鎌形清人 (Kiyoto Kamagata) - マイポータル

基本情報

所属: 岐阜大学工学部准教授

学位: 博士（理学）(東京大学理学系研究科物理学専攻)

研究者番号: 90432492
J-GLOBAL ID: 201801003473180470
researchmap会員ID: 7000022386

外部リンク: https://www.eng.gifu-u.ac.jp/seimei/staff/k-kamagata.html

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / 生物物理学 /

経歴

2024年4月 - 現在

岐阜大学, 工学部, 准教授
2018年10月 - 2024年3月

東北大学, 多元物質科学研究所, 准教授
2009年4月 - 2018年9月

東北大学多元物質科学研究所, 助教
2006年4月 - 2009年3月

大阪大学蛋白質研究所, 特任研究員
2005年4月 - 2006年3月

東京大学, 日本学術振興会特別研究員(PD)

受賞

2008年6月

若手奨励賞, 日本蛋白質科学会

鎌形清人

論文

Net charge driven recruitment of supercharged GFP mutants into FUS droplets.

Kiyoto Kamagata, Yuxing Hong, Trishit Banerjee, Hiroto Takahashi, Eriko Mano

Biochemical and biophysical research communications 759 151661-151661 2025年3月20日査読有り筆頭著者責任著者
Single-molecule microscopy reveals that importin α slides along DNA while transporting cargo molecules.

Trishit Banerjee, Kazuya Jibiki, Hinata Sugasawa, Saori Kanbayashi, Taiki Niikura, Eriko Mano, Shigeru Chaen, Takashi S Kodama, Satoshi Takahashi, Noriko Yasuhara …

Biochemical and biophysical research communications 748 151320-151320 2025年1月11日査読有り最終著者責任著者
Thermostable nucleoid protein Cren7 slides along DNA and rapidly dissociates from DNA while not inhibiting the sliding of other DNA-binding protein.

Trishit Banerjee, K Geethika, Saori Kanbayashi, Satoshi Takahashi, Soumit S Mandal, Kiyoto Kamagata

Journal of molecular biology 168803-168803 2024年9月24日査読有り最終著者責任著者
Single-molecule characterization of target search dynamics of DNA-binding proteins in DNA-condensed droplets.

Kiyoto Kamagata, Ryo Kusano, Saori Kanbayashi, Trishit Banerjee, Hiroto Takahashi

Nucleic acids research 51 6654-6667 2023年6月7日査読有り筆頭著者責任著者
Suppression of TDP-43 aggregation by artificial peptide binder targeting to its low complexity domain.

Kiyoto Kamagata, Saori Kanbayashi, Shuichi Koda, Akito Kadotani, Osamu Ubukata, Takumi Tashima

Biochemical and biophysical research communications 662 119-125 2023年4月20日査読有り筆頭著者責任著者
Rational design of phase separating peptides based on phase separating protein sequence of p53.

Kiyoto Kamagata, Atsumi Hando, Maulana Ariefai, Nanako Iwaki, Saori Kanbayashi, Ryotaro Koike, Keisuke Ikeda

Scientific reports 13(1) 5648-5648 2023年4月6日査読有り筆頭著者責任著者
Rational peptide design for regulating liquid-liquid phase separation on the basis of residue-residue contact energy.

Kiyoto Kamagata, Maulana Ariefai, Hiroto Takahashi, Atsumi Hando, Dwiky Rendra Graha Subekti, Keisuke Ikeda, Atsushi Hirano, Tomoshi Kameda

Scientific reports 12(1) 13718-13718 2022年8月12日査読有り筆頭著者責任著者
Giant Carbon Nano-Test Tubes as Versatile Imaging Vessels for High-Resolution and In Situ Observation of Proteins

Tracy T. Chuong, Toshihiko Ogura, Norihito Hiyoshi, Kazuma Takahashi, Sangho Lee, Keita Hiraga, Hiroki Iwase, Akira Yamaguchi, Kiyoto Kamagata, Eriko Mano …

ACS Applied Materials & Interfaces 14(23) 26507-26516 2022年6月15日
Structure-dependent recruitment and diffusion of guest proteins in liquid droplets of FUS.

