石森浩一郎 (Koichiro Ishimori) - マイポータル

基本情報

所属: 北海道大学大学院理学研究院化学部門物理化学分野教授

学位: 工学博士(京都大学)

ORCID ID: https://orcid.org/0000-0002-5868-0462
J-GLOBAL ID: 200901006051594815
researchmap会員ID: 1000027916

外部リンク: http://barato.sci.hokudai.ac.jp/~stchem/

研究キーワード

研究分野

経歴

2006年 - 現在

北海道大学大学院理学研究院, 教授
2011年4月 - 2021年3月

大阪大学蛋白質研究所, 共同研究員
2017年

京都大学理学部, 非常勤講師
2012年

山口大学農学部, 非常勤講師
2009年 - 2011年

大阪大学蛋白質研究所, 客員フェロー
2011年

奈良先端科学技術大学, 非常勤講師
2010年

鳥取大学工学部, 非常勤講師
2008年 - 2009年

奈良女子大学生活環境学部, 非常勤講師
2005年 - 2007年

京都大学大学院工学研究科, 非常勤講師
2005年 - 2006年

兵庫県立大学大学院生命理学研究科, 非常勤講師
2005年 - 2006年

自然科学研究機構分子科学研究所, 客員教授
2005年 - 2006年

北海道大学大学院理学研究科, 教授
2005年 - 2006年

Visiting Professor,Institute of Molecular Sceince
2005年 - 2006年

Professor,Graduate School of Science, Hokkaido University
2004年 - 2005年

自然科学研究機構分子科学研究所, 客員助教授
1995年 - 2005年

京都大学大学院工学研究科, 助教授
1989年 - 1995年

京都大学工学部, 助手
1993年 - 1994年

米国ウィスコンシン大学マジソン校, 文部省在外研究員
1987年 - 1989年

日本学術振興会, 特別研究員

学歴

1986年3月 - 1989年4月

京都大学, 工学研究科, 分子工学専攻博士後期課程
1984年4月 - 1986年3月

京都大学, 工学研究科, 分子工学専攻修士課程
1980年4月 - 1984年3月

京都大学, 工学部, 石油化学科

委員歴

2013年 - 現在

Journal of Inorganic Biochemistry, Editorial Board
2012年 - 現在

Biophysics and Physicobiology, Editorial Board
2009年 - 現在

生体高分子学会, 編集委員
2005年 - 現在

日本生化学会, 評議員
2011年 - 2013年

日本学術振興会, 科学研究費審査委員
2011年 - 2013年

日本生物物理学会, 北海道支部長
2010年 - 2012年

日本化学会, 北海道支部幹事
2009年 - 2011年

学術振興会, 特別研究員審査委員
2004年 - 2007年

日本生物物理学会, 運営委員・副会長

論文

239

Heat-Induced Conformational Transition Mechanism of Heat Shock Factor 1 Investigated by Tryptophan Probe

Soichiro Kawagoe, Munehiro Kumashiro, Takuya Mabuchi, Hiroyuki Kumeta, Koichiro Ishimori, Tomohide Saio

Biochemistry 2022年12月9日
Metal Sensing by a Glycine–Histidine Repeat Sequence Regulates the Heme Degradation Activity of PM0042 from Pasteurella multocida

Takeshi Uchida, Kazuki Ota, Akinobu Tatsumi, Syota Takeuchi, Koichiro Ishimori

Inorganic Chemistry 2022年8月12日査読有り
Heme binding to cold shock protein D, CspD, from Vibrio cholerae

Dayeon Nam, Wataru Motegi, Koichiro Ishimori, Takeshi Uchida

Biochemical and Biophysical Research Communications 2022年7月査読有り
Structural and Kinetic Views of Molecular Chaperones in Multidomain Protein Folding.

Soichiro Kawagoe, Koichiro Ishimori, Tomohide Saio

International journal of molecular sciences 23(5) 2022年2月24日査読有り
Converting cytochrome c into a DyP-like metalloenzyme

Issei Omura, Koichiro Ishimori, Takeshi Uchida

Dalton Transactions 51(33) 12641-12649 2022年査読有り
Regulation of the expression of the nickel uptake system in Vibrio cholerae by iron and heme via Fur

Kazuyoshi Muranishi, Koichiro Ishimori, Takeshi Uchida

Journal of Inorganic Biochemistry 111713-111713 2022年1月査読有り
Oxidative phase transition of heat shock factor-1

