川端猛 (Takeshi Kawabata) - マイポータル

基本情報

所属: 東北大学大学院情報科学研究科特任准教授

学位: 博士(農学)(1997年3月東京大学)

連絡先: takeshi.kawabata.b8tohoku.ac.jp
研究者番号: 60343274
J-GLOBAL ID: 201901004207398307
researchmap会員ID: B000372121

外部リンク: http://www.sb.ecei.tohoku.ac.jp/lab/members/

1992年(平成4年)3月: 東京大学工学部精密機械工学科卒業
1997年(平成9年)3月: 東京大学農学生命科学研究科応用生命工学専攻博士課程修了。博士（農学）取得指導教員：清水謙多郎教授
1997年(平成9年)4月: 国立遺伝学研究所COE研究員（指導教員：西川建教授)
1999年(平成11年)4月: 科学技術振興事業団( 国立遺伝学研究所で研究に従事) 博士研究員（指導教員：西川建教授)
2000年(平成12年)7月 :日本学術振興会特別研究員( 国立遺伝学研究所で研究に従事) 博士研究員（指導教員：西川建教授)
2001年 (平成13年)10月: 奈良先端科学技術大学院大学情報科学研究科研究員（科学技術振興）（客員助教授）
2006年(平成18年)4月:奈良先端科学技術大学院大学情報科学研究科助教授（任期５年）
2011年(平成23年)4月: 大阪大学蛋白質研究所特任研究員（客員准教授）
2016年(平成28年)6月: 大阪大学蛋白質研究所寄附研究部門准教授（招へい准教授）
2018年(平成30年)4月: 大阪大学蛋白質研究所特任准教授（招へい准教授）

2021年(令和 3年)4月: 蛋白質研究奨励会研究員, 大阪大学大学院生命機能研究科招へい准教授
2022年(令和 4年)4月: 東北大学大学院　情報科学研究科　特任准教授 (木下・大林・西研究室)

研究分野

ライフサイエンス / 生物物理学 /

受賞

2017年9月

第6回（2017) Biophysics and Physicobiology 論文賞 Takeshi Kawabata, Yusuke Sugihara, Yoshifumi Fukunishi, Haruki Nakamura "LigandBox: A database for 3D structures of chemical compounds" BIOPHYSICS Vol.9 pp.113-121 (2013) 日本生物物理学会

川端猛

論文

Identification of ultra-rare disruptive variants in voltage-gated calcium channel-encoding genes in Japanese samples of schizophrenia and autism spectrum disorder.

Chenyao Wang, Shin-Ichiro Horigane, Minoru Wakamori, Shuhei Ueda, Takeshi Kawabata, Hajime Fujii, Itaru Kushima, Hiroki Kimura, Kanako Ishizuka, Yukako Nakamura, Yoshimi Iwayama, Masashi Ikeda, Nakao Iwata, Takashi Okada, Branko Aleksic, Daisuke Mori, Takashi Yoshida, Haruhiko Bito, Takeo Yoshikawa, Sayaka Takemoto-Kimura, Norio Ozaki

Translational psychiatry 12(1) 84-84 2022年2月26日
Protein Data Bank Japan: Celebrating our 20th anniversary during a global pandemic as the Asian hub of three dimensional macromolecular structural data.

Gert-Jan Bekker, Masashi Yokochi, Hirofumi Suzuki, Yasuyo Ikegawa, Takeshi Iwata, Takahiro Kudou, Kei Yura, Toshimichi Fujiwara, Takeshi Kawabata, Genji Kurisu

Protein science : a publication of the Protein Society 31(1) 173-186 2022年1月
Difference of binding modes among three ligands to a receptor mSin3B corresponding to their inhibitory activities

Tomonori Hayami, Narutoshi Kamiya, Kota Kasahara, Takeshi Kawabata, Jun-ichi Kurita, Yoshifumi Fukunishi, Yoshifumi Nishimura, Haruki Nakamura, Junichi Higo

Scientific Reports 11(1) 2021年12月査読有り
Functional characterization of rare NRXN1 variants identified in autism spectrum disorders and schizophrenia

