川上恵典 (Keisuke Kawakami) - マイポータル

基本情報

所属: 特定国立研究開発法人理化学研究所生体機構研究グループ研究員

学位: 理学（博士）(2010年3月岡山大学)

研究者番号: 40619904
J-GLOBAL ID: 201801017567722048
researchmap会員ID: B000333689

外部リンク: https://www.riken.jp/research/labs/rsc/photon_sci/biostruct_mech/

2020年5月 - 現在　　　国立研究開発法人理化学研究所・生体機構研究グループ・研究員
2019年4月 - 2020年4月大阪市立大学・人工光合成研究センター特任准教授
2011年7月 - 2019年3月大阪市立大学・複合先端研究機構特任准教授
2010年4月 - 2011年6月大阪市立大学大学院理学研究科（構造生物化学研究室）学術振興会特別研究員（PD）

研究キーワード

研究分野

経歴

2020年5月 - 現在

国立研究開発法人理化学研究所, 生体機構研究グループ
2019年4月 - 2020年4月

大阪市立大学, 人工光合成研究センター（ReCAP）, 特任准教授
2011年7月 - 2019年3月

大阪市立大学, 複合先端研究機構, 特任准教授
2010年3月 - 2011年6月

大阪市立大学大学院理学研究科, 構造生物化学研究室, 学術振興会特別研究員（PD）

学歴

受賞

2023年6月

三室賞, 光合成セミナー

川上恵典
2022年3月

理研梅峰賞, 理化学研究所
2012年9月

トラベルアワード賞, 日本カロテノイド研究会

川上恵典
2012年6月

光と緑の賞, 日本光合成学会

川上恵典
2011年12月

Breakthrough of the Year 2011, 米国サイエンス誌

川上恵典
2010年8月

ポスター賞, 国際光合成会議

川上恵典

論文

Immune-induced TCR-like antibodies regulate specific T cell response in mice

17(1) 2026年4月16日査読有り
Editorial: Adaptations enabling far-red light photosynthesis in oxygenic photo-autotrophs

16 2025年10月31日査読有り
Preparation, structural characterization, and ultrafast energy transfer dynamics of the phycobilisome–photosystem II megacomplex in a thermophilic cyanobacterium

Keisuke Kawakami, Miki Bandou-Uotani, Masatoshi Kida, Yoshihiro Kato, Yuma Hirota, Yuu Hirose, Daisuke Kosumi, Koji Yonekura

Plant and Cell Physiology 2025年9月10日査読有り筆頭著者責任著者
Dimeric assembly of F ₁ -like ATPase for the gliding motility of Mycoplasm

Takuma Toyonaga, Takayuki Kato, Akihiro Kawamoto, Tomoko Miyata, Keisuke Kawakami, Junso Fujita, Tasuku Hamaguchi, Keiichi Namba, Makoto Miyata

Science Advances 11(9) 2025年2月28日査読有り

Reinvestigation on primary processes of PSII-dimer from Thermosynechococcus vulcanus by femtosecond pump-probe spectroscopy

Photosynthesis Research 159(1) 79-91 2024年  査読有り

Structure of PSI-LHCI fromCyanidium caldariumprovides evolutionary insights into conservation and diversity of red-lineage LHCs

Koji Kato, Tasuku Hamaguchi, Minoru Kumazawa, Yoshiki Nakajima, Kentaro Ifuku, Shunsuke Hirooka, Yuu Hirose, Shin-ya Miyagishima, Takehiro Suzuki, Keisuke Kawakami …

2023年10月27日

Measurement of charges and chemical bonding in a cryo-EM structure

Communications Chemistry 6(1) 2023年5月31日  筆頭著者

Structural resolution of a small organic molecule by serial X-ray free-electron laser and electron crystallography

Kiyofumi Takaba, Saori Maki-Yonekura, Ichiro Inoue, Kensuke Tono, Tasuku Hamaguchi, Keisuke Kawakami, Hisashi Naitow, Tetsuya Ishikawa, Makina Yabashi, Koji Yonekura

Nature Chemistry 2023年3月20日

Structure of a monomeric photosystem I core associated with iron-stress-induced-A proteins from Anabaena sp. PCC 7120.

