神沼英里 更新日: 18/02/19 15:50
プロフィール 国立遺伝学研究所 生命情報研究センター所属。ライフサイエンスAIが専門。DNA配列データ・実験計測画像データを中心とした生命科学分野での自動アノテーション研究に従事。最近は、大規模生命情報データを対象とした機械学習モデリングやクラウドサイエンス（クラウドソーシング応用）の研究をしています。
経歴
2009年4月
国立遺伝学研究所 生命情報・DDBJ研究センター 助教
2017年10月
-
2018年3月
産総研 人工知能研究センター 協力研究員
2001年7月
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2009年3月
独立行政法人理化学研究所 研究員
1999年4月
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2001年6月
和歌山大学 システム工学部 助手
1999年2月
-
1999年3月
日本学術振興会 特別研究員DC2
論文
Shimizu T, Tanizawa Y, Mochizuki T, Nagasaki H, Yoshioka T, Toyoda A, Fujiyama A, Kaminuma E, Nakamura Y
Frontiers in genetics 8 180 2017年12月 [査読有り]
Kodama Y, Mashima J, Kosuge T, Kaminuma E, Ogasawara O, Okubo K, Nakamura Y, Takagi T
Nucleic acids research 2017年10月 [査読有り]
Minamikawa MF, Nonaka K, Kaminuma E, Kajiya-Kanegae H, Onogi A, Goto S, Yoshioka T, Imai A, Hamada H, Hayashi T, Matsumoto S, Katayose Y, Toyoda A, Fujiyama A, Nakamura Y, Shimizu T, Iwata H
Scientific reports 7(1) 4721 2017年7月 [査読有り]
Tanizawa Y, Kobayashi H, Kaminuma E, Sakamoto M, Ohkuma M, Nakamura Y, Arita M, Tohno M
Bioscience of microbiota, food and health 36(3) 129-134 2017年 [査読有り]
Mochizuki T, Tanizawa Y, Fujisawa T, Ohta T, Nikoh N, Shimizu T, Toyoda A, Fujiyama A, Kurata N, Nagasaki H, Kaminuma E, Nakamura Y
PloS one 12(2) e0172269 2017年2月 [査読有り]
書籍等出版物
次世代シーケンサーデータの解析手法 第 7 回 ロングリードアセンブリ
谷澤 靖洋、神沼 英里、中村 保一、遠野 雅徳 、 大崎 研、清水 謙多郎 、門田 幸二 (担当:共著)
乳酸菌学会誌vol27,No.2 解説 2016年7月
育種学研究 Vol.17 No.2 2014年第56回シンポジウム(シンポジウム・ワークショップ)報告
神沼英里, 望月 孝子, 門田 有希, 小林 正明, 大柳 一, 矢野 健太郎 (担当:共著, 範囲:遺伝研スパコンとコマンドラインでのNGSデータ使い倒し講座)
2015年7月
実験医学別冊「次世代シークエンス解析スタンダード」
長崎英樹,望月孝子,谷沢靖洋,神沼英里,中村保一 (担当:共著, 範囲:Ⅵ-4 DDBJ Read Annotation Pipeline 解析パイプラインによるRNA-Seq de novo assemblyとイネ多型解析)
羊土社 2014年8月
遺伝子図鑑
国立遺伝学研究所「遺伝子図鑑」編集委員会 (担当:分担執筆, 範囲:3−9 葉緑体, 11−4 遺伝子のデータベース)
悠書館 2013年10月 ISBN:978-4-903487-79-3
育種学研究 Vol. 15 No. 3 2012年第54回シンポジウム（シンポジウム・ワークショッ プ）報告
神沼 英里, 七夕 高也, 矢野 健太郎, 清水 顕史, 岩田 洋佳 (担当:共著, 範囲:育種のための情報解析ツール使い倒し塾)
日本育種学会 2013年10月
