岩田通夫 (Michio Iwata) - マイポータル

基本情報

学位: 博士（農学）(2014年3月九州大学)

研究者番号: 60746642
J-GLOBAL ID: 202001007764724691
researchmap会員ID: R000009032

外部リンク: http://labo.bio.kyutech.ac.jp/~iwata/

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受賞

論文

A network-based trans-omics approach for predicting synergistic drug combinations.

Midori Iida, Yurika Kuniki, Kenta Yagi, Mitsuhiro Goda, Satoko Namba, Jun-Ichi Takeshita, Ryusuke Sawada, Michio Iwata, Yoshito Zamami, Keisuke Ishizawa …

Communications medicine 4(1) 154-154 2024年7月29日
DIRECTEUR: Transcriptome-based prediction of small molecules that replace transcription factors for direct cell conversion

Momoko Hamano, Toru Nakamura, Ryoku Ito, Yuki Shimada, Michio Iwata, Jun-ichi Takeshita, Ryohei Eguchi, Yoshihiro Yamanishi

Bioinformatics 2024年1月25日
Network-based identification of diagnosis-specific trans-omic biomarkers via integration of multiple omics data

Md Mamunur Rashid, Momoko Hamano, Midori Iida, Michio Iwata, Toshiyuki Ko, Seitaro Nomura, Issei Komuro, Yoshihiro Yamanishi

Biosystems 105122-105122 2024年1月
De novo drug design based on patient gene expression profiles via deep learning.

Chikashige Yamanaka, Shunya Uki, Kazuma Kaitoh, Michio Iwata, Yoshihiro Yamanishi

Molecular informatics 42(8-9) e2300064 2023年8月
【ポストGWAS時代の遺伝統計学オミクス解析と機械学習でヒト疾患を俯瞰する】(第5章)人工知能技術のゲノミクス応用研究遺伝子摂動応答オミクスデータを用いた治療標的予測疾患横断解析によるターゲットリポジショニング

難波里子, 岩田通夫, 山西芳裕

実験医学 41(7) 1193-1199 2023年5月
Epigenetic landscape of drug responses revealed through large-scale ChIP-seq data analyses

Zhaonan Zou, Michio Iwata, Yoshihiro Yamanishi, Shinya Oki

BMC Bioinformatics 23(1) 2022年12月査読有り
Regulome-based characterization of drug activity across the human diseasome

Michio Iwata, Keisuke Kosai, Yuya Ono, Shinya Oki, Koshi Mimori, Yoshihiro Yamanishi

npj Systems Biology and Applications 8(1) 2022年11月7日査読有り筆頭著者
Pathway trajectory analysis with tensor imputation reveals drug-induced single-cell transcriptomic landscape

Michio Iwata, Hiroaki Mutsumine, Yusuke Nakayama, Naomasa Suita, Yoshihiro Yamanishi

Nature Computational Science 2(11) 758-770 2022年11月査読有り筆頭著者
Single-cell-specific drug activities are revealed by a tensor imputation algorithm

Michio Iwata, Yoshihiro Yamanishi

Nature Computational Science 2(11) 707-708 2022年11月招待有り筆頭著者
Small compound-based direct cell conversion with combinatorial optimization of pathway regulations.

Toru Nakamura, Michio Iwata, Momoko Hamano, Ryohei Eguchi, Jun-Ichi Takeshita, Yoshihiro Yamanishi

Bioinformatics (Oxford, England) 38(Suppl_2) ii99-ii105 2022年9月16日
From drug repositioning to target repositioning: prediction of therapeutic targets using genetically perturbed transcriptomic signatures.

