廣田耕志 (Kouji Hirota) - マイポータル

基本情報

所属: 東京都立大学理学研究科化学専攻教授

学位: 博士（理学）(東京大学大学院理学系研究科生物化学専攻)

J-GLOBAL ID: 201201084500571295
researchmap会員ID: B000221291

外部リンク: https://khirota9.wixsite.com/website

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研究分野

経歴

2012年4月 - 現在

首都大学東京理学研究科化学専攻, 教授
2010年5月 - 2012年3月

京都大学医学(系)研究科(研究院), 准教授
2008年4月 - 2010年4月

京都大学医学（系）研究科(研究院), 助教
2005年4月 - 2008年3月

理化学研究員, 基礎科学特別研究員
2001年4月 - 2005年3月

理化学研究所, 協力研究員

学歴

1998年4月 - 2001年3月

東京大学大学院理学系研究科生物化学専攻博士課程
1996年4月 - 1998年3月

東京大学大学院理学系研究科生物化学専攻修士課程
1992年4月 - 1996年3月

東京大学理学部生物化学科

論文

102

The proofreading exonuclease of leading-strand DNA polymerase epsilon prevents replication fork collapse at broken template strands

Tasnim Ahmad, Ryotaro Kawasumi, Tomoya Taniguchi, Takuya Abe, Kazuhiro Terada, Masataka Tsuda, Naoto Shimizu, Toshiki Tsurimoto, Shunichi Takeda, Kouji Hirota

Nucleic Acids Research 2023年11月8日
PCNA recruits cohesin loader Scc2 to ensure sister chromatid cohesion.

Ivan Psakhye, Ryotaro Kawasumi, Takuya Abe, Kouji Hirota, Dana Branzei

Nature structural & molecular biology 2023年8月17日
CTF18-RFC contributes to cellular tolerance against chain-terminating nucleoside analogs (CTNAs) in cooperation with proofreading exonuclease activity of DNA polymerase ε.

Mubasshir Washif, Tasnim Ahmad, Md Bayejid Hosen, Md Ratul Rahman, Tomoya Taniguchi, Hiromori Okubo, Kouji Hirota, Ryotaro Kawasumi

DNA repair 127 103503-103503 2023年7月
Application of neural network-based image analysis to detect sister chromatid cohesion defects

Daiki Ikemoto, Tomoya Taniguchi, Kouji Hirota, Kiyoshi Nishikawa, Kan Okubo, Takuya Abe

Scientific Reports 13(1) 2023年2月6日
SPRTN and TDP1/TDP2 Independently Suppress 5-Aza-2′-deoxycytidine-Induced Genomic Instability in Human TK6 Cell Line

Toshiaki Nakano, Takahito Moriwaki, Masataka Tsuda, Misa Miyakawa, Yuto Hanaichi, Hiroyuki Sasanuma, Kouji Hirota, Masanobu Kawanishi, Hiroshi Ide, Keizo Tano …

Chemical Research in Toxicology 35(11) 2059-2067 2022年10月25日査読有り
<scp>XRCC1</scp> counteracts poly(ADP ribose)polymerase (PARP) poisons, olaparib and talazoparib, and a clinical alkylating agent, temozolomide, by promoting the removal of trapped <scp>PARP1</scp> from broken <scp>DNA</scp>

Kouji Hirota, Masato Ooka, Naoto Shimizu, Kousei Yamada, Masataka Tsuda, Mahmoud Abdelghany Ibrahim, Shintaro Yamada, Hiroyuki Sasanuma, Mitsuko Masutani, Shunichi Takeda

Genes to Cells 2022年3月
Construction of a human hTERT RPE-1 cell line with inducible Cre for editing of endogenous genes.

Naushin L Hindul, Amarjot Jhita, Daiana G Oprea, Tasnim Alamgir Hussain, Oksana Gonchar, Miguel Angel Muro Campillo, Laura O'Regan, Masato T Kanemaki, Andrew M Fry, Kouji Hirota …

Biology open 11(2) 2022年2月15日
lncRNA transcription induces meiotic recombination through chromatin remodelling in fission yeast

Satoshi Senmatsu, Ryuta Asada, Arisa Oda, Charles S. Hoffman, Kunihiro Ohta, Kouji Hirota

Communications Biology 4(1) 2021年12月
Targeting chromosome trisomy for chromosome editing.

