ニッタジョエル (Joel Nitta) - マイポータル - researchmap

基本情報

所属: 千葉大学大学院国際学術研究院国際教養学部准教授

研究者番号: 50901443
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0003-4719-7472
J-GLOBAL ID: 202001000563517693
researchmap会員ID: R000014906

外部リンク: https://joelnitta.com

研究キーワード

4

研究分野

3

経歴

5

2023年4月 - 現在

千葉大学大学院国際学術研究院国際教養学部, 准教授
2022年4月 - 2023年3月

東京大学大学院新領域創成科学研究科先端生命科学専攻, 特任助教
2020年4月 - 2022年3月

東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻, 特任助教
2019年1月 - 2020年3月

スミソニアン国立自然史博物館, 植物研究部, ピーター・バック特別研究員
2016年11月 - 2018年12月

国立科学博物館, 植物研究部, 日本学術振興会外国人特別研究員

学歴

3

2011年8月 - 2016年11月

ハーバード大学, 大学院進化生物学研究科
2008年4月 - 2010年3月

東京大学, 大学院理学系研究科
2002年8月 - 2007年6月

カリフォルニア大学バークレー校, 文理学部

受賞

3

2022年7月

Best Talk, "An Open and Continuously Updated Fern Tree of Life (FTOL)", Intelligent Systems for Molecular Biology: EvolCompGen

Joel H. Nitta, Eric Schuettpelz, Santiago Ramírez-Barahona, Wataru Iwasaki
2022年3月

日本植物分類学会奨励賞, 日本植物分類学会

ニッタジョエル
2021年3月

日本植物分類学会大会発表賞, 日本植物分類学会

ニッタジョエル

論文

33

Identification of gene isoforms and their switching events between male and female embryos of the parthenogenetic crustacean Daphnia magna

Yasuhiko Kato, Joel H. Nitta, Christelle Alexa Garcia Perez, Nikko Adhitama, Pijar Religia, Atsushi Toyoda, Wataru Iwasaki, Hajime Watanabe

Scientific Reports 14(1) 2024年4月30日査読有り
dwctaxon, an R package for editing and validating taxonomic data in Darwin Core format

Joel H. Nitta, Wataru Iwasaki

Journal of Open Source Software 9(93) 6215-6215 2024年1月12日査読有り筆頭著者責任著者
25

進化生物学のモデルシステムとしてのシダ植物研究

ニッタジョエル

植物地理・分類研究 71(2) 115-126 2023年11月査読有り招待有り筆頭著者最終著者責任著者
48

Resolving deep relationships and revealing ancient whole-genome duplications in Pteridaceae using transcriptomic data

Michael J. Song, Carl J. Rothfels, Eric Schuettpelz, Joel H. Nitta, Layne Huie, Fay-Wei Li, Keir M. Wefferling

American Fern Journal 113(3) 191-210 2023年9月29日査読有り
canaper: Categorical analysis of neo‐ and paleo‐endemism in R

Joel H. Nitta, Shawn W. Laffan, Brent D. Mishler, Wataru Iwasaki

Ecography 2023年7月18日査読有り筆頭著者責任著者
Systematics and biogeography of the Old World fern genus Antrophyum

Cheng‐Wei Chen, Stuart Lindsay, Joel H. Nitta, Germinal Rouhan, Michael Sundue, Leon R. Perrie, Yao‐Moan Huang, Wen‐Liang Chiou, Kuo‐Fang Chung

Cladistics 2023年4月20日査読有り
Machine learning methods reveal processes affecting abundance at multiple scales. A commentary on ‘Global and regional drivers of abundance patterns in the hart’s tongue fern complex (Aspleniaceae)’

Joel H. Nitta

Annals of Botany 2023年2月27日査読有り筆頭著者最終著者責任著者
An open and continuously updated fern tree of life

Joel H. Nitta, Eric Schuettpelz, Santiago Ramírez-Barahona, Wataru Iwasaki

Frontiers in Plant Science 13 2022年8月24日査読有り筆頭著者責任著者
Spatial phylogenetics of Japanese ferns: Patterns, processes, and implications for conservation

Joel H. Nitta, Brent D. Mishler, Wataru Iwasaki, Atsushi Ebihara

American Journal of Botany 109(5) 727-745 2022年5月査読有り筆頭著者責任著者
Identifying cryptic fern gametophytes using DNA barcoding: A review

