福田渓 (Kei Fukuda) - マイポータル

基本情報

所属: 山梨大学大学院総合研究部生命環境学域生命農学系（発生工学研究センター）特任助教

研究者番号: 00756786
J-GLOBAL ID: 201801012376615088
researchmap会員ID: B000322379

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / ゲノム生物学 /

経歴

2024年3月 - 現在

山梨大学, 大学院総合研究部生命環境学域生命農学系（発生工学研究センター）, 特任助教
2022年4月 - 現在

特定国立研究開発法人理化学研究所, 眞貝細胞記憶研究室, 客員研究員
2022年4月 - 2024年3月

Melbourne University, Integrative Genomics Unit, Visiting Researcher
2015年4月 - 2022年3月

理化学研究所, 眞貝細胞記憶研究室

学歴

2011年4月 - 2015年3月

九州大学大学院, 医学府
2009年4月 - 2011年3月

総合研究大学院大学, 遺伝学専攻
2005年4月 - 2009年3月

東京工業大学, 生命理工学部

論文

Resf1 is required for proper placental development and configuration of trophoblast cell-specific heterochromatin

Kei Fukuda, Kimiko Inoue, Chikako Shimura, Moe Kitazawa, Michiko Hirose, Shogo Matoba, Atsuo Ogura, Yoichi Shinkai

2025年9月25日筆頭著者責任著者
Chromatin landscape of budding yeast acquiring H3K9 methylation and its reader molecule HP1

Taiki Shimizu, Kei Fukuda, Chikako Shimura, Jun-ichi Nakayama, Masaya Oki, Yoichi Shinkai

2025年9月13日
H3K27 and H3K9 methylation mask potential CTCF binding sites to maintain 3D genome integrity

Kei Fukuda, Chikako Shimura, Yoichi Shinkai

Genome Research 2025年8月5日筆頭著者責任著者
H3K27me3 and the PRC1-H2AK119ub pathway cooperatively maintain heterochromatin and transcriptional silencing after the loss of H3K9 methylation.

Kei Fukuda, Chikako Shimura, Yoichi Shinkai

Epigenetics & chromatin 18(1) 26-26 2025年5月2日筆頭著者責任著者
Trichostatin A Treatment Has Little Impact on Nuclear compartments in Cells Depleted of H3K9me, H3K27me3, and uH2A

Kei Fukuda, Chikako Shimura, Yoichi Shinkai

bioRxiv 2025.04.26.646718 2025年4月26日筆頭著者責任著者
The C-terminal 4CXXC-type zinc finger domain of CDCA7 recognizes hemimethylated DNA and modulates activities of chromatin remodeling enzyme HELLS.

Akeo Shinkai, Hideharu Hashimoto, Chikako Shimura, Hiroaki Fujimoto, Kei Fukuda, Naoki Horikoshi, Masaki Okano, Hitoshi Niwa, Erik W Debler, Hitoshi Kurumizaka …

NUCLEIC ACIDS RESEARCH 52(17) 10194-10219 2024年9月23日査読有り
The role of transposable elements in human evolution and methods for their functional analysis: current status and future perspectives.

Kei Fukuda

Genes & genetic systems 98(6) 289-304 2024年2月10日
Epigenetic plasticity safeguards heterochromatin configuration in mammals

Kei Fukuda, Takeshi Shimi, Chikako Shimura, Takao Ono, Takehiro Suzuki, Kenta Onoue, Satoko Okayama, Hisashi Miura, Ichiro Hiratani, Kazuho Ikeda …

Nucleic Acids Research 2023年5月13日
Multifaceted Roles of Transposons in Mammalian Evolution and the Future of Transposon Research.

Kei Fukuda

Genes & genetic systems 98(6) 287-287 2023年
Potential role of KRAB-ZFP binding and transcriptional states on DNA methylation of retroelements in human male germ cells.

Kei Fukuda, Yoshinori Makino, Satoru Kaneko, Chikako Shimura, Yuki Okada, Kenji Ichiyanagi, Yoichi Shinkai

eLife 11 2022年3月22日
DMRT1-mediated reprogramming drives development of cancer resembling human germ cell tumors with features of totipotency.