Ryo Nagao, Koji Kato, Tasuku Hamaguchi, Yoshifumi Ueno, Naoki Tsuboshita, Shota Shimizu, Miyu Furutani, Shigeki Ehira, Yoshiki Nakajima, Keisuke Kawakami …

Nature communications 14(1) 920-920 2023年2月17日

Exciton quenching by oxidized chlorophyll Z across the two adjacent monomers in a photosystem II core dimer

Photosynthesis Research 2022年8月17日  査読有り

Chl d を持つ Acaryochloris marina の新型光化学系 I 複合体の構造

川上恵典, 伊藤繁, 菓子野康浩

光合成研究 32(2) 95-106 2022年8月  査読有り筆頭著者責任著者

Core and rod structures of a thermophilic cyanobacterial light-harvesting phycobilisome

Nature Communications 13(1) 2022年6月  査読有り筆頭著者責任著者

Theoretical Model of the Far-Red-Light-Adapted Photosystem I Reaction Center of Cyanobacterium Acaryochloris marina Using Chlorophyll d and the Effect of Chlorophyll Exchange

Akihiro Kimura, Hirotaka Kitoh-Nishioka, Toshimichi Aota, Tasuku Hamaguchi, Koji Yonekura, Keisuke Kawakami, Kyoko Shinzawa-Itoh, Natsuko Inoue-Kashino, Kentaro Ifuku, Eiki Yamashita …

J. Phys. Chem. B 2022年5月  査読有り

Structural basis for the absence of low-energy chlorophylls in a photosystem I trimer from Gloeobacter violaceus

eLife 11 2022年4月11日  査読有り

Hydrogen properties and charges in a sub-1.2 Å resolution cryo-EM structure revealed by a cold field emission beam

bioRxiv 2021年12月22日  筆頭著者

Hydrogen properties in an organic molecule revealed by XFEL and electron crystallography

chemRxiv 2021年11月9日

Structural basis for the absence of low-energy chlorophylls responsible for photoprotection from a primitive cyanobacterial PSI

Koji Kato, Tasuku Hamaguchi, Ryo Nagao, Keisuke Kawakami, Yoshifumi Ueno, Takehiro Suzuki, Hiroko Uchida, Akio Murakami, Yoshiki Nakajima, Makio Yokono …

2021年10月1日

Complementary use of high-resolution and high-precision cryo-ED and EM

Koji Yonekura, Saori Maki-Yonekura, Kiyofumi Takaba, Tasuku Hamaguchi, Hisashi Naitow, Keisuke Kawakami

Microscopy and Microanalysis 27(S1) 204-206 2021年8月

Cryo-EM structure of monomeric photosystem II at 2.78 Å resolution reveals factors important for the formation of dimer.

Huaxin Yu, Tasuku Hamaguchi, Yoshiki Nakajima, Koji Kato, Keisuke Kawakami, Fusamichi Akita, Koji Yonekura, Jian-Ren Shen

Biochimica et biophysica acta. Bioenergetics 1862(10) 148471-148471 2021年7月1日  査読有り

Structural implications for a phycobilisome complex from the thermophilic cyanobacterium Thermosynechococcus vulcanus

Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics 1862(9) 148458-148458 2021年6月  筆頭著者責任著者

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MISC
32

ATP合成酵素から進化したMycoplasma mobile滑走運動のモーター—Motor evolved from ATP synthase for Mycoplasma mobile gliding—第49回日本マイコプラズマ学会学術集会