Joel H. Nitta, Sally M. Chambers

Applications in Plant Sciences 10(2) 2022年3月査読有り筆頭著者責任著者
Ecophysiological differentiation between life stages in filmy ferns (Hymenophyllaceae)

Joel H. Nitta, James E. Watkins, N. Michele Holbrook, Tristan W. Wang, Charles C. Davis

Journal of Plant Research 134(5) 971-988 2021年9月査読有り筆頭著者責任著者
A taxonomic and molecular survey of the pteridophytes of the Nectandra Cloud Forest Reserve, Costa Rica

Joel H. Nitta, Atsushi Ebihara, Alan R. Smith

PLOS ONE 15(11) e0241231-e0241231 2020年11月18日査読有り筆頭著者責任著者
Life in the canopy: community trait assessments reveal substantial functional diversity among fern epiphytes

Joel H. Nitta, James E. Watkins, Charles C. Davis

NEW PHYTOLOGIST 227(6) 1885-1899 2020年9月査読有り筆頭著者責任著者
Correction to: An update and reassessment of fern and lycophyte diversity data in the Japanese Archipelago (Journal of Plant Research, (2019), 132, 6, (723-738), 10.1007/s10265-019-01137-3)

Atsushi Ebihara, Joel H. Nitta

Journal of Plant Research 132(6) 739 2019年11月1日最終著者責任著者
An update and reassessment of fern and lycophyte diversity data in the Japanese Archipelago

Atsushi Ebihara, Joel H. Nitta

JOURNAL OF PLANT RESEARCH 132(6) 723-738 2019年11月査読有り最終著者
Virtual issue: Ecology and evolution of pteridophytes in the era of molecular genetics

Joel H. Nitta, Atsushi Ebihara

JOURNAL OF PLANT RESEARCH 132(6) 719-721 2019年11月筆頭著者責任著者
Growth dynamics of independent gametophytes of Pleurosoriopsis makinoi (Polypodiaceae)

Atsushi Ebihara, Joel H. Nitta, Yurika Matsumoto, Yuri Fukazawa, Marie Kurihara, Hitomi Yokote, Kaoru Sakuma, Otowa Akazami

Bulletin of the National Museum of Nature and Science, Series B (Botany), Tokyo 45(2) 77-86 2019年5月査読有り
Microsorum x tohieaense (Polypodiaceae), a New Hybrid Fern from French Polynesia, with Implications for the Taxonomy of Microsorum

Joel H. Nitta, Saad Amer, Charles C. Davis

SYSTEMATIC BOTANY 43(2) 397-413 2018年4月査読有り筆頭著者責任著者
Keeping an eye on coloration: ecological correlates of the evolution of pitcher traits in the genus Nepenthes (Caryophyllales)

Kadeem J. Gilbert, Joel H. Nitta, Gerard Talavera, Naomi E. Pierce

BIOLOGICAL JOURNAL OF THE LINNEAN SOCIETY 123(2) 321-337 2018年2月査読有り
A plastid phylogeny and character evolution of the Old World fern genus Pyrrosia (Polypodiaceae) with the description of a new genus: Hovenkampia (Polypodiaceae)

Xin-Mao Zhou, Liang Zhang, Cheng-Wei Chen, Chun-Xiang Li, Yao-Moan Huang, De-Kui Chen, Ngan Thi Lu, Daniele Cicuzza, Ralf Knapp, Thien Tam Luong …

MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION 114 271-294 2017年9月査読有り

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講演・口頭発表等

37

11

Pteridophyte Phylogeny Group II and beyond: An updated, community-driven, and open classification for ferns and lycophytes

Joel H. Nitta, Carl J. Rothfels, Harald Schneider, Eric Schuettpelz

XX International Botanical Congress 2024年7月24日
琉球列島固有種を含む日本産ホラシノブ属の進化史の解明に向けて：倍数性解析による新知見

ニッタジョエル, 藤原泰央, 甲田龍太郎, Li-Yaung Kuo, 海老原淳

日本植物分類学会第２３回大会 2024年3月11日日本植物分類学会
17

無料プログラミングワークショップの翻訳を可能にするRパッケージdovetailの紹介

ニッタジョエル

Bio"Pack"athon 2024 #2 2024年2月18日
31

Pteridophyte Phylogeny Group II: The next generation of an open, community-driven classification for ferns and lycophytes

Joel H. Nitta

Plant Systematics: Present Status and Future Prospects 2024年2月16日 Department of Botany, University of Calicut, Kerala 招待有り
133