Takuya Abe, Yuya Suzuki, Teppei Ikeya, Kouji Hirota

Scientific reports 11(1) 18054-18054 2021年9月10日
Vertebrate CTF18 and DDX11 essential function in cohesion is bypassed by preventing WAPL-mediated cohesin release

Ryotaro Kawasumi, Takuya Abe, Ivan Psakhye, Keiji Miyata, Kouji Hirota, Dana Branzei

Genes & Development 2021年9月9日
Follow-up genotoxicity assessment of Ames-positive/equivocal chemicals using the improved thymidine kinase gene mutation assay in DNA repair-deficient human TK6 cells.

Akira Sassa, Takayuki Fukuda, Akiko Ukai, Maki Nakamura, Ryosuke Sato, Sho Fujiwara, Kouji Hirota, Shunichi Takeda, Kei-Ichi Sugiyama, Masamitsu Honma …

Mutagenesis 2021年7月3日
XRCC1 prevents toxic PARP1 trapping during DNA base excision repair

Annie A. Demin, Kouji Hirota, Masataka Tsuda, Marek Adamowicz, Richard Hailstone, Jan Brazina, William Gittens, Ilona Kalasova, Zhengping Shao, Shan Zha …

Molecular Cell 2021年6月
Division of labor of Y-family polymerases in translesion-DNA synthesis for distinct types of DNA damage

Yuriko Inomata, Takuya Abe, Masataka Tsuda, Shunichi Takeda, Kouji Hirota

PLOS ONE 16(6) e0252587-e0252587 2021年6月1日
Pold4, the fourth subunit of replicative polymerase δ, suppresses gene conversion in the immunoglobulin-variable gene in avian DT40 cells.

Kota Kojima, Masato Ooka, Takuya Abe, Kouji Hirota

DNA repair 100 103056-103056 2021年4月
Topoisomerase activity is linked to altered nucleosome positioning and transcriptional regulation in the fission yeast fbp1 gene

Ryuta Asada, Satoshi Senmatsu, Ben Montpetit, Kouji Hirota

PLOS ONE 15(11) e0242348-e0242348 2020年11月12日
Direct Determination of Pseudouridine in RNA by Mass Spectrometry Coupled with Stable Isotope Labeling.

Yuka Yamaki, Yuko Nobe, Masami Koike, Yoshio Yamauchi, Kouji Hirota, Nobuhiro Takahashi, Hiroshi Nakayama, Toshiaki Isobe, Masato Taoka

Analytical chemistry 92(16) 11349-11356 2020年8月18日
Participation of TDP1 in the repair of formaldehyde-induced DNA-protein cross-links in chicken DT40 cells

Toshiaki Nakano, Mahmoud I. Shoulkamy, Masataka Tsuda, Hiroyuki Sasanuma, Kouji Hirota, Minoru Takata, Shin-ichiro Masunaga, Shunichi Takeda, Hiroshi Ide, Tadayoshi Bessho …

PLOS ONE 15(6) e0234859-e0234859 2020年6月26日
Topoisomerase I-driven repair of UV-induced damage in NER-deficient cells.

Liton Kumar Saha, Mitsuo Wakasugi, Salma Akter, Rajendra Prasad, Samuel H Wilson, Naoto Shimizu, Hiroyuki Sasanuma, Shar-Yin Naomi Huang, Keli Agama, Yves Pommier …

Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 117(25) 14412-14420 2020年6月23日査読有り
UBC13-mediated ubiquitin signaling promotes removal of blocking adducts from DNA double-strand breaks

Remi Akagawa, Hai Thanh Trinh, Liton Kumar Saha, Masataka Tsuda, Kouji Hirota, Shintaro Yamada, Atsushi Shibata, Masato T. Kanemaki, Shinichiro Nakada, Shunichi Takeda …

iScience, in press 2020年3月査読有り
Roles of lncRNA transcription as a novel regulator of chromosomal function