講演・口頭発表等
A Deep Learning Coding Exercise using Oxford Flower Image Dataset
神沼英里
植物生理学会年会WSデータベース講習会 2018年3月29日
ディープラーニングを用いたDNA配列からの微生物生態属性値の予測
神沼英里, 藤澤貴智, 林史, 中村保一, 高木利久, 瀬々潤, 小笠原理
第12回日本ゲノム微生物学会年会 2018年3月6日
神沼英里
第1回 DSTEP 講習会 in 三島 2018年1月26日
神沼英里,藤澤 貴智,林 史,西澤 達也,中村 保一,小笠原 理
環境微生物系学会合同大会2017 2017年8月29日
Eli Kaminuma, Takatomo Fujisawa, Fumi Hayashi, Tatsuya Nishizawa, Yasukazu Nakamura, Osamu Ogasawara
NIG International Symposium 2017 2017年5月29日
Works
神沼英里, 鹿島久嗣, 高木利久 その他 2016年7月 - 2016年8月
Eli Kaminuma (Hisashi Kashima, Asao Fujiyama, Yasukazu Nakamura, Takatomo Fujisawa, Yukino Baba, Yoshiki Mochizuki) Webサービス 2016年6月
神沼英里 教材 2015年4月 - 2016年12月
Haruo Suzuki (Yukuto Sato, Riu Yamashita, Makoto Kuroda,Eli Kaminuma) Webサービス 2015年1月
神沼英里 (主要貢献者：望月孝子,谷沢靖洋,中村保一) データベース 2013年3月
神沼英里（主要貢献者：藤澤貴智,谷沢靖洋,坂本直子） データベース 2012年8月
神沼英里(主要貢献者：長崎英樹,望月孝子,谷沢靖洋,坂本直子) Webサービス 2009年8月
神沼英里 コンピュータソフト 2007年7月
(MATLAB GUI-based)
競争的資金等の研究課題
農林水産省委託プロジェクト研究「多数の遺伝子が関与する形質を改良する新しい育種技術の開発」
研究期間: 2016年4月 - 2018年3月 代表者: 野中圭介（清水徳朗、神沼英里)
JST: CREST H26年度 特定課題調査費
研究期間: 2014年10月 - 2015年3月 代表者: 鹿島久嗣(松原繁夫、森嶋厚行、小山聡、櫻井祐子、大向 一輝、馬場雪乃、神沼英里)
JST: CREST H25年度 特定課題調査費
研究期間: 2013年11月 - 2014年3月 代表者: 鹿島久嗣（松原繁夫、森嶋厚行、小山聡、櫻井祐子、神沼英里、馬場雪乃、王晶晶、張承成）
農林水産省委託プロジェクト研究「多数の遺伝子が関与する形質を改良する新しい育種技術の開発」:
研究期間: 2013年7月 - 2016年3月 代表者: 清水徳朗 (神沼英里)
日本学術振興会: 科研費基盤研究(C)
研究期間: 2012年4月 - 2015年3月 代表者: 神沼英里
学歴
1995年9月
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1999年3月
奈良先端科学技術大学院大学 情報科学研究科 博士課程（博士(工学))
1993年4月
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1995年3月
奈良女子大学 理学研究科 修士課程
1989年4月
-
1993年3月
奈良教育大学 教育学部 特別教員養成課程(高校理科)
特許
特願2017-032011 : 情報処理装置、情報処理方法及び情報処理プログラム
神沼英里
社会貢献活動
画像認識AIによる植物分類精度調査
【助言・指導】 職場体験学習(静岡県立韮山高等学校2名) 2017年8月24日
【講師】 国立遺伝学研究所 一般公開 2017年4月8日
クラウドサイエンス体験学習
【助言・指導】 職場体験学習(御殿場南高校1年生6名) 2016年8月4日
クラウドサイエンス体験学習
【助言・指導】 職場体験学習(三島市山田中学校5名) 2015年11月13日
静岡新聞夕刊こち女 リケジョ特集「2児の母"生命の謎"探究」
【インタビュイー】 静岡新聞 2015年10月2日
注目の...
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