Satoko Namba, Michio Iwata, Yoshihiro Yamanishi

Bioinformatics (Oxford, England) 38(Suppl 1) i68-i76 2022年6月24日
TRANSDIRE: data-driven direct reprogramming by a pioneer factor-guided trans-omics approach

Ryohei Eguchi, Momoko Hamano, Michio Iwata, Toru Nakamura, Shinya Oki, Yoshihiro Yamanishi

Bioinformatics 38(10) 2839-2846 2022年4月12日査読有り
ネットワーク医学による創薬の実際

飯田緑, 岩田通夫, 山西芳裕

Diabetes Journal: 糖尿病と代謝 49(2) 71-74 2022年4月
投薬による遺伝子発現変動と大規模ChIP-seqデータの統合解析を駆使した薬剤作用標的となる転写因子の探索

鄒兆南, 岩田通夫, 山西芳裕, 沖真弥

日本薬学会年会要旨集 141年会 29V09-am02S 2021年3月
The novel driver gene ASAP2 is a potential druggable target in pancreatic cancer

Atsushi Fujii, Takaaki Masuda, Michio Iwata, Taro Tobo, Hiroaki Wakiyama, Kensuke Koike, Keisuke Kosai, Takafumi Nakano, Shotaro Kuramitsu, Akihiro Kitagawa …

Cancer Science 112(4) 1655-1668 2021年2月19日査読有り
薬物投与による発現変動遺伝子を統合制御する転写因子に着目した解釈可能な化合物–疾患ネットワークの構築

鄒兆南, 岩田通夫, 山西芳裕, 沖真弥

日本薬理学会年会要旨集 94 1-Y-E3-4 2021年
【機械学習を生命科学に使う!シークエンスや画像データをどう解析し、新たな生物学的発見につなげるか?】(第2章)バイオインフォマティクス免疫・微生物・化学・創薬テンソル分解による薬物応答トランスクリプトームの予測と創薬応用

岩田通夫, Yuan Longhao, Zhao Qibin, 田部井靖生, 山西芳裕

実験医学 38(20) 3401-3407 2020年12月
Network-based characterization of disease–disease relationships in terms of drugs and therapeutic targets

Midori Iida, Michio Iwata, Yoshihiro Yamanishi

Bioinformatics 36(Supplement_1) i516-i524 2020年7月1日査読有り
Omics‐based Identification of Glycan Structures as Biomarkers for a Variety of Diseases

Sayaka Akiyoshi, Michio Iwata, Francois Berenger, Yoshihiro Yamanishi

Molecular Informatics 39(1-2) 1900112-1900112 2020年1月査読有り
Predicting drug-induced transcriptome responses of a wide range of human cell lines by a novel tensor-train decomposition algorithm

Michio Iwata, Longhao Yuan, Qibin Zhao, Yasuo Tabei, Francois Berenger, Ryusuke Sawada, Sayaka Akiyoshi, Momoko Hamano, Yoshihiro Yamanishi

Bioinformatics 35(14) i191-i199 2019年7月15日査読有り筆頭著者

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MISC

人工知能技術のゲノミクス応用研究 2.遺伝子摂動応答オミクスデータを用いた治療標的予測-疾患横断解析によるターゲットリポジショニング

難波里子, 岩田通夫, 山西芳裕

実験医学 41(7) 2023年
ダイレクトリプログラミングを誘導する低分子化合物組み合わせのin silico予測

濱野桃子, 中村透, 岩田通夫, 江口凌平, 竹下潤一, 山西芳裕

日本再生医療学会総会(Web) 22nd 2023年
バイオインフォマティクスの世界(第10回)機械学習による薬物応答トランスクリプトームの解析と疾患治療薬の探索—Analysis of drug-induced transcriptome responses by machine learning toward drug discovery

