平川英樹 (Hideki Hirakawa) - マイポータル

基本情報

所属: 公益財団法人かずさＤＮＡ研究所その他部局等主任研究員

J-GLOBAL ID: 201501081279250007
researchmap会員ID: B000243788

外部リンク: https://kaken.nii.ac.jp/d/r/80372746.ja.html

研究キーワード

研究分野

ライフサイエンス / ゲノム生物学 / バイオインフォマティクス

経歴

2022年4月 - 現在

公益財団法人かずさDNA研究所, ゲノム事業推進部植物DNA解析グループ, 主任研究員
2021年8月 - 現在

国立研究開発法人宇宙航空研究開発機構, 有人宇宙技術部門宇宙飛行士運用技術ユニット宇宙医学生物学研究グループ, 主幹研究開発員（兼任）
2019年4月 - 現在

東北大学, 大学院生命科学研究科分子化学生物学専攻ゲノム情報学講座オミックス・情報学, 客員教授（兼任）
2018年3月 - 2022年3月

公益財団法人かずさDNA研究所, ゲノム情報解析施設, 施設長
2013年4月 - 2019年3月

東北大学, 大学院生命科学研究科生態システム生命科学専攻ゲノム生態学講座ゲノム構造機能分野, 客員准教授（兼任）
2014年4月 - 2018年3月

公益財団法人かずさDNA研究所, 技術開発研究部ゲノム情報解析グループ, グループ長
2011年4月 - 2014年3月

公益財団法人かずさDNA研究所, 植物ゲノム研究部植物ゲノム応用研究室, 主任研究員
2009年4月 - 2011年3月

東京大学, 大学院新領域創成科学研究科情報生命科学専攻, 客員准教授（兼任）
2009年4月 - 2011年3月

公益財団法人かずさDNA研究所, 植物ゲノム研究部植物ゲノム情報研究室, 研究員
2008年4月 - 2009年3月

九州大学, 農学研究院, 特任助教
2007年4月 - 2008年3月

九州大学, システム生命科学府, 特任助教
2003年10月 - 2007年3月

九州大学, システム生命科学府, 特任助手
1999年5月 - 2003年9月

九州大学, 農学研究科遺伝子資源工学専攻, リサーチアソシエイト

学歴

1996年4月 - 1999年3月

九州大学, 大学院農学研究院遺伝子資源工学専攻遺伝子制御学講座博士後期課程
1994年4月 - 1996年3月

九州大学, 大学院農学研究科遺伝子資源工学専攻蛋白質化学工学講座博士前期課程
1990年4月 - 1994年3月

九州大学, 農学部, 食糧化学工学科

論文

210

Establishing a comprehensive web-based analysis platform forNicotiana benthamianagenome and transcriptome

Ken-ichi Kurotani, Hideki Hirakawa, Kenta Shirasawa, Koya Tagiri, Moe Mori, Yasunori Ichihashi, Takamasa Suzuki, Yasuhiro Tanizawa, Yasukazu Nakamura, Sachiko Isobe …

2023年9月5日
Transcriptome analysis of tomato plants following salicylic acid-induced immunity against Clavibacter michiganensis ssp. michiganensis

Naoki Yokotani, Yoshinori Hasegawa, Yusuke Kouzai, Hideki Hirakawa, Sachiko Isobe

Plant Biotechnology 2023年9月査読有り
Plant GARDEN: a portal website for cross-searching between different types of genomic and genetic resources in a wide variety of plant species.

Hisako Ichihara, Manabu Yamada, Mitsuyo Kohara, Hideki Hirakawa, Andrea Ghelfi, Takuro Tamura, Akihiro Nakaya, Yasukazu Nakamura, Sachiko Shirasawa, Samatchaya Yamashita …

BMC plant biology 23(1) 391-391 2023年8月12日
Genome sequencing reveals the genetic architecture of heterostyly and domestication history of common buckwheat.

Jeffrey A Fawcett, Ryoma Takeshima, Shinji Kikuchi, Euki Yazaki, Tomoyuki Katsube-Tanaka, Yumei Dong, Meifang Li, Harriet V Hunt, Martin K Jones, Diane L Lister …

Nature plants 2023年8月10日
Genome Sequence and Analysis of Nicotiana benthamiana, the Model Plant for Interactions between Organisms.

