黒田純平 (Junpei Kuroda) - マイポータル

基本情報

所属: JT生命誌研究館研究セクター研究室長・主任研究員
: 大阪大学大学院理学研究科生物科学専攻招聘准教授

J-GLOBAL ID: 202001005783889496
researchmap会員ID: R000009596

研究分野

受賞

2023年8月

Ibidi フォトコンテスト最優秀賞
2020年9月

第５２回結合組織学会学術大会・若手研究者賞

黒田純平
2018年6月

第５１回日本発生生物学会・優秀ポスター賞

黒田純平
2016年12月

第３９回日本分子生物学会年会・優秀ポスター賞

黒田純平
2016年2月

第４回CREST「生命動態」ショートプレゼンテーション優秀賞

黒田純平

論文

Actinotrichia-independent developmental mechanisms of spiny rays facilitate the morphological diversification of Acanthomorpha fish fins

Kazuhide Miyamoto, Junpei Kuroda, Satomi Kamimura, Yasuyuki Sasano, Gembu Abe, Satoshi Ansai, Noriko Funayama, Masahiro Uesaka, Koji Tamura

Nature Communications 2026年2月14日査読有り
A collagen orientation switch reshapes fin architecture

bioRxiv 2026年1月20日責任著者
A facile method for fluorescent visualization of newly synthesized fibrous collagen by capturing the allysine aldehyde groups serving as cross-link precursors

Junpei Kuroda, Kazunori K Fujii, Sugiko Futaki, Azumi Hirata, Yuki Taga, Takaki Koide

bioRxiv 2025年6月筆頭著者責任著者
Keratinocyte-driven dermal collagen formation in the axolotl skin

Ayaka Ohashi, Hirotaka Sakamoto, Junpei Kuroda, Yohei Kondo, Yasuhiro Kamei, Shigenori Nonaka, Saya Furukawa, Sakiya Yamamoto, Akira Satoh

Nature Communications 16(1) 2025年2月24日査読有り
Role of versican in extracellular matrix formation: analysis in 3D culture

Nushrat Jahan, Shamima Islam, Karnan Sivasundaram, Akinobu Ota, Munekazu Naito, Junpei Kuroda, Hideto Watanabe

American Journal of Physiology-Cell Physiology 328(1) C245-C257 2025年1月1日査読有り
Dynamics of actinotrichia, fibrous collagen structures in zebrafish fin tissues, unveiled by novel fluorescent probes

Junpei Kuroda, Hiromu Hino, Shigeru Kondo

PNAS Nexus 2024年7月5日査読有り筆頭著者責任著者
In vivo imaging of bone collagen dynamics in zebrafish.

Hiromu Hino, Shigeru Kondo, Junpei Kuroda

Bone reports 20 101748-101748 2024年3月査読有り責任著者
Collagen9a1c localizes to collagen fibers called actinotrichia in zebrafish fins

Hibiki Nakagawa, Toshihiro Aramaki, Shigeru Kondo, Junpei Kuroda

microPublication Biology 2023年4月査読有り責任著者
The Drosophila AWP1 ortholog Doctor No regulates JAK/STAT signaling for left–right asymmetry in the gut by promoting receptor endocytosis

Yi-Ting Lai, Takeshi Sasamura, Junpei Kuroda, Reo Maeda, Mitsutoshi Nakamura, Ryo Hatori, Tomoki Ishibashi, Kiichiro Taniguchi, Masashi Ooike, Tomohiro Taguchi …

Development 150(6) 2023年3月15日査読有り
Mechanical role of actinotrichia in shaping the caudal fin of zebrafish.

Hibiki Nakagawa, Junpei Kuroda, Toshihiro Aramaki, Shigeru Kondo

Developmental biology 481 52-63 2022年1月査読有り
The physical role of mesenchymal cells driven by the actin cytoskeleton is essential for the orientation of collagen fibrils in zebrafish fins

Junpei Kuroda, Takeshi Itabashi, Atsuko H. Iwane, Toshihiro Aramaki, Shigeru Kondo

Frontiers in Cell and Developmental Biology 8(580520) 580520-580520 2020年9月査読有り筆頭著者
Uptake of osteoblast-derived extracellular vesicles promotes the differentiation of osteoclasts in the zebrafish scale.

Jingjing Kobayashi-Sun, Shiori Yamamori, Mao Kondo, Junpei Kuroda, Mika Ikegame, Nobuo Suzuki, Kei-Ichiro Kitamura, Atsuhiko Hattori, Masaaki Yamaguchi, Isao Kobayashi

Communications biology 3(1) 190-190 2020年4月23日査読有り
Roles of basal keratinocytes in actinotrichia formation.

