小林淳 (kobayashi jun) - マイポータル

基本情報

所属: 厚生労働省　国立感染症研究所インフルエンザ・呼吸器系ウイルス研究センター

J-GLOBAL ID: 201801006199437557
researchmap会員ID: B000333147

経歴

2021年12月 - 2024年1月

厚生労働省国立感染症研究所, インフルエンザ・呼吸器系ウイルス研究センター
2018年8月 - 2021年11月

高エネルギー加速器研究機構, 構造生物学研究センター, 研究員
2016年6月 - 2018年7月

デンカ生研株式会社, 研究員
2015年4月 - 2016年5月

理化学研究所, SACLA利用技術開拓グループ, 特別研究員
2014年4月 - 2015年3月

理化学研究所, SACLA利用技術開拓グループ, リサーチアソシエイト

学歴

2011年4月 - 2014年3月

京都大学大学院, 農学研究科, 応用生命科学専攻
2009年4月 - 2011年3月

高知大学大学院, 大学院総合人間自然科学研究科, 農学専攻
2005年4月 - 2009年3月

高知大学, 農学部, 生物資源科学科

論文

Use of the particle agglutination/particle agglutination inhibition test for antigenic analysis of SARS-CoV-2.

Jun Kobayashi, Shutoku Matsuyama, Masayuki Shirakura, Tomoko Arita, Yasushi Suzuki, Hideki Asanuma, Shinji Watanabe, Hideki Hasegawa, Kazuya Nakamura

Influenza and other respiratory viruses 17(2) e13093 2023年2月
Ligand Recognition by the Lipid Transfer Domain of Human OSBP Is Important for Enterovirus Replication.

Jun Kobayashi, Minetaro Arita, Shota Sakai, Hirotatsu Kojima, Miki Senda, Toshiya Senda, Kentaro Hanada, Ryuichi Kato

ACS infectious diseases 8(6) 1161-1170 2022年6月10日
XFEL structures of the influenza M2 proton channel: Room temperature water networks and insights into proton conduction

Jessica L. Thomaston, Rahel A. Woldeyes, Takanori Nakane, Ayumi Yamashita, Tomoyuki Tanaka, Kotaro Koiwai, Aaron S. Brewster, Benjamin A. Barad, Yujie Chen, Thomas Lemmin …

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 114(51) 13357-13362 2017年12月査読有り
Protein-ligand complex structure from serial femtosecond crystallography using soaked thermolysin microcrystals and comparison with structures from synchrotron radiation

Hisashi Naitow, Yoshinori Matsuura, Kensuke Tono, Yasumasa Joti, Takashi Kameshima, Takaki Hatsui, Makina Yabashi, Rie Tanaka, Tomoyuki Tanaka, Michihiro Sugahara …

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-STRUCTURAL BIOLOGY 73(Pt 8) 702-709 2017年8月査読有り
Role of the Tyr270 residue in 2-methyl-3-hydroxypyridine-5-carboxylic acid oxygenase from Mesorhizobium loti

Jun Kobayashi, Hiromi Yoshida, Toshiharu Yagi, Shigehiro Kamitori, Hideyuki Hayashi, Kimihiko Mizutani, Nobuyuki Takahashi, Bunzo Mikami

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING 123(2) 154-162 2017年2月査読有り
A three-dimensional movie of structural changes in bacteriorhodopsin

Eriko Nango, Antoine Royant, Minoru Kubo, Takanori Nakane, Cecilia Wickstrand, Tetsunari Kimura, Tomoyuki Tanaka, Kensuke Tono, Changyong Song, Rie Tanaka …

SCIENCE 354(6319) 1552-1557 2016年12月査読有り
Membrane protein structure determination by SAD, SIR, or SIRAS phasing in serial femtosecond crystallography using an iododetergent

Takanori Nakane, Shinya Hanashima, Mamoru Suzuki, Haruka Saiki, Taichi Hayashi, Keisuke Kakinouchi, Shigeru Sugiyama, Satoshi Kawatake, Shigeru Matsuoka, Nobuaki Matsumori …

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 113(46) 13039-13044 2016年11月査読有り
Microcrystal delivery by pulsed liquid droplet for serial femtosecond crystallography

Fumitaka Mafune, Ken Miyajima, Kensuke Tono, Yoshihiro Takeda, Jun-ya Kohno, Naoya Miyauchi, Jun Kobayashi, Yasumasa Joti, Eriko Nango, So Iwata …

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-STRUCTURAL BIOLOGY 72(Pt 4) 520-523 2016年4月査読有り
5B35: Serial Femtosecond Crystallography (SFX) of Ground State Bacteriorhodopsin Crystallized from Bicelles Determined Using 7-keV X-ray Free Electron Laser (XFEL) at SACLA

Nakane T, Hanashima S, Suzuki M, Saiki H, Hayashi T, Kakinouchi K, Sugiyama S, Kawatake S, Matsuoka S, Matsumori N …

Worldwide Protein Data Bank 2016年査読有り
Native sulfur/chlorine SAD phasing for serial femtosecond crystallography

