阿部一啓 (Kazuhiro Abe) - マイポータル

基本情報

所属: 北海道大学大学院理学研究院化学部門教授

学位: 博士（理学）(北海道大学)

研究者番号: 60596188
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0003-2681-5921
J-GLOBAL ID: 201201078597497949
researchmap会員ID: 7000003008

外部リンク: https://wwwchem.sci.hokudai.ac.jp/~molbio/

研究キーワード

研究分野

経歴

2024年4月 - 現在

北海道大学, 大学院理学研究院化学部門, 教授
2016年1月 - 2024年4月

名古屋大学, 細胞生理学研究センター基礎生物学研究部門, 准教授
2012年4月 - 現在

名古屋大学, 大学院創薬科学研究科基盤創薬学専攻創薬分子構造学, 准教授
2012年4月 - 2015年12月

名古屋大学, 細胞生理学研究センター基礎生物学研究部門, 助教
2011年4月 - 2012年3月

京都大学特定研究員
2008年4月 - 2011年3月

社団法人バイオ産業情報化コンソーシアム
2005年4月 - 2008年3月

日本学術振興会特別研究員 (PD)
2004年4月 - 2005年3月

日本学術振興会特別研究員 (PD)
2003年4月 - 2004年3月

日本学術振興会特別研究員 (DC2)

学歴

受賞

2013年9月

日本生化学会奨励賞, 日本生化学会
2011年12月

若手奨励賞, 生体エネルギー研究会
2011年10月

JBC Herbert Tabor Award, ASBMB
2008年8月

Margrethe Moller Award, P-ATPase conference
2004年8月

FASEB SRC Young Scientist Award, FASEB

主要な論文

A unique gating mechanism revealed by the cryo-EM structure of monomeric ATP9A flippase

Kazuhiro Abe, Parthiban Marimuthu, Yuheng Qian, Chai C. Gopalasingam, Christoph Gerle, Hideki Shigematsu, Kotaro Tanaka, Himanshu Khandelia

Journal of Biological Chemistry 301(10) 110631-110631 2025年10月査読有り筆頭著者責任著者
A Na pump with reduced stoichiometry is up-regulated by brine shrimp in extreme salinities.

Pablo Artigas, Dylan J Meyer, Victoria C Young, Kerri Spontarelli, Jessica Eastman, Evan Strandquist, Huan Rui, Benoît Roux, Matthew A Birk, Hanayo Nakanishi …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 120(52) e2313999120 2023年12月26日査読有り責任著者
Deep learning driven de novo drug design based on gastric proton pump structures

Kazuhiro Abe, Mami Ozako, Miki Inukai, Yoe Matsuyuki, Shinnosuke Kitayama, Chisato Kanai, Chiaki Nagai, Chai C. Gopalasingam, Christoph Gerle, Hideki Shigematsu …

Communications Biology 6(1) 2023年9月19日査読有り筆頭著者責任著者
Structure and function of H+/K+ pump mutants reveal Na+/K+ pump mechanisms

Victoria C. Young, Hanayo Nakanishi, Dylan J. Meyer, Tomohiro Nishizawa, Atsunori Oshima, Pablo Artigas, Kazuhiro Abe

Nature Communications 13(1) 2022年9月9日査読有り最終著者責任著者
Structural Basis for Binding of Potassium-Competitive Acid Blockers to the Gastric Proton Pump.

Saki Tanaka, Mikio Morita, Tatsuya Yamagishi, Hridya Valia Madapally, Kenichi Hayashida, Himanshu Khandelia, Christoph Gerle, Hideki Shigematsu, Atsunori Oshima, Kazuhiro Abe

Journal of medicinal chemistry 65(11) 7843-7853 2022年5月23日査読有り最終著者責任著者
Gastric proton pump with two occluded K+ engineered with sodium pump-mimetic mutations.

Kazuhiro Abe, Kenta Yamamoto, Katsumasa Irie, Tomohiro Nishizawa, Atsunori Oshima

Nature communications 12(1) 5709-5709 2021年9月29日査読有り筆頭著者責任著者
Transport Cycle of Plasma Membrane Flippase ATP11C by Cryo-EM

Hanayo Nakanishi, Tomohiro Nishizawa, Katsumori Segawa, Osamu Nureki, Yoshinori Fujiyoshi, Shigekazu Nagata, Kazuhiro Abe

Cell Reports 32(13) 108208-108208 2020年9月査読有り最終著者責任著者
A single K+-binding site in the crystal structure of the gastric proton pump

Yamamoto Kenta, Dubey Vikas, Irie Katsumasa, Nakanishi Hanayo, Khandelia Himanshu, Fujiyoshi Yoshinori, Abe Kazuhiro

ELIFE 8 2019年8月22日査読有り最終著者責任著者
Crystal structures of the gastric proton pump.