Jumpei Taguchi, Hirofumi Shibata, Mio Kabata, Masaki Kato, Kei Fukuda, Akito Tanaka, Sho Ohta, Tomoyo Ukai, Kanae Mitsunaga, Yosuke Yamada …

Nature communications 12(1) 5041-5041 2021年8月19日
Derepression of inflammation-related genes link to microglia activation and neural maturation defect in a mouse model of Kleefstra syndrome.

Ayumi Yamada, Takae Hirasawa, Kayako Nishimura, Chikako Shimura, Naomi Kogo, Kei Fukuda, Madoka Kato, Masaki Yokomori, Tetsutaro Hayashi, Mana Umeda …

iScience 24(7) 102741-102741 2021年7月23日
Regulation of mammalian 3D genome organization and histone H3K9 dimethylation by H3K9 methyltransferases.

Kei Fukuda, Chikako Shimura, Hisashi Miura, Akie Tanigawa, Takehiro Suzuki, Naoshi Dohmae, Ichiro Hiratani, Yoichi Shinkai

Communications biology 4(1) 571-571 2021年5月13日
The fibronectin type-III (FNIII) domain of ATF7IP contributes to efficient transcriptional silencing mediated by the SETDB1 complex.

Takeshi Tsusaka, Kei Fukuda, Chikako Shimura, Masaki Kato, Yoichi Shinkai

Epigenetics & chromatin 13(1) 52-52 2020年11月30日
SETDB1-Mediated Silencing of Retroelements.

Kei Fukuda, Yoichi Shinkai

Viruses 12(6) 2020年5月30日査読有り
Characterization of genetic-origin-dependent monoallelic expression in mouse embryonic stem cells.

Hiroaki Ohishi, Wan Kin Au Yeung, Motoko Unoki, Kenji Ichiyanagi, Kei Fukuda, Shoji Maenohara, Kenjiro Shirane, Hatsune Chiba, Takashi Sado, Hiroyuki Sasaki

Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms 25(1) 54-64 2020年1月査読有り
Accurate estimation of 5-methylcytosine in mammalian mitochondrial DNA

Shigeru Matsuda, Takehiro Yasukawa, Yuriko Sakaguchi, Kenji Ichiyanagi, Motoko Unoki, Kazuhito Gotoh, Kei Fukuda, Hiroyuki Sasaki, Tsutomu Suzuki, Dongchon Kang

Scientific Reports 8(1) 5801 2018年12月1日査読有り
A CRISPR knockout screen identifies SETDB1-target retroelement silencing factors in embryonic stem cells.

Kei Fukuda, Akihiko Okuda, Kosuke Yusa, Yoichi Shinkai

Genome research 28(6) 846-858 2018年6月査読有り
Locus-specific hypomethylation of the mouse IAP retrotransposon is associated with transcription factor-binding sites

Ken-ichi Shimosuga, Kei Fukuda, Hiroyuki Sasaki, Kenji Ichiyanagi

MOBILE DNA 8 20 2017年12月査読有り
Evolution of the sperm methylome of primates is associated with retrotransposon insertions and genome instability

Kei Fukuda, Yukihiro Inoguchi, Kenji Ichiyanagi, Tomoko Ichiyanagi, Yasuhiro Go, Masashi Nagano, Yojiro Yanagawa, Noboru Takaesu, Yasuyuki Ohkawa, Hiroo Imai …

HUMAN MOLECULAR GENETICS 26(18) 3508-3519 2017年9月査読有り

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MISC

転写促進と抑制-表と裏から理解する遺伝子発現制御ヘテロクロマチンの核内空間制御におけるクロマチン修飾の役割

福田渓, 志村知古, 志見剛, 木村宏, 眞貝洋一

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 95回 2S16e-06 2022年11月
Identification of factors involved in provirus silencing by CRISPR-Cas9 system

