伊東 潤平

私はウイルス感染症学と情報科学という2つの専門性と獣医学というバックグラウンドを活かし、感染症制御に資するバイオインフォマティクス技術の創出に取り組んでみます。研究のモットーは「あったらいいなをカタチにする」と「作って遊ぼう」です。

ウイルスの流行と進化を理解し予測する手法の開発

ウイルス感染症の制御が難しい一因は、ウイルスが急速に進化し、その性質を変化させることにあります。私はこれまで、COVID-19パンデミックで蓄積した膨大なウイルスゲノムデータを駆使し、ウイルスの流行・進化を理解し、予測する手法の開発に取り組んできました。本研究活動の詳細はリンクの日本語総説にまとめてあります。

• SARS-CoV-2次期流行株予測システムの開発と、本システムによる次期流行株の超早期捕捉
• G2P-Japanコンソーシアムとの連携による次期流行株の迅速性状解析
• SARS-CoV-2適応度予測AI「CoVFit」の開発とウイルス進化予測への適用

感染症制御に資するAI手法の開発

ポストパンデミック時代の現在は、SARS-CoV-2や季節性インフルエンザウイルスを含む様々なウイルスを対象に、感染症制御に資するAI技術の創出に取り組んでいます。

• ウイルスの抗原性予測AI「PLANT」の開発
• ワクチン抗原デザインに資する生成AIの開発
• 宿主トランスクリプトーム情報を活用した効率的なウイルス探索法の開発

ウイルス-インフォマティクス研究領域の発展に向けた取り組み

COVID-19パンデミックにおいて、ウイルス感染症学分野におけるバイオインフォマティクス人材の不足が浮き彫りとなりました。次世代の研究者を育成するために、ウイルス若手統計勉強会 を2021年から主催し、週1回オンライン勉強会を行なっています。また、他分野の研究者との交流を目的としたイベントを、ウイルス学若手ネットワークや生命情報科学若手の会と連携し実施しています。これらの活動についても、リンクの日本語総説にまとめてあります。