久米慶太郎 (Keitaro KUME) - マイポータル

基本情報

所属: 筑波大学医学医療系助教

学位: 修士（理学）(2015年3月筑波大学)
修士（工学）(2017年3月筑波大学)
博士（理学）(2019年3月筑波大学)

J-GLOBAL ID: 201901020168304311
researchmap会員ID: B000357879

研究キーワード

研究分野

学歴

2013年4月 - 2019年3月

筑波大学, 生命環境科学研究科, 生物科学専攻
2015年4月 - 2017年3月

筑波大学, システム情報工学研究科, コンピュータサイエンス専攻

論文

Toward a Patient-Centered Care Supporting System: Integration of Multidisciplinary Health Records in Breast Cancer Care

Sugiyama, Atsuko, Utsunomiya, Kazuki, Okumiya, Hayato, Fujimoto, Katsuhiko, Shimomura, Yuka, Sanuki, Masaru, Kume, Keitaro, Yano, Takahiro, Kagawa, Rina, Bando, Hiroko

Studies in health technology and informatics 316 1719-1723 2024年8月
Integrated Electronic Health Record of Multidisciplinary Professionals Throughout the Cancer Care Pathway: A Pilot Study Exploring Patient-Centered Information in Breast Cancer Patients

Sugiyama, Atsuko, Okumiya, Hayato, Fujimoto, Katsuhiko, Utsunomiya, Kazuki, Shimomura, Yuka, Sanuki, Masaru, Kume, Keitaro, Yano, Takahiro, Kagawa, Rina, Bando, Hiroko

JOURNAL OF MULTIDISCIPLINARY HEALTHCARE 17 2069-2081 2024年4月
Transcriptome data sets of free-living diplomonads, Treponema sp, and Hexamita sp.

Kume, Keitaro, Tsubasa, Gen, Kazuki, Abe, Hiroshi, Komatsuzaki, Euki, Yazaki, Goro, Tanifuji, Ryoma, Kamikawa, Inagaki, Yuji, Hashimoto, Tetsuo

MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS 12(11) e0050623-e0050623 2023年11月査読有り責任著者
AtLASS: A scheme for end-to-end prediction of splice sites using attention-based bi-LSTM.

Harada, Ryo, Kume, Keitaro, Horie, Kazumasa, Nakayama, Takuro, Inagaki, Yuji, Amagasa, Toshiyuki

IPSJ Transactions on Bioinformatics 16 20-27 2023年7月査読有り
Hospital-level Variation of the Cardiac Rehabilitation after Myocardial Infarction in Japan during Fiscal Years 2014?2015 using the National Database

Sun, Yu, Jun, Komiyama, Takehiro, Sugiyama, Masao, Iwagami, Miho, Ishimaru, Hiroki, Matsui, Keitaro, Kume, Masaru, Sanuki, Teruyuki, Koyama, Genta, Kato …

Circulation reports 5(5) 177-186 2023年4月査読有り
Association between types of home healthcare and emergency house calls, hospitalization, and end-of-life care in Japan

Sun, Yu, Iwagami, Masao, Komiyama, Jun, Sugiyama, Takehiro, Inokuchi, Ryota, Sakata, Nobuo, Ito, Tomoko, Yoshie, Satoru, Matsui, Hiroki, Kume, Keitaro …

Journal of the American Geriatrics Society 71(6) 1795-1805 2023年2月
Draft genome sequence of Aduncisulcus paluster, a free-living microaerophilic eukaryote belonging to Fornicata.

Ikuko, Yuyama, Kume, Keitaro, Tamura, Takumi, Inagaki, Yuji, Hashimoto, Tetsuo

Microbiology Resource Announcements 12(2) e0053922 2023年2月査読有り筆頭著者責任著者
The Effect of Home Care Support Clinics on Hospital Readmission in Heart Failure Patients in Japan

Sun, Yu, Iwagami, Masao, Komiyama, Jun, Sugiyama, Takehiro, Inokuchi, Ryota, Sakata, Nobuo, Ito, Tomoko, Yoshie, Satoru, Matsui, Hiroki, Kume, Keitaro …

Journal of general internal medicine 38(9) 2156-2163 2023年1月
Genome evolution of a nonparasitic secondary heterotroph, the diatom