豊永拓真, 加藤貴之, 川本晃大, 宮田知子, 浜口祐, 川上恵典, 難波啓一, 宮田真人

日本マイコプラズマ学会雑誌 = Japanese journal of mycoplasmology (49) 34-37 2022年5月

クロロフィルdを持つ遠赤色光型反応中心A.marina PSIの光捕集機構に関する理論解析:クロロフィルa-型PSIとの比較

木村明洋, 鬼頭宏任, 青田俊道, 浜口祐, 米倉功治, 川上恵典, 新沢(伊藤)恭子, 井上(菓子野)名津子, 伊福健太郎, 菓子野康浩 …

日本物理学会講演概要集(CD-ROM) 77(1) 2022年

Theoretical Elucidation of Geometrical Structures of the CaMn4O5 Cluster in Oxygen Evolving Complex of Photosystem II Scope and Applicability of Estimation Formulae of Structural Deformations via the Mixed-Valence and Jahn-Teller Effects

Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Shusuke Yamanaka, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Nobuo Kamiya, Kizashi Yamaguchi

QUANTUM SYSTEMS IN PHYSICS, CHEMISTRY AND BIOLOGY - THEORY, INTERPRETATION, AND RESULTS 78 307-451 2019年

Crystallographic study on estimation of the valence of each of the four Mn atoms in Photosystem II using anomalous diffraction techniques

Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Nobuo Kamiya, Yoshiaki Kawano, Keitaro Yamashita, Hideo Ago, Masaki Yamamoto, Jian-Ren Shen

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES 75 A363-A363 2019年

On the guiding principles for understanding of geometrical structures of the CaMn4O5 cluster in oxygen-evolving complex of photosystem II. Proposal of estimation formula of structural deformations via the Jahn-Teller effects

K. Yamaguchi, M. Shoji, H. Isobe, S. Yamanaka, Y. Umena, K. Kawakami, N. Kamiya

MOLECULAR PHYSICS 115(5) 636-666 2017年

Theoretical modelling of biomolecular systems I. Large-scale QM/MM calculations of hydrogen-bonding networks of the oxygen evolving complex of photosystem II

Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Shusuke Yamanaka, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen, Takahito Nakajima, Kizashi Yamaguchi

MOLECULAR PHYSICS 113(3-4) 359-384 2015年2月

ヨウ素イオンによるシアノバクテリア由来光化学系IIの酸素発生阻害機構

川上恵典, 萩原大介, 梅名泰史, 福島佳優, 伊藤亮孝, 手木芳男, 沈建仁, 神谷信夫, 神谷信夫

日本結晶学会年会講演要旨集 2015 2015年

ヨウ素イオンによるシアノバクテリア由来光化学系IIの酸素発生阻害機構

川上恵典, 萩原大介, 梅名泰史, 福島佳優, 伊藤亮孝, 手木芳男, 沈建仁, 神谷信夫, 神谷信夫

日本結晶学会年会講演要旨集 2015 2015年

Large-scale QM/MM calculations of hydrogen bonding networks for proton transfer and water inlet channels for water oxidation—Theoretical system models of the oxygen-evolving complex of Photosystem II

Mitsuo Shoji, Hiroshi Isobe, Shusuke Yamanaka, Yasufumi Umena, Keisuke Kawakami, Nobuo Kamiya, Jian-Ren Shen, Takahito Nakajima, Kizashi Yamaguchi

Advances in Quantum Chemistry 70 325-413 2015年

Identification of β-Cryptoxanthin in Oxygen-Evolving Photosystem II from Thermosynechococcus vulcanus

Keisuke Kawakami, Ritsuko Fujii, Yasufumi Umena, Shin-ichiro Ozawa, Yuichiro Takahashi, Hideki Hashimoto, Jian-Ren Shen, Nobuo Kamiya