Takanori Nakane, Changyong Song, Mamoru Suzuki, Eriko Nango, Jun Kobayashi, Tetsuya Masuda, Shigeyuki Inoue, Eiichi Mizohata, Toru Nakatsu, Tomoyuki Tanaka …

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 71 2519-2525 2015年12月査読有り
4YOP: CRYSTAL STRUCTURE OF HEN EGG-WHITE LYSOZYME

Nakane T, Song C, Suzuki M, Nango E, Kobayashi J, Masuda T, Inoue S, Mizohata E, Nakatsu T, Tanaka T …

Worldwide Protein Data Bank 2015年査読有り
Crystal structure of 5-formyl-3-hydroxy-2-methylpyridine 4-carboxylic acid 5-dehydrogenase, an NAD⁺-dependent dismutase from Mesorhizobium loti.

Mugo AN, Kobayashi J, Mikami B, Yoshikane Y, Yagi T, Ohnishi K

Biochemical and biophysical research communications 456(1) 35-40 2015年1月査読有り
Native sulfur/chlorine SAD phasing for serial femtosecond crystallography

Takanori Nakane, Changyong Song, Mamoru Suzuki, Eriko Nango, Jun Kobayashi, Tetsuya Masuda, Shigeyuki Inoue, Eiichi Mizohata, Toru Nakatsu, Tomoyuki Tanaka …

Acta Crystallographica Section D: Biological Crystallography 71(Pt 12) 2519-2525 2015年査読有り
Structure of 4-pyridoxolactonase from Mesorhizobium loti

Jun Kobayashi, Yu Yoshikane, Toshiharu Yagi, Seiki Baba, Kimihiko Mizutani, Nobuyuki Takahashi, Bunzo Mikami

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS 70(Pt 4) 424-432 2014年4月査読有り
Crystal structure of pyridoxine 4-oxidase from Mesorhizobium loti.

Mugo AN, Kobayashi J, Yamasaki T, Mikami B, Ohnishi K, Yoshikane Y, Yagi T

Biochimica et biophysica acta 1834(6) 953-963 2013年6月査読有り
Crystallization and preliminary X-ray analysis of pyridoxine 4-oxidase, the first enzyme in pyridoxine degradation pathway I

Andrew Njagi Mugo, Jun Kobayashi, Bunzo Mikami, Kouhei Ohnishi, Toshiharu Yagi

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS 68(Pt 1) 66-68 2012年1月査読有り
The Crystal Structure of SDR-Type Pyridoxal 4-Dehydrogenase of Mesorhizobium loti

Huy Nhat Chu, Jun Kobayashi, Bunzo Mikami, Toshiharu Yagi

BIOSCIENCE BIOTECHNOLOGY AND BIOCHEMISTRY 75(2) 388-390 2011年2月査読有り
Crystallization and preliminary X-ray analysis of SDR-type pyridoxal dehydrogenase from Mesorhizobium loti

Huy Nhat Chu, Jun Kobayashi, Yu Yoshikane, Bunzo Mikami, Toshiharu Yagi

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS 66(Pt 6) 718-720 2010年6月査読有り
Crystallization and preliminary X-ray analysis of 4-pyridoxolactonase from Mesorhizobium loti

Sayoko Matsuda, Nana Yokochi, Yu Yoshikane, Jun Kobayashi, Chu Nhat Huy, Seiki Baba, Seiki Kuramitsu, Bunzo Mikami, Toshiharu Yagi

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS 65(Pt 9) 886-889 2009年9月査読有り
Crystallization and preliminary X-ray analysis of AAMS amidohydrolase, the final enzyme in degradation pathway I of pyridoxine

Jun Kobayashi, Hiromi Yoshida, Huy Nhat Chu, Yu Yoshikane, Shigehiro Kamitori, Toshiharu Yagi

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY AND CRYSTALLIZATION COMMUNICATIONS 65(Pt 8) 829-831 2009年8月査読有り

MISC

抗体を酵素化する変異導入

小林淳, 一二三恵美, 宇田泰三, 加藤龍一

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 92回 [1P-113] 2019年9月
Fv‐clasp化した抗体酵素の結晶構造と絶対分子量から推定した溶液構造

小林淳, 吉田尚史, 吉田尚史, 有森貴夫, 高木淳一, 一二三恵美, 宇田泰三, 加藤龍一

日本細胞生物学会大会(Web) 71st ROMBUNNO.1P‐041 (WEB ONLY) 2019年
XFELの創薬利用を目指したタンパク質‐リガンド複合体微結晶のシリアルフェムト秒構造解析

内藤久志, 松浦祥悟, 登野健介, 登野健介, 城地保昌, 城地保昌, 亀島敬, 亀島敬, 初井宇記, 初井宇記 …

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 17th 126 2017年5月22日
膜蛋白質のSFXによる迅速位相決定を志向したヨウ素含有界面活性剤の開発