Junpei Kuroda, Atsuko H Iwane, Shigeru Kondo

Mechanisms of development 153 54-63 2018年10月査読有り筆頭著者
Epidermal regulation of bone morphogenesis through the development and regeneration of osteoblasts in the zebrafish scale.

Miki Iwasaki, Junpei Kuroda, Koichi Kawakami, Hironori Wada

Developmental biology 437(2) 105-119 2018年5月15日査読有り
O-fucose monosaccharide of Drosophila Notch has a temperature-sensitive function and cooperates with O-glucose glycan in Notch transport and Notch signaling activation.

Akira Ishio, Takeshi Sasamura, Tomonori Ayukawa, Junpei Kuroda, Hiroyuki O Ishikawa, Naoki Aoyama, Kenjiroo Matsumoto, Takuma Gushiken, Tetsuya Okajima, Tomoko Yamakawa …

The Journal of biological chemistry 290(1) 505-19 2015年1月2日査読有り
A gain-of-function screen to identify genes that reduce lifespan in the adult of Drosophila melanogaster.

Minoru Nakayama, Tomoki Ishibashi, Hiroyuki O Ishikawa, Hiroyasu Sato, Takao Usui, Takayuki Okuda, Hiroyuki Yashiro, Hironori Ishikawa, Yoshie Taikou, Asako Minami …

BMC genetics 15 46-46 2014年4月16日査読有り
An in-silico genomic survey to annotate genes coding for early development-relevant signaling molecules in the pearl oyster, Pinctada fucata.

Davin H E Setiamarga, Keisuke Shimizu, Junpei Kuroda, Kengo Inamura, Kei Sato, Yukinobu Isowa, Makiko Ishikawa, Reo Maeda, Tomoyuki Nakano, Tomoko Yamakawa …

Zoological science 30(10) 877-88 2013年10月査読有り
Canonical Wnt signaling in the visceral muscle is required for left–right asymmetric development of the Drosophila midgut

Junpei Kuroda, Mitsutoshi Nakamura, Masashi Yoshida, Haruka Yamamoto, Takaaki Maeda, Kiichiro Taniguchi, Naotaka Nakazawa, Ryo Hatori, Akira Ishio, Ayumi Ozaki …

Mechanisms of Development 128(11-12) 625-639 2012年1月査読有り筆頭著者
Left-right asymmetric morphogenesis of the anterior midgut depends on the activation of a non-muscle myosin II in Drosophila.

Takashi Okumura, Hiroo Fujiwara, Kiichiro Taniguchi, Junpei Kuroda, Naotaka Nakazawa, Mitsutoshi Nakamura, Ryo Hatori, Akira Ishio, Reo Maeda, Kenji Matsuno

Developmental biology 344(2) 693-706 2010年8月15日査読有り
The development and evolution of left-right asymmetry in invertebrates: lessons from Drosophila and snails.

Takashi Okumura, Hiroki Utsuno, Junpei Kuroda, Edmund Gittenberger, Takahiro Asami, Kenji Matsuno

Developmental dynamics : an official publication of the American Association of Anatomists 237(12) 3497-515 2008年12月査読有り

MISC

生物のからだはどのように左右非対称になるのか？～ショウジョウバエを用いてその仕組みを探る～

黒田純平、中村充利、松野健治

生産と技術 63(3) 99-102 2013年8月筆頭著者

講演・口頭発表等

Aligning Fibers, Rocking Fins: Morphogenesis of fish fin bones orchestrated by collagen fibers and cells

Junpei Kuroda, Hiromu Hino

第48回日本分子生物学会年会 2025年12月5日
ほねほねロック～さまざまな動物が奏でる多様な骨格形成～

熱田勇士, 黒田純平

第48回日本分子生物学会年会 2025年12月5日
The dynamics of collagen fibers in tissue morphogenesis revealed by a novel technique of collagen visualization and a unique tissue model

Junpei Kuroda, Kazunori K. Fujii, Sugiko Futaki, Azumi Hirata, Yuki Taga, Shigeru Kondo, Takaki Koide

第34回バイオイメージング学会学術集会 2025年9月26日
カエデイソヤムシParaspadella gotoiのヒレの形態形成を支える細胞骨格動態

黒田純平, 後藤太一郎

2025年日本ベントス学会・日本プランクトン学会合同大会 2025年9月11日
A novel technique for live imaging of bone formation in zebrafish fin via visualization of collagen fibers