Kanako Ishizuka, Tomoyuki Yoshida, Takeshi Kawabata, Ayako Imai, Hisashi Mori, Hiroki Kimura, Toshiya Inada, Yuko Okahisa, Jun Egawa, Masahide Usami, Itaru Kushima, Mako Morikawa, Takashi Okada, Masashi Ikeda, Aleksic Branko, Daisuke Mori, Toshiyuki Someya, Nakao Iwata, Norio Ozaki

Journal of Neurodevelopmental Disorders 12(1) 25-25 2020年12月査読有り筆頭著者
Molecular Interaction Mechanism of a 14-3-3 Protein with a Phosphorylated Peptide Elucidated by Enhanced Conformational Sampling

Junichi Higo, Takeshi Kawabata, Ayumi Kusaka, Kota Kasahara, Narutoshi Kamiya, Ikuo Fukuda, Kentaro Mori, Yutaka Hata, Yoshifumi Fukunishi, Haruki Nakamura

Journal of Chemical Information and Modeling 60(10) 4867-4880 2020年10月26日査読有り
Current State and Perspectives Related to the Polyethylene Terephthalate Hydrolases Available for Biorecycling

Fusako Kawai, Takeshi Kawabata, Masayuki Oda

ACS Sustainable Chemistry & Engineering 2020年6月5日査読有り
The Biological Structure Model Archive (BSM-Arc): an archive for in silico models and simulations

Gert-Jan Bekker, Takeshi Kawabata, Genji Kurisu

Biophysical Reviews 2020年2月5日査読有り
Current knowledge on enzymatic PET degradation and its possible application to waste stream management and other fields.

Kawai F, Kawabata T, Oda M

Applied microbiology and biotechnology 103(11) 4253-4268 2019年6月査読有り
Multimodal Structural Distribution of the p53 C-Terminal Domain upon Binding to S100B via a Generalized Ensemble Method: From Disorder to Extradisorder.

Iida S, Kawabata T, Kasahara K, Nakamura H, Higo J

Journal of chemical theory and computation 15(4) 2597-2607 2019年4月査読有り
混合正規分布を用いた剛体フィッティング法：電顕密度マップに原子モデルを重ねる計算

川端猛

生物物理 59(6) 320-323 2019年招待有り筆頭著者
Detection of cave pockets in large molecules: Spaces into which internal probes can enter, but external probes from outside cannot

Takeshi Kawabata

Biophysics and Physicobiology 16 391-406 2019年査読有り筆頭著者
Gaussian-input Gaussian mixture model for representing density maps and atomic models

Takeshi Kawabata

Journal of Structural Biology 203(1) 1-16 2018年7月1日査読有り
統合失調症に強い関連を示した稀な遺伝子変異に基づく精神疾患の分子病態解明

木村大樹, 藤田幸, 川端猛, 森大輔, 岩山佳美, 岡久祐子, 池田匡志, 岩田仲生, 吉川武男, 山下俊英, 中村春木, 尾崎紀夫

先進医薬研究振興財団研究成果報告集 2017年度 80-81 2018年3月
Rigid-Body Fitting of Atomic Models on 3D Density Maps of Electron Microscopy.

Kawabata T

Advances in experimental medicine and biology 1105 219-235 2018年査読有り
New tools and functions in data-out activities at Protein Data Bank Japan (PDBj)

Akira R. Kinjo, Gert-Jan Bekker, Hiroshi Wako, Shigeru Endo, Yuko Tsuchiya, Hiromu Sato, Hafumi Nishi, Kengo Kinoshita, Hirofumi Suzuki, Takeshi Kawabata, Masashi Yokochi, Takeshi Iwata, Naohiro Kobayashi, Toshimichi Fujiwara, Genji Kurisu, Haruki Nakamura

Protein Science 27(1) 95-102 2017年9月査読有り
Rare genetic variants in CX3CR1 and their contribution to the increased risk of schizophrenia and autism spectrum disorders

