阿部一啓 (Kazuhiro Abe) - マイポータル

基本情報

所属: 北海道大学大学院理学研究院化学部門教授

学位: 博士（理学）(北海道大学)

研究者番号: 60596188
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0003-2681-5921
J-GLOBAL ID: 201201078597497949
researchmap会員ID: 7000003008

外部リンク: http://www.cespi.nagoya-u.ac.jp/index.html

研究キーワード

研究分野

経歴

2024年4月 - 現在

北海道大学, 大学院理学研究院化学部門, 教授
2016年1月 - 2024年4月

名古屋大学, 細胞生理学研究センター基礎生物学研究部門, 准教授
2012年4月 - 現在

名古屋大学, 大学院創薬科学研究科基盤創薬学専攻創薬分子構造学, 准教授
2012年4月 - 2015年12月

名古屋大学, 細胞生理学研究センター基礎生物学研究部門, 助教
2011年4月 - 2012年3月

京都大学特定研究員
2008年4月 - 2011年3月

社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム
2005年4月 - 2008年3月

日本学術振興会特別研究員 (PD)
2004年4月 - 2005年3月

日本学術振興会特別研究員 (PD)
2003年4月 - 2004年3月

日本学術振興会特別研究員 (DC2)

学歴

受賞

2013年9月

日本生化学会奨励賞, 日本生化学会
2011年12月

若手奨励賞, 生体エネルギー研究会
2011年10月

JBC Herbert Tabor Award, ASBMB
2008年8月

Margrethe Moller Award, P-ATPase conference
2004年8月

FASEB SRC Young Scientist Award, FASEB

主要な論文

Structural Basis for Binding of Potassium-Competitive Acid Blockers to the Gastric Proton Pump.

Saki Tanaka, Mikio Morita, Tatsuya Yamagishi, Hridya Valia Madapally, Kenichi Hayashida, Himanshu Khandelia, Christoph Gerle, Hideki Shigematsu, Atsunori Oshima, Kazuhiro Abe

Journal of medicinal chemistry 65(11) 7843-7853 2022年5月23日
Gastric proton pump with two occluded K+ engineered with sodium pump-mimetic mutations.

Kazuhiro Abe, Kenta Yamamoto, Katsumasa Irie, Tomohiro Nishizawa, Atsunori Oshima

Nature communications 12(1) 5709-5709 2021年9月29日
Transport Cycle of Plasma Membrane Flippase ATP11C by Cryo-EM

Hanayo Nakanishi, Tomohiro Nishizawa, Katsumori Segawa, Osamu Nureki, Yoshinori Fujiyoshi, Shigekazu Nagata, Kazuhiro Abe

Cell Reports 32(13) 108208-108208 2020年9月査読有り
A single K+-binding site in the crystal structure of the gastric proton pump

Yamamoto Kenta, Dubey Vikas, Irie Katsumasa, Nakanishi Hanayo, Khandelia Himanshu, Fujiyoshi Yoshinori, Abe Kazuhiro

ELIFE 8 2019年8月22日
Crystal structures of the gastric proton pump.

Kazuhiro Abe, Katsumasa Irie, Hanayo Nakanishi, Hiroshi Suzuki, Yoshinori Fujiyoshi

Nature 556(7700) 214-218 2018年4月
Cryo-EM structure of gastric H+,K+-ATPase with a single occupied cation-binding site

Kazuhiro Abe, Kazutoshi Tani, Thomas Friedrich, Yoshinori Fujiyoshi

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 109(45) 18401-18406 2012年11月査読有り
Conformational rearrangement of gastric H+,K+-ATPase induced by an acid suppressant

Kazuhiro Abe, Kazutoshi Tani, Yoshinori Fujiyoshi

NATURE COMMUNICATIONS 2(155) 1-9 2011年1月
E2P State Stabilization by the N-terminal Tail of the H,K-ATPase beta-Subunit Is Critical for Efficient Proton Pumping under in Vivo Conditions

Katharina L. Duerr, Kazuhiro Abe, Neslihan N. Tavraz, Thomas Friedrich

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 284(30) 20147-20154 2009年7月
Inter-subunit interaction of gastric H+,K+-ATPase prevents reverse reaction of the transport cycle.

