笠原健人 (Kasahara Kento) - マイポータル

基本情報

所属: 大阪大学大学院基礎工学研究科物質創成専攻化学工学領域分子集合系化学工学グループ（松林グループ）助教

研究者番号: 10824469
ORCID ID: https://orcid.org/0000-0001-7138-250X
J-GLOBAL ID: 202001015283710975
researchmap会員ID: B000382319

研究キーワード

研究分野

経歴

2020年4月 - 現在

大阪大学, 大学院基礎工学研究科物質創成専攻化学工学領域分子集合系化学工学グループ（松林グループ）, 助教
2018年4月 - 2020年3月

国立研究開発法人理化学研究所生命機能科学研究センター, 分子機能シミュレーション研究チーム, 研究員
2015年4月 - 2017年3月

独立行政法人日本学術振興会, 特別研究員（DC2）

学歴

2014年4月 - 2018年3月

京都大学大学院, 工学研究科分子工学専攻博士課程
2012年4月 - 2014年3月

京都大学大学院, 工学研究科分子工学専攻修士課程

委員歴

2023年4月 - 現在

溶液化学研究会若手の会, 実行委員
2021年6月 - 現在

溶液化学研究会, 編集委員

受賞

論文

A methodology of quantifying membrane permeability based on returning probability theory and molecular dynamics simulation

Yuya Matsubara, Ryo Okabe, Ren Masayama, Nozomi Morishita Watanabe, Hiroshi Umakoshi, Kento Kasahara, Nobuyuki Matubayasi

arXiv preprint arXiv:2404.11363 2024年4月責任著者
Influence of cholesterol on hydrogen-bond dynamics of water molecules in lipid-bilayer systems at varying temperatures

Kokoro Shikata, Kento Kasahara, Nozomi Morishita Watanabe, Hiroshi Umakoshi, Kang Kim, Nobuyuki Matubayasi

arXiv preprint arXiv:2403.08289 2024年3月
Solvation dynamics on the diffusion timescale elucidated using energy-represented dynamics theory

Kazuya Okita, Natsuumi Ito, Nozomi Morishita-Watanabe, Hiroshi Umakoshi, Kento Kasahara, Nobuyuki Matubayasi

Physical Chemistry Chemical Physics 2024年査読有り責任著者
Free-energy decomposition of salt effects on the solubilities of small molecules and the role of excluded-volume effects

Stefan Hervø-Hansen, Daoyang Lin, Kento Kasahara, Nobuyuki Matubayasi

Chemical Science 15(2) 477-489 2024年査読有り
Elucidating protein-ligand binding kinetics based on returning probability theory

Kento Kasahara, Ren Masayama, Kazuya Okita, Nobuyuki Matubayasi

The Journal of Chemical Physics 2023年9月査読有り筆頭著者責任著者
凝縮系のダイナミクスを解析するためのエネルギー表示理論の開発

笠原健人, 沖田和也, 松林伸幸

理論化学会誌「フロンティア」 5(2) 90-98 2023年4月査読有り招待有り筆頭著者責任著者
分子会合過程に対する理論的アプローチ

笠原健人

化学と工業 2023年4月査読有り招待有り筆頭著者最終著者責任著者
溶液統計力学と分子動力学に基づく分子会合過程の理論的解析

笠原健人

溶液化学研究会誌 3 2023年3月査読有り招待有り筆頭著者最終著者責任著者
Arylazopyrazole-Based Photoswitchable Inhibitors Selective for Escherichia coli Dihydrofolate Reductase

Himadri S. Sarkar, Takato Mashita, Toshiyuki Kowada, Satoshi Hamaguchi, Toshizo Sato, Kento Kasahara, Nobuyuki Matubayasi, Toshitaka Matsui, Shin Mizukami

ACS Chemical Biology 18(2) 340-346 2023年1月20日査読有り
Diffusion theory of molecular liquids in the energy representation and application to solvation dynamics

Kazuya Okita, Kento Kasahara, Nobuyuki Matubayasi

The Journal of Chemical Physics 157(24) 244505-244505 2022年12月28日査読有り責任著者
Crystal Growth of Urea and Its Modulation by Additives as Analyzed by All-Atom MD Simulation and Solution Theory

Senri Tanaka, Naoki Yamamoto, Kento Kasahara, Yoshiki Ishii, Nobuyuki Matubayasi

The Journal of Physical Chemistry B 126(28) 5274-5290 2022年7月21日査読有り
Modified protein-water interactions in CHARMM36m for thermodynamics and kinetics of proteins in dilute and crowded solutions

Daiki Matsubara, Kento Kasahara, Hisham Dokainish, Hiraku Oshima, Yuji Sugita

Molecules 27(17) 5726-5743 2022年査読有り
分子動力学シミュレーション法の基礎

笠原健人

溶液化学研究会誌 1 22-30 2022年査読有り招待有り筆頭著者最終著者責任著者
Constructing a Memory Kernel of the Returning Probability to Efficiently Describe Molecular Binding Processes

Kento Kasahara, Ren Masayama, Yuya Matsubara, Nobuyuki Matubayasi

Chemistry Letters 51(8) 823-827 2022年査読有り筆頭著者責任著者
Solvation in nitration of benzene and the valence electronic structure of the Wheland intermediate

Kaho Nakatani, Sho Teshigawara, Yuta Tanahashi, Kento Kasahara, Masahiro Higashi, Hirofumi Sato

Physical Chemistry Chemical Physics 24(27) 16453-16461 2022年査読有り
Atomistic description of molecular binding processes based on returning probability theory

Kento Kasahara, Ren Masayama, Kazuya Okita, Nobuyuki Matubayasi

J. Chem. Phys. 155(20) 204503 2021年査読有り筆頭著者責任著者
Optimized Hydrogen Mass Repartitioning Scheme Combined with Accurate Temperature/Pressure Evaluations for Thermodynamic and Kinetic Properties of Biological Systems

