石垣和慶 (Kazuyoshi Ishigaki) - マイポータル

基本情報

所属: 理化学研究所　生命医科学研究センター　ヒト免疫遺伝研究チームチームリーダー

学位: 医学博士(2014年3月東京大学)

ORCID ID: https://orcid.org/0000-0003-2881-0657
J-GLOBAL ID: 202001015845835806
researchmap会員ID: R000012873

Common SNPがヒト免疫機能に与える影響を解明し、自己免疫疾患の病態解明、新規創薬、臨床応用を目指して研究をしています。

研究キーワード

経歴

2021年4月 - 現在

理化学研究所生命医科学研究センター, ヒト免疫遺伝研究チーム
2018年6月 - 2021年3月

Broad Institute
2018年6月 - 2021年3月

Harvard Medical School
2018年6月 - 2021年3月

Brigham And Women's Hospital, Department of Medicine, Division of genetics and rheumatology
2016年4月 - 2018年5月

理化学研究所・統合生命医科学研究センター（統計解析研究チーム）
2014年4月 - 2016年3月

理化学研究所・統合生命医科学研究センター（自己免疫疾患研究チーム）
2010年4月 - 2014年3月

東京大学大学院医学系研究科（アレルギー・リウマチ学）
2008年4月 - 2010年3月

東京都立駒込病院
2005年4月 - 2008年3月

国保旭中央病院

学歴

2010年4月 - 2014年3月

東京大学大学院医学系研究科（アレルギー・リウマチ学）
1999年4月 - 2005年3月

東京大学医学部医学科

受賞

2018年6月

奨励賞, 日本骨免疫学会
2018年4月

奨励賞, 日本リウマチ学会

論文

How can genetics analysis allow for early detection of rheumatoid arthritis

Kazuhiko Yamamoto, Kazuyoshi Ishigaki, Yukinori Okada

Seminars in Arthritis and Rheumatism 64 152323-152323 2024年2月
Tutorial: a statistical genetics guide to identifying HLA alleles driving complex disease.

Saori Sakaue, Saisriram Gurajala, Michelle Curtis, Yang Luo, Wanson Choi, Kazuyoshi Ishigaki, Joyce B Kang, Laurie Rumker, Aaron J Deutsch, Sebastian Schönherr …

Nature protocols 2023年7月26日
Multimodal repertoire analysis unveils B cell biology in immune-mediated diseases

Mineto Ota, Masahiro Nakano, Yasuo Nagafuchi, Satomi Kobayashi, Hiroaki Hatano, Ryochi Yoshida, Yuko Akutsu, Takahiro Itamiya, Nobuhiro Ban, Yumi Tsuchida …

Annals of the Rheumatic Diseases ard-2023 2023年7月19日
Immunomics analysis of rheumatoid arthritis identified precursor dendritic cells as a key cell subset of treatment resistance.

Saeko Yamada, Yasuo Nagafuchi, Min Wang, Mineto Ota, Hiroaki Hatano, Yusuke Takeshima, Mai Okubo, Satomi Kobayashi, Yusuke Sugimori, Nakano Masahiro …

Annals of the rheumatic diseases 82(6) 809-819 2023年6月査読有り
Mobile element variation contributes to population-specific genome diversification, gene regulation and disease risk.

Shohei Kojima, Satoshi Koyama, Mirei Ka, Yuka Saito, Erica H Parrish, Mikiko Endo, Sadaaki Takata, Misaki Mizukoshi, Keiko Hikino, Atsushi Takeda …

Nature genetics 55(6) 939-951 2023年5月11日査読有り
Genome-wide association study reveals BET1L associated with survival time in the 137,693 Japanese individuals

Masato Akiyama, Saori Sakaue, Atsushi Takahashi, Kazuyoshi Ishigaki, Makoto Hirata, Koichi Matsuda, Yukihide Momozawa, Yukinori Okada, Toshiharu Ninomiya, Masaru Koido …

Communications Biology 6(1) 2023年2月3日査読有り
Discovery and systematic characterization of risk variants and genes for coronary artery disease in over a million participants.

Krishna G Aragam, Tao Jiang, Anuj Goel, Stavroula Kanoni, Brooke N Wolford, Deepak S Atri, Elle M Weeks, Minxian Wang, George Hindy, Wei Zhou …

Nature genetics 54(12) 1803-1815 2022年12月査読有り
Control of naive and effector CD4 T cell receptor repertoires by rheumatoid-arthritis-risk HLA alleles

Yasuo Nagafuchi, Mineto Ota, Hiroaki Hatano, Mariko Inoue, Satomi Kobayashi, Mai Okubo, Yusuke Sugimori, Masahiro Nakano, Saeko Yamada, Ryochi Yoshida …

Journal of Autoimmunity 133 102907-102907 2022年12月査読有り
Genome-Wide Association Study of Age-Related Macular Degeneration Reveals 2 New Loci Implying Shared Genetic Components with Central Serous Chorioretinopathy.

