蒲池雄介 (Yusuke Kamachi) - マイポータル

基本情報

所属: 高知工科大学環境理工学群教授

学位: 博士（理学）(名古屋大学)

ORCID ID: https://orcid.org/0000-0001-5018-1119
J-GLOBAL ID: 200901023756165982
researchmap会員ID: 0000005013

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研究分野

経歴

2015年6月 - 現在

高知工科大学, 環境理工学群, 教授
2007年4月 - 2015年5月

大阪大学, 生命機能研究科, 准教授
2002年4月 - 2007年3月

大阪大学, 生命機能研究科, 助教授
2001年5月 - 2002年6月

ミネソタ大学, 遺伝学・細胞生物学・発生生物学学部, 文部科学省在外研究員
1994年4月 - 2002年3月

大阪大学, 細胞生体工学センター, 助手

学歴

主要な論文

CRISPR-Cas9-Mediated Genome Modifications in Zebrafish.

Yusuke Kamachi, Atsuo Kawahara

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2637 313-324 2023年
Key sequence features of CRISPR RNA for dual-guide CRISPR-Cas9 ribonucleoprotein complexes assembled with wild-type or HiFi Cas9

Keita Okada, Kanae Aoki, Teruyuki Tabei, Kota Sugio, Katsunori Imai, Yuki Bonkohara, Yusuke Kamachi

Nucleic Acids Research 50(5) 2854-2871 2022年3月21日
Efficient CRISPR-Cas9-Mediated Knock-In of Composite Tags in Zebrafish Using Long ssDNA as a Donor

Deshani C. Ranawakage, Keita Okada, Kota Sugio, Yuya Kawaguchi, Yuki Kuninobu-Bonkohara, Takuya Takada, Yusuke Kamachi

Frontiers in Cell and Developmental Biology 8 2021年2月11日査読有り
HiBiT-qIP, HiBiT-based quantitative immunoprecipitation, facilitates the determination of antibody affinity under immunoprecipitation conditions

Deshani C. Ranawakage, Takuya Takada, Yusuke Kamachi

Scientific Reports 9 2019年12月1日
Evolution of Sox2 and Functional Redundancy in Relation to Other SoxB1 Genes

Yusuke Kamachi

Sox2: Biology and Role in Development and Disease 89-106 2015年1月1日
SOX2-Partner Factor Interactions and Enhancer Regulation

Hisato Kondoh, Yusuke Kamachi

Sox2: Biology and Role in Development and Disease 131-144 2015年1月1日
Sox proteins: regulators of cell fate specification and differentiation

Yusuke Kamachi, Hisato Kondoh

DEVELOPMENT 140(20) 4129-4144 2013年10月
B1 SOX Coordinate Cell Specification with Patterning and Morphogenesis in the Early Zebrafish Embryo

Yuichi Okuda, Eri Ogura, Hisato Kondoh, Yusuke Kamachi

PLOS GENETICS 6(5) 36 2010年5月
Adaptation of GAL4 Activators for GAL4 Enhancer Trapping in Zebrafish

Eri Ogura, Yuichi Okuda, Hisato Kondoh, Yusuke Kamachi

DEVELOPMENTAL DYNAMICS 238(3) 641-655 2009年3月
Comparative genomic and expression analysis of group B1 sox genes in zebrafish indicates their diversification during vertebrate evolution

Y Okuda, H Yoda, M Uchikawa, M Furutani-Seiki, H Takeda, H Kondoh, Y Kamachi

DEVELOPMENTAL DYNAMICS 235(3) 811-825 2006年3月
Pax6 and SOX2 form a co-DNA-binding partner complex that regulates initiation of lens development

Y Kamachi, M Uchikawa, A Tanouchi, R Sekido, H Kondoh

GENES & DEVELOPMENT 15(10) 1272-1286 2001年5月
Pairing SOX off with partners in the regulation of embryonic development

Y Kamachi, M Uchikawa, H Kondoh

TRENDS IN GENETICS 16(4) 182-187 2000年4月
Mechanism of regulatory target selection by the SOX high-mobility-group domain proteins as revealed by comparison of SOX1/2/3 and SOX9

Y Kamachi, KSE Cheah, H Kondoh

MOLECULAR AND CELLULAR BIOLOGY 19(1) 107-120 1999年1月
Involvement of Sox1, 2 and 3 in the early and subsequent molecular events of lens induction