Soichiro Kawagoe, Motonori Matsusaki, Koichiro Ishimori, Tomohide Saio

2021年12月3日
C9orf72-derived arginine-rich poly-dipeptides impede phase modifiers

Hitoki Nanaura, Honoka Kawamukai, Ayano Fujiwara, Takeru Uehara, Yuichiro Aiba, Mari Nakanishi, Tomo Shiota, Masaki Hibino, Pattama Wiriyasermkul, Sotaro Kikuchi …

Nature Communications 12(1) 2021年12月査読有り
Functional cooperativity between the trigger factor chaperone and the ClpXP proteolytic complex

Kamran Rizzolo, Angela Yeou Hsiung Yu, Adedeji Ologbenla, Sa Rang Kim, Haojie Zhu, Koichiro Ishimori, Guillaume Thibault, Elisa Leung, Yi Wen Zhang, Mona Teng …

Nature Communications 12(1) 281-281 2021年12月査読有り
Zinc-Dependent Oligomerization of Thermus thermophilus Trigger Factor Chaperone

Haojie Zhu, Motonori Matsusaki, Taiga Sugawara, Koichiro Ishimori, Tomohide Saio

Biology 10(11) 1106-1106 2021年10月26日査読有り責任著者
Conformational ensemble of a multidomain protein explored by Gd³⁺ electron paramagnetic resonance

Tomohide Saio, Soya Hiramatsu, Mizue Asada, Hiroshi Nakagawa, Kazumi Shimizu, Hiroyuki Kumeta, Toshikazu Nakamura, Koichiro Ishimori

Biophysical Journal 120(15) 2943-2951 2021年8月3日査読有り最終著者
Radical transfer but not heme distal residues is essential for pH dependence of dye-decolorizing activity of peroxidase from Vibrio cholerae

Takeshi Uchida, Issei Omura, Sayaka Umetsu, Koichiro Ishimori

Journal of Inorganic Biochemistry 219 2021年6月
Author Correction: Functional cooperativity between the trigger factor chaperone and the ClpXP proteolytic complex.

Kamran Rizzolo, Angela Yeou Hsiung Yu, Adedeji Ologbenla, Sa Rang Kim, Haojie Zhu, Koichiro Ishimori, Guillaume Thibault, Elisa Leung, Yi Wen Zhang, Mona Teng …

Nature communications 12(1) 2753-2753 2021年5月6日
Mechanistic insights into heme-mediated transcriptional regulation via a bacterial manganese-binding iron regulator, iron response regulator (Irr)

Dayeon Nam, Yuki Matsumoto, Takeshi Uchida, Mark R. O'Brian, Koichiro Ishimori

The Journal of biological chemistry 295(32) 11316-11325 2020年8月7日査読有り責任著者
Spectroscopic Characterization of Halorhodopsin Reconstituted into Nanodisks Using Native Lipids.

Ayumi Yamamoto, Takashi Tsukamoto, Kenshiro Suzuki, Eri Hashimoto, Yoshihiro Kobashigawa, Kousuke Shibasaki, Takeshi Uchida, Fuyuhiko Inagaki, Makoto Demura, Koichiro Ishimori

Biophysical journal 118(11) 2853-2865 2020年4月29日査読有り責任著者
Osmotic pressure effects identify dehydration upon cytochrome c-cytochrome c oxidase complex formation contributing to a specific electron pathway formation

Wataru Sato, Seiji Hitaoka, Takeshi Uchida, Kyoko Shinzawa-Itoh, Kazunari Yoshizawa, Shinya Yoshikawa, Koichiro Ishimori

Biochemical Journal 477(8) 1565-1578 2020年4月査読有り責任著者
Biophysical research in Hokkaido University, Japan.

Tomoyasu Aizawa, Makoto Demura, Kazutoshi Gohara, Hisashi Haga, Koichiro Ishimori, Masataka Kinjo, Tamiki Komatsuzaki, Katsumi Maenaka, Min Yao

Biophysical reviews 12(2) 233-236 2020年4月査読有り
A single mutation converts Alr5027 from cyanobacteria Nostoc sp. PCC 7120 to a heme-binding protein with heme-degrading ability

Nobuhiko Dojun, Kazuyoshi Muranishi, Koichiro Ishimori, Takeshi Uchida

Journal of Inorganic Biochemistry 203 110916 2020年2月査読有り
Accelerating structural life science by paramagnetic lanthanide probe methods

Tomohide Saio, Koichiro Ishimori

Biochimica et Biophysica Acta - General Subjects 1864(2) 2020年2月査読有り
Integrated bio-metal science: New frontiers of bio-metal science opened with cutting-edge techniques