Masato Akiyama, Masahiro Miyake, Yukihide Momozawa, Satoshi Arakawa, Maiko Maruyama-Inoue, Mikiko Endo, Yusuke Iwasaki, Kazuyoshi Ishigaki, Nana Matoba, Yukinori Okada …

Ophthalmology 2022年11月22日査読有り
Prediction of the cell-type-specific transcription of non-coding RNAs from genome sequences via machine learning

Masaru Koido, Chung-Chau Hon, Satoshi Koyama, Hideya Kawaji, Yasuhiro Murakawa, Kazuyoshi Ishigaki, Kaoru Ito, Jun Sese, Nicholas F. Parrish, Yoichiro Kamatani …

Nature Biomedical Engineering 2022年11月21日査読有り
Multi-ancestry genome-wide association analyses identify novel genetic mechanisms in rheumatoid arthritis.

Kazuyoshi Ishigaki, Saori Sakaue, Chikashi Terao, Yang Luo, Kyuto Sonehara, Kensuke Yamaguchi, Tiffany Amariuta, Chun Lai Too, Vincent A Laufer, Ian C Scott …

Nature genetics 54(11) 1640-1651 2022年11月査読有り筆頭著者
Splicing QTL analysis focusing on coding sequences reveals mechanisms for disease susceptibility loci.

Kensuke Yamaguchi, Kazuyoshi Ishigaki, Akari Suzuki, Yumi Tsuchida, Haruka Tsuchiya, Shuji Sumitomo, Yasuo Nagafuchi, Fuyuki Miya, Tatsuhiko Tsunoda, Hirofumi Shoda …

Nature communications 13(1) 4659-4659 2022年8月24日査読有り
Distinct transcriptome architectures underlying lupus establishment and exacerbation

Masahiro Nakano, Mineto Ota, Yusuke Takeshima, Yukiko Iwasaki, Hiroaki Hatano, Yasuo Nagafuchi, Takahiro Itamiya, Junko Maeda, Ryochi Yoshida, Saeko Yamada …

Cell 2022年8月査読有り責任著者
Large-scale genome-wide association study of coronary artery disease in genetically diverse populations.

Catherine Tcheandjieu, Xiang Zhu, Austin T Hilliard, Shoa L Clarke, Valerio Napolioni, Shining Ma, Kyung Min Lee, Huaying Fang, Fei Chen, Yingchang Lu …

Nature medicine 28(8) 1679-1692 2022年8月査読有り
Single-cell eQTL models reveal dynamic T cell state dependence of disease loci.

Aparna Nathan, Samira Asgari, Kazuyoshi Ishigaki, Cristian Valencia, Tiffany Amariuta, Yang Luo, Jessica I Beynor, Yuriy Baglaenko, Sara Suliman, Alkes L Price …

Nature 606(7912) 120-128 2022年6月査読有り
Biological insights into systemic lupus erythematosus through an immune cell-specific transcriptome-wide association study.

Xianyong Yin, Kwangwoo Kim, Hiroyuki Suetsugu, So-Young Bang, Leilei Wen, Masaru Koido, Eunji Ha, Lu Liu, Yuma Sakamoto, Sungsin Jo …

Annals of the rheumatic diseases 81(9) 1273-80 2022年5月24日査読有り
HLA autoimmune risk alleles restrict the hypervariable region of T cell receptors.

Kazuyoshi Ishigaki, Kaitlyn A Lagattuta, Yang Luo, Eddie A James, Jane H Buckner, Soumya Raychaudhuri

Nature genetics 54(4) 393-402 2022年4月査読有り筆頭著者
Mobile elements in human population-specific genome and phenotype divergence

Shohei Kojima, Satoshi Koyama, Mirei Ka, Yuka Saito, Erica H. Parrish, Mikiko Endo, Sadaaki Takata, Misaki Mizukoshi, Keiko Hikino, Atsushi Takeda …

bioRxiv 2022年3月27日
Immune cell multiomics analysis reveals contribution of oxidative phosphorylation to B-cell functions and organ damage of lupus.

Yusuke Takeshima, Yukiko Iwasaki, Masahiro Nakano, Yuta Narushima, Mineto Ota, Yasuo Nagafuchi, Shuji Sumitomo, Tomohisa Okamura, Keith Elkon, Kazuyoshi Ishigaki …

Annals of the rheumatic diseases 81(6) 845-853 2022年3月2日
Repertoire analyses reveal T cell antigen receptor sequence features that influence T cell fate.

