矢原耕史 (Koji Yahara) - マイポータル

基本情報

所属: 国立感染症研究所薬剤耐性研究センター室長

研究者番号: 70542356
J-GLOBAL ID: 201801016771288741
researchmap会員ID: B000298237

https://sites.google.com/site/kojiyahara/
https://twitter.com/KojiYahara

研究分野

論文

121

Emergence of the mobile RND-type efflux pump gene cluster tmexCD1-toprJ1 in Klebsiella pneumoniae clinical isolates in Japan

Aki Hirabayashi, Hirokazu Yano, Koji Yahara, Sadao Aoki, Yo Sugawara, Toshiki Kajihara, Naomi Shibayama, Shizuo Kayama, Masato Suzuki, Motoyuki Sugai

Journal of Antimicrobial Chemotherapy 2024年11月6日
Lipid Fingerprinting by MALDI Biotyper Sirius Instrument Fails to Differentiate the Three Subspecies of theMycobacterium abscessusComplex

Mitsunori Yoshida, Hanako Fukano, Koji Yahara, Satoshi Nakano, Takeshi Komine, Masato Suzuki, Azumi Fujinaga, Kohei Dohke, Yoshihiko Hoshino

2024年9月25日
Effects of coronavirus disease 2019 on the spread of respiratory-transmitted human-to-human bacteria.

Toshiki Kajihara, Koji Yahara, Taro Kamigaki, Aki Hirabayashi, Yumiko Hosaka, Norikazu Kitamura, Reiko Shimbashi, Motoi Suzuki, Motoyuki Sugai, Keigo Shibayama

The Journal of infection 89(2) 106201-106201 2024年8月
Clinical outcomes of flomoxef versus cefmetazole in hospitalized patients with urinary tract infections: Combined retrospective analyses of two real-world databases and in vitro data

Takahiro Niimura, Mitsuhiro Goda, Satoshi Nakano, Toshiki Kajihara, Koji Yahara, Aki Hirabayashi, Koji Miyata, Marie Ikai, Motoko Shinohara, Yusuke Minato …

medRxiv 2024年7月17日
Comparison of disease and economic burden between MRSA infection and MRSA colonization in a university hospital: a retrospective data integration study.

Aki Hirabayashi, Koji Yahara, Keisuke Oka, Toshiki Kajihara, Teruko Ohkura, Yumiko Hosaka, Keigo Shibayama, Motoyuki Sugai, Tetsuya Yagi

Antimicrobial resistance and infection control 13(1) 27-27 2024年2月29日
Exploring the effects of antimicrobial treatment on the gut and oral microbiomes and resistomes from elderly long-term care facility residents via shotgun DNA sequencing

Norikazu Kitamura, Toshiki Kajihara, Camila Gazolla Volpiano, Myo Naung, Guillaume Méric, Aki Hirabayashi, Hirokazu Yano, Masaya Yamamoto, Fumiaki Yoshida, Tsunesaburo Kobayashi …

Microbial Genomics 10(2) 2024年2月20日
Antimicrobial use and combination of resistance phenotypes in bacteraemic Escherichia coli in primary care: a study based on Japanese national data in 2018.

Yumiko Hosaka, Yuichi Muraki, Toshiki Kajihara, Sayoko Kawakami, Aki Hirabayashi, Masahiro Shimojima, Hiroki Ohge, Motoyuki Sugai, Koji Yahara

The Journal of antimicrobial chemotherapy 79(2) 312-319 2024年2月1日
Shotgun metagenomic analysis of saliva microbiome suggests Mogibacterium as a factor associated with chronic bacterial osteomyelitis.

Hiroko Yahara, Souichi Yanamoto, Miho Takahashi, Yuji Hamada, Takuya Asaka, Yoshimasa Kitagawa, Kuniyasu Moridera, Kazuma Noguchi, Yutaka Maruoka, Koji Yahara

PloS one 19(5) e0302569 2024年
Development of selective isolation media for detecting the genera Actinomyces and Schaalia from oral specimens containing indigenous bacteria.