Kamikawa, Ryoma, Mochizuki, Takako, Sakamoto, Mika, Tanizawa, Yasuhiro, Nakayama, Takuro, Onuma, Ryo, Cenci, Ugo, Moog, Daniel, Speak, Samuel, Sarkozi, Krisztina …

Science advances 8(17) eabi5075 2022年4月29日査読有り
Medical expenditures for fragility hip fracture in Japan: a study using the nationwide health insurance claims database

Mori, Takahiro, Komiyama, Jun, Fujii, Tomoko, Sanuki, Masaru, Kume, Keitaro, Kato, Genta, Mori, Yukiko, Ueshima, Hiroaki, Matsui, Hiroki, Tamiya, Nanako …

Archives of osteoporosis 17(1) 61 2022年4月11日
Progress in understanding the phylogeny of the Plasmodium vivax lineage

Arisue, Nobuko, Honma, Hajime, Kume, Keitaro, Hashimoto, Tetsuo

PARASITOLOGY INTERNATIONAL 87 102507-102507 2022年4月査読有り
The closest relative of Archaeplastida is revealed by phylogenomic analyses that include Microheliella maris.

Yazaki, Euki, Yabuki, Akinori, Imaizumi, Ayaka, Kume, Keitaro, Hashimoto, Tetsuo, Inagaki, Yuji

Open Biology 12(4) 210376-210376 2022年4月査読有り
Phylogenomics invokes the clade housing Cryptista, Archaeplastida, and Microheliella maris.

Yazaki, Euki, Yabuki, Akinori, Imaizumi, Ayaka, Kume, Keitaro, Hashimoto, Tetsuo, Inagaki, Yuji

bioRχiv 2021年8月
Barthelonids represent a deep-branching metamonad clade with mitochondrion-related organelles predicted to generate no ATP

Euki, Yazaki, Kume, Keitaro, Takashi, Shiratori, Yana, Eglit, Goro, Tanifuji, Ryo, Harada, Alastair, Simpson, Ken-ichiro, Ishida, Tetsuo, Hashimoto, Inagaki, Yuji

Proceedings of the Royal Society B 287(1934) 20201538-20201538 2020年9月査読有り
Mitochondrial genomes of Hemiarma marina and Leucocryptos marina revised the evolution of cytochrome c maturation in Cryptista.

Yuki, Nishimura, Keitaro, Kume, Keito, Sonehara, Goro, Tanifuji, Takashi, Shiratori, Ken-ichiro, Ishida, Tetsuo, Hashimoto, Inagaki, Yuji, Moriya, Ohkuma

Frontiers in Ecology and Evolution 8 140 2020年5月査読有り筆頭著者
Barthelonids represent a deep-branching Matamonada clade with mitochondrion-related organelles generating no ATP.

Euki, Yazaki, Kume, Keitaro, Takashi, Shiratori, Yana, Edli, Goro, Tanifuji, Ryo, Harada, Alastair, Simpson, Ken-ichiro, Ishida, Tetsuo, Hashimoto, Inagaki, Yuji

bioRχiv 2019年10月査読有り
Apicoplast phylogeny reveals the position of Plasmodium vivax basal to the Asian primate malaria parasite clade

Arisue, Nobuko, Hashimoto, Tetsuo, Kawai, Satoru, Honma, Hajime, Kume, Keitaro, Horii, Toshihiro

Scientific Reports 9(1) 7274 2019年5月査読有り
NommPred: Prediction of Mitochondrial and Mitochondrion-Related Organelle Proteins of Nonmodel Organisms

Kume, Keitaro, Amagasa, Toshiyuki, Hashimoto, Tetsuo, Kitagawa, Hiroyuki

EVOLUTIONARY BIOINFORMATICS 14 2018年12月査読有り筆頭著者
The draft genome of Kipferlia bialata reveals reductive genome evolution in fornicate parasites

Goro Tanifuji, Shun Takabayashi, Keitaro Kume, Mizue Takagi, Takuro Nakayama, Ryoma Kamikawa, Yuji Inagaki, Tetsuo Hashimoto

PLoS ONE 13(3) e0194487 2018年3月1日査読有り
Organelles that illuminate the origins of Trichomonas hydrogenosomes and Giardia mitosomes

Michelle M. Leger, Martin Kolisko, Ryoma Kamikawa, Courtney W. Stairs, Keitaro Kume, Ivan Cepicka, Jeffrey D. Silberman, Jan O. Andersson, Feifei Xu, Akinori Yabuki …