Kazuhiro Abe, Katsumasa Irie, Hanayo Nakanishi, Hiroshi Suzuki, Yoshinori Fujiyoshi

Nature 556(7700) 214-218 2018年4月査読有り筆頭著者責任著者
Cryo-EM structure of gastric H+,K+-ATPase with a single occupied cation-binding site

Kazuhiro Abe, Kazutoshi Tani, Thomas Friedrich, Yoshinori Fujiyoshi

PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 109(45) 18401-18406 2012年11月査読有り筆頭著者責任著者
Conformational rearrangement of gastric H+,K+-ATPase induced by an acid suppressant

Kazuhiro Abe, Kazutoshi Tani, Yoshinori Fujiyoshi

NATURE COMMUNICATIONS 2(155) 1-9 2011年1月査読有り
E2P State Stabilization by the N-terminal Tail of the H,K-ATPase beta-Subunit Is Critical for Efficient Proton Pumping under in Vivo Conditions

Katharina L. Duerr, Kazuhiro Abe, Neslihan N. Tavraz, Thomas Friedrich

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 284(30) 20147-20154 2009年7月査読有り
Inter-subunit interaction of gastric H+,K+-ATPase prevents reverse reaction of the transport cycle.

Abe, K, Tani, K, Nishizawa, T, Fujiyoshi, Y

EMBO Journal 28(11) 1637-1643-1643 2009年査読有り

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MISC

『細胞死を司るポンプ』脂質フリッパーゼATP11Cの結晶構造とCryo-EM構造

中西華代, 西澤知宏, 瀬川勝盛, 濡木理, 藤吉好則, 長田重一, 阿部一啓, 阿部一啓

日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集 46th 2020年
胃H⁺,K⁺-ATPase E2P状態におけるK⁺結合化学量論を決定する因子の構造研究

山本健太, 入江克雅, 藤吉好則, 阿部一啓, 山本健太, 入江克雅, 藤吉好則, 阿部一啓

日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集 45th 2019年
胃プロトンポンプH⁺,K⁺-ATPaseのK⁺結合構造解析

山本健太, 山本健太, 入江克雅, 入江克雅, 藤吉好則, 藤吉好則, 阿部一啓, 阿部一啓

日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集 44th 2018年
胃プロトンポンプH⁺,K⁺-ATPaseのK⁺結合構造解析

山本健太, 山本健太, 入江克雅, 入江克雅, 藤吉好則, 藤吉好則, 阿部一啓, 阿部一啓

日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集 44th 2018年
胃プロトンポンプの2.8Å分解能結晶構造解析

阿部一啓, 阿部一啓, 阿部一啓, 入江克雅, 入江克雅, 中西華代, 中西華代, 藤吉好則, 藤吉好則

日本生体エネルギー研究会討論会講演要旨集 43rd 2017年
Unique properties of gastric H+ K+-ATPase and conserved conformational changes among P-type ATPases

Kazuhiro Abe

Seikagaku 84(2) 115-119 2012年
Conformational rearrangement of gastric H+,K+-ATPase with an acid suppressant.

Abe, K, Tani, K, Fujiyoshi, Y

Nature Communications 2(155) 1-9 2011年1月
Structural and functional characterization of H+,K+-ATPase with bound fluorinated phosphate analogs

Kazuhiro Abe, Kazutoshi Tani, Yoshinori Fujiyoshi

JOURNAL OF STRUCTURAL BIOLOGY 170(1) 60-68 2010年4月
High and low affinity ATP effects on both NaE1 and KE2 of Na/K-ATPase studied by substrate analogues.

K Tanoue, S Kaya, K Abe, T Imagawa, Y Hayashi, K Sakaguchi, K Taniguchi

JOURNAL OF GENERAL PHYSIOLOGY 126(1) 41A-42A 2005年7月
K+-induced change in oligomeric assembly of C12E8-solubilized pig gastric H/K-ATPase observed by single-molecule detection techniques.

K Abe, S Kaya, K Sakaguchi, T Imagawa, Y Hayashi, K Taniguchi

JOURNAL OF GENERAL PHYSIOLOGY 126(1) 34A-35A 2005年7月
Presence of two different ATP effects on both Na-bound and Rb-occluded Na/K-ATPase

K Taniguchi, K Tanoue, K Abe, S Kaya, T Imagawa, K Sakaguchi

BIOPHYSICAL JOURNAL 86(1) 192A-192A 2004年1月

書籍等出版物

AIが描く胃薬の未来図 cryo-EMとDeep Quartetが拓く新たな阻害剤のデザイン「実験医学増刊：構造生命科学 AlphaFold時代にどう活かす？〜生命機能を解く、変える、創るための技術と研究戦略」

阿部一啓, 横島聡, 吉森篤史 (担当:分担執筆)

羊土社 2025年9月5日 (ISBN: 9784758104296)
Methods in Molecular Biology, P-type ATPases, 39 Two-dimensional crystallization of gastric H+,K+-ATPase for structural analysis by electron crystallography

Abe K

Springer 2016年1月 (ISBN: 9781493931781)
Methods in Molecular Biology, P-type ATPases, 4 Isoration of H+,K+-ATPase-enriched membrane fraction from pig stomach