Abe, K, Tani, K, Nishizawa, T, Fujiyoshi, Y

EMBO Journal 28 1637-1643 2009年

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MISC

『細胞死を司るポンプ』脂質フリッパーゼATP11Cの結晶構造とCryo-EM構造

中西華代, 西澤知宏, 瀬川勝盛, 濡木理, 藤吉好則, 長田重一, 阿部一啓, 阿部一啓

日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集 46th 2020年
胃H⁺,K⁺-ATPase E2P状態におけるK⁺結合化学量論を決定する因子の構造研究

山本健太, 入江克雅, 藤吉好則, 阿部一啓, 山本健太, 入江克雅, 藤吉好則, 阿部一啓

日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集 45th 2019年
K+ binding and proton redistribution in the E2P state of the H+, K+-ATPase

Dubey Vikas, Han Minwoo, Kopec Wojciech, Solov'yov Ilia A, Abe Kazuhiro, Khandelia Himanshu

SCIENTIFIC REPORTS 8 2018年8月24日
Crystal structures of the gastric proton pump.

Kazuhiro Abe, Katsumasa Irie, Hanayo Nakanishi, Hiroshi Suzuki, Yoshinori Fujiyoshi

Nature 556(7700) 214-218 2018年4月
The Elusive Proton in the Gastric Proton Potassium ATPase

Dubey Vikas, Abe Kazuhiro, Solov'yov Ilia, Khandelia Himanshu

BIOPHYSICAL JOURNAL 114(3) 146A-146A 2018年2月2日
胃プロトンポンプH⁺,K⁺-ATPaseのK⁺結合構造解析

山本健太, 山本健太, 入江克雅, 入江克雅, 藤吉好則, 藤吉好則, 阿部一啓, 阿部一啓

日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集 44th 2018年
胃プロトンポンプH⁺,K⁺-ATPaseのK⁺結合構造解析

山本健太, 山本健太, 入江克雅, 入江克雅, 藤吉好則, 藤吉好則, 阿部一啓, 阿部一啓

日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集 44th 2018年
The cryo-EM structure of gastric H+, K+-ATPase with bound BYK99, a high-affinity member of K+-competitive, imidazo[1,2-a]pyridine inhibitors

Kazuhiro Abe, Jun Shimokawa, Mao Naito, Keith Munson, Olga Vagin, George Sachs, Hiroshi Suzuki, Kazutoshi Tani, Yoshinori Fujiyoshi

SCIENTIFIC REPORTS 7 6632 2017年7月査読有り
The cryo-EM structure of gastric H+, K+-ATPase with bound BYK99, a high-affinity member of K+-competitive, imidazo[1,2-a]pyridine inhibitors

Kazuhiro Abe, Jun Shimokawa, Mao Naito, Keith Munson, Olga Vagin, George Sachs, Hiroshi Suzuki, Kazutoshi Tani, Yoshinori Fujiyoshi

SCIENTIFIC REPORTS 7 2017年7月
胃プロトンポンプの2.8Å分解能結晶構造解析

阿部一啓, 阿部一啓, 阿部一啓, 入江克雅, 入江克雅, 中西華代, 中西華代, 藤吉好則, 藤吉好則

日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集 43rd 2017年
Cryo-electron microscopy for structure analyses of membrane proteins in the lipid bilayer

Kazuhiro Abe, Yoshinori Fujiyoshi

Current Opinion in Structural Biology 39 71-78 2016年8月1日査読有り招待有り
Systematic Comparison of Molecular Conformations of H+,K+-ATPase Reveals an Important Contribution of the A-M2 Linker for the Luminal Gating

