尾上耕一 (OGAMI KOICHI) - マイポータル

基本情報

所属: 名古屋大学大学院医学系研究科助教 (テニュア)

ORCID iD: https://orcid.org/0000-0001-9380-9666
J-GLOBAL ID: 201801006240050346
researchmap会員ID: B000287067

研究分野

経歴

2024年4月 - 現在

名古屋大学, 大学院医学系研究科, 助教（テニュア）
2020年12月 - 2024年3月

名古屋大学, 大学院医学系研究科, 助教
2018年1月 - 2020年11月

名古屋市立大学大学院, 薬学研究科, 助教
2016年11月 - 2017年12月

理化学研究所, ライフサイエンス技術基盤研究センター, 研究員
2013年11月 - 2016年10月

コロンビア大学, ポストドクトラルリサーチサイエンティスト
2013年4月 - 2013年10月

名古屋市立大学大学院, 薬学研究科, 博士研究員

受賞

2022年10月

研究奨励賞, 第3回シロリムス新作用研究会
2012年7月

発表賞, 第58回日本薬学会東海支部総会・大会大学院フォーラム

論文

Fine Regulation of MicroRNAs in Gene Regulatory Networks and Pathophysiology

Mayu Seida, Koichi Ogami, Seiko Yoshino, Hiroshi I. Suzuki

International Journal of Molecular Sciences 26(7) 2861-2861 2025年3月21日査読有り
A Combinatorial Code for CPEB-Mediated c-myc Repression

Koichi Ogami, Keima Ogawa, Shoko Sanpei, Fumito Ichikawa, Tsuyoshi Udagawa, Shin-ichi Hoshino

Cells 12(19) 2410-2410 2023年10月6日査読有り筆頭著者
TUG1-mediated R-loop resolution at microsatellite loci as a prerequisite for cancer cell proliferation

Miho M. Suzuki, Kenta Iijima, Koichi Ogami, Keiko Shinjo, Yoshiteru Murofushi, Jingqi Xie, Xuebing Wang, Yotaro Kitano, Akira Mamiya, Yuji Kibe …

Nature Communications 14(1) 2023年8月22日査読有り
Protocol for analyzing intact mRNA poly(A) tail length using nanopore direct RNA sequencing.

Koichi Ogami, Yuka Oishi, Shin-Ichi Hoshino

STAR protocols 4(2) 102340-102340 2023年5月26日査読有り筆頭著者
Systematic characterization of seed overlap microRNA cotargeting associated with lupus pathogenesis

Kitai H, Kato N, Ogami K, KomatsuS, Watanabe Y, Yoshino S, Koshi E, Tsubota S, Funahashi Y, Maeda T …

BMC Biology 20(1) 248-248 2022年11月11日査読有り
mTOR- and LARP1-dependent regulation of TOP mRNA poly(A) tail and ribosome loading

Ogami K, Oishi Y, Sakamoto K, Okumura M, Yamagishi R, Inoue T, Hibino M, Nogimori T, Yamaguchi N, Furutachi K …

Cell Reports 41(4) 111548-111548 2022年10月査読有り筆頭著者
Nuclear RNA Exosome and Pervasive Transcription: Dual Sculptors of Genome Function

Koichi Ogami, Hiroshi I. Suzuki

International Journal of Molecular Sciences 22(24) 2021年12月13日査読有り筆頭著者
Widespread transcript shortening through alternative polyadenylation in secretory cell differentiation

Larry C. Cheng, Dinghai Zheng, Erdene Baljinnyam, Fangzheng Sun, Koichi Ogami, Percy Luk Yeung, Mainul Hoque, Chi-Wei Lu, James L. Manley, Bin Tian

Nature Communications 11(1) 2020年12月査読有り
Efficient differentiation and purification of human induced pluripotent stem cell-derived endothelial progenitor cells and expansion with the use of inhibitors of ROCK, TGF-β, and GSK3β

Hiromasa Aoki, Misaki Yamashita, Tadahiro Hashita, Koichi Ogami, Shinichi Hoshino, Takahiro Iwao, Tamihide Matsunaga

Heliyon 6(3) e03493-e03493 2020年3月査読有り
ABCE1 Acts as a Positive Regulator of Exogenous RNA Decay.