Y Kamachi, M Uchikawa, J Collignon, R Lovell-Badge, H Kondoh

DEVELOPMENT 125(13) 2521-2532 1998年7月
Involvement of SOX proteins in lens-specific activation of crystallin genes

Y. Kamachi, S. Sockanathan, Q. Liu, M. Breitman, R. Lovell-Badge, H. Kondoh

EMBO Journal 14(14) 3510-3519 1995年
Overlapping positive and negative regulatory elements determine lens-specific activity of the δ-crystallin enhancer

Yusuke Kamachi, Hisato Kondoh

Molecular and Cellular Biology 13(9) 5206-5215 1993年9月

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MISC

Real-time observation of DNA conformational change using gold nanodimers

Hiroyuki Morimura, Hidekazu Ishitobi, Tomoyuki Mikami, Yusuke Kamachi, Hisato Kondoh, Yasushi Inouye

Optics InfoBase Conference Papers 2013年12月1日
B1 SOX coordinate cell specification with patterning and morphogenesis in the early zebrafish embryo

Yuichi Okuda, Hisato Kondoh, Yusuke Kamachi

DEVELOPMENTAL BIOLOGY 344(1) 490-491 2010年8月
カイコにおける改良型GAL4の転写活性とその利用について

小林功, 小島桂, 内野恵郎, 飯塚哲也, 立松謙一郎, 米村真之, 田中博光, 瀬筒秀樹, 町井博明, 田村俊樹 …

野蚕 (64) 8-9 2009年8月
カイコにおける改良型GAL4の転写活性とその利用について

小林功, 小島桂, 内野恵郎, 飯塚哲也, 立松謙一郎, 米村真之, 田中博光, 瀬筒秀樹, 町井博明, 田村俊樹 …

日本野蚕学会大会講演要旨集 15th 7 2009年
A transition in Sox2 gene regulation distinguishes the epiblastic and anterior neural plate states

Makiko Iwafuchi, Tatsuya Takemoto, Masanori Uchikawa, Yusuke Kamachi, Hisato Kondoh

DEVELOPMENTAL BIOLOGY 319(2) 593-593 2008年7月
融合型GAL4転写因子を利用した発現システムの改良

小林功, 内野恵郎, 小島桂, 田中博光, 山川稔, 小倉絵里, 蒲池雄介, 田村俊樹

日本蚕糸学会大会・蚕糸・昆虫機能学術講演会講演要旨集 78th 2008年
トランスジェニックカイコへの融合型GAL4転写因子の利用

小林功, 内野恵郎, 小島桂, 田中博光, 山川稔, 門宏明, 日下部宜宏, 小倉絵里, 蒲池雄介, 田村俊樹

日本蚕糸学会大会・蚕糸・昆虫機能学術講演会講演要旨集 77th 2007年
カイコにおける融合型GAL4の転写活性

小林功, 内野恵郎, 小島桂, 田中博光, 山川稔, 門宏明, 日下部宜宏, 小倉絵里, 蒲池雄介, 田村俊樹

生化学 2007年
SOX2は新規ゴナドトロピン(Gn)分泌調節候補遺伝子である

佐藤直子, 堀川玲子, 蒲池雄介, 近藤寿人, 吉田理恵, 緒方勤

日本内分泌学会雑誌 82(2) 475-476 2006年9月
Regulation of Sox2 in the development of eye primordia

M. Inoue, M. Uchikawa, Y. Kamachi, H. Kondoh

MECHANISMS OF DEVELOPMENT 122 S169-S169 2005年9月
Regulation of Sox2 gene in early neural development

M. Uchikawa, T. Takemoto, M. Iwafuchi, Y. Yoshida, Y. Kamachi, H. Kondoh

MECHANISMS OF DEVELOPMENT 122 S167-S167 2005年9月
Evaluation and application of binary expression systems in zebrafish

Y. Kamachi, E. Ogura, H. Kondoh

MECHANISMS OF DEVELOPMENT 122 S147-S148 2005年9月
Zebrafish B1 sox genes revealing evolutional diversification of function and expression profiles

Y. Okuda, M. Uchikawa, H. Kondoh, Y. Kamachi

MECHANISMS OF DEVELOPMENT 122 S156-S156 2005年9月
Mechanisms of neural induction and patterning illuminated by the regulation of Sox2 enhancers

H. Kondoh, T. Takemoto, M. Inoue, M. Iwafuchi, Y. Yoshida, Y. Kamachi, M. Uchikawa

MECHANISMS OF DEVELOPMENT 122 S175-S175 2005年9月
Defective inhibition of beta-catenin signaling in variants of SOX1 from spina bifida patients.