Satoshi Senmatsu, Kouji Hirota

Genes & Genetic Systems 2020年

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MISC

Activation induced deaminase(AID)のconditional knockoutによる抗体遺伝子再編成制御技術の開発

松井晋, 瀬尾秀宗, 村山晃歩, 黒澤恒平, 阿部拓也, 廣田耕志, 太田邦史

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 42nd 2019年
lncRNAによるストレス種特異的な遺伝子発現の制御

岡崎賢吾, 竹俣直道, 小田有沙, 山田貴富, ガリポンジョゼフィーヌ, 三好知一郎, 鈴木穣, 菅野純夫, HOFFMAN Charles S., 廣田耕志 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 39th 2016年
Ctf18-RFCのPCNA装着は非DNA合成モードのPolεによって促進される

藤澤遼, 大橋英治, 廣田耕志, 釣本敏樹

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 39th 2016年
Tup family corepressorとCCAAT-binding factorによるクロマチン構造変化の拮抗的な制御がmRNA転写開始点を決定する

浅田隆大, 竹俣直道, 太田邦史, 廣田耕志

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 37th 2014年
長鎖ノンコーディングRNAの転写はクロマチン制御因子の呼び込みをポジティブフィードバック的に促進する

竹俣直道, 廣田耕志, 山田貴富, 小田有沙, JOSEPHINE Galipon, 三好知一郎, HOFFMAN Charles, 太田邦史

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 36th 2013年
複製チェックポイントと染色体高次構造を仲介する新規因子による遺伝的組換え開始制御

伊藤将, 三好知一郎, 久郷和人, 山田真太郎, 山田真太郎, 古市真樹, 小田有沙, 小田有沙, 山田貴富, 廣田耕志 …

日本遺伝学会大会プログラム・予稿集 84th 2012年
染色体高次構造とS期チェックポイントを減数分裂期組換えの開始と連係させるリエゾン因子

伊藤将, 三好知一郎, 三好知一郎, 久郷和人, 山田真太郎, 古市真樹, 小田有沙, 山田貴富, 廣田耕志, 廣田耕志 …

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 35th 2012年
ヒストン修飾酵素Gcn5およびSet1はlncRNAの転写と協調してグルコース飢餓応答に働く

竹俣直道, 廣田耕志, GALIPON Josephine, 小田有沙, 三好知一郎, 山田貴富, 太田邦史

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 35th 2012年
ゲノムの“ダークマター”長鎖ncRNAが制御する多彩な生命現象長鎖ncRNAによるクロマチン・転写活性化の制御

太田邦史, 太田邦史, 小田有沙, GALIPON Josephine, 竹俣直道, 三好知一郎, 廣田耕志

実験医学 29(11) 2011年
長鎖ノンコーディングRNAの転写によるヒストン修飾制御と遺伝発現制御

竹俣直道, 廣田耕志, GALIPON Josephine, 三好知一郎, HOFFMAN Charles, 太田邦史

日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web) 34th 2011年
Creating cell models of familial Parkinson's disease using the chicken DT40 B cell line

Eiko Minakawa, Satoshi Horimoto, Kouji Hirota, Shunichi Takeda, Ryosuke Takahashi

NEUROSCIENCE RESEARCH 71 E191-E191 2011年
グルコース飢餓時におけるmRNA型長鎖非翻訳RNA発現のゲノムワイド解析

小田有沙, 三好知一郎, 久郷和人, 廣田耕志, 太田邦史

生化学 2010年
ノンコーディングRNAの転写を介したクロマチン再編成・ヒストン修飾の制御と遺伝子活性化機構

竹俣直道, 廣田耕志, 廣田耕志, JOSEPHINE Galipon, 三好知一郎, 太田邦史

生化学 2010年
mlonRNA 仮説 : ノンコーディングRNA転写による新規クロマチン構造変化機構

廣田耕志, 太田邦史

化学と生物 47(5) 296-298 2009年5月1日
Analyses of the polymorphic Dmc-1-M200V variant

J. Hikiba, K. Hirota, W. Kagawa, S. Ikawa, T. Kinebuchi, I. Sakane, Y. Takizaw, S. Yokoyama, B. Mandon-Pipin, A. Nicolas …