Ken-Ichi Kurotani, Hideki Hirakawa, Kenta Shirasawa, Yasuhiro Tanizawa, Yasukazu Nakamura, Sachiko Isobe, Michitaka Notaguchi

Plant & cell physiology 64(2) 248-257 2023年2月9日
The genome of Lyophyllum shimeji provides insight into the initial evolution of ectomycorrhizal fungal genomes.

Yuuki Kobayashi, Tomoko F Shibata, Hideki Hirakawa, Tomoaki Nishiyama, Akiyoshi Yamada, Mitsuyasu Hasebe, Shuji Shigenobu, Masayoshi Kawaguchi

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes 30(1) 2023年2月1日
An improved reference genome for Trifolium subterraneum L. provides insight into molecular diversity and intra-specific phylogeny.

Kenta Shirasawa, Roger Moraga, Andrea Ghelfi, Hideki Hirakawa, Hideki Nagasaki, Kioumars Ghamkhar, Brent A Barrett, Andrew G Griffiths, Sachiko N Isobe

Frontiers in plant science 14 1103857-1103857 2023年
Haploid-resolved and chromosome-scale genome assembly in hexa-autoploid sweetpotato (Ipomoea batatas(L.) Lam)

Ung-Han Yoon, Qinghe Cao, Kenta Shirasawa, Hong Zhai, Tae-Ho Lee, Masaru Tanaka, Hideki Hirakawa, Jang-Ho Hahn, Xiangfeng Wang, Ho Soo Kim …

2022年12月25日
Chromosome-scale genome assembly of Eustoma grandiflorum, the first complete genome sequence in the genus Eustoma

Kenta Shirasawa, Ryohei Arimoto, Hideki Hirakawa, Motoyuki Ishimorai, Andrea Ghelfi, Masami Miyasaka, Makoto Endo, Saneyuki Kawabata, Sachiko N Isobe

G3 Genes|Genomes|Genetics 13(2) 2022年12月19日
Genome assembly and transcriptomic analyses of the repeatedly rejuvenating jellyfish Turritopsis dohrnii.

Yoshinori Hasegawa, Takashi Watanabe, Reo Otsuka, Shigenobu Toné, Shin Kubota, Hideki Hirakawa

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes 30(1) 2022年12月15日
Chromosome-scale genome assembly of Glycyrrhiza uralensis revealed metabolic gene cluster centred specialized metabolites biosynthesis.

Amit Rai, Hideki Hirakawa, Megha Rai, Yohei Shimizu, Kenta Shirasawa, Shinji Kikuchi, Hikaru Seki, Mami Yamazaki, Atsushi Toyoda, Sachiko Isobe …

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes 29(6) 2022年12月1日
De novo whole-genome assembly in an interspecific hybrid table grape, 'Shine Muscat'.

Kenta Shirasawa, Hideki Hirakawa, Akifumi Azuma, Fumiya Taniguchi, Toshiya Yamamoto, Akihiko Sato, Andrea Ghelfi, Sachiko N Isobe

DNA research : an international journal for rapid publication of reports on genes and genomes 29(6) 2022年12月1日
Haplotype-resolvedde novogenome assemblies of four coniferous tree species

Kenta Shirasawa, Kentaro Mishima, Hideki Hirakawa, Tomonori Hirao, Miyoko Tsubomura, Soichiro Nagano, Taiichi Iki, Sachiko Isobe, Makoto Takahashi

2022年11月17日
Comprehensive collection of genes and comparative analysis of full-length transcriptome sequences from Japanese larch (Larix kaempferi) and Kuril larch (Larix gmelinii var. japonica)

Kentaro Mishima, Hideki Hirakawa, Taiichi Iki, Yoko Fukuda, Tomonori Hirao, Akira Tamura, Makoto Takahashi

BMC Plant Biology 22(1) 470-470 2022年10月4日
Widespread and transgenerational retrotransposon activation in inter‐ and intraspecies recombinant inbred populations of Lotus japonicus

Eigo Fukai, Manabu Yoshikawa, Niraj Shah, Niels Sandal, Akio Miyao, Seijiro Ono, Hideki Hirakawa, Turgut Yigit Akyol, Yosuke Umehara, Ken‐Ichi Nonomura …

The Plant Journal 111(5) 1397-1410 2022年9月
Development of a genome-wide marker design workflow for onions and its application in target amplicon sequencing-based genotyping

Daisuke Sekine, Satoshi Oku, Tsukasa Nunome, Hideki Hirakawa, Mai Tsujimura, Toru Terachi, Atsushi Toyoda, Masayoshi Shigyo, Shusei Sato, Hikaru Tsukazaki

DNA Research 29(5) 2022年8月23日
Plant GARDEN: a portal website for accessing plant genome, DNA marker, and SNP information

H. Ichihara, H. Hirakawa, A. Ghelfi, M. Kohara, M. Yamada, T. Tamura, A. Nakaya, Y. Nakamura, S. Shirasawa, E. Sugihara …

Acta Horticulturae (1339) 415-418 2022年4月
A genome-wide association and fine-mapping study of white rust resistance in hexaploid chrysanthemum cultivars with a wild diploid reference genome.