JS Nye, L Kan, J Luo, Reddy, V, SG Guy, Z Gu, M Matsumata, Y Kamachi, J Charrow, JF Sarwark …

AMERICAN JOURNAL OF HUMAN GENETICS 69(4) 582-582 2001年10月
Sp1, AP-2によるレンズフィレンシン遺伝子プロモータの活性制御の解析

正木茂夫, 米澤敏, 蒲池雄介, 近藤寿人

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 21 594-594 1998年12月1日
How the specificity of the SOX HMG domain proteins is determined in transcriptional activation.

Y Kamachi, M Uchikawa, H Kondoh

DEVELOPMENTAL BIOLOGY 186(2) A120-A120 1997年6月
Two mechanisms in the action of repressor delta EF1: binding site competition with an activator and general repression

R Sekido, K Murai, Y Kamachi, H Kondoh

DEVELOPMENTAL BIOLOGY 186(2) A121-A121 1997年6月
Coexpression of Pax6 and Sox2/3 as a condition of lens differentiation

H Kondoh, M Uchikawa, Y Kamachi, H Takeda, M FurutaniSeiki, R Karlstrom

DEVELOPMENTAL BIOLOGY 186(2) S26-S26 1997年6月
Involvement of SOX proteins in activation of crystallin genes and lens development

Y. Kamachi

Tanpakushitsu kakusan koso. Protein, nucleic acid, enzyme 41 1113-1123 1996年1月1日

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

発光タグHiBiTの高機能化・多機能化を通した新規発生遺伝子解析手法の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

蒲池雄介
発生における分化スイッチを担うSoxパートナー因子複合体のin vivo作用機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2018年4月 - 2021年3月

蒲池雄介
タンパク質とゲノムの相互作用を組織特異的に検出する方法の開発と応用

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2015年4月 - 2018年3月

蒲池雄介
Sox転写因子とmicroRNAが構成する遺伝子制御ネットワークの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2013年4月 - 2017年3月

蒲池雄介
細胞分化スイッチ機構を担うＳＯＸ－パートナー因子複合体のゲノム標的認識

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2011年4月 - 2015年3月

近藤寿人, 蒲池雄介
胚発生と対応する幹細胞群を活用した、神経系原基形成の遺伝子制御ネットワークの研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2010年5月 - 2014年3月

近藤寿人, 蒲池雄介, 内川昌則, 竹本龍也
転写制御機構から探る再生原理

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2011年4月 - 2013年3月

蒲池雄介
神経分化を負に制御する新規転写抑制機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2010年4月 - 2013年3月

蒲池雄介
PAX6―SOX2―DNA複合体の塩基配列特異的な構造変化と遺伝子スイッチ機能

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2008年 - 2009年

近藤寿人, 蒲池雄介
Sox遺伝子の機能と発現制御機構の多様化から探る系統発生のゲノム基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2008年 - 2009年

蒲池雄介, 近藤寿人, 内川昌則
神経系成立の基盤としてのSOX因子群の制御と相互作用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2005年 - 2009年

近藤寿人, 蒲池雄介, 内川昌則, 竹本龍也
初期神経発生におけるSOX因子の転写調節ネットワークの小型魚類を利用した解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2006年 - 2007年

蒲池雄介
Sox遺伝子の機能と発現制御機構の多様化から探る系統発生のゲノム基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2006年 - 2007年

蒲池雄介, 近藤寿人, 内川昌則
Sox遺伝子の制御配列の保存と多用性が示す遺伝子群の進化

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2005年 - 2005年

近藤寿人, 蒲池雄介, 内川昌則
HMGタンパク質SOX2の細胞分化と形態形成における転写調節ネットワーク

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2004年 - 2005年

蒲池雄介
小型魚類を利用した眼形成遺伝子の挿入突然変異法による探索

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2004年 - 2005年

蒲池雄介
小型魚類を利用した網羅的な転写制御カスケード同定法の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2004年 - 2004年

蒲池雄介
転写活性化におけるSOX2とPax6のパートナーシップと水晶体分化の分子機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2000年 - 2001年

蒲池雄介
Soxファミリー転写調節因子による細胞分化の制御

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 1999年 - 2001年

近藤寿人, 佐々木洋, 蒲池雄介
HMGドメイン転写因子SOXによるN-カドヘリン遺伝子の発現制御

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究(C) 2000年 - 2000年

蒲池雄介

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