Takuto Nogimori*, Koichi Ogami*, Yuka Oishi, Ryoya Goda, Nao Hosoda, Yoshiaki Kitamura, Yukio Kitade, Shin-Ichi Hoshino

Viruses 12(2) 2020年2月4日査読有り筆頭著者
The RNA-binding protein QKI-7 recruits the poly(A) polymerase GLD-2 for 3' adenylation and selective stabilization of microRNA-122.

Hiroaki Hojo, Yuka Yashiro, Yuta Noda, Koichi Ogami, Ryota Yamagishi, Shunpei Okada, Shin-Ichi Hoshino, Tsutomu Suzuki

The Journal of biological chemistry 295(2) 390-402 2020年1月10日査読有り
Large expert-curated database for benchmarking document similarity detection in biomedical literature search

Database 2019年10月29日査読有り
A novel method for stabilizing microRNA mimics

Takuto Nogimori, Kazuya Furutachi, Koichi Ogami, Nao Hosoda, Shin-ichi Hoshino

Biochemical and Biophysical Research Communications 511(2) 422-426 2019年4月査読有り
NRDE-2, the human homolog of fission yeast Nrl1, prevents DNA damage accumulation in human cells

Richard P*, Ogami K*, Chen Y, Feng S, Moresco JJ, Yates JR, Manley JL

RNA Biology 15(7) 868-876 2018年6月査読有り筆頭著者
MicroRNP-mediated translational activation of nonadenylated mRNAs in a mammalian cell-free system

Motoaki Wakiyama, Koichi Ogami, Ryo Iwaoka, Kazuma Aoki, Shin-Ichi Hoshino

Genes to Cells 23(5) 332-344 2018年5月1日査読有り
RNA surveillance by the nuclear RNA exosome: Mechanisms and significance

Koichi Ogami, Yaqiong Chen, James L. Manley

Non-coding RNA 4(1) 8 2018年3月11日査読有り筆頭著者責任著者
Mtr4/ZFC3H1 protects polysomes through nuclear RNA surveillance

Koichi Ogami, James L. Manley

Cell Cycle 16(21) 1999-2000 2017年11月2日査読有り筆頭著者責任著者
An Mtr4/ZFC3H1 complex facilitates turnover of unstable nuclear RNAs to prevent their cytoplasmic transport and global translational repression

Koichi Ogami, Patricia Richard, Yaqiong Chen, Mainul Hoque, Wencheng Li, James J. Moresco, John R. Yates, Bin Tian, James L. Manley

GENES & DEVELOPMENT 31(12) 1257-1271 2017年6月査読有り筆頭著者
RBBP6 isoforms regulate the human polyadenylation machinery and modulate expression of mRNAs with AU-rich 3 ' UTRs

Dafne Campigli Di Giammartino, Wencheng Li, Koichi Ogami, Jossie J. Yashinskie, Mainul Hoque, Bin Tian, James L. Manley

GENES & DEVELOPMENT 28(20) 2248-2260 2014年10月査読有り
Antiproliferative protein Tob directly regulates c-myc proto-oncogene expression through cytoplasmic polyadenylation element-binding protein CPEB

K. Ogami, N. Hosoda, Y. Funakoshi, S. Hoshino

ONCOGENE 33(1) 55-64 2014年1月査読有り筆頭著者

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MISC

急性骨髄性白血病における早期転写終結型mRNAの解析(Detection of Prematurely Terminated Pre-mRNA in Acute Myeloid Leukemia)

尾上耕一, 越智陽太郎, 南谷泰仁, 小川誠司, 鈴木洋, 鈴木洋

日本癌学会総会記事 83回 J-1016 2024年9月
相分離集合体から迫る新しいがん研究生体分子凝集体の動態理解と染色体外DNAの治療標的化(Biomolecular condensates as a new hallmark of cancer Understanding Dynamics of Biomolecular Condensates and Targeting extrachromosomal DNA(ecDNA) in Cancer)

鈴木洋, 尾上耕一, 芳野聖子

日本癌学会総会記事 83回 S19-6 2024年9月
Making TOP mRNA a Top Priority: Unraveling the Regulation of Protein Synthesis Machinery through Poly(A) Tail Dynamics

Ogami Koichi, Hoshino Shin-ichi

生物物理 63(Suppl.1-2) S221-S221 2023年10月招待有り
がん抑制遺伝子産物BTG3はCaf1によるmRNAポリA鎖分解の抑制を介して遺伝子発現を正に制御する

中北侑希, 稲垣佑都, 細田直, 尾上耕一, 山岸良太, 星野真一

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 95回 3T14a-06 2022年11月
miRNA生合成経路をみる