Hitomi Sawai, Koichiro Ishimori

Biophysics and Physicobiology 17 94-97 2020年

もっとみる

MISC

タンパク質折り畳みにおけるプロリン cis/trans異性化を調節するトリガー因子シャペロンの構造ダイナミクス

KAWAGOE Soichiro, KAWAGOE Soichiro, NAKAGAWA Hiroshi, KUMETA Hiroyuki, ISHIMORI Koichiro, SAIO Tomohide

電子スピンサイエンス学会年会講演要旨集 60th (CD-ROM) 2021年
電子伝達タンパク質シトクロムcを用いた難分解性色素分解酵素の設計

大村翼世, 石森浩一郎, 内田毅

生体分子科学討論会講演要旨集 47th 2021年
難分解性色素を分解可能なシトクロムcの設計と創製

大村翼世, 石森浩一郎, 内田毅

酸化反応討論会講演要旨集 53rd 2020年
筋萎縮性側索硬化症原因タンパク質Fused in sarcoma(FUS)における液-液相分離制御機構の解明

川向ほの香, 齋尾智英, 石森浩一郎

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 43rd 2020年
NMRおよびMDシミュレーションを用いた遷移状態での構造解析により調べたPPIアーゼシャペロンの触媒機構

KAWAGOE Soichiro, SAIO Tomohide, NAKAGAWA Hiroshi, KUMETA Hiroyuki, ISHIMORI Koichiro

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 20th (Web) 2020年
溶液中蛋白質構造解析のための常磁性金属イオンの解明

SAIO Tomohide, ISHIMORI Koichiro

生物物理(Web) 60(Supplement 1-2) 2020年
毒性反復ペプチドによるFUS液-液相分離の調節不全への機構的洞察

KAWAMUKAI Honoka, SAIO Tomohide, ISHIMORI Koichiro

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 20th (Web) 2020年
コレラ菌由来DyP型ペルオキシダーゼ(VcDyP)の色素分解反応の機構解明と至適pHの変換

大村翼世, 石森浩一郎, 内田毅

酸化反応討論会講演要旨集 52nd 2019年
ランタノイドイオンを用いたマルチドメインタンパク質MurDの構造分布解析

斉尾智英, 平松蒼野, 浅田瑞枝, 瀧下俊平, 中川洋, 中村敏和, 石森浩一郎

日本細胞生物学会大会(Web) 71st 2019年
タンパク質フォールディングにおける分子シャペロンの機能とメカニズム:立体構造と速度論からのアプローチ

斉尾智英, 石森浩一郎

日本生化学会大会(Web) 92nd 2019年
蛋白質巻き戻しにおけるトリガー因子とClpXシャペロンの協調作用の構造的基礎

ZHU Haojie, SAIO Tomohide, HOURY WalidA, ISHIMORI Koichiro

Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 58th (CD-ROM) 2019年
重金属イオンを利用したマルチドメインタンパク質におけるドメイン間距離の測定

川向ほの香, 瀧下俊平, 齋尾智英, 齋尾智英, 石森浩一郎, 石森浩一郎

日本生化学会大会(Web) 92nd 2019年
最適pHの変換による染料脱色ペルオキシダーゼ(DyP)の活性制御【JST・京大機械翻訳】

大村翼世, 石森浩一郎, 内田毅

金属の関与する生体関連反応シンポジウム講演要旨集 28th (Web) 2018年
パルスEPRとGd³⁺を用いたマルチドメイン蛋白質MurDの立体構造変化の解析

平松蒼野, 齋尾智英, 浅田瑞枝, 瀧下俊平, 中村敏和, 石森浩一郎

電子スピンサイエンス学会年会講演要旨集 57th 2018年
Complex Network Approach for Characterization of Protein Secondary Structure

Shohei Konno, Takao Namiki, Koichiro Ishimori

Chem-Bio Informatics Society(CBI) Annual Meeting 2017 Abstracts Abstracts P05-02 2017年10月査読有り
マルチドメインタンパク質における構造アンサンブルと各構造の存在比の解析

瀧下俊平, 齋尾智英, 齋尾智英, 齋尾智英, 平松蒼野, 久米田博之, 久米田博之, 清水和美, 石森浩一郎, 石森浩一郎

Abstracts. Annual Meeting of the NMR Society of Japan 56th 2017年
パルスEPRとGd³⁺を用いたマルチドメイン蛋白質MurDの構造変化解析