Kiyoto Kamagata, Nanako Iwaki, Saori Kanbayashi, Trishit Banerjee, Rika Chiba, Virginie Gaudon, Bertrand Castaing, Seiji Sakomoto

Scientific reports 12(1) 7101-7101 2022年5月2日査読有り筆頭著者責任著者
Single-Molecule Microscopy Meets Molecular Dynamics Simulations for Characterizing the Molecular Action of Proteins on DNA and in Liquid Condensates

Kiyoto Kamagata

Frontiers in Molecular Biosciences 8(1139) 795367 2021年11月19日査読有り筆頭著者最終著者責任著者
Molecular principles of recruitment and dynamics of guest proteins in liquid droplets.

Kiyoto Kamagata, Nanako Iwaki, Milan Kumar Hazra, Saori Kanbayashi, Trishit Banerjee, Rika Chiba, Seiji Sakomoto, Virginie Gaudon, Bertrand Castaing, Hiroto Takahashi …

Scientific reports 11(1) 19323-19323 2021年9月29日査読有り筆頭著者責任著者
Testing mechanisms of DNA sliding by architectural DNA-binding proteins: dynamics of single wild-type and mutant protein molecules in vitro and in vivo.

Kiyoto Kamagata, Yuji Itoh, Cheng Tan, Eriko Mano, Yining Wu, Sridhar Mandali, Shoji Takada, Reid C Johnson

Nucleic acids research 49(15) 8642-8664 2021年8月5日査読有り筆頭著者責任著者
Engineering of the genome editing protein Cas9 to slide along DNA.

Trishit Banerjee, Hiroto Takahashi, Dwiky Rendra Graha Subekti, Kiyoto Kamagata

Scientific reports 11(1) 14165-14165 2021年7月8日査読有り最終著者責任著者
Characterization of design grammar of peptides for regulating liquid droplets and aggregates of FUS.

Kiyoto Kamagata, Rika Chiba, Ichiro Kawahata, Nanako Iwaki, Saori Kanbayashi, Kana Maeda, Hiroto Takahashi, Atsushi Hirano, Koji Fukunaga, Keisuke Ikeda …

Scientific reports 11(1) 6643-6643 2021年3月23日査読有り筆頭著者責任著者
The disordered DNA-binding domain of p53 is indispensable for forming an encounter complex to and jumping along DNA.

Dwiky Rendra Graha Subekti, Kiyoto Kamagata

Biochemical and biophysical research communications 534 21-26 2020年12月10日査読有り最終著者責任著者
The HMGB chromatin protein Nhp6A can bypass obstacles when traveling on DNA.

Kiyoto Kamagata, Kana Ouchi, Cheng Tan, Eriko Mano, Sridhar Mandali, Yining Wu, Shoji Takada, Satoshi Takahashi, Reid C Johnson

Nucleic acids research 48(19) 10820-10831 2020年11月4日査読有り筆頭著者責任著者
Dependence of DNA length on binding affinity between TrpR and trpO of DNA.

Nobuo Shimamoto, Mikito Toda, Shigetoshi Nara, Tamiki Komatsuzaki, Kiyoto Kamagata, Takashi Kinebuchi, Jun-Ichi Tomizawa

Scientific reports 10(1) 15624-15624 2020年9月24日査読有り
Transient binding and jumping dynamics of p53 along DNA revealed by sub-millisecond resolved single-molecule fluorescence tracking.

Dwiky Rendra Graha Subekti, Agato Murata, Yuji Itoh, Satoshi Takahashi, Kiyoto Kamagata

Scientific reports 10(1) 13697-13697 2020年8月13日査読有り最終著者責任著者
A synthetic ion channel with anisotropic ligand response.