Sadao Aoki, Hiroko Yahara, Ryoma Nakao, Osamu Tsuzukibashi, Koji Yahara

Access microbiology 6(5) 2024年
Nationwide genome surveillance of carbapenem-resistantPseudomonas aeruginosain Japan

Hirokazu Yano, Wataru Hayashi, Sayoko Kawakami, Sadao Aoki, Eiko Anzai, Norikazu Kitamura, Aki Hirabayashi, Toshiki Kajihara, Shizuo Kayama, Yo Sugawara …

2023年12月19日
National genomic surveillance integrating standardized quantitative susceptibility testing clarifies antimicrobial resistance in Enterobacterales

Shizuo Kayama, Koji Yahara, Yo Sugawara, Sayoko Kawakami, Kohei Kondo, Hui Zuo, Shoko Kutsuno, Norikazu Kitamura, Aki Hirabayashi, Toshiki Kajihara …

Nature Communications 14(1) 2023年12月5日
Author Correction: Repeated out-of-Africa expansions of Helicobacter pylori driven by replacement of deleterious mutations (Nature Communications, (2022), 13, 1, (6842), 10.1038/s41467-022-34475-3)

Harry A. Thorpe, Elise Tourrette, Koji Yahara, Filipa F. Vale, Siqi Liu, Mónica Oleastro, Teresa Alarcon, Tsachi Tsadok Perets, Saeid Latifi-Navid, Yoshio Yamaoka …

Nature Communications 14(1) 2023年12月
Corrigendum: 'Genome-wide association study of gastric cancer- and duodenal ulcer-derived Helicobacter pylori strains reveals discriminatory genetic variations and novel oncoprotein candidates'

Vo Phuoc Tuan, Koji Yahara, Ho Dang Quy Dung, Tran Thanh Binh, Pham Huu Tung, Tran Dinh Tri, Ngo Phuong Minh Thuan, Vu Van Khien, Tran Thi Huyen Trang, Bui Hoang Phuc …

Microbial genomics 9(7) 2023年7月1日
Corrigendum: 'Genome-wide association study of gastric cancer- and duodenal ulcer-derived Helicobacter pylori strains reveals discriminatory genetic variations and novel oncoprotein candidates'.

Vo Phuoc Tuan, Koji Yahara, Ho Dang Quy Dung, Tran Thanh Binh, Pham Huu Tung, Tran Dinh Tri, Ngo Phuong Minh Thuan, Vu Van Khien, Tran Thi Huyen Trang, Bui Hoang Phuc …

Microbial genomics 9(7) 2023年7月
Distribution, Trends, and Antimicrobial Susceptibility of Bacteroides, Clostridium, Fusobacterium, and Prevotella Species Causing Bacteremia in Japan During 2011-2020: A Retrospective Observational Study Based on National Surveillance Data.

Toshiki Kajihara, Koji Yahara, Norikazu Kitamura, Aki Hirabayashi, Yumiko Hosaka, Motoyuki Sugai

Open forum infectious diseases 10(7) ofad334 2023年7月
Author Correction: Repeated out-of-Africa expansions of Helicobacter pylori driven by replacement of deleterious mutations.

Harry A Thorpe, Elise Tourrette, Koji Yahara, Filipa F Vale, Siqi Liu, Mónica Oleastro, Teresa Alarcon, Tsachi-Tsadok Perets, Saeid Latifi-Navid, Yoshio Yamaoka …

Nature communications 14(1) 1539-1539 2023年3月20日
院内における多剤耐性菌の感染制御-サーベイランス確立に向けて- JANISでの取り組み

川上小夜子, 矢原耕史, 梶原俊毅, 平林亜希, 保阪由美子, 菅井基行

日本感染症学会総会・学術講演会・日本化学療法学会学術集会合同学会プログラム・抄録集 97回・71回ジョイントシンポジウム1-ジョイントシンポジウム1 2023年3月
Association between the proportion of laparoscopic approaches for digestive surgeries and the incidence of consequent surgical site infections, 2009–2019: A retrospective observational study based on national surveillance data in Japan

Toshiki Kajihara, Koji Yahara, Aki Hirabayashi, Yumiko Hosaka, Norikazu Kitamura, Motoyuki Sugai, Keigo Shibayama

PLOS ONE 18(2) e0281838-e0281838 2023年2月17日
黄色ブドウ球菌における多剤耐性表現型のサーベイランスとWGS所見との相関性(Surveillance of multidrug resistance phenotypes in S. aureus and correlation with WGS findings)

矢原耕史, 保阪由美子, Clarck Adam, 北川浩樹, 久恒順三, 菅井基行, 柴山恵吾, Stelling John

日本細菌学雑誌 78(1) 105-105 2023年2月
Genomic Epidemiological Analysis of Antimicrobial-Resistant Bacteria with Nanopore Sequencing.