Kei Fukuda, Kosuke Yusa, Yoichi Shinkai

GENES & GENETIC SYSTEMS 91(6) 346-346 2016年12月
Switching from PTGS to TGS for epigenetic regulation of retrotransposons during male germ cell development in mice

Kota Inoue, Kenji Ichiyanagi, Kei Fukuda, Michael Glinka, Hiroyuki Sasaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 91(6) 360-360 2016年12月
ミトコンドリアDNAメチル化修飾の解析~ミトコンドリアゲノムにエピジェネティクスは存在するのか

安川武宏, 松田盛, 坂口裕理子, 鵜木元香, 後藤和人, 福田渓, 一柳健司, 鈴木勉, 佐々木裕之, 康東天

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 39th 2016年
Transcriptional regulation of monoallelically expressed genes in ground-state embryonic stem cells

Hiroaki Ohishi, Motoko Unoki, Kei Fukuda, Shoji Maenohara, Kyohei Hori, Hatsune Chiba, Takashi Sado, Hiroyuki Sasaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 90(6) 369-369 2015年12月
霊長類の生殖細胞エピゲノムの進化とゲノム進化の相互作用

福田渓, 一柳健司, 佐々木裕之, 永野昌志, 柳川洋二郎, 高江洲昇, 高江洲昇, 今井啓雄

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 87th 70 2015年9月10日
ミトコンドリアゲノムエピジェネティクスは存在するか~mtDNAメチル化修飾の解析~

安川武宏, 松田盛, 鵜木元香, 坂口裕理子, 福田渓, 後藤和人, 一柳健司, 鈴木勉, 佐々木裕之, 康東天

日本ミトコンドリア学会年会要旨集 15th 2015年
B-54 霊長類におけるエピゲノム進化の解明

一柳健司, 佐々木裕之, 福田渓

霊長類研究所年報 44 96-96 2014年12月4日
Distinct retrotoransposon regulation at different developmental stages of mouse male germ cells by the piRNA system and chromatin modification

Kota Inoue, Kenji Ichiyanagi, Kei Fukuda, Kenichi Shimosuga, Hiroyuki Sasaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 89(6) 316-316 2014年12月
Zfp57 is Essential for Transcriptional Regulation of Monoallelic Gene Expression in Ground-State Embryonic Stem Cells

Hiroaki Ohishi, Motoko Unoki, Kei Fukuda, Takashi Sado, Hiroyuki Sasaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 89(6) 309-309 2014年12月
霊長類の生殖細胞エピゲノムの進化

福田渓, 一柳健司, 永野昌志, 柳川洋二郎, 高江洲昇, 今井啓雄, 佐々木裕之

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 86th 96 2014年8月31日
The evolution of the primate epigenome driven by transposable elmenets

Kei Fukuda, Kenji Ichiyanagi, Yukihiro Inoguchi, Hiroyuki Sasaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 88(6) 343-343 2013年12月
B-9 霊長類におけるエピゲノム進化の解明

一柳健司, 佐々木裕之, 福田渓

霊長類研究所年報 43 95-95 2013年11月13日
Genome-wide comparison of DNA methylation between human and chimpanzee

Fukuda Kei, Kenji Ichiyanagi, Hirohisa Hirai, Hiroyuki Sasaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 87(6) 413-413 2012年12月
B-23 霊長類におけるエピゲノム進化の解明

一柳健司, 佐々木裕之, 福田渓

霊長類研究所年報 42 106-106 2012年10月4日
The difference of DNA methylation between humans and chimpanzees

