Ｊ・Ｒ・ＨＴａｍｅ (J.R.H. Tame) - マイポータル

基本情報

所属: 横浜市立大学大学院理学部理学科生命医科学研究科生命医科学専攻

学位: Ph.D.(Medical Research Council分子生物学研究所)

J-GLOBAL ID: 200901087447723510
researchmap会員ID: 1000362687

外部リンク: http://www.tsurumi.yokohama-cu.ac.jp/pdl

私の研究はX線結晶学および他の生物物理学的技術によるたんぱく質構造の研究に関係する。私のグループは、金属のナノドットを作るなどのさまざまなバイオテクノロジー的用途のための人工タンパク質を設計しています。
タンパク質の熱力学とタンパク質-リガンドの親和性を制御する原因に長年関心を持もっている。

研究キーワード

研究分野

経歴

横浜市立大学国際総合科学部生命医科学コース生命医科学研究科生命医科学専攻, 教授

委員歴

1991年

BRITISH CRYSTALLOGRAPHIC ASSOCIATION, BCA

論文

Crystal and Cryo-EM structure of PPL, a novel hexameric R-type lectin from the poisonous mushroom Pleurocybella porrigens.

Daisuke Adachi, Naito Ishimoto, Kenji Mizutani, Katsuya Takahashi, Reiji Kubota, Haruka Kawabata, Sam-Yong Park, Laurens Vandebroek, Arnout R D Voet, Masao Yamada …

Glycobiology 2025年12月4日
Structural insights into Influenza A virus RNA polymerase PB1 binding to nuclear import host factor RanBP5

Tomomi Uchikubo-Kamo, Naito Ishimoto, Haruka Umezawa, Mikako Hirohama, Maasa Ono, Haruka Kawabata, Kenichi Kamata, Mio Ohki, Hisashi Yoshida, Jae-Hyun Park …

Biochemical and Biophysical Research Communications 150952-150952 2024年11月
Structural basis for hepatitis B virus restriction by a viral receptor homologue.

Kaho Shionoya, Jae-Hyun Park, Toru Ekimoto, Junko S Takeuchi, Junki Mifune, Takeshi Morita, Naito Ishimoto, Haruka Umezawa, Kenichiro Yamamoto, Chisa Kobayashi …

Nature communications 15(1) 9241-9241 2024年10月25日
The unique allosteric property of crocodilian haemoglobin elucidated by cryo-EM.

Katsuya Takahashi, Yongchan Lee, Angela Fago, Naim M Bautista, Jay F Storz, Akihiro Kawamoto, Genji Kurisu, Tomohiro Nishizawa, Jeremy R H Tame

Nature communications 15(1) 6505-6505 2024年8月2日
Structural basis for ligand recognition and signaling of hydroxy-carboxylic acid receptor 2.

Jae-Hyun Park, Kouki Kawakami, Naito Ishimoto, Tatsuya Ikuta, Mio Ohki, Toru Ekimoto, Mitsunori Ikeguchi, Dong-Sun Lee, Young-Ho Lee, Jeremy R H Tame …

Nature communications 14(1) 7150-7150 2023年11月6日
Structural basis of CXC chemokine receptor 1 ligand binding and activation.

Naito Ishimoto, Jae-Hyun Park, Kouki Kawakami, Michiko Tajiri, Kenji Mizutani, Satoko Akashi, Jeremy R H Tame, Asuka Inoue, Sam-Yong Park

Nature communications 14(1) 4107-4107 2023年7月11日
Structure of the human galanin receptor 2 bound to galanin and Gq reveals the basis of ligand specificity and how binding affects the G-protein interface.

Yunseok Heo, Naito Ishimoto, Ye-Eun Jeon, Ji-Hye Yun, Mio Ohki, Yuki Anraku, Mina Sasaki, Shunsuke Kita, Hideo Fukuhara, Tatsuya Ikuta …

PLoS biology 20(8) e3001714 2022年8月
Structural insights into the HBV receptor and bile acid transporter NTCP.