Takahiro Muraoka, Daiki Noguchi, Rinshi S Kasai, Kohei Sato, Ryo Sasaki, Kazuhito V Tabata, Toru Ekimoto, Mitsunori Ikeguchi, Kiyoto Kamagata, Norihisa Hoshino …

Nature communications 11(1) 2924-2924 2020年6月10日査読有り
How p53 Molecules Solve the Target DNA Search Problem: A Review.

Kiyoto Kamagata, Yuji Itoh, Dwiky Rendra Graha Subekti

International journal of molecular sciences 21(3) 1031 2020年2月4日査読有り招待有り筆頭著者責任著者

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MISC

非ドメイン型タンパク質の相分離を制御するバインダーペプチドと相分離ペプチドの合理的設計

鎌形清人

Medical Science Digest 49 481-484 2023年8月査読有り招待有り筆頭著者責任著者
相分離液滴へのゲストタンパク質の取り込みと運動性の解析 —p53やFUSをモデルとして—

鎌形清人

生化学 95(3) 330-335 2023年6月査読有り招待有り筆頭著者責任著者
疾患関連相分離タンパク質をターゲットとしたペプチドバインダーの設計

鎌形清人

日薬理誌 157(6) 392-395 2022年招待有り筆頭著者責任著者
DNA結合タンパク質研究の最前線 –がん抑制タンパク質p53の動態-

鎌形清人

BIO Clinica 36 2021年4月招待有り筆頭著者最終著者責任著者
DNA結合タンパク質研究の最前線

鎌形清人

Precision Medicine 3(6) 547-553 2020年6月招待有り筆頭著者責任著者
がん抑制タンパク質p53はどのように標的DNA配列探索問題を解いているのか？

鎌形清人, 伊藤優志, Subekti Dwiky Rendra Graha

日本物理学会誌 74(7) 472-475 2019年7月査読有り招待有り
生物物理学的アプローチによるがん抑制タンパク質p53のDNA認識・結合機構の解明

鎌形清人, 伊藤優志

生化学 89(4) 533-537 2017年8月査読有り招待有り
DNA結合蛋白質p53のスライディング探索の単分子蛍光観察

村田崇人, 伊藤優志, 鎌形清人

生物物理 56(2) 109-111 2016年4月査読有り招待有り
新規一分子蛍光観察法によるタンパク質の構造変化の可視化折り畳み研究への応用

鎌形清人

化学と生物 51(1) 22-27 2013年1月招待有り
新技術によるタンパク質研究の新展開

鎌形清人

生物物理 52(2) 104-105 2012年3月25日
新規一分子蛍光観測法による蛋白質の折り畳みの自由エネルギー地形の探索

鎌形清人, 川口敏史, 馬場昭典, 三本木至宏, 小松崎民樹, 高橋聡

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 12th 2012年
STARING AT A PROTEIN: ENSEMBLE AND SINGLE-MOLECULE INVESTIGATIONS ON PROTEIN-FOLDING DYNAMICS

Satoshi Takahashi, Kiyoto Kamagata

SINGLE-MOLECULE BIOPHYSICS: EXPERIMENT AND THEORY, VOL 146 146 3-22 2012年査読有り
生物物理と高分子科学の接点一分子蛍光観察法を用いたタンパク質フォールディングの解明

小井川浩之, 鎌形清人, 高橋聡

高分子 60(11) 801-803-820 2011年11月招待有り
地域と世界に貢献する東北大学多元物質科学研究所タンパク質ダイナミクスからみた生命現象

高橋聡, 鎌形清人

Mater Integr 24(4/5) 33-37 2011年6月1日
新しいタンパク質科学の可能性新時代を切り拓くマルチタレントDavid Baker

鎌形清人, 高橋聡

化学 66(1) 68-69 2011年1月招待有り
1分子測定によるタンパク質の折りたたみ研究の展開

鎌形清人, 木下雅仁, 高橋聡

生物物理 49(6) 282-286 2009年12月査読有り招待有り
蛋白質を基板から解き放つ--蛋白質の折り畳み運動の解明を目指した--分子観察法の開発 (特集生命機能を解き明かす最新計測技術)