中根崇智, 花島慎弥, 鈴木守, 鈴木守, 斎木悠, 林太一, 垣之内啓介, 垣之内啓介, 杉山成, 杉山成 …

日本結晶学会年会講演要旨集 2016 112 2016年11月17日
XFELと同期したパルス駆動試料インジェクターの開発

登野健介, 真船文隆, 宮島謙, 武田佳宏, 河野淳也, 宮内直弥, 小林淳, 城地保昌, 南後恵理子, 岩田想 …

日本放射光学会年会・放射光科学合同シンポジウム予稿集 29th 74 2016年1月9日
シリアルフェムト秒X線結晶構造解析のための試料調製方法

田中智之, 菅原道泰, 山下鮎美, 小林淳, 田中里枝, 登野健介, 城地保昌, 亀島敬, PARK Jaehyun, SONG Changyong …

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 15th 95 2015年5月26日
Bombyx moriカロテノイド結合タンパク質のX線結晶構造解析

塚副成, 稲熊隆博, 小林淳, 水谷公彦, 高橋延行, 三上文三

日本食品科学工学会大会講演集 61st 155 2014年8月28日
Crystal structure of pyridoxine 4-oxidase from Mesorhizobium loti

MUGO Andrew, KOBAYASHI Jun, MIKAMI Bunzo, YAMASAKI Taiji, YOSHIKANE Yu, YAGI Toshiharu, OHNISHI Kouhei

日本農芸化学会大会講演要旨集(Web) 2014 2D01P05 (WEB ONLY) 2014年3月5日
Geobacillus属由来の糖転移酵素のオリゴ糖複合体の結晶構造

尾藤浩高, 安西友里恵, 小林淳, 水谷公彦, 高橋延行, 岡田正通, 山口庄太郎, 三上文三

日本農芸化学会関西支部講演会講演要旨集 483rd 16 2014年1月31日
自由電子レーザーを用いた膜蛋白質の系統的構造解析

岩田想, 岩田想, 木村香菜子, 島村達郎, 南後恵理子, 田中智之, 西澤知宏, 濡木理, 田中里枝, 鈴木守 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 37th 2014年
根粒菌ピリドキシン4‐オキシダーゼの三次構造

八木年晴, NJAGI Mugo Andrew, 渡邊江里子, 小林淳, 山崎太嗣, 三上文三, 大西浩平, 吉金優

ビタミン 87(5/6) 293-294 2013年6月25日
微生物由来トランスグルタミナーゼの活性部位とプロ領域ペプチドとの相互作用

森光平, 小林淳, 吉村卓也, 水谷公彦, 高橋延行, 星由起子, 山口庄太郎, 三上文三

日本農芸化学会関西支部講演会講演要旨集 479th 4 2013年
4‐Pyridoxolactonase‐5‐Pyridoxolactone複合体の構造

小林淳, 三上文三, 八木年晴

日本生化学会大会(Web) 86th 2T18A-01(2P-115) (WEB ONLY) 2013年
Crystal structure of pyridoxine 4-oxidase, the first enzyme in degradation pathway I for pyridoxine.

MUGO Andrew N, KOBAYASHI Jun, MIKAMI Bunzou, OHNISHI Kouhei, YAGI Toshiharu

日本農芸化学会中四国支部講演会講演要旨集 32nd 40 2012年1月21日
膜酵素4‐ピリドキシン酸デヒドロゲナーゼのCoQ結合部位

鈴木太郎, 葛飛, 小林淳, 吉金優, 八木年晴

日本農芸化学会中四国支部講演会講演要旨集 26th 21 2010年1月23日
Crystal structure of SDR-type pyridoxal 4-dehydrogenase from Mesorhizobium loti

CHU Huy Nhat, KOBAYASHI Jun, YOSHIKANE Yu, YAGI Toshiharu, MIKAMI Bunzo

生化学 ROMBUNNO.1P-0072 2010年
ビタミンB₆分解酵素4‐pyridoxolactonaseのX線結晶構造解析

小林淳, 吉金優, 馬場清喜, 三上文三, 八木年晴

生化学 ROMBUNNO.1P-0071 2010年
ピリジン環分解ジオキシゲナーゼ(MHPCO)の機能におけるTyr270の働き

小林淳, 八木年晴, 吉田裕美, CHU Nhat Huy, 神鳥成弘

生化学 ROMBUNNO.3T5A-2 2009年9月25日
MHPC dioxygenaseのX線結晶構造解析

小林淳, 吉田裕美, 神鳥成弘, 吉金優, 八木年晴

生化学 81(7) 640 2009年7月25日
PLP,PMP,PNP,PNGの酵素HPLC法による定量条件の改良 II

井手陽平, 小林淳, 村山隆太郎, 吉金優, 八木年晴

ビタミン 83(4) 223-223 2009年4月25日

共同研究・競争的資金等の研究課題

単純ヘルペスウイルス1型におけるインターフェロン抑制機構の構造基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究若手研究 2021年4月 - 2024年3月

小林淳

小林淳

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共同研究・競争的資金等の研究課題

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