岩田通夫, 山西芳裕

医学のあゆみ 281(11) 1103-1108 2022年6月11日
ネットワーク医学による創薬の実際

飯田緑, 岩田通夫, 山西芳裕

Diabetes Journal 49(2) 2022年
トランスオミクス解析によるダイレクトリプログラミング誘導転写因子の予測

濱野桃子, 江口凌平, 岩田通夫, 中村透, 山西芳裕

日本再生医療学会総会(Web) 21st 2022年
投薬による遺伝子発現変動と大規模ChIP-seqデータの統合解析を駆使した薬剤作用標的となる転写因子の探索

ZOU Zhaonan, 岩田通夫, 山西芳裕, 沖真弥

日本薬学会年会要旨集(Web) 141st 2021年
化合物応答トランスクリプトーム解析によるダイレクトリプログラミングを誘導する低分子化合物のインシリコ予測

濱野桃子, 中村透, 岩田通夫, 江口凌平, 山西芳裕

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 44th 2021年
バイオインフォマティクス II.免疫・微生物・化学・創薬 7.テンソル分解による薬物応答トランスクリプトームの予測と創薬応用

岩田通夫, YUAN Longhao, ZHAO Qibin, 田部井靖生, 山西芳裕

実験医学 38(20) 2020年
低分子化合物のオミクス解析によるデータ駆動型ダイレクトリプログラミング

中村透, 岩田通夫, 濱野桃子, 江口凌平, 山西芳裕

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
パイオニア転写因子を考慮したデータ駆動型ダイレクトリプログラミング

江口凌平, 濱野桃子, 岩田通夫, 中村透, 沖真弥, 山西芳裕

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
遺伝子発現制御に着目した薬剤摂動トランスクリプトームと大規模ChIP-seqデータの統合解析による薬剤作用ターゲット探索

鄒兆南, 岩田通夫, 山西芳裕, 沖真弥

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
Tensor-train分解アルゴリズムによる高次テンソル解析:薬物応答遺伝子発現データからの創薬

岩田通夫, YUAN Longhao, ZHAO Qibin, 田部井靖生, 山西芳裕

統計関連学会連合大会講演報告集 2018 2018年
Tensor-train分解アルゴリズムによる薬物応答遺伝子発現データからの創薬

岩田通夫, YUAN Longhao, ZHAO Qibin, 田部井靖生, 山西芳裕, 山西芳裕

ケモインフォマティクス討論会予稿集(Web) 41st 2018年
漢方薬リポジショニング:ビッグデータと機械学習による漢方薬の効能予測

澤田隆介, 岩田通夫, 梅崎雅人, 臼井義比古, 小林敏一, 窪野孝貴, 林周作, 門脇真, 山西芳裕, 山西芳裕

ケモインフォマティクス討論会予稿集(Web) 41st 2018年

書籍等出版物

機械学習を生命科学に使う! : シークエンスや画像データをどう解析し、新たな生物学的発見につなげるか?

小林, 徹也, 杉村, 薫, 舟橋, 啓

羊土社 2020年12月 (ISBN: 9784758103916)
ダイレクトリプログラミング : 再生医療の新展開

鈴木, 淳史

エヌ・ティー・エス 2020年8月 (ISBN: 9784860436711)

講演・口頭発表等

薬物応答１細胞トランスクリプトームの予測と創薬応用

岩田通夫

NGS EXPO 2023 招待有り
テンソル補完を用いたパスウェイ軌道解析による薬物応答１細胞遺伝子発現ランドスケープの解明

Iwata, M, Mutsumine, H, Nakayama, Y, Suita, N, Yamanishi, Y

FIT2023 第22回情報科学技術フォーラム招待有り
Single cell-specific drug activities are revealed by pathway trajectory analysis with tensor imputation

Iwata, M

JSPS-INSERM 招待有り
多層オミクス解析による遺伝子発現機構のディジーゾーム解析と治療薬探索

岩田通夫, 沖真弥, 山西芳裕

第43回日本分子生物学会年会招待有り

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

肝内胆管癌多層オミックス解析と機械学習によるリポジショニング薬の同定

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

高橋純一, 三森功士, 岩田通夫
時系列解析による薬の作用メカニズム解明と新たな疾患治療候補薬の探索

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究若手研究 2021年4月 - 2024年3月

岩田通夫
大規模代謝反応システムにおけるメタボロミクスデータからの数式モデル構築法

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2012年 - 2013年

岩田通夫

岩田通夫

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MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

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