坂本丞 (Joe Sakamoto) - マイポータル

基本情報

所属: 浜松医科大学医学部医学科薬理学講座助教

学位: 博士（理学）(2017年3月静岡大学創造科学技術大学院)

J-GLOBAL ID: 201701003630199700
researchmap会員ID: B000277935

外部リンク: https://www.hama-med.ac.jp/education/fac-med/dept/pharmacology/index.html

研究キーワード

研究分野

経歴

2026年4月 - 現在

浜松医科大学, 医学部医学科薬理学講座, 助教
2025年8月 - 2026年3月

大学共同利用機関法人自然科学研究機構生命創成探究センター, バイオフォトニクス研究グループ, 特任助教（併任）
2025年4月 - 2026年3月

大学共同利用機関法人自然科学研究機構生理学研究所, バイオフォトニクス研究部門, 特任助教
2022年5月 - 2025年3月

大学共同利用機関法人自然科学研究機構生命創成探究センター, バイオフォトニクス研究グループ, 特任研究員
2022年4月

基礎生物学研究所, 超階層生物学センターバイオイメージング解析室, 特任助教
2020年4月 - 2022年3月

大学共同利用機関法人自然科学研究機構基礎生物学研究所, 生命熱動態研究室, 特任助教
2017年5月 - 2020年3月

大学共同利用機関法人自然科学研究機構基礎生物学研究所, 生物機能解析センター光学解析室, NIBBリサーチフェロー
2017年4月 - 2018年3月

大学共同利用機関法人自然科学研究機構基礎生物学研究所, 生物機能解析センター光学解析室, 特別協力研究員

学歴

2014年4月 - 2017年3月

静岡大学創造科学技術大学院, 自然科学系教育部, バイオサイエンス専攻
2012年4月 - 2014年3月

静岡大学大学院, 理学研究科, 生物科学専攻
2008年4月 - 2012年3月

静岡大学, 理学部, 生物科学科

委員歴

2022年4月 - 現在

Biothermology研究会, コアメンバー

受賞

2022年5月

物質・デバイス共同研究賞, 生体内の細胞温度制御計測システムによる細胞の熱動態解析

亀井保博, Kai Lu, 和沢鉄一, 坂本丞, Cong Quang Vu, 中野雅裕, 小松崎民樹, 永井健治
2016年11月

平成28年度Zoological Science Award（藤井賞）, Molecular cloning of cDNA encoding an aquaglyceroporin, AQP-h9, in the Japanese tree frog, Hyla japonica: possible roles of AQP-h9 as a glycerol transporter in freeze tolerance, 日本動物学会

廣田敦司, 滝谷優, 坂本丞, 鈴木雅一, 田中滋康, 岡田令子
2014年2月

静岡大学大学院理学系研究科生物科学専攻「専攻長賞」, 硬骨魚類の内分泌腺に発現する転写因子およびクラスタリンに関する分子生物学的研究, 静岡大学大学院
2012年2月

静岡大学理学部生物科学科「学科長賞」, 硬骨魚類における甲状腺特異的因子の機能解析および魚類におけるクラスタリンの機能解析, 静岡大学

坂本丞

論文

Coupled amplitude-phase transport in heterogeneous optical media

Masaki Watabe, Joe Sakamoto, Hideaki Yoshimura, Tomomi Nemoto, Kazunari Kaizu

Physical Review A 2026年5月18日
Wavelength-tunable Depletion Expands Fluorophore Compatibility in Two-Photon STED Nanoscopy

Tomomi Nemoto, Joe Sakamoto, Hirokazu Ishii, Kohei Otomo, Yuichi Kozawa, Shunichi Sato, Hiroyuki Yokoyama

2026年4月24日
Heat‐Shock‐Inducible Gene Expression Systems in Amphibians: Utility in Regeneration and Metamorphosis Studies

Ayumi Yamato, Koga Fujita, Mana Yoshida, Chikato Yamamoto, Koudai Abe, Makoto Suzuki, Aiko Kawasumi‐Kita, Joe Sakamoto, Yasuhiro Kamei, Hajime Ogino …

Development, Growth & Differentiation 2026年2月
TAD boundary disruption in Xq27–q28 deletions rewires 3D chromatin architecture to drive primary skewed X chromosome inactivation

Kimiko Katoh, Hiroyo Nishide, Yu Hamaguchi, Minami Soga, Kaori Aiba, Kagayaki Kato, Motosuke Tsutsumi, Joe Sakamoto, Elena Solovieva, Tomomi Nemoto …

2026年
Optical turbulence retrieval of heterogeneous media

Masaki Watabe, Joe Sakamoto, Hideaki Yoshimura, Tomomi Nemoto, Kazunari Kaizu

arXiv 2025年6月16日筆頭著者
Amyloid-β-induced alteration of fast and localized calcium elevations in cultured astrocytes.

