井上健太郎 (INOUE KENTARO) - マイポータル

基本情報

所属: 宮崎大学工学教育研究部准教授

学位: 博士(情報工学)(九州工業大学)

J-GLOBAL ID: 201501006876618626
researchmap会員ID: B000248194

外部リンク: https://sites.google.com/site/kntrinoue/

研究キーワード

研究分野

経歴

2021年6月 - 現在

宮崎大学, 工学教育研究部, 准教授
2017年2月 - 2021年5月

宮崎大学, 工学教育研究部, 助教
2016年4月 - 2017年1月

国立研究開発法人理化学研究所, 研究員
2013年4月 - 2016年3月

国立研究開発法人理化学研究所, 特別研究員
2011年4月 - 2013年3月

九州工業大学, 博士研究員

学歴

2008年4月 - 2011年3月

九州工業大学大学院, 情報工学府, 情報科学専攻
2006年4月 - 2008年3月

九州工業大学大学院, 情報工学府, 情報科学専攻
2002年4月 - 2006年3月

九州工業大学, 情報工学部, 生物化学システム工学科

委員歴

2020年4月 - 現在

生命情報学勉強会@宮崎大学
2025年4月 - 2027年3月

日本バイオインフォマティクス学会九州地域部会, 部会長
2017年10月 - 2017年10月

日本バイオインフォマティクス学会九州地域部会, セミナー世話人
2017年 - 2017年

FiSTA, Program committee

主要な受賞

2015年10月

研究奨励賞, 生命医薬情報学連合大会

井上健太郎, 篠原久明, 岡田眞里子
2014年10月

Excellent poster award, 生命医薬情報学連合大会

井上健太郎, 篠原久明, 岡田眞里子
2010年9月

Best poster award, InCoB

井上健太郎, 倉田博之

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主要な論文

SBDyNetVis: a visualization tool of dynamic network for systems biology model

Kentaro Inoue

BioSystems 258 105644-105644 2025年12月
Regulation mechanisms of CARMA1-Bcl10-MALT1 complex assembly inferred from the analysis of TRAF6‐deficient cells

Kentaro Inoue, Tomoharu Yasuda, Yoshihiro Baba, Tadashi Yamamoto, Tomohiro Kurosaki, Hisaaki Shinohara

Genes to Cells 2023年3月5日査読有り筆頭著者
Feedback enrichment analysis for transcription factor-target genes in signaling pathways

Kentaro Inoue

Biosystems 198 104262-104262 2020年12月査読有り筆頭著者最終著者責任著者
Sensitivity analysis for reproducible candidate values of model parameters in signaling hub model

Kentaro Inoue

PLOS ONE 14(2) e0211654-e0211654 2019年2月12日査読有り筆頭著者最終著者責任著者
Oscillation dynamics underlie functional switching of NF-κB for B-cell activation

Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara, Marcelo Behar, Noriko Yumoto, Gouhei Tanaka, Alexander Hoffmann, Kazuyuki Aihara, Mariko Okada-Hatakeyama

npj Systems Biology and Applications 2 16024 2016年10月査読有り筆頭著者
Stimulus-Dependent Inhibitor of Apoptosis Protein Expression Prolongs the Duration of B Cell Signalling.

Shinohara H, Inoue K, Yumoto N, Nagashima T, Okada-Hatakeyama M

Scientific reports 6 27706 2016年6月査読有り
CADLIVE toolbox for MATLAB: automatic dynamic modeling of biochemical networks with comprehensive system analysis.

Inoue K, Maeda K, Miyabe T, Matsuoka Y, Kurata H

Bioprocess and biosystems engineering 37(9) 1925-1927 2014年9月査読有り筆頭著者
Positive feedback within a kinase signaling complex functions as a switch mechanism for NF-κB activation.

Shinohara H, Behar M, Inoue K, Hiroshima M, Yasuda T, Nagashima T, Kimura S, Sanjo H, Maeda S, Yumoto N …

Science (New York, N.Y.) 344(6185) 760-764 2014年5月査読有り
CADLIVE optimizer: web-based parameter estimation for dynamic models.

Inoue K, Maeda K, Kato Y, Tonami S, Takagi S, Kurata H

Source Code for Biology and Medicine 7(1) 9 2012年査読有り筆頭著者
Application of approximate pattern matching in two dimensional spaces to grid layout for biochemical network maps.

Inoue K, Shimozono S, Yoshida H, Kurata H

PloS one 7(6) e37739 2012年査読有り筆頭著者
CADLIVE Converter for constructing a biochemical network map

Kentaro Inoue, Sayaka Tomeda, Shinpei Tonami, Yuki Shimokawa, Masayo Ono, Hiroyuki Kurata

Biochemical Engineering Journal 54(3) 200-206 2011年査読有り筆頭著者
Diffusion model based spectral clustering for protein-protein interaction networks.