Abe, Kazuhiro, Tani, Kazutoshi, Fujiyoshi, Yoshinori

Journal of Biological Chemistry 289(44) 30590-30601 2014年9月17日査読有り
Biochemical and electron crystallographic studies of gastric proton pump

Kazuhiro Abe

Seikagaku 86(4) 429-440 2014年招待有り
Carbon sandwich preparation preserves quality of two-dimensional crystals for cryo-electron microscopy

Fan Yang, Kazuhiro Abe, Kazutoshi Tani, Yoshinori Fujiyoshi

MICROSCOPY 62(6) 597-606 2013年12月査読有り
The four-transmembrane protein IP39 of Euglena forms strands by a trimeric unit repeat

Hiroshi Suzuki, Yasuyuki Ito, Yuji Yamazaki, Katsuhiko Mineta, Masami Uji, Kazuhiro Abe, Kazutoshi Tani, Yoshinori Fujiyoshi, Sachiko Tsukita

NATURE COMMUNICATIONS 4 1766 2013年4月査読有り
Cryo-EM structure of gastric H+,K+-ATPase with a single occupied cation-binding site

Kazuhiro Abe, Kazutoshi Tani, Thomas Friedrich, Yoshinori Fujiyoshi

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 109(45) 18401-18406 2012年11月査読有り
Unique properties of gastric H+ K+-ATPase and conserved conformational changes among P-type ATPases

Kazuhiro Abe

Seikagaku 84(2) 115-119 2012年
Conformational rearrangement of gastric H+,K+-ATPase with an acid suppressant.

Abe, K, Tani, K, Fujiyoshi, Y

Nature Communications 2(155) 1-9 2011年1月
Structural and functional characterization of H+,K+-ATPase with bound fluorinated phosphate analogs

Kazuhiro Abe, Kazutoshi Tani, Yoshinori Fujiyoshi

JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY 170(1) 60-68 2010年4月
A Novel Ratchet Mechanism of Gastric H+,K+-ATPase Revealed by Electron Crystallography of Two-dimensional Crystals

Kazuhiro Abe, Kazutoshi Tani, Tomohiro Nishizawa, Yoshinori Fujiyoshi

YAKUGAKU ZASSHI-JOURNAL OF THE PHARMACEUTICAL SOCIETY OF JAPAN 130(2) 205-210 2010年2月

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書籍等出版物

Methods in Molecular Biology, P-type ATPases, 39 Two-dimensional crystallization of gastric H+,K+-ATPase for structural analysis by electron crystallography

Abe K

Springer 2016年1月 (ISBN: 9781493931781)
Methods in Molecular Biology, P-type ATPases, 4 Isoration of H+,K+-ATPase-enriched membrane fraction from pig stomach

Abe K, Olesen C (担当:共著)

Springer 2016年1月 (ISBN: 9781493931781)

講演・口頭発表等

胃プロトンポンプの結晶構造 –胃酸抑制剤の結合、H+排出およびK+対向輸送に関する分子基盤

阿部一啓

日本薬学会 2020年3月27日
胃プロトンポンプのプロトン排出機構に関する構造基盤

阿部一啓

第97回日本生理学会大会 2020年3月17日招待有り
Molecular mechanisms for the drug binding, H+-extrusion and the K+ counter-transport

Kazuhiro Abe

Academia Sinica IBC seminar 2019年12月12日 Academia Sinica 招待有り
Crystal structure of the gastric proton pump

Kazuhiro Abe

World Laureates Forum 2nd conference 2019年10月28日 World Laureates Association 招待有り
X線結晶学とクライオ電顕で得られた構造情報の上手な活用法～胃プロトンポンプの構造解析を例として～