Kaito Nakata, Joe Sakamoto, Kohei Otomo, Masanao Sato, Hirokazu Ishii, Motosuke Tsutsumi, Ryosuke Enoki, Tomomi Nemoto

Scientific reports 15(1) 18944-18944 2025年5月29日
Excessive chondrogenesis in the blastema initiates during hypomorphic limb regeneration in Xenopus froglet, but not during patterned limb regeneration in Xenopus tadpoles and newts

Suzu Kobari, Hibiki Yokoyama, Kagayaki Kato, Rina Sato, Nana Kitagawa, Joe Sakamoto, Yasuhiro Kamei, Hitoshi Yokoyama

2025年4月2日
Transport-of-intensity phase imaging using commercially available confocal microscope

Naru Yoneda, Joe Sakamoto, Takumi Tomoi, Tomomi Nemoto, Yosuke Tamada, Osamu Matoba

Journal of Biomedical Optics 29(11) 2024年11月7日
Spatiotemporal control of transgene expression using an infrared laser in the crustacean Daphnia magna

Rina Shimizu, Joe Sakamoto, Nikko Adhitama, Mana Fujikawa, Pijar Religia, Yasuhiro Kamei, Hajime Watanabe, Yasuhiko Kato

Scientific Reports 14(25696) 2024年10月査読有り
Amyloid-β-induced Alteration of Fast and Localized Calcium Elevations in Cultured Astrocytes

Kaito Nakata, Joe Sakamoto, Kohei Otomo, Masanao Sato, Hirokazu Ishii, Motosuke Tsutsumi, Ryosuke Enoki, Tomomi Nemoto

2024年9月24日筆頭著者
Cold-induced suspension and resetting of Ca2+ and transcriptional rhythms in the suprachiasmatic nucleus neurons

Ryosuke Enoki, Naohiro Kon, Kimiko Shimizu, Kenta Kobayashi, Sota Hiro, Ching-Pu Chang, Tatsuto Nakane, Hirokazu Ishii, Joe Sakamoto, Yoshifumi Yamaguchi …

iScience 26(12) 108390-108390 2023年12月
Invention sharing is the mother of developmental biology (part 4)

Hajime Ogino, Yasuhiro Kamei, Toshinori Hayashi, Joe Sakamoto, Makoto Suzuki, Takeshi Igawa, Mariko Kondo, Masanori Taira

Development, Growth & Differentiation 65(6) 286-287 2023年8月23日
Automated contour extraction for light-sheet microscopy images of zebrafish embryos based on object edge detection algorithm

Akiko Kondow, Kiyoshi Ohnuma, Atsushi Taniguchi, Joe Sakamoto, Makoto Asashima, Kagayaki Kato, Yasuhiro Kamei, Shigenori Nonaka

Development, Growth and Differentiation 23 June 2023 2023年6月23日査読有り
The shh limb enhancer is activated in patterned limb regeneration but not in hypomorphic limb regeneration in Xenopus laevis.

Reimi Tada, Takuya Higashidate, Takanori Amano, Shoma Ishikawa, Chifuyu Yokoyama, Suzu Kobari, Saki Nara, Koshiro Ishida, Akane Kawaguchi, Haruki Ochi …

Developmental biology 2023年5月27日
Targeted single-cell gene induction by optimizing the dually regulated CRE/loxP system by a newly defined heat-shock promoter and the steroid hormone in Arabidopsis thaliana

Takumi Tomoi, Toshiaki Tameshige, Eriko Betsuyaku, Saki Hamada, Joe Sakamoto, Naoyuki Uchida, Keiko U Torii, Kentaro K Shimizu, Yosuke Tamada, Hiroko Urawa …

