小金渕佳江 (Kae Koganebuchi) - マイポータル

基本情報

所属: 東京大学大学院理学系研究科生物科学専攻助教

学位: 博士（医学）(2017年北里大学)
修士（生命科学）(2010年東京大学)

研究者番号: 10753593
ORCID iD: https://orcid.org/0000-0002-6972-2218
J-GLOBAL ID: 201701005056219598
researchmap会員ID: B000277673

主な研究テーマ
・日本列島ヒト集団の形成史の推定
・地域特異的に見られる疾患の拡散プロセスの推定
・次世代シーケンサーを用いた配列解析における実験手法の開発

研究キーワード

研究分野

経歴

2020年5月 - 現在

琉球大学大学院医学研究科, 人体解剖学講座, 非常勤講師
2020年5月 - 現在

東京大学, 大学院理学系研究科生物科学専攻, 助教
2022年4月 - 2025年3月

宇都宮歯科衛生士専門学校, 非常勤講師
2022年4月 - 2025年3月

慶應義塾大学, 理工学部, 非常勤講師
2019年1月 - 2020年5月

琉球大学医学部, 先端医学研究センター, 特命助教
2017年4月 - 2020年3月

学校法人智晴学園琉球リハビリテーション学院, 非常勤講師
2017年4月 - 2019年1月

琉球大学大学院, 医学研究科人体解剖学講座, ポスドク研究員
2015年4月 - 2017年3月

日本学術振興会特別研究員（DC2）
2010年4月 - 2013年3月

民間企業, 法人営業・マーケティングプランナー

学歴

2013年4月 - 2017年3月

北里大学大学院医療系研究科医学専攻
2008年4月 - 2010年3月

東京大学大学院新領域創成科学研究科先端生命科学専攻
2004年4月 - 2008年3月

筑波大学, 第二学群生物学類

委員歴

受賞

2023年3月

Top Downloaded Article, An analysis of the demographic history of the risk allele R4810K in RNF213 of moyamoya disease, Annals of Human Genetics
2019年10月

若手会員大会発表賞, 日本人類学会

小金渕佳江
2017年3月

総代, 北里大学大学院医療系研究科

小金渕佳江
2017年3月

優秀博士論文賞, 北里大学大学院医療系研究科

小金渕佳江
2016年9月

スチューデントリサーチデイベストポスター賞, 北里大学大学院医療系研究科

小金渕佳江
2014年3月

第1種奨学金の特に優れた業績による返還免除（半額免除）, 独立行政法人日本学生支援機構

論文

Jomon genomics reveal cold adaptation in Upper Paleolithic hunter-gatherers of eastern Eurasia

MINORU YONEDA, Tadayuki Masuyama, Motoyuki Ogawa, Takashi Gakuhari, Kazuaki Hirata, Yasuhiro Yamada, Ryuzaburo Takahashi, Takafumi Katsumura, Guido Valverde, Akio Tanino …

Science Advances 2026年8月12日
East Eurasian Dispersals to the Americas: A Spatiotemporal Perspective from Paleogenomics

Kae Koganebuchi, Hiroki Oota

Quaternary Science Advances 2026年8月
Demographic history of the Jomon people: insights from whole-mitogenome analysis

Koki Yoshida, Yoshiki Wakiyama, Yuka Nakamura, Guido Valverde, Akio Tanino, Daisuke Waku, Takafumi Katsumura, Motoyuki Ogawa, Tomohito Nagaoka, Kazuaki Hirata …

Anthropological Science 2026年
Collagen of ancient bones gives an indication of endogenous DNA preservation based on next-generation sequencing technology

Yuka Nakamura, Daisuke Waku, Yoshiki Wakiyama, Yusuke Watanabe, Kae Koganebuchi, Tomohito Nagaoka, Kazuaki Hirata, Jun Ohashi, Ryuzaburo Takahashi, Minoru Yoneda …

Anthropological Science 2024年
Metagenomic analyses of 7000 to 5500 years old coprolites excavated from the Torihama shell-mound site in the Japanese archipelago.