NATURE ECOLOGY & EVOLUTION 1(4) 0092 2017年4月査読有り

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MISC

機械学習を用いた非モデル生物におけるミトコンドリア及び関連オルガネラタンパク質の予測手法 (ニューロコンピューティング)

久米慶太郎, 天笠俊之, 橋本哲男, 北川博之

電子情報通信学会技術研究報告 = IEICE technical report : 信学技報 116(120) 139-144 2016年7月4日
Fornicata生物のミトコンドリア関連オルガネラタンパク質におけるmatrix targeting signal

久米慶太郎, 高林舜, 森田幸之介, 神川龍馬, 稲垣祐司, 橋本哲男

第15回進化学会 2014年8月
フォルニカータ生物群におけるミトコンドリア関連オルガネラ標的シグナルの分子進化

久米慶太郎, 高林舜, 森田幸之介, 神川龍馬, 稲垣祐司, 橋本哲男

第83回日本寄生虫学会 2014年3月

講演・口頭発表等

Toward a Patient-Centered Care Supporting System: Integration of Multidisciplinary Health Records in Breast Cancer Care

Sugiyama, Atsuko, Utsunomiya, Kazuki, Okumiya, Hayato, Fujimoto, Katsuhiko, Shimomura, Yuka, Sanuki, Masaru, Kume, Keitaro, Yano, Takahiro, Kagawa, Rina, Bando, Hiroko

34th Medical Informatics Europe Conference (MIE2024)
ディプロモナス類の寄生虫化に伴う遺伝子レパートリーの変化：近縁自由生活種とのオルソログ比較解析

久米, 慶太郎, 若島, 朋幸, 厳, 翼, 岩本, 亮介, 井上, 貴史, 谷藤, 吾朗, 神川, 龍馬, 稲垣, 祐司, 橋本, 哲男

第93回日本寄生虫学会大会
Giardia intestinalis とその自由生活性近縁種におけるAcetyl-CoA Synthetase (ACS) の比較解析

小金丸, 利隆, 田村, 嘉孝, 星, 康貴, 久米, 慶太郎, 橋本, 哲男, 奈良, 武司

第93回日本寄生虫学会大会
Association between types of home healthcare and emergency house calls, hospitalization, and end of-life care: A nationwide study in Japan

孫, 瑜, 岩上将夫, 小宮山潤, 杉山雄大, 井口, 竜太, 佐方信夫, 伊藤智子, 吉江悟, 松井宏樹, 久米慶太郎, 讃岐勝, 加藤源太, 森由希子, 植嶋大晃, 田宮, 菜奈子

WONCA Sydney World Conference
AtLASS: A Scheme for end-to-end prediction of splice sites using attention-based bi-LSTM.

原田亮, 久米慶太郎, 堀江和正, 中山卓郎, 稲垣, 祐司, 天笠俊之

第74回バイオ情報学(SIGBIO)研究会
寄生性の祖先から自由生活性に転じたディプロモナス類における自由生活関連タンパク質の探

厳翼, 久米慶太郎, 阿部一貴, 矢﨑裕規, 小松崎洋志, 谷藤吾朗, 神川龍馬, 稲垣, 祐司, 橋本哲男

第92回寄生虫学会大会
全国レセプトデータを用いた在宅療養支援診療所の心不全再入院に対する予防効果の検討

孫, 瑜, 岩上将夫, 小宮山潤, 杉山雄大, 井口竜太, 佐方信夫, 伊藤智子, 吉江悟, 讃岐勝, 久米慶太郎, 松居宏樹, 植嶋大晃, 森由希子, 加藤源太, 田宮菜奈子

第81回日本公衆衛生学会総会
全国レセプトデータを用いた在宅療養支援診療所の心不全再入院に対する予防

孫瑜, 岩上将夫, 小宮山潤, 杉山, 雄大, 井口竜太, 佐方信夫, 伊藤智子, 吉江悟, 讃岐勝, 久米慶太郎, 松居宏樹, 植嶋大晃, 加藤源太, 森由希子, 田宮菜奈子

第81回日本公衆衛生学会 2022年10月7日
Microheriella maris units Archaeplastida and Cryptista in phylogenomics.