Kei Fukuda, Kenji Ichiyanagi, Hirohisa Hirai, Hiroyuki Sasaki

GENES & GENETIC SYSTEMS 86(6) 415-415 2011年12月

講演・口頭発表等

de novo DNAメチル化におけるCDCA7の役割

志村知古

第１８回エピジェネティクス研究会 2025年6月20日
DNA結合たんぱく質の標的領域を大規模並列的に同定する実験手法の考案

福田渓

第１８回日本エピジェネティクス研究会 2025年6月20日
3D ゲノムの形成におけるクロマチン修飾の役割

第4回 Hi-C 研究会 2024年11月 HiC研究会
トランスポゾン制御因子の獲得がトランスポゾンレパートリーの多様性に与える影響

第96回日本遺伝学会 2024年9月日本遺伝学会
トランスポゾンの制御状態の進化がもたらす生物種間多様性

第17回日本エピジェネティクス研究会年会 2024年5月日本エピジェネティクス研究会
転写促進と抑制-表と裏から理解する遺伝子発現制御ヘテロクロマチンの核内空間制御におけるクロマチン修飾の役割

福田渓, 志村知古, 志見剛, 木村宏, 眞貝洋一

第95回日本生化学会大会 2022年11月日本生化学会
Epigenetic plasticity safeguards heterochromatin organization in mammals

第95回日本生化学会大会 2022年11月日本生化学会
ヒト生殖細胞形成過程におけるトランスポゾンの制御と個体差

第45回日本分子生物学会 2022年11月日本分子生物学会
哺乳類のレトロエレメント制御機能と進化

第94回日本遺伝学会 2022年9月日本遺伝学会
Regulation of histone H3K9 methylation and 3D genome organization by histone methyltransferases

第14回日本エピジェネティクス研究会年会 2021年6月日本エピジェネティクス研究会
マウス精子におけるIAPレトロトランスポゾンのローカス特異的な低メチル化は転写因子結合部位と関連する

下須賀健一、福田渓、佐々木裕之、一柳健司

第41回日本分子生物学会 2018年12月日本分子生物学会
A CRISPR Knockout Screen Identifies Retroelement Silencing Factors in Embryonic Stem Cells

第90回日本遺伝学会 2018年9月日本遺伝学会
A CRISPR Knockout Screen Identifies Setdb1-target Retroelement Silencing Factors in Embryonic Stem Cells

The FASEB Science Research Conference 2018年6月 FASEB
A CRISPR Knockout Screen Identifies Retroelement Silencing Factors in Embryonic Stem Cells

第11回日本エピジェネティクス研究会年会 2017年5月日本エピジェネティクス研究会
Genome-wide genetic screen for provirus silencing factors in embryonic stem cells with a lentiviral CRISPR-guide RNA library

福田渓、遊佐宏介、眞貝洋一

第39回日本分子生物学会 2016年12月日本分子生物学会
単アレル性発現遺伝子はZfp57によるDNAメチル化依存的及び非依存的な制御を受ける

大石裕晃、鵜木元香、一柳健司、福田渓、前之原章司、千葉初音、佐渡敬、佐々木裕之

第39回日本分子生物学会 2016年12月日本分子生物学会
ミトコンドリアDNAメチル化修飾の解析〜ミトコンドリアゲノムにエピジェネティクスは存在するのか

安川武宏、松田盛、坂口裕理子、鵜木元香、後藤和人、福田渓、一柳健司、鈴木勉、佐々木裕之、康東天

第39回日本分子生物学会 2016年12月日本分子生物学会
霊長類のエピゲノム進化におけるシス制御配列やトランスポゾン配列の役割

福田渓、一柳健司

第39回日本分子生物学会 2016年12月日本分子生物学会
Identification of factors involved in provirus silencing by CRISPR-Cas9 system

Kei Fukuda, Kosuke Yusa, Yoichi Shinkai

第88回日本遺伝学会 2016年9月日本遺伝学会
Switching from PTGS to TGS for epigenetic regulation of retrotransposons during male germ cell development in mice

Kota Inoue, Kenji Ichiyanagi, Kei Fukuda, Michael Glinka, Hiroyuki Sasaki

第88回日本遺伝学会 2016年9月日本遺伝学会

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共同研究・競争的資金等の研究課題

高次クロマチンのマクロ構造の制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2022年4月 - 2025年3月

福田渓
H3K9me2ドメインの形成基盤と高次クロマチン構造形成における役割の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2019年4月 - 2022年3月

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講演・口頭発表等

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