Jae-Hyun Park, Masashi Iwamoto, Ji-Hye Yun, Tomomi Uchikubo-Kamo, Donghwan Son, Zeyu Jin, Hisashi Yoshida, Mio Ohki, Naito Ishimoto, Kenji Mizutani …

Nature 2022年5月17日
Reverse Engineering Analysis of the High-Temperature Reversible Oligomerization and Amyloidogenicity of PSD95-PDZ3.

Sawaros Onchaiya, Tomonori Saotome, Kenji Mizutani, Jose C Martinez, Jeremy R H Tame, Shun-Ichi Kidokoro, Yutaka Kuroda

Molecules (Basel, Switzerland) 27(9) 2022年4月28日査読有り
Early-stage dynamics of chloride ion–pumping rhodopsin revealed by a femtosecond X-ray laser

Ji-Hye Yun, Xuanxuan Li, Jianing Yue, Jae-Hyun Park, Zeyu Jin, Chufeng Li, Hao Hu, Yingchen Shi, Suraj Pandey, Sergio Carbajo …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 118(13) 2021年3月30日
The symmetric designer protein Pizza as a scaffold for metal coordination.

Jeroen P M Vrancken, Hiroki Noguchi, Kam Y J Zhang, Jeremy R H Tame, Arnout R D Voet

Proteins 2021年3月12日
Shape and Size Complementarity-Induced Formation of Supramolecular Protein Assemblies with Metal-Oxo Clusters

Laurens Vandebroek, Hiroki Noguchi, Kenichi Kamata, Jeremy R. H. Tame, Luc Van Meervelt, Tatjana N. Parac-Vogt, Arnout R. D. Voet

Crystal Growth & Design 21(2) 1307-1313 2021年2月3日
Structural plasticity of a designer protein sheds light on β-propeller protein evolution.

Bram Mylemans, Ina Laier, Kenichi Kamata, Satoko Akashi, Hiroki Noguchi, Jeremy R H Tame, Arnout R D Voet

The FEBS journal 288(2) 530-545 2021年1月
The structure of SeviL, a GM1b/asialo-GM1 binding R-type lectin from the mussel Mytilisepta virgata.

Kenichi Kamata, Kenji Mizutani, Katsuya Takahashi, Roberta Marchetti, Alba Silipo, Christine Addy, Sam-Yong Park, Yuki Fujii, Hideaki Fujita, Tsuyoshi Konuma …

Scientific reports 10(1) 22102-22102 2020年12月16日
Influence of circular permutations on the structure and stability of a six-fold circular symmetric designer protein

Bram Mylemans, Hiroki Noguchi, Els Deridder, Eveline Lescrinier, Jeremy R. H. Tame, Arnout R. D. Voet

Protein Science 29(12) 2375-2386 2020年12月1日
A GM1b/asialo-GM1 oligosaccharide-binding R-type lectin from purplish bifurcate mussels Mytilisepta virgata and its effect on MAP kinases.

Yuki Fujii, Marco Gerdol, Sarkar M A Kawsar, Imtiaj Hasan, Francesca Spazzali, Tatsusada Yoshida, Yukiko Ogawa, Sultana Rajia, Kenichi Kamata, Yasuhiro Koide …

The FEBS journal 287(12) 2612-2630 2020年6月
Pumping mechanism of NM-R3, a light-driven bacterial chloride importer in the rhodopsin family

Ji-Hye Yun, Mio Ohki, Jae-Hyun Park, Naito Ishimoto, Ayana Sato-Tomita, Wonbin Lee, Zeyu Jin, Jeremy R. H. Tame, Naoya Shibayama, Sam-Yong Park …

Science Advances 6(6) eaay2042-eaay2042 2020年2月
Molecular assemblies built with the artificial protein Pizza

Jeroen P.M. Vrancken, Jana Aupič, Christine Addy, Roman Jerala, Jeremy R.H. Tame, Arnout R.D. Voet

Journal of Structural Biology: X 4 2020年1月1日
Hybrid assemblies of a symmetric designer protein and polyoxometalates with matching symmetry

Laurens Vandebroek, Hiroki Noguchi, Kenichi Kamata, Jeremy R. H. Tame, Luc Van Meervelt, Tatjana N. Parac-Vogt, Arnout R. D. Voet

Chemical Communications 2020年
Computational design of symmetrical eight-bladed β-propeller proteins.