高橋聡, 鎌形清人

バイオインダストリー 26(2) 7-14 2009年2月
「一分子測定法による蛋白質の折り畳み研究の展開」

鎌形清人, 木下雅仁, 高橋聡

生物物理 2009年
タンパク質のフォールディング速度と構造パラメータとの相関解析

鎌形清人, 鎌形清人, 桑島邦博

生物物理 46(3) 144-149 2006年査読有り招待有り
Equilibrium and kinetically observed molten globule states (review)

Protein Folding Handbook 852-879 2005年6月査読有り招待有り

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書籍等出版物

P53 - A Guardian of the Genome and Beyond "A Study of p53 Action on DNA at the Single Molecule Level"

Kiyoto Kamagata

IntechOpen 2021年3月査読有り
相分離生物学の全貌 26章「がん抑制タンパク質p53の液ー液相分離」

鎌形清人

東京化学同人 2020年11月 (ISBN: 9784807913466)
揺らぎ・ダイナミクスと生体機能 : 物理化学的視点から見た生体分子 4.1, 4.2章「一分子計測」

小井川浩之、鎌形清人、高橋聡

化学同人 2013年9月 (ISBN: 9784759815108)

講演・口頭発表等

タンパク質の液滴を測り、操り、創る

鎌形清人

第６回生命科学科セミナー（日本大学） 2025年2月21日招待有り
タンパク質液滴を測り、操り、創る

鎌形清人

新領域開拓課題「一分子の科学」合同合宿セミナー 2024年10月9日招待有り
Watching, Manipulating, and Creating Protein Droplets

Kiyoto Kamagata

The 8th LLPS Symposium/ The Biophysical Society of Japan Joint Seminar 2024年9月25日招待有り
Liquid-liquid phase separation of tumor suppressor p53

Kiyoto Kamagata

第83回日本癌学会学術総会 2024年9月21日招待有り
がん抑制タンパク質p53の液－液相分離に関する生物物理学的研究

鎌形清人

第32回日本Cell Death学会学術集会 2024年7月20日招待有り
Elucidating fusion dynamics of FUS protein droplets using fluorescence microscopy and optical tweezers

Syamil M A Husna, Atsumi Hando, Saori Kanbayashi, Kiyoto Kamagata

IUPAB 2024 2024年6月27日
Characterization, regulation, and design of protein droplets

Kiyoto Kamagata, Ryo Kusano, Atsumi Hando, Nanako Iwaki, Maulana Ariefai, Keisuke Ikeda, Tomoshi Kameda

IUPAB 2024 2024年6月27日
Exploring the design rules for artificial phase-separating peptides based on natural phase-separating protein sequences

Joe Mori, Atsumi Hando, Satoshi Takahashi, Keisuke Ikeda, Kiyoto Kamagata

IUPAB 2024 2024年6月26日
タンパク質液滴を測り、操り、創る

鎌形清人

第10回分子サイバネティクス・第54回分子ロボティクス定例研究会 2024年6月1日招待有り
DNA液滴中でのDNA結合タンパク質の標的探索運動の単分子解析

鎌形清人

第46回日本分子生物学会年会 2023年12月7日招待有り
DNA液滴でのDNA結合タンパク質の単分子解析および相分離ペプチドの合理的設計

鎌形清人

第61回日本生物物理学会年会 2023年11月15日招待有り
Design of phase separating peptide and peptide-based regulation of phase separation of drug-target disordered proteins.

Kamagata K

2nd International Conference on Polymer Science and Engineering (Polymers-2023) 2023年11月1日招待有り
蛋白質液滴を測り、操り、創る