Katsuhiko Sumitomo, Kenta Shirasawa, Sachiko Isobe, Hideki Hirakawa, Akiho Harata, Michiharu Nakano, Yoshihiro Nakano, Masafumi Yagi, Tamotsu Hisamatsu, Hiroyasu Yamaguchi …

Horticulture research 9 uhac170 2022年
Transcriptome analysis of Clavibacter michiganensis subsp. michiganensis-infected tomatoes: a role of salicylic acid in the host response

Naoki Yokotani, Yoshinori Hasegawa, Masaru Sato, Hideki Hirakawa, Yusuke Kouzai, Yoko Nishizawa, Eiji Yamamoto, Yoshiki Naito, Sachiko Isobe

BMC Plant Biology 21(1) 476-476 2021年12月
Construction of a high-density linkage map and graphical representation of the arrangement of transcriptome-based unigene markers on the chromosomes of onion, Allium cepa L.

Satoshi Fujito, Turgut Yigit Akyol, Takuya Mukae, Tadayuki Wako, Ken-ichiro Yamashita, Hikaru Tsukazaki, Hideki Hirakawa, Keisuke Tanaka, Yoko Mine, Shusei Sato …

BMC Genomics 22(1) 481-481 2021年12月

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MISC

360

ロングリード技術による針葉樹4種の全ゲノム解読

白澤健太, 三嶋賢太郎, 平川英樹, 平尾知士, 坪村美代子, 永野聡一郎, 井城泰一, 磯部祥子, 高橋誠

日本森林学会大会学術講演集 134th 2023年
日本品種のイチゴのパンゲノム解析

磯部祥子, 白澤健太, 平川英樹, 濱野恵, 龍勝利, 黒倉健

園芸学研究別冊 22(1) 2023年
孤児作物のゲノム遺伝学およびその展望

大田竜也, FAWCETT Jeffrey A., 竹島亮馬, 菊池真司, 大迫敬義, 白澤健太, 法月美悠, 松井勝弘, 矢崎裕規, 小木曽映里 …

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 25th 2023年
植物ゲノム情報ポータルサイト「Plant GARDEN」の改訂(2022年度・第4四半期版)

市原寿子, 平川英樹, 山田学, 小原光代, 山下サマッチャヤー, 白澤沙知子, 戸田陽介, 清水武彦, 中村保一, 中村保一 …

育種学研究 25 2023年
モモ25品種の比較ゲノム解析

衣川達己, 谷澤靖洋, 中村保一, 伊藤武彦, 田中裕之, 平川英樹, 篠澤章久, 篠澤章久, 馬場正, 小田賢司 …

園芸学研究別冊 22(1) 2023年
植物ゲノム統合データベースPlant GARDEN、微生物、メタボローム統合データベース間の連携検索システムの開発

平川英樹, 藤澤貴智, 守屋勇樹, 信定知江, 長崎英樹, 森宙史, 福島敦史, Ghelfi Andrea, 市原寿子, 中村保一 …

トーゴーの日2022 1 2022年10月5日
MicrobeDB.jpからMicrobiome Datahubへ: 微生物・植物・メタボロームのデータ統合と統合微生物データベースの再構築

藤澤貴智, 平川英樹, 守屋勇樹, 信定知江, 金谷重彦, 有田正規, 田畑哲之, 磯部祥子, 東光一, 中村保一 …

トーゴーの日2022 1 2022年10月5日
De novoアセンブリとbulked segregant 解析を用いたキヌア本葉の赤色色素生産に関わる遺伝子の同定