Frontiers in Plant Science in press 1171531-1171531 2023年5月査読有り
Intracellular Heat Transfer and Thermal Property Revealed by Kilohertz Temperature Imaging with a Genetically Encoded Nanothermometer

Kai Lu, Tetsuichi Wazawa, Joe Sakamoto, Cong Quang Vu, Masahiro Nakano, Yasuhiro Kamei, Takeharu Nagai

Nano Letters 2022年7月6日
Lattice-patterned collagen fibers and their dynamics in axolotl skin regeneration

Rena Kashimoto, Saya Furukawa, Sakiya Yamamoto, Yasuhiro Kamei, Joe Sakamoto, Shigenori Nonaka, Tomonobu M. Watanabe, Tatsuya Sakamoto, Hirotaka Sakamoto, Akira Satoh

iScience 25(7) 104524-104524 2022年6月
Temperature elevation detection in migrating cells

Takayuki Nakamura, Joe Sakamoto, Kohki Okabe, Atsushi Taniguchi, Takahiro G. Yamada, Shigenori Nonaka, Yasuhiro Kamei, Akira Funahashi, Makoto Tominaga, Noriko F. Hiroi

Optics Continuum 1(5) 1085-1085 2022年5月15日
Development of a screening system for agents that modulate taste receptor expression with the CRISPR-Cas9 system in medaka

Kana Beppu, Rie Tsutsumi, Satoshi Ansai, Nana Ochiai, Mai Terakawa, Marie Mori, Masashi Kuroda, Kazuki Horikawa, Takumi Tomoi, Joe Sakamoto …

Biochemical and Biophysical Research Communications 601 65-72 2022年4月
Application of infrared laser to living cells for manipulation of gene expression, and in vivo temperature measurement method

Yasuhiro Kamei, Takumi Tomoi, Joe Sakamoto, Suguru Ohe, Yosuke Tamada

Biomedical Imaging and Sensing Conference 2021 2021年10月27日

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MISC

共焦点顕微鏡下における強度輸送定量位相イメージングによる三次元位相再構成

米田成, 米田成, 坂本丞, 坂本丞, 友井拓実, 根本知己, 根本知己, 根本知己, 玉田洋介, 玉田洋介 …

応用物理学会学術講演会講演予稿集(CD-ROM) 72nd 2025年
Quantitative Phase Imaging Under Commercially Available Confocal Microscopy

Naru Yoneda, Joe Sakamoto, Takumi Tomoi, Tomomi Nemoto, Yosuke Tamada, Osamu Matoba

2025年
Author Correction: Infrared laser–induced gene expression in single cells characterized by quantitative imaging in Physcomitrium patens

Takumi Tomoi, Yuka Yoshida, Suguru Ohe, Yukiko Kabeya, Mitsuyasu Hasebe, Tomohiro Morohoshi, Takashi Murata, Joe Sakamoto, Yosuke Tamada, Yasuhiro Kamei

Communications Biology 2024年12月7日
カイコ核多角体ウイルスのポリヘドリンプロモーターを活性化するための遺伝子制御ネットワーク内の転写シグナルの解読

佐藤昌直, 中西登志紀, 斎田美佐子, 坂本丞, 浅野眞一郎, 亀井保博

蚕糸・昆虫機能利用学術講演会・日本蚕糸学会大会講演要旨集 94th 2024年
ヒメツリガネゴケにおける赤外レーザー照射による遺伝子発現誘導の単一細胞定量イメージング解析

友井拓実, 吉田優佳, 大江駿, 坂本丞, 亀井保博, 玉田洋介

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 87th 2023年
強度輸送方程式による波面計測と蛍光イメージングへの応用

坂本丞, 米田成, 的場修

バイオイメージング 32(2) 2023年
カイコ核多角体病ウイルス感染時のポリヘドリンプロモーター超活性化を駆動するp143を中心とした遺伝子制御ネットワークモデル

中西登志紀, 斎田美佐子, 坂本丞, 浅野眞一郎, 亀井保博, 佐藤昌直

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 46th 2023年
歯周病原細菌Porphyromonas gingivalis(Pg)投与したNASHモデルメダカの病態解析