Jung, Jaewoon, Kasahara, Kento, Kobayashi, Chigusa, Oshima, Hiraku, Mori, Takaharu, Sugita, Yuji

Journal of Chemical Theory and Computation 17(9) 5312-5321 2021年査読有り
New parallel computing algorithm of molecular dynamics for extremely huge scale biological systems

Jung, Jaewoon, Kobayashi, Chigusa, Kasahara, Kento, Tan, Cheng, Kuroda, Akiyoshi, Minami, Kazuo, Ishiduki, Shigeru, Nishiki, Tatsuo, Inoue, Hikaru, Ishikawa, Yutaka …

Journal of Computational Chemistry 42(4) 231-241 2021年査読有り
Reduced efficacy of a Src kinase inhibitor in crowded protein solution

Kasahara, Kento, Re, Suyong, Nawrocki, Grzegorz, Oshima, Hiraku, Mishima-Tsumagari, Chiemi, Miyata-Yabuki, Yukako, Kukimoto-Niino, Mutsuko, Yu, Isseki, Shirouzu, Mikako, Feig, Michael …

Nature Communications 12(1) 1-8 2021年査読有り筆頭著者
博士論文紹介「分子性液体における拡散と溶媒和の積分方程式理論」

笠原健人

アンサンブル 22(1) 81-86 2020年査読有り招待有り筆頭著者最終著者責任著者

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MISC

Simulations of biomolecules in cellular crowded environments

Yuji Sugita, Kento Kasahara, Hiraku Oshima, Isseki Yu, Grzegorz Nawrocki, Suyong Re, Michael Feig

JOURNAL OF BIOMOLECULAR STRUCTURE & DYNAMICS 37 51-52 2019年5月
Elucidating the crowding effect on protein-ligand binding process

Kento Kasahara, Hiraku Oshima, Grzegorz Nawrocki, Isseki Yu, Suyong Re, Michael Feig, Yuji Sugita

ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 257 2019年3月

講演・口頭発表等

Atomistic Description of Molecular Binding Processes Based on Bimolecular Reaction Theory

笠原健人

9th International Discussion Meeting on Relaxations in Complex Systems (9IDMRCS) 2023年8月17日招待有り
分子会合ダイナミクスを記述する理論的手法の開発

笠原健人

研究会「理論化学若手セミナー」 2023年7月8日招待有り
Atomistic Description of Molecular Binding Processes Based on Bimolecular Reaction Theory

Kento Kasahara

StudyCamp2023 2023年6月7日招待有り
溶液統計力学と分子動力学に基づく分子会合過程の理論的解析

笠原健人

第44回溶液化学シンポジウム 2022年10月27日招待有り
分子動力学に基づく分子会合過程の理論的解析

笠原健人

溶液化学研究会第１回溶液化学夏季講演会 2021年7月26日招待有り
混雑環境がタンパク質–リガンド結合に及ぼす影響の分子動力学解析

笠原健人

九州大学セミナー 2019年12月5日招待有り
拡散律速反応ダイナミクスの分子理論

研究会『化学反応のポテンシャル曲面とダイナミクス』 2017年4月9日招待有り
分子動力学と2分子反応理論に基づく分子会合過程の記述

笠原健人

次世代若手研究者による応用計算・理論化学研究会2023
Molecular dynamics analysis of the crowding effects on protein-ligand binding mechanism

Kento Kasahara, Suyong Re, Hiraku Oshima, Nawrocki Grzegorz, Michael Feig, Yuji Sugita

第42回日本分子生物学会年会招待有り

担当経験のある科目(授業)

2021年4月 - 現在

化学工学演習I（学部） (大阪大学基礎工学部)
2020年4月 - 現在

化学工学実験I（学部） (大阪大学基礎工学部)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

分子動力学と分光実験に基づく膜透過現象に対する共溶媒効果の究明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2023年4月 - 2026年3月

笠原健人, 渡邉望美
クロススケール細胞内分子構造動態の実験データ融合モデリング

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 学術変革領域研究(A) 2021年9月 - 2026年3月

杉田有治, 笠原健人
膜透過現象に対する共溶媒添加効果の動力学解析

HPCI 令和5年度A期 HPCIシステム利用研究課題（若手課題） 2023年4月 - 2024年3月

笠原健人, 小嶋秀和, 山田一雄, 肥喜里志門, 渡邉望美, 沖田和也, 八十島宣宏
不均一環境がタンパク質-基質結合過程に及ぼす影響の動力学解析

HPCI 令和4年度一般利用区分「富岳」若手課題（B期） 2022年10月 - 2023年9月

笠原健人, 小嶋秀和, 肥喜里志門, 山田一雄
不均一環境下での分子会合過程を解析するための新規理論手法開発

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究若手研究 2021年4月 - 2023年3月

笠原健人
溶液内における蛍光消光反応ダイナミクスの分子理論

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2015年4月 - 2017年3月

笠原健人

学術貢献活動

分子集合系計算科学セミナー

企画立案・運営等

笠原健人・石井良樹 (https://sites.google.com/view/bunsisyugo/%E9%96%8B%E5%82%AC%E5%B1%A5%E6%AD%B4?authuser=0) 2021年9月28日 - 現在
第2回分子集合系計算科学セミナー

企画立案・運営等, パネル司会・セッションチェア等

2021年10月4日 - 2021年10月4日
第1回分子集合系計算科学セミナー

企画立案・運営等, パネル司会・セッションチェア等

笠原健人・石井良樹 2021年9月28日 - 2021年9月28日

笠原健人

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

委員歴

受賞

論文

MISC

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

学術貢献活動

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