久篠沙耶子, 水野信之, 西村和紗, 上野まりこ, 中崎鉄矢, 小林安文, 藤田泰成, 白澤健太, 平川英樹, 安井康夫 …

日本作物学会講演会要旨集 254 70-70 2022年9月18日
Plant GARDENからMi-GARDENへ~公開ゲノム情報とユーザーデータをつなぐ~

磯部祥子, 市原寿子, 山田学, 中村保一, 中村保一, 戸田陽介, 小原光代, 山下サマッチャヤー, 七夕高也, 平川英樹 …

日本植物学会大会研究発表記録(CD-ROM) 86th 2022年
カラマツ着花変異系統を用いた着花に関わる原因遺伝子座の探索

三嶋賢太郎, 井城泰一, 平川英樹, 白澤健太, 福田陽子, 福田有樹, 宮本尚子, 平尾知士, 永野聡一郎, 平岡裕一郎 …

日本森林学会大会学術講演集 133rd 2022年
マメ科モデル植物ミヤコグサの種内・種間組換え近交系集団におけるLTRレトロトランスポゾンの活性化

深井英吾, 深井英吾, 深井英吾, 深井英吾, 深井英吾, 吉川学, SHAH N., SANDAL N., 宮尾安藝雄, 小野聖二郎 …

育種学研究 24 2022年
性染色体スケールのホウレンソウゲノム配列を活用した間性株の雌花率に関するQTL解析

山野薫, 豊田敦, 平川英樹, 小野寺康之

日本育種学会・日本作物学会北海道談話会会報 63 48-49 2022年
センブリの開花に関わる遺伝子の探索

河野徳昭, 平川英樹, 山本和彦, 熊谷健夫, 渕野裕之, 川原信夫, 川原信夫, 由井秀紀, 金子倫久, 高田泰生 …

日本薬学会年会要旨集(Web) 142nd 2022年
ゲノム・遺伝子・NGSデータを調べるゲノム 4.Plant GARDEN-さまざまな植物のゲノムやマーカー情報を集めたポータルサイト

磯部祥子, 市原寿子, 平川英樹

実験医学 40(17) 2022年
MetaboBank:メタボローム研究のための一次レポジトリおよび統合データベース

時松敏明, 児玉悠一, 福田亜沙美, 藤澤貴智, 長崎英樹, 荒武, 荒武, 高橋みき子, 大澤祥子, 小林紀郎 …

質量分析総合討論会講演要旨集 70th 2022年
ホウレンソウ間性株における雌花着生率に関するQTL解析

山野薫, 豊田敦, 平川英樹, 小野寺康之

育種学研究 24 2022年
未利用地から農地への転換に伴う土壌微生物群集構造変化の解析

高田理江, 花野滋, 宮本託志, 滝澤理仁, 冨永逹, 柴田大輔, 櫻井望, 平川英樹, 小林優

日本土壌肥料学会講演要旨集(Web) 68 2022年
植物の多様性の理解のためにゲノム解析が明らかにできていること

磯部祥子, 白澤健太, 佐藤光彦, 市原寿子, 田島直之, 平川英樹

育種学研究 24 2022年
植物の参照ゲノム配列とユーザーのゲノム配列データを比較するプラットホーム「Mi-GARDEN」の開発

磯部祥子, 堀口晃一郎, 山田学, 三澤拓真, 中村保一, 市原寿子, 小原光代, 平川英樹

育種学研究 24 2022年
セントポーリアの白色縞模様花弁における2種類のMYB転写因子の部位別発現

倉田大地, 津崎智久, 立澤文見, 平川英樹, 白澤健太, 細川宗孝, 細川宗孝

園芸学研究別冊 21(2) 2022年

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講演・口頭発表等

針葉樹４種のゲノム情報データベースBreedingTrees-by-Genesの構築

平川英樹, 白澤健太, 井城泰一, 高島有哉, 福田有樹, 平尾知士, 三嶋賢太郎

第134回日本森林学会大会 2023年3月26日
菌根菌叢・細菌叢同定ウェブインターフェースの開発

平川英樹, 丹羽理恵子, 佐藤修正, 江沢辰広

第17回日本ゲノム微生物学会年会 2023年3月8日
ホウレンソウ育種の効率化に向けたPseudomoleculeの構築

平川英樹, 豊田敦, 伊藤武彦, 鈴木穣, 永野惇, 杉山優, 小野寺康

日本育種学会第138回講演会 2020年10月10日

共同研究・競争的資金等の研究課題

先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(学術研究支援基盤形成) 学術変革領域研究(学術研究支援基盤形成) 2022年4月 - 2028年3月