K Ishizuka, Y Fujita, T Kawabata, H Kimura, Y Iwayama, T Inada, Y Okahisa, J Egawa, M Usami, I Kushima, Y Uno, T Okada, M Ikeda, B Aleksic, D Mori, To Someya, T Yoshikawa, N Iwata, H Nakamura, T Yamashita, N Ozaki

Translational Psychiatry 7(8) e1184-e1184 2017年8月査読有り
A novel rare variant R292H in RTN4R affects growth cone formation and possibly contributes to schizophrenia susceptibility

H Kimura, Y Fujita, T Kawabata, K Ishizuka, C Wang, Y Iwayama, Y Okahisa, I Kushima, M Morikawa, Y Uno, T Okada, M Ikeda, T Inada, A Branko, D Mori, T Yoshikawa, N Iwata, H Nakamura, T Yamashita, N Ozaki

Translational Psychiatry 7(8) e1214-e1214 2017年8月査読有り
Mutational analysis of cutinase-like enzyme, Cut190, based on the 3D docking structure with model compounds of polyethylene terephthalate

Takeshi Kawabata, Masayuki Oda, Fusako Kawai

JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING 124(1) 28-35 2017年7月査読有り
HOMCOS: an updated server to search and model complex 3D structures

Takeshi Kawabata

Journal of Structural and Functional Genomics 17(4) 83-99 2016年12月1日査読有り
Toward the next step in G protein-coupled receptor research: a knowledge-driven analysis for the next potential targets in drug discovery

Koji Nagata, Yukie Katayama, Tomomi Sato, Yeondae Kwon, Takeshi Kawabata

Journal of Structural and Functional Genomics 17(4) 111-133 2016年12月1日査読有り

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MISC

Biological Structure Model Archive:計算機で得られた生体分子モデルのアーカイブ

BEKKER Gert-Jan, KAWABATA Takeshi, KURISU Genji

生物物理(Web) 59(Supplement 1-2) 2019年
統合失調症に強い関連を示した稀な遺伝子変異に基づく精神疾患の分子病態解明

木村大樹, 藤田幸, 川端猛, 森大輔, 岩山佳美, 岡久祐子, 池田匡志, 岩田仲生, 吉川武男, 山下俊英, 中村春木, 尾崎紀夫

先進医薬研究振興財団研究成果報告集 2017年度 80-81 2018年3月
統合失調症発症に強い影響を及ぼす、頻度の低い稀な遺伝子変異を22q11.2欠失領域に存在するミエリン関連遺伝子のRTN4Rに同定した

木村大樹, 藤田幸, 川端猛, 石塚佳奈子, Wang Chenyao, 岩山佳美, 岡久祐子, 久島周, 宇野洋太, 岡田俊, 森川真子, 森大輔, 池田匡志, 稲田俊也, Aleksic Branko, 吉川武男, 岩田仲生, 中村春木, 山下俊英, 尾崎紀夫

日本生物学的精神医学会・日本神経精神薬理学会合同年会プログラム・抄録集 39回・47回 190-190 2017年9月
Protein Data Bank Japan (PDBj): updated semantic web services and tools for large structures

A. R. Kinjo, G-J. Bekker, H. Suzuki, Y. Tsuchiya, T. Kawabata, Y. Ikegawa, G. Kurisu, H. Nakamura

EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS 46 S274-S274 2017年7月
統合失調症発症に強い影響を及ぼす、頻度の低い稀な遺伝子変異を22q11.2欠失領域に存在するミエリン関連遺伝子のRTN4Rに同定した

木村大樹, 尾崎紀夫, 藤田幸, 川端猛, 石塚佳奈子, Wang Chenyao, 岩山佳美, 岡久祐子, 久島周, 森川真子, 宇野洋太, 岡田俊, 森大輔, 池田匡志, 稲田俊也, Aleksic Branko, 吉川武男, 岩田仲生, 中村春木, 山下俊英

精神神経学雑誌 (2017特別号) S622-S622 2017年6月
Searching and viewing hybrid structure data

Hirofumi Suzuki, Gert-Jan Bekker, Takeshi Kawabata, Genji Kurisu, Haruki Nakamura