Hiromu Hino, Shigeru Kondo, Junpei Kuroda

The 31st Japanese Medaka and Zebrafish Meeting 2025年9月1日
The dynamics of collagen remodeling in tissue morphogenesis revealed by a novel technique of collagen visualization and a unique tissue model

Junpei Kuroda

AMED International Symposium "Proteostasis in Biology and Medicine" 2025年8月27日
Morphological Regulation of Bone Formation by Non-Cartilaginous Collagen Structures Observed in Fish Fin

Hiromu Hino, Shigeru Kondo, Junpei Kuroda

第77回日本細胞生物学会・第58回日本発生生物学会合同大会 2025年7月16日
Functional analysis of gene family which controls collagen fibers arrangement during fish fin morphogenesis

Rintaro Tanimoto, Takeshi Itabashi, Atsuko Iwane, Shigeru Kondo, Junpei Kuroda

第77回日本細胞生物学会・第58回日本発生生物学会合同大会 2025年7月16日
Role of type IX collagen in the morphogenesis of fin skeleton in zebrafish

Jin Hagiwara, Hibiki Nakagawa, Shigeru Kondo, Junpei Kuroda

第77回日本細胞生物学会・第58回日本発生生物学会合同大会 2025年7月16日
Collagen fiber structures regulating fish fin ray bone formation revealed by collagen fluorescence visualization technology

Hino Hiromu, Kondo Shigeru, Kuroda Junpei

第57回日本結合組織学会学術大会 2025年6月7日
Functional analysis of gene family which controls collagen fibers arrangement in fish fin

Rintaro Tanimoto, Takeshi Itabashi, Atsuko Iwane, Shigeru Kondo, Junpei Kuroda

第57回日本結合組織学会学術大会 2025年6月7日
Type IX collagen contributes to the stabilization of collagen crystals distributed at the fin tip in zebrafish

Jin Hagiwara, Hibiki Nakagawa, Shigeru Kondo, Junpei Kuroda

第57回日本結合組織学会学術大会 2025年6月7日
形態形成を支えるコラーゲンの動態を“見たい”というモチベーションで挑む研究

黒田純平

第57回日本結合組織学会学術大会 2025年6月6日招待有り
ゼブラフィッシュ新規変異体を用いた、ヒレづくりにおいて骨組みとなるコラーゲン繊維の配向を形成する遺伝子の機能解析

谷本凜太朗, 板橋岳志, 岩根敦子, 近藤滋, 黒田純平

第47回日本分子生物学会年会 2024年11月29日
Function of type IX collagen essential for the orientation of collagen structures distributed at the tip of zebrafish fin

Jin Hagiwara, Hibiki Nakagawa, Toshihiro Aramaki, Shigeru Kondo, Junpei Kuroda

第47回日本分子生物学会年会 2024年11月28日
Architecture of fish fins created by the interaction between rod-shaped collagen crystals and cells

Junpei Kuroda

第47回日本分子生物学会年会 2024年11月27日招待有り
新規コラーゲン可視化法により明らかになったゼブラフィッシュ組織の成長過程におけるコラーゲン線維のダイナミクス

黒田純平

第97回日本生化学会 2024年11月8日招待有り
Growth dynamics of collagen fibers in zebrafish fins unveiled by a novel imaging tool for collagen visualization

Junpei Kuroda, Hiromu Hino, Shigeru Kondo

18th International Zebrafish Conference 2024年8月20日
Approaching dynamics of collagen remodeling in tissue morphogenesis: insights from research using a unique tissue model and a breakthrough imaging tool

Junpei Kuroda, Hiromu Hino, Shigeru Kondo

第57回日本発生生物学会 2024年6月20日
Novel cellular dynamics enabling transport of collagen fiber structures during zebrafish fin growth

Hiromu Hino, Shigeru Kondo, Junpei Kuroda

第57回日本発生生物学会 2024年6月20日

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

コラーゲン繊維を直交させずに平面状に一方向に配向させる原理の解明

科学技術振興機構創発的研究支援事業 2023年4月 - 2030年3月
ゼブラフィッシュの組織再生を支える細胞制御機構の解明

成茂基金成茂動物科学振興基金 2025年
骨形成の足場であるコラーゲン結晶体を輸送する新規メカニズム

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

黒田純平
細胞が棒状機材を操作することで作るしなやかなヒレの形態形成原理

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2021年9月 - 2023年3月

黒田純平
直線状のコラーゲン結晶を基にした骨の２分岐パターンの形成原理

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2019年4月 - 2022年3月

黒田純平
古典的Wntシグナルによるショウジョウバエ消化管の左右非対称な形態形成機構の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2011年 - 2012年

黒田純平