尾上耕一, 鈴木洋

実験医学別冊リアルタイム・デジタルPCR実験スタンダード 2022年1月筆頭著者
B-cell translocation gene 2(BTG2)によるポリA分解促進機構の解明

石井裕一郎, 横川真梨子, 城えりか, 高嶋大翔, 沢崎綾一, 寒河江彪流, 尾上耕一, 星野真一, 大澤匡範

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 94回 [P-175] 2021年11月
がん抑制遺伝子産物TobによるmRNA分解を介したがん抑制と学習記憶の調節

尾上耕一, 星野真一

ファルマシア特集 RNA研究が切り開く薬学フロンティア 51(1) 27-31 2015年1月筆頭著者
非正準ポリ(A)ポリメラーゼPAPD5、PAPD7の機能解析

趙理海, 尾上耕一, 星野真一

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 85回 2P-632 2012年12月
細胞質ポリA鎖伸長因子CPEBによるc-myc mRNAの安定性制御

三瓶祥子, 尾上耕一, 星野真一

日本生化学会大会プログラム・講演要旨集 85回 2P-634 2012年12月
癌抑制遺伝子産物Tobによるc-myc遺伝子の発現調節機構

尾上耕一, 細田直, 船越祐司, 星野真一

日本薬学会年会要旨集 132年会(3) 89-89 2012年3月
癌抑制遺伝子産物Tobは癌原遺伝子c-mycの発現を負に制御する

尾上耕一, 細田直, 船越祐司, 星野真一

日本薬学会年会要旨集 131年会(3) 103-103 2011年3月

講演・口頭発表等

Making TOP mRNA a Top Priority: Unraveling the Regulation of Protein Synthesis Machinery through Poly(A) Tail Dynamics

Koichi Ogami, Shin-ichi Hoshino

第61回生物物理学会年会シンポジウム「Uncovering the mechanisms of cell response by TOR complexes：トア複合体による細胞応答の仕組みを理解する」 2023年11月招待有り
Poly(A) tail length positively correlates with the extent of mRNA ribosome loading

Koichi Ogami, Yuka Oishi, Natsumi Yamaguchi, Shin-ichi Hoshino

Cold Spring Harbor Laboratory meeting: Translational Control (Virtual) 2020年9月
Nulcear surveillance of polyadenylated lncRNAs by Mtr4/ZFC3H1

Ogami K

The 24th Tokyo RNA Club 2017年12月11日招待有り
An Mtr4/ ZFC3H1 complex facilitates turnover of unstable nuclear RNAs to prevent their cytoplasmic transport and global translational repression

Ogami K, Chen Y, Richard P, Hoque M, Li W, Moresco JJ, Yates JR, Tian B, Manley JL

Cold Spring Harbor Laboratory meeting: Eukaryotic mRNA Processing 2017年8月
The RNA helicase Mtr4 regulates accumulation of multiple types of lncRNA in human cells.

Ogami K, Hoque M, Li W, Tian B, Manley JL

Cold Spring Harbor Laboratory meeting: Eukaryotic mRNA Processing 2015年8月

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

造血器腫瘍における多階層オミクス解析に基づくRNA修飾を標的としたがん治療プラットフォームの開発

日本医療研究開発機構(AMED) 革新的がん医療実用化研究事業 2023年4月 - 2026年3月

鈴木洋, 越智陽太郎, 尾上耕一
がんで蓄積する未成熟転写終結RNAの多層的ライフサイクルの全容解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2025年3月

尾上耕一
がん細胞における高頻度なイントロン内ポリアデニル化の発生要因の解明

武田科学振興財団 2021年度医学系研究助成（がん領域・基礎） 2021年11月 - 2024年5月

尾上耕一
mRNAポリA鎖の長さと翻訳活性の相関性解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2020年4月 - 2022年3月

尾上耕一
RNAポリメラーゼIIのコンビナトリアルなCTDリン酸化状態の識別技術の基盤構築

日比野基金医学系研究助成 2021年3月 - 2022年3月

尾上耕一
細胞質ポリ(A)鎖伸長因子CPEBによる多様な遺伝子発現調節の分子基盤

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2018年4月 - 2020年3月

尾上耕一

学術貢献活動

Peer Review

査読

NAR Genomics and Bioinformatics 2022年

尾上耕一

基本情報

研究分野

経歴

受賞

論文

MISC

講演・口頭発表等

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

学術貢献活動

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