FEBS JOURNAL 275 113-113 2008年6月
染色体増幅,組換え,修復の制御 4.減数分裂期の組換え開始制御

廣田耕志, 福田智行, 太田邦史

実験医学 25(5) 732-738 2007年3月15日
Chromatin regulation at fission yeast CRE-related sequences

Kouji Hirota, Takehiko Shibata, Kunihiro Ohta

CELL STRUCTURE AND FUNCTION 30 94-94 2005年6月
分裂酵母の細胞極性伸張に関わるシグナル伝達経路の解析

廣田耕志, 田仲加代子, 山本正幸

日本分子生物学会年会プログラム・講演要旨集 21 554-554 1998年12月1日
SMN-GEMIN2 comple χ stimulates the RAD51-mediated recombination reactions

Takaku M, Tsujita T, Horikoshi N, Takizawa Y, Qing Y, Hirota K, Ikura M, Ikura T, Takeda S, Kurumizaka, H

第34 回日本分子生物学会年会 12 月15 日横浜査読有り

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

相同的組換えでの相同並行三重鎖DNAの働き

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

柴田武彦, 廣田耕志
革新的ガン治療に向けた遺伝子シナジー解明のための国際共同研究ネットワーク

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2019年10月 - 2024年3月

廣田耕志, 津田雅貴, 阿部拓也
非コードRNA転写領域のクロマチンを開くパイオニアポリメラーゼ複合体の探索

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 2021年7月 - 2023年3月

廣田耕志
放射線などで生じる末端に付加体が付く単鎖DNA切断における複製停止機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2020年4月 - 2023年3月

廣田耕志
ヒトゲノム編集細胞を使った、化学物質の薬理作用・有害性を解析するシステムの構築

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2016年5月 - 2021年3月

武田俊一, 廣田耕志, 笹沼博之, 安井学, Brown John, 津田雅貴
複製停止解除におけるポリメラーゼネットワーク制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2016年4月 - 2019年3月

廣田耕志, 阿部拓也
非コードRNAによるクロマチン・高次ゲノム構造制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2016年4月 - 2018年3月

廣田耕志
新規損傷乗り越えアッセイによる損傷乗り越えの鎖特異性の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究 2016年4月 - 2018年3月

廣田耕志
ノンコーディングRNA転写と共役したクロマチン構造変化の制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2014年4月 - 2016年3月

廣田耕志
プロテオミクスと遺伝学の融合によるゲノム恒常性維持マシナリーの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2013年4月 - 2016年3月

廣田耕志
遺伝子破壊細胞を使った、化学物質の生物効果をハイスループットに解析するシステム

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 2011年4月 - 2016年3月

武田俊一, 廣田耕志, 山田亮, 岡田徹也, 笹沼博之, 清水宏泰, 高橋良輔, 清水宏泰
複製ポリメラーゼδによる複製フォークの安定化機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2012年4月 - 2014年3月

廣田耕志
長鎖非翻訳ＲＮＡを介したクロマチン／染色体機能の制御

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 2009年4月 - 2014年3月

太田邦史, 山田貴富, 久郷和人, 廣田耕志
プロテオミクスと遺伝学の融合によるクロマチンーDNA修復のクロストークの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(A) 2010年 - 2012年

廣田耕志
ノンコーディングRNA転写に共役する新規クロマチン制御機構の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2009年 - 2010年

廣田耕志
DT40細胞でニワトリBリンパ球細胞特異的な組換え因子を探索する

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2008年 - 2009年

廣田耕志
複製・分配・クロマチン構造と組換え開始の相互作用

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 2005年 - 2009年

太田邦史, 廣田耕志, 福田智行, ブランゼイダーナ, 山田貴富
M26/CRE配列におけるクロマチン再編成とストレス応答

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2007年 - 2008年

太田邦史, 廣田耕志, 廣田耕志, 山田貴富
分裂酵母の飢餓・ストレス応答における転写・組換え活性化とクロマチン再編成の機構

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2005年 - 2006年

太田邦史, 廣田耕志
酵母染色体組換えにおける染色体機能装置の連携

日本学術振興会科学研究費助成事業特定領域研究 1999年 - 2003年

太田邦史, 梅津桂子, 廣田耕志, 山田貴富, 水野健一

廣田耕志

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論文

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