Luca Nishimura, Akio Tanino, Mayumi Ajimoto, Takafumi Katsumura, Motoyuki Ogawa, Kae Koganebuchi, Daisuke Waku, Masahiko Kumagai, Ryota Sugimoto, Hirofumi Nakaoka …

PloS one 19(1) e0295924 2024年
Demographic history of Ryukyu islanders at the southern part of the Japanese Archipelago inferred from whole-genome resequencing data

Kae Koganebuchi, Masatoshi Matsunami, Minako Imamura, Yosuke Kawai, Yuki Hitomi, Katsushi Tokunaga, Shiro Maeda, Hajime Ishida, Ryosuke Kimura

Journal of Human Genetics 68(11) 759-767 2023年7月20日
Haplotype phasing of a bipolar disorder pedigree revealed rare multiple mutations of SPOCD1 gene in the 1p36-35 susceptibility locus.

Gakuya Takamatsu, Kumiko Yanagi, Kae Koganebuchi, Fuyuko Yoshida, Jun-Seok Lee, Kanako Toyama, Kotaro Hattori, Chiaki Katagiri, Tsuyoshi Kondo, Hiroshi Kunugi …

Journal of affective disorders 310 96-105 2022年8月1日
Complete mitochondrial genome sequencing reveals double-buried Jomon individuals excavated from the Ikawazu shell-mound site were not in a mother–child relationship

DAISUKE WAKU, TAKASHI GAKUHARI, KAE KOGANEBUCHI, MINORU YONEDA, OSAMU KONDO, TADAYUKI MASUYAMA, YASUHIRO YAMADA, HIROKI OOTA

Anthropological Science 130(1) 39-45 2022年
Whole-Genome Sequencing of a 900-Year-Old Human Skeleton Supports Two Past Migration Events from the Russian Far East to Northern Japan.

Takehiro Sato, Noboru Adachi, Ryosuke Kimura, Kazuyoshi Hosomichi, Minoru Yoneda, Hiroki Oota, Atsushi Tajima, Atsushi Toyoda, Hideaki Kanzawa-Kiriyama, Hiromi Matsumae …

Genome biology and evolution 13(9) 2021年9月1日
Exploring correlations in genetic and cultural variation across language families in northeast Asia.

Hiromi Matsumae, Peter Ranacher, Patrick E Savage, Damián E Blasi, Thomas E Currie, Kae Koganebuchi, Nao Nishida, Takehiro Sato, Hideyuki Tanabe, Atsushi Tajima …

Science advances 7(34) 2021年7月
An analysis of the demographic history of the risk allele R4810K in RNF213 of moyamoya disease

Kae Koganebuchi, Kimitoshi Sato, Kiyotaka Fujii, Toshihiro Kumabe, Kuniaki Haneji, Takashi Toma, Hajime Ishida, Keiichiro Joh, Hidenobu Soejima, Shuhei Mano …

Annals of Human Genetics 85(5) 166-177 2021年5月20日査読有り筆頭著者
Fine-scale genetic structure and demographic history in the Miyako Islands of the Ryukyu Archipelago.

Masatoshi Matsunami, Kae Koganebuchi, Minako Imamura, Hajime Ishida, Ryosuke Kimura, Shiro Maeda

Molecular biology and evolution 2021年1月11日査読有り
Paleogenomics of human remains in East Asia and Yaponesia focusing on current advances and future directions

Kae Koganebuchi, Hiroki Oota

ANTHROPOLOGICAL SCIENCE 129(1) 59-69 2021年
Ancient Jomon genome sequence analysis sheds light on migration patterns of early East Asian populations

Takashi Gakuhari, Shigeki Nakagome, Simon Rasmussen, Morten E. Allentoft, Takehiro Sato, Thorfinn Korneliussen, Blánaid Ní Chuinneagáin, Hiromi Matsumae, Kae Koganebuchi, Ryan Schmidt …

Communications Biology 3(1) 2020年12月査読有り
Analysis of ancient human mitochondrial DNA from Verteba Cave, Ukraine: insights into the Late Neolithic-Chalcolithic Cucuteni-Tripolye culture

Ryan W. Schmidt, Ken Wakabayashi, Daisuke Waku, Takashi Gakuhari, Kae Koganebuchi, Motoyuki Ogawa, Jordan K. Karsten, Mykhailo Sokhatsky, Hiroki Oota

ANTHROPOLOGICAL SCIENCE 128(1) 1-10 2020年4月査読有り
A new targeted capture method using bacterial artificial chromosome (BAC) libraries as baits for sequencing relatively large genes.