阿部一啓

2019年度生理研研究会 2019年9月30日生理学研究所招待有り
胃プロトンポンプの輸送機構に対する構造基盤

阿部一啓

生物物理第57回年会台湾‐日本二国間シンポジウム：X線結晶構造解析とクライオ電顕2019 2019年9月24日日本生物物理学会招待有り
Structural basis for the H+-extrusion and the K+-occlusion of the gastric proton pump

Abe K

Society of General Physiology /SOBLA 2019 2019年9月3日 Society of General Physiology /SOBLA 招待有り
Crystal structure of the gastric proton pump

Kazuhiro Abe, Kenta Yamamoto, Katsumasa Irie, Hanayo Nakanishi, Yoshinori Fujiyoshi

GRC membrane transport 2019年7月1日
胃の強酸性化の分子メカニズム ‐胃プロトンポンプの結晶構造解析

阿部一啓

日本生体エネルギー研究会第４４回討論会 2018年12月6日招待有り
Crystal structures of the gastric proton pump

Kazuhiro Abe

AsCA2018 2018年12月2日招待有り
1. 胃プロトンポンプの結晶構造によって明らかになったH+排出機構

阿部一啓

大阪大学蛋白質研究所セミナー構造生物学と計算科学の融合による動的構造生物学の新しい展開 2018年9月招待有り
胃プロトンポンプの結晶構造

阿部一啓

第９１回日本生化学会大会シンポジウム生化学から広がる膜輸送体研究の深化, 2018年9月
3. 胃の強酸性化の秘密

阿部一啓

創薬等ライフサイエンス研究支援基盤事業平成30年度BINDS公開シンポジウム「知って、使って、進むあなたの研究」 2018年9月招待有り
4. 胃プロトンポンプの構造生理学～胃酸に対してプロトンを押し出すメカニズム～

阿部一啓

大阪大学蛋白質研究所セミナー構造情報に基づいた膜イオン輸送タンパク質の生理機能の解明に向けて 2018年9月大阪大学蛋白質研究所招待有り
Structural basis for the H+ extrusion and the transport stoichiometry of the gastric proton pump

Kazuhiro Abe

Frontiers in P-type ATPase Research 2018, Institute for Quantitative Bioscience 2018年7月 The University of Tokyo 招待有り
Crystal structure of the gastric proton pump at 2.8A resolution

Kazuhiro Abe

日本生体エネルギー研究会 2017年12月19日
Structural and functional analysis of gastric proton pump and acid suppressants

Kazuhiro Abe

ConBio2017 2017年12月6日
Structural and functional analysis of gastric H+,K+-ATPase

Kazuhiro Abe

The 15th international conference on Na,K-ATPase and related transport ATPases 2017年9月24日招待有り
胃プロトンポンプの構造生理学

阿部一啓

日本物理学会第72回年次大会 2017年3月18日招待有り
Binding model of the acid suppressant to the gastric proton pump

Abe K

Japan Biophysical Society meeting 2016年11月25日招待有り

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担当経験のある科目(授業)

所属学協会

主要な共同研究・競争的資金等の研究課題

クライオ電子顕微鏡のフィードバックに基づく膜タンパク質複合体の生産と技術支援

国立研究開発法人日本医療研究開発機構創薬等ライフサイエンス研究支援基盤事業 2017年4月 - 2022年3月

大嶋篤典
胃酸分泌の分子メカニズム解明と新規薬剤開発の為の構造基盤

武田科学振興財団生命科学研究助成 2018年11月 - 2021年3月

阿部一啓
胃プロトンポンプの構造生理学研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2017年4月 - 2021年3月
細胞膜におけるリン脂質の非対称分布とその崩壊

文部科学省戦略的創造研究推進事業 2014年10月 - 2020年3月
最大級のイオン濃度勾配を形成する胃プロトンポンプ作動機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 2014年4月 - 2018年3月

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阿部一啓

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研究分野

経歴

学歴

受賞

主要な論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

主要な共同研究・競争的資金等の研究課題

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