Hiroki Noguchi, Christine Addy, David Simoncini, Staf Wouters, Bram Mylemans, Luc Van Meervelt, Thomas Schiex, Kam Y J Zhang, Jeremy R H Tame, Arnout R D Voet

IUCrJ 6(Pt 1) 46-55 2019年1月1日

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MISC

Development and applications of artificial symmetrical proteins

Jeroen P.M. Vrancken, Jeremy R.H. Tame, Arnout R.D. Voet

Computational and Structural Biotechnology Journal 18 3959-3968 2020年1月1日
Seeing the light with BLUF proteins

Sam-Yong Park, Jeremy R. H. Tame

Biophysical Reviews 9(2) 169-176 2017年4月1日
Structure of PB1-PB2 subunit interface of inflenza A virus RNA polymerase

Kanako Sugiyama, Eiji Obayashi, Atsushi Kawaguchi, Yukari Suzuki, Jeremy R. H. Tame, Kyosuke Nagata, Sam-Yong Park

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES 67 C411-C412 2011年
The structural basis for the essential PA-PB1 subunit interaction in influenza RNA polymerase

Hisashi Yoshida, Eiji Obayashi, Atsushi Kawaguchi, Kyosuke Nagata, Jeremy R. H. Tame, Sam-Yong Park

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES 67 C413-C413 2011年
Autotransporter passenger proteins: virulence factors with common structural themes

Kaoru Nishimura, Nami Tajima, Young-Ho Yoon, Sam-Yong Park, Jeremy R. H. Tame

JOURNAL OF MOLECULAR MEDICINE-JMM 88(5) 451-458 2010年5月
R-state haemoglobin with low oxygen affinity: Crystal structures of deoxy human and carbonmonoxy horse haemoglobin bound to the effector molecule L35

T Yokoyama, S Neya, A Tsuneshige, T Yonetani, SY Park, JRH Tame

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 356(3) 790-801 2006年2月
Crystal structures of unliganded and half-liganded human hemoglobin derivatives cross-linked between Lys 82 beta(1) and Lys 82 beta(2)

SY Park, N Shibayama, T Hiraki, JRH Tame

BIOCHEMISTRY 43(27) 8711-8717 2004年7月
Crystal structure of the GTP-binding protein Obg from Thermus thermophilus HB8

M Kukimoto-Niino, K Murayama, M Inoue, T Terada, JRH Tame, S Kuramitsu, M Shirouzu, S Yokoyama

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 337(3) 761-770 2004年3月
Direct observation of photolysis-induced tertiary structural changes in hemoglobin

S Adachi, SY Park, JRH Tame, Y Shiro, N Shibayama

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 100(12) 7039-7044 2003年6月
The dimerization interface of the metastasis-associated protein S100A4 (Mts1) - In vivo and in vitro studies

S Tarabykina, DJ Scott, P Herzyk, TJ Hill, JRH Tame, M Kriajevska, D Lafitte, PJ Derrick, GG Dodson, NJ Maitland …

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 276(26) 24212-24222 2001年6月
The dimerization interface of the metastasis-associated protein S100A4 (Mts1) - In vivo and in vitro studies

S Tarabykina, DJ Scott, P Herzyk, TJ Hill, JRH Tame, M Kriajevska, D Lafitte, PJ Derrick, GG Dodson, NJ Maitland …

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 276(26) 24212-24222 2001年6月
The functional similarity and structural diversity of human and cartilaginous fish hemoglobins

Y Naoi, KT Chong, K Yoshimatsu, G Miyazaki, JRH Tame, SY Park, S Adachi, H Morimoto

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 307(1) 259-270 2001年3月
Ab initio phasing of a 4189-atom protein structure at 1.2 angstrom resolution

JRH Tame

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 56 1554-1559 2000年12月
The structures of deoxy human haemoglobin and the mutant Hb Tyr alpha 42His at 120 K

JRH Tame, B Vallone

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 56 805-811 2000年7月
The structures of deoxy human haemoglobin and the mutant Hb Tyr alpha 42His at 120 K

JRH Tame, B Vallone

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION D-BIOLOGICAL CRYSTALLOGRAPHY 56(7) 805-811 2000年7月
Specificity and interactions of the protein OppA: Partitioning solvent binding effects using mass spectrometry

AA Rostom, JRH Tame, JE Ladbury, CV Robinson

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 296(1) 269-279 2000年2月
Ab initio phasing of a 4189 atom protein structurl at 1・2(]E88FD[) resolution

Acta Crystallographica Section D 56(12) 1554 2000年
What is the true structure of liganded haemoglobin?