CAROTENOID SCIENCE 19 48-51 2015年  査読有り

ヨウ素イオンによる光化学系II複合体の酸素発生阻害機構

川上恵典, 萩原大介, 梅名泰史, 梅名泰史, 福島佳優, 伊藤亮孝, 手木芳男, 沈建仁, 神谷信夫

日本生化学会大会(Web) 87th 2014年

26aXC-1 植物型光合成反応中心の光捕集過程 : 構造情報に基づく理解2(26aXC 化学物理1,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

柴田穣, 西俊輔, 川上恵典, 沈建仁, Renger Thomas

日本物理学会講演概要集 68(1) 414-414 2013年3月26日

Theoretical insight into hydrogen-bonding networks and proton wire for the CaMn4O5 cluster of photosystem II. Elongation of Mn–Mn distances with hydrogen bonds

M. Shoji, H. Isobe, S. Yamanaka, Y. Umena, K. Kawakami, N. Kamiya, J.-R. Shen, K. Yamaguchi

Catal. Sci. & Technol. 3(7) 1831-1848 2013年

光合成の水分解・酸素発生機構の解明に向けて

神谷信夫, 川上恵典, 梅名泰史, 沈建仁

放射光学会誌 26 3-10 2013年

Theoretical illumination of water-inserted structures of the CaMn4O5 cluster in the S-2 and S-3 states of oxygen-evolving complex of photosystem II: full geometry optimizations by B3LYP hybrid density functional

H. Isobe, M. Shoji, S. Yamanaka, Y. Umena, K. Kawakami, N. Kamiya, J. -R. Shen, K. Yamaguchi

DALTON TRANSACTIONS 41(44) 13727-13740 2012年

高分解能構造から見えてきた光合成水分解の仕組み

沈健仁, 梅名泰史, 川上恵典, 神谷信夫

生物物理 52(3) 140-143 2012年

25pGP-2 光合成酸素発生を支える光化学系IIの原子構造(25pGP 領域12シンポジウム:光化学系IIにおける酸素発生中心,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

沈建仁, 梅名泰史, 川上恵典, 神谷信夫

日本物理学会講演概要集 66(1) 376-376 2011年3月3日

25pGP-7 光化学系IIマンガンクラスターの電子構造の密度汎関数理論による研究(25pGP 領域12シンポジウム:光化学系IIにおける酸素発生中心,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理))

山中秀介, 神田慧太, 梅名泰史, 川上恵典, 沈建仁, 神谷信夫, 奥村光隆, 中村春木, 山口兆

日本物理学会講演概要集 66(1) 378-378 2011年3月3日

27pHC-12 結晶構造情報に基づくシミュレーションによる光化学系II反応中心の時間分解蛍光スペクトルの解析(27pHC 非線形光学/超高速現象,領域5(光物性))

柴田穣, 西俊輔, 野地智康, 川上恵典, 沈建仁, Renaer Thomas

日本物理学会講演概要集 66(1) 794-794 2011年3月3日

Mechanism of PSII oxygen evolution predicted from its 1.9 angstrom resolution structure

Nobuo Kamiya, Keisuke Kawakami, Yasufumi Umena, Jian-Ren Shen

ACTA CRYSTALLOGRAPHICA A-FOUNDATION AND ADVANCES 67 C80-C81 2011年

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共同研究・競争的資金等の研究課題
6

近赤外光で駆動する光合成超分子構造の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 2024年4月 - 2026年3月

川上恵典

クライオ電子顕微鏡による光合成蛋白質超複合体の構造解析基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2026年3月

川上恵典, 小澄大輔

好熱性シアノバクテリア由来光合成超複合体の機能・構造解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2020年4月 - 2023年3月

川上恵典, 長尾遼

光合成超複合体のエネルギー伝達機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2020年4月 - 2022年3月

川上恵典

膜蛋白質の機能分子としての利用を指向した新規ゲル化手法の開発とナノ材料創成

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2014年4月 - 2017年3月

水野稔久, 川上惠典, 野地智康

光化学系２複合体の構造生物学

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 2012年4月 - 2016年3月

川上恵典

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