黒川顕, 川嶋実苗, 豊田敦, 鈴木穣, 林哲也, 中村保一, 森宙史, 野口英樹, 浅井潔, 岩崎渉, 森下真一, 笠原雅弘, 伊藤武彦, 瀬々潤, 中谷明弘, 島村徹平, 波江野洋, 熊谷雄太郎, 高橋弘喜, 平川英樹, 浜田道昭, 山田拓司
作物の機能的SNP情報の整備および有用遺伝子同定への利用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2022年4月 - 2026年3月

平川英樹, 小野寺康之, 増田税
中国雲南省の野生ソバ遺伝資源を活用した栽培化関連遺伝子の網羅的同定

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2018年10月 - 2021年3月

安井康夫, 水野信之, FAWCETT JEFFREY, 大迫敬義
ソバの自家不和合性を打破する分子機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2018年4月 - 2021年3月

安井康夫, 松井勝弘, 中崎鉄也, 平川英樹
キクの光周性花成における暗期長認識機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2018年4月 - 2021年3月

樋口洋平, 久松完
ホウレンソウにおける雄性化／雌性化抑制の分子機構解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2018年4月 - 2021年3月

小野寺康之, 星野洋一郎
アジサイが形成する2種類の花器官-その作り分け機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究若手研究 2018年4月 - 2021年3月

奈島賢児
サツマイモネコブセンチュウ系統のエフェクター多型比較

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2017年4月 - 2021年3月

浅水恵理香
先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究（研究領域提案型）『学術研究支援基盤形成』新学術領域研究（研究領域提案型）『学術研究支援基盤形成』 2016年 - 2021年

小原雄治, 加藤和人, 川嶋実苗, 豊田敦, 鈴木穣, 三井純, 林哲也, 時野隆至, 黒川顕, 中村保一, 野口英樹, 高木利久, 岩崎渉, 森下真一, 浅井潔, 笠原雅弘, 伊藤武彦, 山田拓司, 小椋義俊, 久原哲, 高橋弘喜, 瀬々潤, 榊原康文
縄文時代の植物大型化のメカニズム解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2017年4月 - 2020年3月

那須浩郎, 大田竜也, 中山誠二, 山田昌久
オミクス統合解析によるニンニク遺伝資源・コアコレクションの構築とその機能性評価

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2017年4月 - 2020年3月

執行正義, 澤田有司, 山田朋宏, 佐藤修正, 小林誠
花の模様形成を決める細胞の位置別のエピジェネティックスの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2017年4月 - 2020年3月

平川英樹, 細川宗孝, 白澤健太
植物耐酸性研究の新展開：菌根形成による耐酸性獲得の生理・分子機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2017年4月 - 2020年3月

江澤辰広, 曾根輝雄, 増田税
ミトコンドリア・核ゲノム関連遺伝子ネットワークの解明によるイチゴ雄性不稔の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2017年4月 - 2020年3月

永野聡一郎, 野口裕司
ナデシコ属野生種の低温春化型開花機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2017年4月 - 2020年3月

八木雅史, 宇野雄一
キクの季節的成長制御機構の解明 -ロゼット形成と花成能力の変化について-

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2016年4月 - 2019年3月

久松完, 樋口洋平, 住友克彦
甘草を中心とする重要マメ科薬用資源植物の統合ゲノム研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 基盤研究(A) 2015年4月 - 2019年3月

齊藤和季, 山崎真巳, ライアミット, 鈴木秀幸, 吉本尚子, 高橋弘喜, 櫻井哲也, 持田恵一, 中林亮, 平川英樹, 高上馬希重, 關光, 村中俊哉
LD係数を利用した連鎖地図作成法の開発と高次倍数性種への応用

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2015年4月 - 2018年3月

磯部祥子, 中谷明弘, 田中勝
陸上植物ー菌根菌共生の進化の原点を探る：モデル植物フタバネゼニゴケの基盤整備

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2015年4月 - 2018年3月

中川知己
植物アルカロイド生合成系の分子進化の解明と代謝工学

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 基盤研究(S) 2014年5月 - 2018年3月

佐藤文彦, 南博道, 細江智夫, 山田泰之, 永尾雅哉, 河野徳昭, 大和勝幸, 西田律夫, 平川英樹, 豊田敦

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産業財産権

特開2022-046306 キク白さび病抵抗性を判定する方法、製造方法、分子マーカー、キク白さび病抵抗性関連遺伝子、キク白さび病抵抗性のキク属植物

住友克彦, 磯部祥子, 白澤健太, 平川英樹

平川英樹

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研究キーワード

研究分野

経歴

学歴

論文

MISC

講演・口頭発表等

共同研究・競争的資金等の研究課題

産業財産権

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