Inoue K, Li W, Kurata H

PloS one 5(9) e12623-10 2010年9月査読有り筆頭著者

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主要なMISC

生物モデルにおける同じ動態を再現可能なパラメタセットのグローバルなパラメタ変動解析

井上健太郎

情報処理学会バイオ情報学研究報告 2020-BIO-63(3) 1-6 2020年9月筆頭著者最終著者責任著者
シグナル伝達系の大規模数理モデルにおけるパラメタ推定法

井上健太郎

情報処理学会バイオ情報学研究報告 51(8) 1-2 2017年
B細胞の免疫応答を制御するシグナル活性の閾値決定機構

篠原久明, 井上健太郎, 岡田眞里子

感染・炎症・免疫 45(1) 2015年
B細胞受容体シグナル伝達系における正のフィードバック制御によるNF-κBの活性化のスイッチ様の応答

篠原久明, 井上健太郎, 岡田眞里子

新着論文レビュー 2014年6月
キナーゼシグナル複合体内における正のフィードバックはNF-kBを活性化するスイッチとして働く

篠原久明, 井上健太郎, 岡田眞里子

Japanese Scientists in Science 2014 2014年
Hybrid Layout Algorithm using Approximate Pattern Matching in Two Dimensional Space for Biochemical Network Layout

Kentaro Inoue, Shinichi Shimozono, Hideaki Yoshida, Hiroyuki Kurata

情報処理学会バイオ情報学研究報告 24(6) 1-6 2011年
スペクトルクラスタリングによるタンパク質相互作用ネットワークの機能モジュール分解

井上健太郎, 倉田博之

ソフトウェアバイオロジー 9 37-41 2010年
スペクトル法によるタンパク質相互作用ネットワークのモジュール分解,

井上健太郎, Weijiang Li, 倉田博之

情報処理学会研究報告 BIO-17(14) 1-4 2009年5月25日
Modular decomposition based spectrum for protein-protein interaction network

Kentaro Inoue, Weijiang Li, Hiroyuki Kurata

情報処理学会バイオ情報学研究報告 17(14) 1-4 2009年
大規模生命分子ネットワークのトポロジカル解析

井上健太郎, 下川由紀, 倉田博之

ソフトウェアバイオロジー 6 45-49 2007年

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講演・口頭発表等

生物システムのための動的ネットワーク可視化ツール

井上健太郎

第48回日本分子生物学会年会 2025年12月3日
Mathematical model of NFkB signaling regulated by TRAF6 in B cell

Kentaro Inoue, Hisaaki Shinohara

IIBMP2023 2023年9月7日
iPS細胞のDNAメチル化解析

住吉凪海, 関谷麻杜, 西野光一郎, 井上健太郎

第45回日本分子生物学会年会 2022年11月30日
生命科学のビックデータ解析

井上健太郎

宮崎大学イブニングセミナー 2022年3月3日招待有り
シグナル伝達経路における転写因子-標的遺伝子のフィードバックエンリッチメント解析

井上健太郎

生命医薬情報学連合大会(IIBMP2021) 2021年9月
Wide parameter space analysis for reproducible parameter sets in simple model

井上健太郎

生命医薬情報学連合大会(IIBMP2020) 2020年9月1日
細胞の仕組みをITの力で読み解く

井上健太郎

宮崎大学イブニングセミナー 2019年12月12日招待有り
転写を介したシグナル伝達システムのフィードバックループ

井上健太郎

第42回分子生物学会年会 2019年12月3日
Sensitivity analysis for elementary circuits in signal transduction model

井上健太郎

ICSB2019 2019年11月1日
Pathway analysis and enrichment analysis for signaling pathway system

井上健太郎

IIBMP2019 2019年9月9日
シグナル伝達経路のネットワーク構造とダイナミクスにおける数理モデルの感度特性

井上健太郎

第41回分子生物学会年会 2018年11月28日
Global sensitivity analysis in signaling pathway model

井上健太郎

IIBMP2018 2018年9月19日
シグナル伝達系の数理モデル

井上健太郎

MZセミナー 2018年5月18日
Mathematical model and experiments for canonical NF-kB signaling

井上健太郎

新学術領域「数理シグナル」第２回シンポジウム 2018年2月10日
シグナル伝達系における大規模モデルのシミュレーションに向けた研究

井上健太郎

ConBio2017 2017年12月6日
シグナル伝達系の大規模数理モデルにおけるパラメタ推定法

井上健太郎

情報処理学会第51回バイオ情報学研究会 2017年9月26日
シグナル伝達系の数理モデル解析

井上健太郎

JSBi九州地域部会セミナー 2017年3月10日

主要な担当経験のある科目(授業)

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所属学協会

2013年 - 現在

日本分子生物学会
2006年 - 現在

日本バイオインフォマティクス学会

Works(作品等)

SBDyNetVis: 動的ネットワーク可視化ツール

コンピュータソフト
胸骨圧迫判定システム

コンピュータソフト

共同研究・競争的資金等の研究課題

セキュアな広域地域横断的データ連携によるデータ駆動型医学系研究創生プログラム

国立研究開発法人日本医療研究開発機構（AMED）医学系研究支援プログラム（特色型） 2025年10月 - 2028年3月
AIによる生物のシグナル伝達系数理モデルの自動構築

文部科学省 AI for Science萌芽的挑戦研究創出事業（SPReAD） 2026年7月 - 2027年1月
細胞システムを再現する大規模数理モデル構築のためのパラメタ推定法の開発

宮崎大学戦略重点経費・学部長裁量経費 2018年 - 2018年

井上健太郎
NF-kB活性の振動とスイッチライク応答における制御メカニズムの解明

文部科学省科学研究費補助金(若手研究(B)) 若手研究(B) 2015年 - 2017年

井上健太郎
実験とシミュレーションによるNFkBシグナル伝達システムの解明

文部科学省科学研究費補助金(研究活動スタート支援) 研究活動スタート支援 2013年 - 2014年

井上健太郎

井上健太郎

基本情報

研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

委員歴

主要な受賞

主要な論文

主要なMISC

講演・口頭発表等

主要な担当経験のある科目(授業)

所属学協会

Works(作品等)

共同研究・競争的資金等の研究課題

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共著者の一覧