Euki, Yazaki, Akinori, Yabuki, Ayaka, Imaizumi, Keitaro, Kume, Tetsuo, Hashimoto, Inagaki, Yuji

Asian Congress of Protistology IV 2021年11月19日
エンドヘレア太陽虫Microheliella marisの系統的位置とミトコンドリアゲノム．

矢吹彬憲, 矢﨑裕規, 今泉彩香, 白鳥峻志, 久米慶太郎, 橋本哲男, 稲垣, 祐司

日本藻類学会第44回大会 2020年3月26日
エンドヘレア太陽虫Microheliella marisの系統的位置とミトコンドリアゲノム．

矢吹彬憲, 矢﨑裕規, 今泉彩香, 白鳥峻志, 久米慶太郎, 橋本哲男, 稲垣, 祐司

日本藻類学会第44回大会 2020年3月19日
フィロジェノミック解析により推測されたMicroheliella marisの系統的位置．

矢﨑裕規, 今泉彩香, 久米慶太郎, 白鳥峻志, 橋本哲男, 矢吹彬憲, 石田健一郎, 稲垣, 祐司

第3回日本共生学会大会 2019年11月19日
有孔虫Ammonia beccariiのミトコンドリアに局在するDNA分子群．

石谷佳之, 久米慶太郎, 稲垣, 祐司

第3回日本共生生物学会 2019年11月19日
Mitochondrial genome of strain SRT308: insights into structure and gene content fo the ancestral euglenozoan mitochondrial genome.

Yazaki, Euki, Shiratori, Takashi, Kume, Keitaro, Hashimoto, Tetsuo, Ishida, Ken-ichiro, Inagaki, Yuji

ISEP XXII 2018年5月27日
ユーグレノゾア基部から分岐する新奇原生生物のミトコンドリアゲノム.

矢崎裕規, 白鳥峻志, 久米慶太郎, 橋本哲男, 石田健一郎, Inagaki, Yuji

第50回日本原生生物学会・第1回日本共生生物学会合同大会 2017年11月17日
A heterolobosean strain SRT213 and its mitochondrion-related organelle.

Yazaki, Euki, Shiratori, Takashi, Kume, Keitaro, Hashimoto, Tetsuo, Ishida, Ken-ichiro, Inagaki, Yuji

ICOP2017 2017年7月31日
The draft genome of Kipferlia bialata reveals that the gain of function contributes the massive reductive evolution in Metamonada.

Goro, Tanifuji, Sun, Takabayashi, Keitaro, Kume, Mizue, Takagi, Inagaki, Yuji, Tetsuo, Hashimoto

Protis-2016 Moscow Forum 2016年6月6日
機械学習を用いた非モデル生物におけるミトコンドリア及び関連オルガネラタンパク質の予測手法

久米慶太郎, 天笠俊之, 橋本, 哲男, 北川, 博之

情報処理学会研究報告バイオ情報学研究会 2016年6月情報処理学会
フォルニカータ生物群の基部から分岐する新奇嫌気性生物PAP020株のミトコンドリア様オルガネラの代謝機能の推測

矢崎裕規, 白鳥峻志, 久米慶太郎, 橋本哲男, 石田健一郎, 稲垣, 祐司

第85回日本寄生虫学会 2016年3月19日
Prediction and comparison of the metabolism of mitochondrion-related organelles in free-living fornicate organisms.

Keitaro, Kume, Shun, Takabayashi, Ryoma, Kamikawa, Goro, Tanifuji, Inagaki, Yuji, Tetsuo, Hashimoto

2nd International Symposium on Matryoshka-type Evolution of Eukaryotic Cells 2015年9月30日

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所属学協会

2016年7月 - 現在

情報処理学会
2013年12月 - 現在

日本寄生虫学会
2013年8月 - 現在

日本進化学会

共同研究・競争的資金等の研究課題

寄生虫の多様なミトコンドリア輸送シグナルを予測する深層学習AIの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2023年 - 2025年

久米慶太郎
真核生物における嫌気的ATP合成経路の多様性と進化

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2022年 - 2025年

橋本哲男
フォルニカータ生物群におけるミトコンドリア関連オルガネラの機能進化の解明

日本学術振興会科研費国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2019年 - 2023年

橋本哲男
医療・介護等データベース利用のボトルネック解消を目的とした人工データベースの開発

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2019年8月 - 2021年3月

久米慶太郎

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