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES 73 C974-C974 2017年
Omokage Search and Gmfit: Shape Similarity Search and Superposition among Models and Maps

Takeshi Kawabata, Hirofumi Suzuki, Haruki Nakamura

BIOPHYSICAL JOURNAL 110(3) 157A-157A 2016年2月
EMDB,PDB,SASBDB中の多階層構造データを対象としたウェブベースのサービス

SUZUKI Hirofumi, SUZUKI Hirofumi, KAWABATA Takeshi, BEKKER Gert-Jan, BEKKER Gert-Jan, NAKAMURA Haruki, NAKAMURA Haruki

生物物理(Web) 56(Supplement 1-2) 2016年
A Comparison of 3D Conformations of Endothelin-1 Analogs to Find the Pharmacophore Model Required for Endothelin Receptor Ligand Activity

M. A. Benson, Takeshi Kawabata, Narutoshi Kamiya, Haruki Nakamura

BIOPHYSICAL JOURNAL 106(2) 479A-479A 2014年1月
Homcos : A Server to Search and Model 3D Structures of Protein-Protein and Compound-Protein Complexes

Takeshi Kawabata, Haruki Nakamura, Akira Kinjo

BIOPHYSICAL JOURNAL 106(2) 207A-207A 2014年1月
Comparison of two polyester-degrading enzymes from Thermobifida alba AHK119

Fusako Kawai, Uschara Thumarat, Kengo Kitadokoro, Naoki Tanaka, Takeshi Kawabata

ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY 244 2012年8月
Electrostatic discrimination between adenine- and guanine-specific binding sites in proteins

G Basu, D Sivanesan, T Kawabata, N Go

PROTEIN SCIENCE 13 75-75 2004年8月

書籍等出版物

実験医学増刊 Vol.40 No.17 バイオDBとウェブツールラボで使える最新70選〜知る・学ぶ・使う、バイオDX時代の羅針盤

小野, 浩雅 (担当:共著, 範囲:第5章タンパク質やその立体構造について調べる 4．Molmil ─ ウェブベースの分子ビューア【Gert-Jan Bekker，川端猛，栗栖源嗣】, 5．HOMCOS ─ タンパク質の結合立体構造の検索とモデリング【川端猛】, 6．AlphaFoldDB ─ タンパク質の予測立体構造のデータベース【川端猛】)

羊土社 2022年10月24日 (ISBN: 4758104069)
バイオインフォマティクス入門第2版

日本バイオインフォマティクス学会 (担当:共著, 範囲:第4章構造解析4ー14 電子顕微鏡のインフォマティクス【川端猛】)

慶應義塾大学出版会 2021年12月17日 (ISBN: 4766427912)
よくわかるバイオインフォマティクス入門 (KS生命科学専門書)

岩部直之, 川端猛, 浜田道昭, 門田幸二, 須山幹太, 光山統泰, 黒川顕, 森宙史, 東光一, 吉沢明康, 片山俊明

講談社 2018年11月19日 (ISBN: 4065138213)
見てわかる構造生命科学: 生命科学研究へのタンパク質構造の利用

中村, 春木, 川端, 猛, 鷹野, 優, 鈴木, 博文, 緒方, 一博, 椎名, 政昭, 笠原, 浩太, 寒川, 剛, 大島, 勘二, 神谷, 成敏

化学同人 2014年4月3日 (ISBN: 4759815775)
タンパク質の立体構造入門――基礎から構造バイオインフォマティクスへ (KS生命科学専門書)

藤, 博幸, 太田, 元規, 川端, 猛, 木下, 賢吾, 白井, 剛, 諏訪, 牧子, 高田, 彰二, 高橋, 聡, 廣明, 秀一, 真柳, 浩太, 倭, 剛久, 由良, 敬

講談社 2010年11月25日 (ISBN: 4061538810)
はじめてのバイオインフォマティクス (KS生命科学専門書)

藤, 博幸, 講談社サイエンティフィク

講談社 2006年12月18日 (ISBN: 4061538624)

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