Kae Koganebuchi, Takashi Gakuhari, Hirohiko Takeshima, Kimitoshi Sato, Kiyotaka Fujii, Toshihiro Kumabe, Satoshi Kasagi, Takehiro Sato, Atsushi Tajima, Hiroki Shibata …

PloS one 13(7) e0200170 2018年査読有り筆頭著者
The allele frequency of ALDH2*Glu504Lys and ADH1B*Arg47His for the Ryukyu islanders and their history of expansion among East Asians

Kae Koganebuchi, Kuniaki Haneji, Takashi Toma, Keiichiro Joh, Hidenobu Soejima, Kazuma Fujimoto, Hajime Ishida, Motoyuki Ogawa, Tsunehiko Hanihara, Shoji Harada …

AMERICAN JOURNAL OF HUMAN BIOLOGY 29(2) 2017年3月査読有り筆頭著者
Genome-Wide SNP Analysis Reveals Population Structure and Demographic History of the Ryukyu Islanders in the Southern Part of the Japanese Archipelago

Takehiro Sato, Shigeki Nakagome, Chiaki Watanabe, Kyoko Yamaguchi, Akira Kawaguchi, Kae Koganebuchi, Kuniaki Haneji, Tetsutaro Yamaguchi, Tsunehiko Hanihara, Ken Yamamoto …

MOLECULAR BIOLOGY AND EVOLUTION 31(11) 2929-2940 2014年11月査読有り
Autosomal and Y-chromosomal STR markers reveal a close relationship between Hokkaido Ainu and Ryukyu islanders

Kae Koganebuchi, Takafumi Katsumura, Shigeki Nakagome, Hajime Ishida, Shoji Kawamura, Hiroki Oota

ANTHROPOLOGICAL SCIENCE 120(3) 199-208 2012年12月査読有り筆頭著者
Potential gene flow in natural populations of the Drosophila ananassae species cluster inferred from a nuclear mitochondrial pseudogene

Kyoichi Sawamura, Kae Koganebuchi, Hajime Sato, Koichi Kamiya, Muneo Matsuda, Yuzuru Oguma

MOLECULAR PHYLOGENETICS AND EVOLUTION 48(3) 1087-1093 2008年9月査読有り

MISC

Paleogenomics of human remains in East Asia and Yaponesia focusing on current advances and future directions

KAE KOGANEBUCHI, HIROKI OOTA

Anthropological Science 129(1) 59-69 2021年査読有り招待有り筆頭著者
Biomedical and genetic characteristics of the Ryukyuans: demographic history, diseases and physical and physiological traits

Kae Koganebuchi, Ryosuke Kimura

Annals of Human Biology 46(4) 1-13 2019年5月19日査読有り招待有り筆頭著者責任著者
Jomon genome sheds light on East Asian population history

BioRxiv 2019年3月

書籍等出版物

哺乳類学の百科事典 = Encyclopedia of mammalogy

日本哺乳類学会 (担当:分担執筆, 範囲:５．哺乳類の遺伝：古代DNA)

丸善出版 2025年11月 (ISBN: 9784621311967)
神奈川県横浜市神奈川区神奈川台場跡第８地点─集合住宅建設に伴う埋蔵文化財発掘調査報告書─

内海遥, 辻本彩, 能城修一, 小金渕佳江, 考古石材研究所, パリノ・サーヴェイ

スターツCAM株式会社・国際文化財株式会社 2025年9月
月刊「細胞」2024年12月臨時増刊号パレオゲノミクスで見えてきた人類進化

小金渕佳江 (担当:分担執筆, 範囲:糞石と土壌堆積物における古代ゲノム研究の展開、p.p.1047–1050)

ニュー・サイエンス社 2024年11月30日
週刊「医学のあゆみ」遺伝統計学の新潮流 ─新規創薬・個別化医療への挑戦

小金渕佳江 (担当:分担執筆, 範囲:琉球諸島の人々における集団ゲノム解析、p.p.1069–1075)