平松蒼野, 齋尾智英, 齋尾智英, 浅田瑞枝, 瀧下俊平, 中村敏和, 石森浩一郎

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 17th 2017年
ヘム生合成制御因子Irrにおけるヘムによる標的DNAへの結合制御機構

南多娟, 内田毅, 齋尾智英, O’BRIAN Mark R., 石森浩一郎

日本生化学会大会(Web) 90th 2017年
ヘムを制御分子とする細胞内鉄濃度制御機構の構造化学的解明

小倉麻梨子, 齋尾智英, 内田毅, 田中秀明, 田中秀明, 栗栖源嗣, 栗栖源嗣, 岩井一宏, 石森浩一郎

日本蛋白質科学会年会プログラム・要旨集 17th 2017年
Amorphous Aggregation of Cytochrome C with Inherently low Amyloidogenicity is Characterized by the Metastability of Supersaturation and the Phase Diagram

Yuxi Lin, Jozsef Kardos, Koichiro Ishimori, Yuji Goto, Young-Ho Lee

BIOPHYSICAL JOURNAL 110(3) 399A-399A 2016年2月

もっとみる

書籍等出版物

タンパク質科学

化学同人 2005年
Protein Science

Kagaku Dojin 2005年

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

生命金属動態を制御するシグナル伝達の分子機構

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2019年6月 - 2024年3月

石森浩一郎
「生命金属科学」分野の創成による生体内金属動態の統合的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2019年6月 - 2024年3月

津本浩平, 石森浩一郎, 小椋康光, 古川良明, 青野重利, 城宜嗣, 高野順平, 神戸大朋
ナノディスクを用いた膜結合金属蛋白質の集積配列による活性制御

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2019年6月 - 2021年3月

石森浩一郎, 内田毅
細胞場夾雑系における圧力効果を用いた蛋白質の物理化学的特性解析法の確立と応用

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2018年4月 - 2020年3月

石森浩一郎
ミトコンドリア呼吸鎖における電子伝達複合体の動的構造解析と電子伝達制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2016年4月 - 2019年3月

石森浩一郎, 内田毅, 齋尾智英
複合化活性部位を有する金属酸化酵素における感応性化学種の制御とその設計

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2015年4月 - 2017年3月

石森浩一郎
水素原子レベルの時分割解析による呼吸鎖末端酸化酵素のプロトンポンプ機構の研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2014年4月 - 2017年3月

吉川信也, 石森浩一郎, 館野賢, 新澤伊藤, 久保稔, 玉田太郎, 御前智則
ナノディスクを利用したミトコンドリア呼吸鎖における電子伝達機構の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2013年4月 - 2016年3月

石森浩一郎, 内田毅, 齋尾智英
ヘムをシグナリング分子とする情報伝達システムの構造化学的基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2013年4月 - 2015年3月

石森浩一郎
活性部位の複合化による感応性化学種の制御を利用した酸化酵素の設計と創製

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2013年4月 - 2015年3月

石森浩一郎
サブユニット特異的部分同位体ラベル化による巨大膜蛋白質の構造解析

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2013年4月 - 2015年3月

石森浩一郎, 内田毅
ヘムをシグナリング分子とする情報伝達システムの構造化学的基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2011年4月 - 2013年3月

石森浩一郎
新規ヘム標的タンパク質ＨＳＰ２７の細胞防御制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2011年 - 2013年

加部泰明, 石森浩一郎
セグメントラベルと先端的NMR手法を駆使した高分子量蛋白質複合体の相互作用解析

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2011年 - 2012年

石森浩一郎, 内田毅
ヘムをシグナル伝達分子として機能する蛋白質制御系の構造化学的基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2009年 - 2011年

石森浩一郎, 内田毅
高圧下蛍光分光システムによる蛋白質の構造的揺らぎの定量的解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2009年 - 2010年

石森浩一郎
電子伝達蛋白質複合体の構造化学的解明とその会合・解離の分子機構

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2008年 - 2009年

石森浩一郎, 内田毅
高圧分光法を用いた蛋白質における構造的揺らぎの解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2007年 - 2007年

石森浩一郎, 内田毅, 竹内浩
ヘム依存性転写制御複合体の構造と機能

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2006年 - 2007年

石森浩一郎, 内田毅
圧力を用いた分子体積プロファイル解析による蛋白質立体構造形成過程での水分子の寄与

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2006年 - 2007年

石森浩一郎, 内田毅

もっとみる

石森浩一郎

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

委員歴

論文

MISC

書籍等出版物

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

メニュー

共著者の一覧