下本歩, 黒柳美和, 吉浦康寿, 坂本丞, 亀井保博, 神谷重樹

日本栄養・食糧学会近畿支部大会講演要旨集 62nd 2023年
赤外レーザー照射による単一の植物細胞における遺伝子発現誘導法

友井拓実, 爲重才覚, 坂本丞, 立松圭, 玉田洋介, 別役重之, 亀井保博

Optics & Photonics Japan講演予稿集(CD-ROM) 2023 2023年
共焦点顕微鏡下における強度輸送方程式に基づく定量位相イメージング

米田成, 坂本丞, 友井拓実, 玉田洋介, 的場修

Optics & Photonics Japan講演予稿集(CD-ROM) 2023 2023年
ベクターを利用した細菌のメダカへの投与の検討

郷龍希, 彦坂悠衣, 亀井保博, 坂本丞, 安齋賢, 神谷重樹

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 46th 2023年
歯周病原細菌Porphyromonas gingivalis(Pg)投与によるNASHモデルメダカ病態への影響

下本歩, 黒柳美和, 吉浦康寿, 坂本丞, 亀井保博, 神谷重樹

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 46th 2023年
NASHメダカモデルにおけるマイクロプラスチック摂取が病態へ及ぼす影響の評価

岡部華子, 山本麻衣, 坂本丞, 亀井保博, 神谷重樹

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 46th 2023年
ヒメツリガネゴケにおける熱ショック応答を介した局所的遺伝子発現誘導に関する定量的解析

友井拓実, 吉田優佳, 大江駿, 坂本丞, 玉田洋介, 亀井保博

日本植物生理学会年会(Web) 63rd 2022年
骨粗しょう症モデルメダカの確立

彦坂悠衣, 安齋賢, 浅尾桃子, 青山智絵, 斎田美佐子, 坂本丞, 亀井保博, 神谷重樹

日本栄養・食糧学会大会講演要旨集 76th 2022年
異なる温度域に生息する生物の熱ショック応答温度の違いと熱ショック因子(HSF1)の関連

藤森千加, 坂本丞, 上川優子, 西村亮祐, 亀井保博

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 45th 2022年
光を用いたヒメツリガネゴケのゲノム操作法の確立に向けたカロテノイド生合成経路遺伝子の機能解析

沼田千鶴, 中村真菜, 友井拓実, 吉田優佳, 坂本丞, 亀井保博, 玉田洋介

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 86th 2022年
単一細胞レベルの局所加熱でキメラ根組織を自在に誘導するためのデータ駆動型アプローチ

友井拓実, 爲重才覚, 坂本丞, 立松圭, 別役重之, 亀井保博

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 86th 2022年
Invention sharing is the mother of developmental biology (Part 3).

Hajime Ogino, Yasuhiro Kamei, Toshinori Hayashi, Joe Sakamoto, Makoto Suzuki, Takeshi Igawa

Development, growth & differentiation 64(1) 4-4 2022年1月
Invention sharing is the mother of developmental biology

Hajime Ogino, Yasuhiro Kamei, Toshinori Hayashi, Joe Sakamoto, Makoto Suzuki, Takeshi Igawa

Development, Growth & Differentiation 63(8) 395-396 2021年10月

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書籍等出版物

正しい結果を得るためのイメージング&画像解析実践テキスト : あなたの目的にあった顕微鏡の選択と撮像、定量解析フローの組み立て

大友康平, 加藤輝, 亀井保博, 甲本信也, 小山宏史, 坂本丞, 谷口篤史, 堤基佐, 野中茂紀, 渡辺英治他 (担当:分担執筆)

羊土社 2024年5月 (ISBN: 9784758122719)
達人に訊くバイオ画像取得と定量解析Q&A : 顕微鏡の設定からImageJによる解析・自動化まで

加藤輝, 小山宏史, 亀井保博, 坂本丞, 谷口篤史, 野中茂紀, 村田隆

羊土社 2021年4月 (ISBN: 9784758122504)