医歯薬出版株式会社 2024年3月
週刊「医学のあゆみ」 -古代ゲノム学と医学の交差点-

小金渕佳江 (担当:分担執筆, 範囲:アルコール代謝関連遺伝子の多様性を現代人および古代人ゲノムから探る、p.p.270–273)

医歯薬出版株式会社 2023年7月

講演・口頭発表等

ゲノム解析から見るヒトの多様性

小金渕佳江

清泉女学院中学高等学校研究室訪問セミナー 2025年3月26日招待有り
ヒトゲノムを用いた集団形成過程の推定

小金渕佳江

国際先導研究「時空言語学」の創成：地理と歴史を融合した言語の変化と発展への新たなアプローチ打合せ会 2025年3月5日
私たちはどんな生物か？ゲノムが明かすヒトの軌跡

小金渕佳江

埼玉県立越谷北高等学校 SSH講演会 2024年12月16日招待有り
特別講演I「東アジアにおけるヒトの地域性を探るゲノム多様性研究」

小金渕佳江

日本DNA多型学会第33回学術集会 2024年11月28日招待有り
シンポジウム・アイヌ研究と研究倫理「若手研究者とアイヌ研究倫理」

小金渕佳江

第78回日本人類学会大会 2024年10月12日
ゲノム解析で紐解くヒトの進化と多様性

小金渕佳江

東京大学理学部で考える女子中高生の未来2024 ONLINE 2024年8月24日招待有り
Human genomic insights into the historical population dynamics of the Ryukyu Islands, Japan

Kae Koganebuchi

the International Conference of the Korean Society for Molecular and Cellular Biology 2023年11月6日招待有り
日本列島を中心としたヒト移住史のゲノム学研究

小金渕佳江

日本考古学協会2023年度宮城大会 2023年10月29日
南太平洋ヒト集団を対象とした糞便 DNA メタバーコーディングによる植物性摂食物同定

小金渕佳江, 所谷敬司, 熊谷真彦, 勝村啓史, 梅﨑昌裕, 太田博樹

第77回日本人類学会大会 2023年10月8日
The peopling of Eurasia and the Americas inferred from human genome analysis

Koganebuchi, Kae, Oota, Hiroki

XXI INQUA Congress 2023年7月18日
ゲノム研究からヒトの進化多様性を探る

小金渕佳江

埼玉県高校生物研究会総会・講演会 2023年5月23日招待有り
教育セッション13：遺伝性疾患と進化

小金渕佳江

日本人類遺伝学会第67回大会 2022年12月17日招待有り
東アジア人類集団におけるアルコール代謝関連遺伝子に働いた正の自然選択

小金渕佳江, 太田博樹

日本人類遺伝学会第67回大会 2022年12月17日
多様性が生まれるその背景-遺伝学の視点から-

小金渕佳江

日本学術会議主催公開シンポジウム「人類学者と語る人間の「ちがい」と差別」 2022年11月19日招待有り
生物人類学におけるヒトのゲノム研究倫理

小金渕佳江

第76回日本人類学会大会・第38回日本霊長類学会大会連合大会 2022年9月16日
遺伝子から考える飲酒と霊長類の関係性

小金渕佳江

第 11 回応用生理人類学研究センター講演会 2022年2月23日招待有り
進化から迫るヒトの食の多様性–酒とともに生きる:アルコール代謝に見る遺伝子と飲酒行動の多様性–

小金渕佳江

第75回日本人類学会大会 2021年10月10日
下戸遺伝子と日本列島人ゲノムに見るヒトの多様性

小金渕佳江

第75回日本人類学会大会公開シンポジウム「人類進化史から理解するヒトの遺伝的多様性」 2021年10月9日
なぜ我々はワークフロー言語を書くのか－事例紹介: nf-core－

小金渕佳江

2021年日本バイオインフォマティクス学会年会・第10回生命医薬情報連合学連合大会 2021年9月27日
東アジアにおけるヒト多様性の成立過程を集団遺伝学解析により推定する

小金渕佳江

2021年度日本冷凍空調学会年次大会 2021年9月10日招待有り

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担当経験のある科目(授業)

