食道扁平上皮癌（ESCC）の個別化医療実現を目指し、治療抵抗性、再発、転移を克服しうる治療法の最適化を図ることを目的に、収集した腫瘍や血漿中DNAのオミックスデータモデリングによるシミュレーションとゲノム編集技術による実験的検証から、背景にある癌細胞の腫瘍内での不均一性の検出、クローン構造の推定とその機能との関連予測を行った。統合データから有効な分子標的の無いESCCの治療のmissing linkを補う新規分子標的候補を同定した。さらに、細胞株へのCrispr/Cas9による高効率の変異導入法の開発と抗癌剤などによるクローン選択から治療抵抗性形成に必要な変異蓄積パターンを解明した。