講演・口頭発表等

温度イメージングによる生細胞内の熱物性計測と温度分布の再構築

坂本丞

一般社団法人レーザー学会学術講演会第44回年次大会 2024年1月19日招待有り
高速レシオメトリック温度イメージングによる生細胞の熱物性解析

坂本丞

日本分光学会 2022年度分光学会生細胞分光部会研究会 2023年3月16日招待有り
レシオ型蛍光タンパク質性温度プローブgTEMPの熱動態解析への応用

坂本丞

Biothermology Workshop 2020 2020年12月22日招待有り

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

深層学習と定量位相イメージングを統合したラベルフリーオルガネライメージングシステムの開発

自然科学研究機構先端光科学研究分野プロジェクト 2025年7月 - 2026年3月
細胞内ナノスケール温度分布の可視化に向けた二光子超解像顕微鏡法と定量位相イメージング法の統合

物質・デバイス共同研究拠点度基盤共同研究 2025年4月 - 2026年3月
定量位相イメージングによるラベルフリー温度計測系の確立

生命創成探究センター 2025年度ExCELLS若手奨励研究 2025年4月 - 2026年3月
生きた細胞や組織における散乱・揺らぎ計測と制御

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 学術変革領域研究(A) 2020年11月 - 2025年3月

玉田洋介, 松田厚志, 坂本丞
定量位相イメージングによる細胞内温度計測系の確立と細胞生物学への応用

生命創成探究センター 2024年度ExCELLS若手奨励研究 2024年4月 - 2025年3月
熱ショック転写因子HSF1の温度感知機構の比較生物学的解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究若手研究 2019年4月 - 2022年3月

坂本丞

社会貢献活動

第３回基礎から学ぶ顕微鏡光学系実習 OPT2023

講師, 助言・指導, 企画, 運営参加・支援

先端バイオイメージング支援プラットフォーム 2023年11月19日 - 2023年11月21日
基礎から学ぶ顕微鏡光学系実習OPT2022冬

司会, 講師, 助言・指導, 企画, 報告書執筆

先端バイオイメージング支援プラットフォーム 2022年12月19日 - 2022年12月21日
生物画像データ解析トレーニングコース 2022

助言・指導, 運営参加・支援

先端バイオイメージング支援プラットフォーム 2022年12月6日 - 2022年12月8日
2022年基礎から学ぶ顕微鏡光学系実習

司会, 講師, 助言・指導, 企画, 運営参加・支援, 実演, 報告書執筆

先端バイオイメージング支援プラットフォーム大学共同利用機関法人自然科学研究機構基礎生物学研究所 2022年3月2日 - 2022年3月4日
2021年度基礎から学ぶ顕微鏡光学系実習

講師, 助言・指導, 企画, 運営参加・支援, 報告書執筆

新学術領域研究・学術研究支援基盤形成「先端バイオイメージング支援プラットフォーム」 2021年7月12日 - 2021年7月14日
オンラインIMARIS実習2021

運営参加・支援

2021年6月22日 - 2021年6月24日
DIY Microscope Training Course 2021

助言・指導, 企画, 運営参加・支援, 報告書執筆

新学術領域研究・学術研究支援基盤形成「先端バイオイメージング支援プラットフォーム」 2021年2月8日 - 2021年2月12日
生物画像データ解析トレーニングコース

助言・指導, 企画, 運営参加・支援

自然科学研究機構・生命創成探究センターおよび基礎生物学研究所オンライン 2020年12月9日 - 2020年12月11日
第14回 NIBB Bioimaging Forum ～非光学的モダリティによる生物イメージングの新展開～

司会, 企画, 運営参加・支援, 報告書執筆

基礎生物学研究所光学解析室 2020年11月6日 - 2020年11月6日
生物画像データ解析トレーニングコース2019

助言・指導, 運営参加・支援

基礎生物学研究所 2019年12月10日 - 2019年12月12日
生物画像データ解析トレーニングコース

助言・指導

自然科学研究機構・生命創生探求センターおよび基礎生物学研究所基礎生物学研究所 2018年12月4日 - 2018年12月6日
The 10th NIBB International Practical Course "Genome Editing and Imaging of Fish and Amphibians "

助言・指導, 運営参加・支援

基礎生物学研究所 2018年9月20日 - 2018年9月29日
イベリアトゲイモリを用いた生命科学研究のためのトレーニングコース

助言・指導, 運営参加・支援

基礎生物学研究所 2018年8月27日 - 2018年8月31日

坂本丞

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

委員歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

社会貢献活動

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