2022年4月 - 2025年3月

人類学 (宇都宮歯科衛生士専門学校)
2022年4月 - 2025年3月

自然人類学 (慶應義塾大学)
2017年4月 - 2019年8月

解剖学（内臓学） (学校法人智晴学園琉球リハビリテーション学院)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

「時空言語学」の創成：地理と歴史を融合した言語の変化と発展への新たなアプローチ

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際先導研究) 2024年11月 - 2031年3月

菊澤律子, 持橋大地, 渡部展也, 小金渕佳江, John Lowry, 朱易安, 岡本進, Paul Geraghty, 白井聡子, 佐野文哉, 村脇有吾, 吉岡乾, Apolonia Tamata, Mika Sela
先史日本列島および韓半島における人獣共通感染症の学際的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2025年4月 - 2030年3月

宮路淳子, 中務真人, 小金渕佳江, 中沢隆, 河原一樹, 日下宗一郎
古代プロテオーム解析による分子古病理学の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2024年4月 - 2029年3月

蔦谷匠, 小金渕佳江, 西内巧, 長岡朋人, 澤藤りかい
人間の「ちがい」と差別に関する人類学的研究

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(開拓) 2024年6月 - 2027年3月

竹沢泰子, 小金渕佳江, 海部陽介, 陳天璽
日本列島の哺乳類相成立における生態要因と人為要因の解明：古生態学からのアプローチ

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2027年3月

久保麦野, 小金渕佳江, 佐々木尚子, 藤田祐樹, 高原光
日本列島の哺乳類相成立における生態要因と人為要因の解明：古生態学からのアプローチ

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2027年3月

久保麦野, 小金渕佳江, 高原光, 佐々木尚子, 藤田祐樹
ゲノム多様性解析によるフィリピン先住民の集団史と適応に関する共同研究

日本学術振興会二国間交流事業フィリピン（DOST）との共同研究 2025年4月 - 2027年3月

河村正二, 太田博樹, 田嶋敦, 颯田葉子, 中山一大, 小金渕佳江, 渡部裕介
古代寄生虫DNAから読み解く先史時代のヒト感染症拡散と移住経路

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2024年4月 - 2026年3月

小金渕佳江
古代日本列島人の寄生虫感染症の復元に関する糞石DNA解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究若手研究 2021年4月 - 2024年3月

小金渕佳江
古代ゲノムで解明するバイカル地域人類集団の変遷

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2018年10月 - 2021年3月

木村亮介, 佐藤丈寛, 小金渕佳江, 石田肇
琉球諸島ヒト集団における全ゲノム配列解析による環境適応の検証

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究若手研究 2018年4月 - 2021年3月

小金渕佳江
先史時代人骨ゲノムによる二重構造モデルの検証

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2015年4月 - 2017年3月

小金渕佳江

社会貢献活動

WEcafe（サイエンスカフェ）人類学におけるゲノム解析に関する話題提供

出演

WEcafe 2023年1月28日
ウィークエンド・カフェ・デ・サイエンス出演

出演

武田先端計測知財団 2014年
展示ガイド

助言・指導

サイエンスアゴラ 2008年
教育ボランティア

助言・指導

国立科学博物館 2008年
展示ガイド

助言・指導

つくばサイエンスフェスティバル 2007年

メディア報道

縄文時代の人々の糞石でヒト寄生虫のDNAを探索

東京大学広報室広報誌「淡青」48号 2024年3月会誌・広報誌
日本人なぜ酒に弱い、陰に病？古代人DNAから体質解明

日本経済新聞 https://www.nikkei.com/article/DGXZQOUC303G30Q3A930C2000000/ 2023年10月
“沖縄本島と宮古島地方は同じ祖先” 琉大研究チームが発表

NHK 沖縄 NEWS WEB https://www3.nhk.or.jp/lnews/okinawa/20230720/5090024066.html 2023年7月
酒に弱い人の遺伝子-中国南部から伝来か-

毎日新聞 https://mainichi.jp/articles/20161221/dde/018/040/023000c 2016年12月新聞・雑誌

小金渕佳江

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

委員歴

受賞

論文

MISC

書籍等出版物

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

社会貢献活動

メディア報道

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