Abe K, Olesen C (担当:共著)

Springer 2016年1月 (ISBN: 9781493931781)

講演・口頭発表等

老犬は新しい芸を覚えるか？

阿部一啓

第68回日本脂質生化学会 2026年6月4日日本脂質生化学会
クライオ電顕構造と深眉学習を利用した日プロトンポンプ新規阻害剤の開発

阿部一啓

日本顕微鏡学会第82回学術講演会 2026年5月27日公益社団法人日本顕微鏡学会招待有り
胃の酸性化の秘密～胃プロトンポンプの構造生理学

阿部一啓

第2回 PRI 鈴木梅太郎シンポジウム 2026年3月13日国立研究開発法人理化学研究所招待有り
疾病変異体を模したATP11CフリッパーゼQ79E変異体の構造機能解析によって明らかにされたリン脂質認識の分子基盤

阿部一啓

日本生体エネルギー研究会第51回討論会 2025年12月11日日本生体エネルギー研究会
P2-type ATPaseによるH⁺ とNa⁺ の特異性についての考察

阿部一啓

cQUESTシンポジウム「膜タンパク質内部のイオン透過を考える」 2025年12月10日招待有り
Structural physiology of the primary transporters P-type ATPase

Kazuhiro Abe

The 55th NIPS International Symposium "The forefront and future prospects of ion channel research". 2025年12月3日招待有り
細胞膜集合体による細胞機能・運命制御

阿部一啓

第98回日本生化学会大会・シンポジウム2S07e 2025年11月4日招待有り
胃プロトンポンプの構造情報と AI によって駆動された新規阻害剤のde novo デザイン

阿部一啓

第 53 回構造活性相関シンポジウム 2025年9月4日招待有り
AI-driven de novo drug design based on the cryo-EM structure of the gastric proton pump

Kazuhiro Abe

The 1st HU-NYCU DDP Symposium on Chemistry 2025年7月4日招待有り
Molecular biochemistry of the gastric proton pump and related P-ATPases

Kazuhiro Abe

Academia Sinica IBC seminar 2025年6月27日 Academia Sinica 招待有り
細胞膜脂質フリッパーゼATP11Cの構造生理学

阿部一啓

第25回日本蛋白質科学会年会 2025年6月18日招待有り
細胞膜脂質フリッパーゼATP11Cの構造生理学

阿部一啓

第45回生体膜と薬物の相互作用シンポジウム 2024年10月10日日本薬学会物理系薬学部会招待有り
Structural physiology of P-type ATPases that generate asymmetric distributions of cations and phospholipids

Kazuhiro Abe

"Biased assembly" in Neuroscience and Cell Biology 2024年9月23日 Academia Sinica 招待有り
能動輸送体 P-type ATPase の構造生理学

阿部一啓

2024年度生理研研究会「生理機能の理解に向けた膜タンパク質機能ダイナミクス研究の最前線と未来開拓」 2024年9月2日招待有り
Structural physiology of gastric proton pump and related cation pumps

Kazuhiro Abe

The 15th CSE International Summer School & The 12th ALP International Symposium 2024年8月24日北海道大学大学院総合化学院招待有り
能動輸送体 P-type ATPaseの分子生命化学

阿部一啓

第61回日本生化学会北海道支部例会 2024年7月20日招待有り
Structural physiology of gastric proton pump and related cation pumps

Kazuhiro Abe

IUPAB2024 2024年6月24日招待有り
胃プロトンポンプのクライオ電顕構造に基づいたAIによる新規薬剤のデザイン

阿部一啓

第80回顕微鏡学会 2024年6月4日招待有り
カチオン能動輸送体の構造生理学と創薬

阿部一啓

第101回日本生理学会大会 2024年3月28日招待有り
構造解析による胃の酸性化メカニズムとAIを利用した胃酸抑制剤の開発

阿部一啓

循環器研究ユニットシンポジウム 2024年2月29日招待有り

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担当経験のある科目(授業)

所属学協会

主要な共同研究・競争的資金等の研究課題

クライオ電子顕微鏡のフィードバックに基づく膜タンパク質複合体の生産と技術支援

国立研究開発法人日本医療研究開発機構創薬等ライフサイエンス研究支援基盤事業 2017年4月 - 2022年3月

大嶋篤典
胃酸分泌の分子メカニズム解明と新規薬剤開発の為の構造基盤

武田科学振興財団生命科学研究助成 2018年11月 - 2021年3月

阿部一啓
胃プロトンポンプの構造生理学研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2017年4月 - 2021年3月
細胞膜におけるリン脂質の非対称分布とその崩壊

文部科学省戦略的創造研究推進事業 2014年10月 - 2020年3月
最大級のイオン濃度勾配を形成する胃プロトンポンプ作動機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 2014年4月 - 2018年3月

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阿部一啓

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

受賞

主要な論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

主要な共同研究・競争的資金等の研究課題

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