Kaitlyn A Lagattuta, Joyce B Kang, Aparna Nathan, Kristen E Pauken, Anna Helena Jonsson, Deepak A Rao, Arlene H Sharpe, Kazuyoshi Ishigaki, Soumya Raychaudhuri

Nature immunology 23(3) 446-457 2022年2月17日査読有り責任著者

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MISC

Trans-ancestry genome-wide association study identifies novel genetic mechanisms in rheumatoid arthritis

Kazuyoshi Ishigaki, Saori Sakaue, Chikashi Terao, Yang Luo, Kyuto Sonehara, Kensuke Yamaguchi, Tiffany Amariuta, Chun Lai Too, Vincent A Laufer, Ian C Scott …

medRxiv 2021年12月5日
Meta-analysis of 208,370 East Asians identifies 113 genomic loci and yields new non-immune cell relevant biological insights for systemic lupus erythematosus

Xianyong Yin, Kwangwoo Kim, Hiroyuki Suetsugu, So-Young Bang, Leilei Wen, Masaru Koido, Eunji Ha, Lu Liu, Yuma Sakamoto, Sungsin Jo …

medRxiv 2020年8月25日
Predicting cell-type-specific non-coding RNA transcription from genome sequence

Masaru Koido, Chung-Chau Hon, Satoshi Koyama, Hideya Kawaji, Yasuhiro Murakawa, Kazuyoshi Ishigaki, Kaoru Ito, Jun Sese, Yoichiro Kamatani, Piero Carninci …

bioRxiv 2020年3月30日
自己免疫疾患のメカニズムへの最新のアプローチ関節リウマチ患者由来滑膜線維芽細胞の統合的機能ゲノム解析

土屋遥香, 太田峰人, 住友秀次, 石垣和慶, 鈴木亜香里, 高地雄太, 土田優美, 庄田宏文, 乾洋, 武冨修治 …

日本リウマチ学会総会・学術集会プログラム・抄録集 63回 202-202 2019年3月
刺激下でのCD4陽性T細胞におけるexpression quantitative trait locusの検討

土田優美, 太田峰人, 太田峰人, 石垣和慶, 石垣和慶, 住友秀次, 山口健介, 永渕泰雄, 土屋遥香, 庄田宏文 …

日本臨床免疫学会総会プログラム・抄録集 47th 2019年
滑膜線維芽細胞による関節リウマチの炎症形成メカニズムに対する遺伝免疫学的アプローチ

土屋遥香, 太田峰人, 住友秀次, 石垣和慶, 鈴木亜香里, 高地雄太, 土田優美, 庄田宏文, 乾洋, 武冨修治 …

日本臨床免疫学会総会プログラム・抄録集 46回 84-84 2018年11月
滑膜線維芽細胞による関節リウマチの炎症形成メカニズムに対する遺伝免疫学的アプローチ

土屋遥香, 太田峰人, 住友秀次, 石垣和慶, 鈴木亜香里, 高地雄太, 土田優美, 庄田宏文, 乾洋, 武冨修治 …

日本臨床免疫学会総会プログラム・抄録集 46回 117-117 2018年11月
滑膜線維芽細胞による関節リウマチの炎症形成メカニズムに対する遺伝免疫学的アプローチ

土屋遥香, 太田峰人, 住友秀次, 石垣和慶, 鈴木亜香里, 高地雄太, 土田優美, 庄田宏文, 乾洋, 武冨修治 …

日本臨床免疫学会総会プログラム・抄録集 46回 84-84 2018年11月
滑膜線維芽細胞による関節リウマチの炎症形成メカニズムに対する遺伝免疫学的アプローチ

土屋遥香, 太田峰人, 住友秀次, 石垣和慶, 鈴木亜香里, 高地雄太, 土田優美, 庄田宏文, 乾洋, 武冨修治 …

日本臨床免疫学会総会プログラム・抄録集 46回 117-117 2018年11月
全身性エリテマトーデスの病因を明らかにするための免疫細胞サブセットのマルチオミクス解析

TAKESHIMA Yusuke, TAKESHIMA Yusuke, IWASAKI Yukiko, OTA Mineto, OTA Mineto, ISHIGAKI Kazuyoshi, SUMITOMO Shuji, KOCHI Yuta, OKAMURA Tomohisa, KOYASU Shigeo …

日本リウマチ学会総会・学術集会プログラム・抄録集 62nd 2018年
リンパ球サブセット特異的トランスクリプトーム分析は全身性エリテマトーデス(SLE)のB細胞異常におけるミトコンドリアの関与を明らかにした

YAMAMOTO Kazuhiko, YAMAMOTO Kazuhiko, TAKESHIMA Yusuke, IWASAKI Yukiko, OTA Mineto, ISHIGAKI Kazuyoshi, SUMITOMO Shuji, SUZUKI Akari, KOCHI Yuta, OKAMURA Tomohisa …