JRH Tame

TRENDS IN BIOCHEMICAL SCIENCES 24(10) 372-377 1999年10月
Crystallographic and calorimetric analysis of peptide binding to OppA protein

SH Sleigh, PR Seavers, AJ Wilkinson, JE Ladbury, JRH Tame

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 291(2) 393-415 1999年8月
Crystallographic and calorimetric analysis of peptide binding to OppA protein

SH Sleigh, PR Seavers, AJ Wilkinson, JE Ladbury, JRH Tame

JOURNAL OF MOLECULAR BIOLOGY 291(2) 393-415 1999年8月

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書籍等出版物

Approaches To Entropy

J・R・H Tame

Springer 2019年8月

講演・口頭発表等

アデェニルシクラゼの光活性化

J・R・H Tame

Astbury Conversation 2018年4月16日招待有り
The Power of the Intangible

J・R・H Tame

the OpenEye CUP meeting in Santa Fe, the British Biophysical Society biennial meeting (Warwick), and the Oxygen Binding Proteins meeting (Sheffield) 2014年
Some thoughts on scoring functions

J・R・H Tame

Newcastle University 2012年
Some thoughts on scoring functions

J・R・H Tame

J-CUP II 2011年
Seminar

J・R・H Tame

Riken Wako Institute 2011年
Autotransporter proteins

J・R・H Tame

Nottingham University 2010年
Protein allostery

J・R・H Tame

Bari 2010年
Influenza RNA Polymerase

J・R・H Tame

Nottingham 2010年

所属学協会

BRITISH CRYSTALLOGRAPHIC ASSOCIATION

Works(作品等)

ERATO PROTONIC NANOMACHINE PROJECT

1999年 - 2001年

共同研究・競争的資金等の研究課題

改変レクチンの創製による自己免疫性神経疾患の糖鎖に着目した回復技術の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2024年4月 - 2027年3月

大関泰裕, 山田雅雄, 小川由起子, 鎌田健一, 宮西伸光, 藤井佑樹, J・R・H Tame
実験と計算科学の融合による任意の標的ガングリオシドに選択的な人工レクチンの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2023年4月 - 2027年3月

藤井佑樹, 小関準, 大関泰裕, 鎌田健一, J・R・H Tame, 川嵜達也
人工タンパク質デザインによる新機能の創出

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2016年4月 - 2019年3月

J・R・H Tame, 池上貴久
BAM 複合体による細胞膜タンパク質輸送機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2010年 - 2012年

ジェレミーテイム, 朴三用, 雲財悟
BAM 複合体による細胞膜タンパク質輸送機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2010年 - 2012年

ジェレミーテイム, 朴三用, 雲財悟
病原性細菌由来オートトランスポーターの分泌機構と高次構造相関

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2007年 - 2008年

JEREMY R.H.Tame, 朴三用, 雲財悟
タンパク質分子のナノスケール電子デバイスへの応用

科学技術振興機構国際的な科学技術共同研究などの推進/戦略的国際科学技術協力推進事業/SICP/イギリス 2006年 - 2008年

J・R・H Tame
ヘム結合プロテイン

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費 2004年 - 2006年

JEREMY R.H. Tame, TAME Jeremy・R・H, KINGSTON Isabel Jane
鉄イオン標的タンパク質(Fur)の機能と構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2002年 - 2003年

TAME J.R.H.
PROTEIN DESIGN
BACTERIAL FLAGELLAR MOTOR
HEME UPTAKE BY BACTERIA
HEMOGLOBIN EVOLUTION

Ｊ・Ｒ・ＨＴａｍｅ

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研究キーワード

研究分野

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委員歴

論文

MISC

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講演・口頭発表等

所属学協会

Works(作品等)

共同研究・競争的資金等の研究課題

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