年3月25日
Microbial spatiotemporal dynamics in soybean root-associated environments

Masako Kifushi, Yohei Nishikawa, Masahito Hosokawa, Keigo Ide, Masato Kogawa, Toyoaki Anai, Haruko Takeyama

18th International Symposium on Microbial Ecology 2022年8月16日
駿河湾における海洋細菌叢の時空間変動解析

木村彰伸, 西川洋平, 井手圭吾, 實野佳奈, 小川雅人, 細川正人, 小林憲一, 岡本一利, 竹山春子

第22回マリンバイオテクノロジー学会 2022年5月29日
Efficient Enzyme Discovery from Complex Environmental Microbiota using Microbial Single-Cell Sequencing

Soichiro Tsuda, Takuya Yoda, Keigo Ide, Masahito Hosokawa

ENZYME ENGINEERING XXVI 2022年5月22日
Microfluidic droplet-based single-cell genomics in aquatic and marine environments for revealing microbial and phage diversity

Yohei Nishikawa, Masato Kogawa, Masahito Hosokawa, Keigo Ide, Ryota Wagatsuma, Yuko Tsukada, Haruko Takeyama

2021 AFOB conference 2021年11月
多摩川を対象としたシングルセルゲノム解析による薬剤耐性菌の動態解明

塚田祐子, 西川洋平, 我妻竜太, 小川雅人, 井手圭吾, 細川正人, 竹山春子

第73回日本生物工学会大会 2021年10月28日
微小液滴を用いた単一粒子ゲノム構築技術を応用した環境中のウイルスゲノム解析

我妻竜太, 西川洋平, 塚田祐子, 井手圭吾, 千々岩樹佳, 細川正人, 竹山春子

第11回CSJ化学フェスタ2021 2021年10月19日
Evaluation of the impact of genetic diversity on PIWI-interacting RNA analysis

Kaoru Sato, Keigo Ide, Noriko Tanaka

American Society of Human Genomics 2021 2021年10月18日
Targeted single-cell genomics reveals novel host adaptation strategies of the symbiotic bacteria Endozoicomonas in Acropora tenuis coral

Keigo Ide, Yohei Nishikawa, Masato Kogawa, Ryota Wagatsuma, Yuko Tsukada, Masahito Hosokawa, Yoshikatsu Nakano, Shoichiro Suda, Haruko Takeyama

World Microbe Forum 2021年6月23日
網羅的微生物シングルセルゲノム解析技術の応用による環境細菌の遺伝子の水平伝播の解析

柳澤有祐, 小川雅人, 西川洋平, 細川正人, 井手圭吾, 實野佳奈, 塚田祐子, 岡本一利, 小林憲一, 竹山春子

第21回マリンバイオテクノロジー学会大会 2021年5月15日
微小液滴を用いたシングルセル技術による難培養性昆虫共生細菌の全ゲノム解析

安佛尚志, 西川洋平, 小川雅人, 井手圭吾, 相川拓也, 竹山春子

第65回日本応用動物昆虫学会 2021年3月24日
ヒト皮膚常在細菌における種内多様性のシングルセル解析

佐伯達也, 有川浩司, 依田卓也, 遠藤垂穂, 井手圭吾, 小川雅人, 竹山春子, 細川正人

第94回日本細菌学会総会 2021年3月23日
High-throughput screening of antibiotic-resistant genes in an urban river, Kanda River by metagenomic analysis

Chang Xiao, Keigo Ide, Ryota Wagatsuma, Yohei Nishikawa, Hiroko Matsunaga, Daisuke Tominaga, Haruko Takeyama

日本農芸化学会2021年度大会 2021年3月19日
コオロギ科の新規ミトコンドリアゲノム解読およびアリヅカコオロギ属の分子進化解析

三野流斗, 片岡孝介, 早川翔大, 井手圭吾, Nguyen Chuong, Nguyen Phuong Thao, 峯田克彦, 竹山春子, 竹田真木生, 佐藤俊幸, 鈴木丈詞, 由良敬, 朝日透

日本生物物理学会関東支部会 2021年3月
シングルセルゲノムを教師データとしたメタゲノムアセンブリの高品質化

有川浩司, 井手圭吾, 小川雅人, 依田卓也, 佐伯達也, 竹山春子, 細川正人

第43回日本分子生物学会年会 2020年12月3日
がん診断応用に向けたがん組織微小領域のゲノム・トランスクリプトーム統合解析

山﨑美輝, 松永浩子, 細川正人, 有川浩司, 坂梨千佳子, 鈴木直子, 井手圭吾, 我妻竜太, 竹山春子

第43回日本分子生物学会 2020年12月2日
シングルセルゲノム解析から明らかになるAcropora tenuisサンゴ共在Endozoicomonasの多様な宿主適応戦略

井手圭吾, 西川洋平, 岩本英介, 小川雅人, 細川正人, 中野義勝, 須田彰一郎, 竹山春子

第43回分子細胞生物学会 2020年12月
マダイ仔魚における腹部膨満症の病原菌特定

實野佳奈, 井手圭吾, 西川洋平, 松永浩子, 鈴木吉典, 倉石祐, 野田浩之, 岡本一利, 竹山春子

第10回CSJ化学フェスタ 2020年10月20日
タイワンエンマコオロギのゲノム全塩基配列解読:大量生産に向けた高効率品種改良技術の幕開け

片岡孝介, 嶺井隆平, 井手圭吾, 小倉淳, 竹山春子, 竹田真木生, 鈴木丈詞, 由良敬, 朝日透

第64回日本応用動物昆虫学会大会 2020年3月17日
大規模シングルセルゲノム解析技術を駆使した環境微生物の多様性の理解

細川正人, 西川洋, 小川雅人, 千々岩樹, 井手圭吾, 有川浩司, 竹山春子

第42回日本分子生物学会年会 2019年12月5日

もっとみる

担当経験のある科目(授業)

2019年4月 - 2021年3月

先端分子微生物学 - 第5回生命科学とビックデータ (早稲田大学)
2017年4月 - 2020年3月

生物統計学 TA (早稲田大学)
2017年4月 - 2020年3月

バイオインフォマティクス演習 TA (早稲田大学)

所属学協会

2022年10月 - 現在

日本バイオインフォマティクス学会
2020年9月 - 2022年3月

日本進化学会
2019年4月 - 2022年3月

日本マリンバイオテクノロジー学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

シングルゲノム情報に基づくサンゴ共在Endozoicomonas属の宿主適応機構の解明

公益財団法人日本科学協会笹川科学研究助成学術研究部門 2021年4月 - 2022年3月

産業財産権

特許第6744648号単一生物単位の配列情報の新規処理法

有川浩司, 細川正人, 竹山春子, 井手圭吾, 小川雅人
特許第6744642号単一生物単位の配列情報の新規処理法

有川浩司, 細川正人, 竹山春子, 小川雅人, 井手圭吾

井手圭吾

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

受賞

論文

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

メニュー

共著者の一覧

フォロー一覧