日本免疫学会総会・学術集会記録(CD-ROM) 47 2018年
様々なB細胞サブセットのRNA配列決定によって明らかにされたSLEにおける異常なB細胞受容体レパートリー成熟

OTA Mineto, ISHIGAKI Kazuyoshi, SUMITOMO Shuji, TAKESHIMA Yusuke, IWASAKI Yukiko, OKAMURA Tomohisa, KOCHI Yuta, YAMAMOTO Kazuhiko, FUJIO Keishi

日本リウマチ学会総会・学術集会プログラム・抄録集 62nd 2018年
自己免疫疾患感受性多型のsplicing QTL effectを介したtrans-eQTL effectの網羅的評価

山口健介, 山口健介, 高地雄太, 石垣和慶, 石垣和慶, 太田峰人, 太田峰人, 竹島雄介, 竹島雄介, 土田優美 …

日本リウマチ学会総会・学術集会プログラム・抄録集 62nd 2018年
末梢血免疫担当サブセット毎のトランスクリプトーム解析による成人発症Still病の病態解明へのアプローチ

白井晴己, 岩崎由希子, 竹島雄介, 杉森祐介, 大久保麻衣, 小林聖未, 柳岡治先, 柳岡治先, 太田峰人, 永渕泰雄 …

日本リウマチ学会総会・学術集会プログラム・抄録集 62nd 2018年
SLE・抗リン脂質抗体症候群ヒト免疫細胞を用いたsQTL解析による疾患感受性遺伝子領域の解析

山口健介, 高地雄太, 石垣和慶, 土田優美, 土屋遥香, 住友秀次, 加藤里佳, 櫻井恵一, 仲地真一郎, 永渕泰雄 …

日本リウマチ学会総会・学術集会プログラム・抄録集 61回 605-605 2017年3月
関節リウマチの病因・病態関節リウマチ患者の末梢血CD4+T細胞で同定された疾患活動性と相関する遺伝子群とアバタセプトの影響

住友秀次, 永渕泰雄, 石垣和慶, 土田優美, 土屋遥香, 太田峰人, 仲地真一郎, 加藤里佳, 櫻井恵一, 花田徳大 …

日本リウマチ学会総会・学術集会プログラム・抄録集 61回 506-506 2017年3月
SLE・抗リン脂質抗体症候群ヒト免疫細胞を用いたsQTL解析による疾患感受性遺伝子領域の解析

山口健介, 高地雄太, 石垣和慶, 土田優美, 土屋遥香, 住友秀次, 加藤里佳, 櫻井恵一, 仲地真一郎, 永渕泰雄 …

日本リウマチ学会総会・学術集会プログラム・抄録集 61回 605-605 2017年3月
末梢血単球(PBMC)の細胞型特異的RNA-seqは全身性エリテマトーデスに対するB細胞におけるミトコンドリア貢献を明らかにした

TAKESHIMA Yusuke, IWASAKI Yukiko, OTA Mineto, ISHIGAKI Kazuyoshi, SUMITOMO Shuji, SHODA Hirofumi, KOCHI Yuta, OKAMURA Tomohisa, FUJIO Keishi, YAMAMOTO Kazuhiko …

日本リウマチ学会総会・学術集会プログラム・抄録集 61st 2017年
末梢単核細胞(PBMC)中の免疫細胞サブセットのゲノム包括分析とトランスクリプトーム解析は全身性エリテマトーデスに対するB細胞のミトコンドリア関与を明らかにする

TAKESHIMA Yusuke, TAKESHIMA Yusuke, IWASAKI Yukiko, OTA Mineto, OTA Mineto, NAGAFUCHI Yasuo, ISHIGAKI Kazuyoshi, SUMITOMO Shuji, KOCHI Yuta, OKAMURA Tomohisa …

日本免疫学会総会・学術集会記録(CD-ROM) 46 2017年
関節リウマチにおける免疫細胞サブセットのトランスクリプトームプロファイリング

OTA Mineto, SUMITOMO Shuji, ISHIGAKI Kazuyoshi, TAKESHIMA Yusuke, IWASAKI Yukiko, KOCHI Yuta, FUJIO Keishi, YAMAMOTO Kazuhiko

日本リウマチ学会総会・学術集会プログラム・抄録集 61st 2017年

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共同研究・競争的資金等の研究課題

老化細胞の蓄積を起因とするループス腎炎の病態形成と治療標的分子の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2023年4月 - 2026年3月

一瀬邦弘, 石垣和慶, 井川敬
自己免疫疾患のリスク多型機能解析による個別化抗サイトカイン療法の確立

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2022年4月 - 2025年3月

石垣和慶
自己免疫疾患のリスク多型の機能を制御する転写因子の探索

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援 2021年8月 - 2023年3月

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