鎌形清人

CSJ化学フェスタ 2023年10月18日招待有り
相分離タンパク凝集体をほぐす分子モーターシステムの設計と課題

鎌形清人

第12回分子モーター討論会 2023年9月28日招待有り
天然変性タンパク質を標的としたペプチドバインダーの合理的設計

鎌形清人

第7回タタバイオ分子クラブ 2022年11月21日招待有り
がん疾患関連タンパク質p53の液-液相分離と人工ペプチドによる制御

鎌形清人

2022年度日本分光学会NMR分光部会集中講義 2022年10月18日招待有り
液–液相分離会合体の分子取り込みと並進拡散運動に関する分子文法解析

鎌形清人

第60回日本生物物理学会年会 2022年9月28日招待有り
疾患関連相分離タンパク質を標的としたペプチドバインダーの設計法の開発

第73回日本薬理学会北部会 2022年9月18日招待有り
液-液相分離会合体の分子取り込みと並進拡散運動に関する分子文法解析

鎌形清人

第6回LLPS研究会 2022年6月25日招待有り
液-液相分離会合体の分子取り込みと並進拡散運動に関する分子文法解析

鎌形清人, 岩城奈々子, Yaakov Levy

第22回蛋白質科学会年会 2022年6月8日

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所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

液滴から疾患凝集体への転移を防ぐタンパク質の網羅的探索

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2025年4月 - 2028年3月

鎌形清人
タンパク異常凝集を防ぐ人工相分離タンパク質の設計と実験的検証

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2025年4月 - 2027年3月

鎌形清人
液滴形成を制御する非ドメイン型タンパク質の探索と液滴内単分子機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2024年4月 - 2026年3月

鎌形清人
液－液相分離を制御する非ドメイン型タンパク質の探索と単分子機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 学術変革領域研究(A) 2022年6月 - 2024年3月

鎌形清人
相分離タンパク凝集体をほぐす人工タンパク質の合理的設計

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2021年4月 - 2023年3月

鎌形清人
DNA上を動く！速くて正確なゲノム編集タンパク質の合理的設計

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

鎌形清人
DNAのハイパーモバイル水制御によるp53の非特異結合定数と1次元拡散への効果

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2019年4月 - 2022年3月

鈴木誠, 鎌形清人, 最上譲二
DNA結合蛋白質の機能解析のためのマイクロ秒時分割単分子計測技術の創出

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2016年4月 - 2019年3月

鎌形清人, 高橋聡
弱い相互作用を持つたんぱく質の新規デザイン

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2016年4月 - 2019年3月

笠原浩太, 鎌形清人, 丹羽達也
DNA整列固定技術を用いたDNA結合蛋白質の網羅的単分子機能解析（国際共同研究強化）

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金（国際共同研究強化）国際共同研究加速基金（国際共同研究強化） 2017年 - 2019年

鎌形清人
DNA整列固定技術を用いたDNA結合蛋白質の網羅的単分子機能解析

日本学術振興会科学研究費補助金(国際共同研究加速基金（国際共同研究強化）） 2017年 - 2019年

鎌形清人
高度化した一分子蛍光計測によるタンパク質の構造形成運動の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2013年6月 - 2018年3月

高橋聡, 鎌形清人, 小井川浩之, 間野絵梨子
DNA結合蛋白質の機能解析のためのマイクロ秒時分割単分子計測技術の創出

文部科学省科学研究費補助金(基盤研究(C)) 2016年 - 2018年

鎌形清人
蛋白質の構造変化を自在に操作する技術の創出‐トランスポーターへの応用‐

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2015年4月 - 2017年3月

鎌形清人
ハイブリッド光検出器を使った高速度一分子蛍光観察法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2014年4月 - 2016年3月

高橋聡, 鎌形清人
新規単分子蛍光観察法によるがん抑制因子p53のDNA探索機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 若手研究(B) 2014年4月 - 2016年3月

鎌形清人, 杉山弘, 遠藤政幸
蛋白質の構造変化を自在に操作する技術の創出‐トランスポーターへの応用‐

文部科学省科学研究費補助金(新学術領域研究(研究領域提案型)) 2015年 - 2016年

鎌形清人
天然変性タンパク質ｐ５３の一分子構造・構造揺らぎ解析法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2012年4月 - 2014年3月

鎌形清人
一分子蛍光観察用ライトガイド型フローセルの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2011年 - 2012年

高橋聡, 鎌形清人
変性タンパク質の動的多様構造の新規解析法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2010年 - 2011年

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