FTOLとPPG2:シダ植物の進化と分類の最先端

ニッタジョエル

シダ・ミュージアムつくばシダ展 2023年9月16日招待有り
18

分類学データを正確・速やかに管理するRパッケージ「dwctaxon」の紹介

ニッタジョエル, 岩崎渉

日本植物学会第87回大会 2023年9月4日
30

大規模かつ日々増加するデータを利用する系統解析ワークフローの開発

ニッタジョエル, 岩崎渉

日本進化学会第25回大会 2023年9月1日
16

The dwctaxon R package for editing and validating taxonomic data

Joel H. Nitta, Wataru Iwasaki

2023 Botanical Society of America Conference 2023年7月26日
40

シダ植物に関する新しいコミュニティ主導型分類体系

ニッタジョエル

日本植物分類学会第２２回大会 2023年3月3日日本植物分類学会
Introducing taxastand and dwctaxon, a pair of R packages for standardizing species names in Darwin Core format

Joel H. Nitta, Wataru Iwasaki

BioDigiCon 2022 2022年9月28日
The Open Fern Tree of Life: 常に最新の状態を保つ全シダ植物系統樹に向けて

ニッタジョエル, Eric Schuettpelz, 岩崎渉

日本植物学会第86回大会 2022年9月17日
The Open Fern Tree of Life: 常に最新の状態を保つ全シダ植物系統樹に向けて

ニッタジョエル, Eric Schuettpelz, Santiago Ramírez-Barahona, 岩崎渉

日本進化学会第２４回大会 2022年8月5日
Resolving species names rapidly and accurately with the “taxastand” R package

Joel H. Nitta, Wataru Iwasaki

2022 Botanical Society of America Conference 2022年7月26日
An Open and Continuously Updated Fern Tree of Life (FTOL)

Joel H. Nitta, Eric Schuettpelz, Santiago Ramírez-Barahona, Wataru Iwasaki

2022 Botanical Society of America Conference 2022年7月26日
An Open and Continuously Updated Fern Tree of Life (FTOL)

Joel H. Nitta, Eric Schuettpelz, Santiago Ramírez-Barahona, Wataru Iwasaki

30th Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology 2022年7月13日
DNA Barcoding of Fern Gametophytes: Past, Present, and Future

Joel H. Nitta

XVI Conference of the Indian Fern Society and International Symposium 2022年3月18日招待有り
シダ植物の群集形成および系統分類学的研究

新田ジョエル

日本植物分類学会第21回大会 2022年3月5日招待有り
64

種名の曖昧性を迅速・正確に解決するRパッケージ「taxastand」

ニッタジョエル, 岩崎渉

日本植物分類学会第21回大会 2022年3月5日
427

シダ植物コケシノブ科における世代間の生理生態学的特異化

ニッタジョエル, James E. Watkins, Jr., N. Michele Holbrook, Tristan W. Wang, Charles C. Davis

日本植物学会第85回大会 2021年9月18日
44

canaper: Categorical analysis of neo- and paleo-endemism in R

Joel H. Nitta

2021 Botanical Society of America Conference 2021年7月20日

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所属学協会

3

2017年9月 - 現在

日本植物学会
2017年3月 - 現在

日本植物分類学会
2015年7月 - 現在

American Society of Plant Taxonomists

共同研究・競争的資金等の研究課題

4

Evolutionary origins of endemic ferns on an island biodiversity hotspot

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究若手研究 2022年4月 - 2027年3月

ニッタジョエル
シダ植物系統グループ

国際共同研究 2022年1月

Joel H. Nitta, Eric Schuettpelz, Harald Schneider, Carl J. Rothfels
次世代シーケンサーを用いた倍数性シダ類複合体の進化史解明

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2016年11月 - 2019年3月

海老原淳, NITTA JOEL
Dissertation Research: Investigating the Role of a Cryptic Life Stage in Fern Evolution and Community Assembly

National Science Foundation Doctoral Dissertation Improvement Grant 2013年6月 - 2015年5月

Charles C. Davis, Joel H. Nitta

社会貢献活動

1

Git と Docker を使ってデータ解析の再現性を向上させる

講師, 運営参加・支援

ソフトウエア・カーペントリー千葉大学西千葉キャンパスアカデミック・リンク・センター（図書館）I棟「まなび」 2024年5月30日 - 2024年5月31日