Masato Suzuki, Yusuke Hashimoto, Aki Hirabayashi, Koji Yahara, Mitsunori Yoshida, Hanako Fukano, Yoshihiko Hoshino, Keigo Shibayama, Haruyoshi Tomita

Methods in molecular biology (Clifton, N.J.) 2632 227-246 2023年

もっとみる

MISC

日本の薬剤耐性に関するナショナルサーベイランス JANIS: 厚生労働省院内感染対策サーベイランス(Japan Nosocomial Infection Surveillance)

川上小夜子, 矢原耕史, 柴山恵吾, 菅井基行

日本臨床微生物学会雑誌 30(Suppl.1) 124-124 2019年12月
細菌分泌系と病原性院内感染を引き起こす病原菌におけるVI型分泌系(Type VI secretion systems in bacterial pathogens causing nosocomial infections)

鈴木仁人, 吉田真歩, 矢原耕史, 柴山恵吾

日本細菌学雑誌 73(1) 8-8 2018年2月
細菌の遺伝多型と表現型のゲノムワイド関連解析最近の2つの研究から(Genome-wide association studied in bacteria: from two recent publications)

矢原耕史, Meric Guillaume, Bentley Stephen, Parkhill Julian, Didelot Xavier, Kelly David, Sheppard Samuel, 鈴木仁人, 柴山恵吾

日本細菌学雑誌 73(1) 92-92 2018年2月
細菌検査データとDPCデータの統合によるMRSA菌血症のリスク分析

宮本直樹, 矢原耕史, 堀田吏乃, 矢野知美, 森井大一, 筒井敦子, 八板謙一郎, 柴山恵吾, 渡邊浩

日本環境感染学会総会プログラム・抄録集 33回 177-177 2018年2月
【どこでも誰でもより長くナノポアシークエンサーが研究の常識を変える!】ナノポアシークエンサーによる薬剤耐性菌ゲノムの解析

鈴木仁人, 矢原耕史, 平林亜希, 柴山恵吾

実験医学 36(1) 21-26 2018年1月
アシネトバクター属菌に拡散しているTMB型メタロ-β-ラクタマーゼ遺伝子の解析

鈴木仁人, 松井真理, 鈴木里和, 瀬川孝耶, 矢原耕史, 鹿山鎭男, 菅井基行, 柴山恵吾

緑膿菌感染症研究会講演記録 51回 100-105 2017年12月
MAIDI-TOF MSデータを用いたバンコマイシン低感受性MRSA株の自動判別

朝倉弘太, 片山由紀, 松井秀仁, 高田徹, 花木秀明, 柴山恵吾, 矢原耕史, 高久智生, 落合友則, 小松則夫 …

日本臨床微生物学雑誌 28(Suppl.1) 441-441 2017年12月
MRSA感染症再燃患者血液培養液から初めて分離されたslow-VISA(Vancomycin-Intermediate Staphylococcus aureus)の解析

畦地拓哉, 片山由紀, 宮崎元康, 矢原耕史, 笹野央, 朝倉弘太, 岡村圭祐, 浦田秀則, 小宮ゆきえ, 鈴木仁人 …

日本化学療法学会雑誌 65(Suppl.A) 384-384 2017年3月
日本国内における抗菌薬販売量の年次推移

筒井敦子, 矢原耕史, 鈴木里和, 柴山恵吾

感染症学雑誌 91(臨増) 284-284 2017年3月
骨・関節のMRSA再燃感染症から検出されたslow-VISA

笹野央, 内山勝文, 片山由紀, 畦地拓哉, 朝倉弘太, 鈴木仁人, 矢原耕史, 柴山恵吾, 松井秀仁, 花木秀明

感染症学雑誌 91(臨増) 383-383 2017年3月
MRSA感染症再燃患者血液培養液から初めて分離されたslow-VISA(Vancomycin-Intermediate Staphylococcus aureus)の解析

畦地拓哉, 片山由紀, 宮崎元康, 矢原耕史, 笹野央, 朝倉弘太, 高田徹, 鈴木仁人, 柴山恵吾, 岡村圭祐 …

日本化学療法学会雑誌 65(Suppl.A) 384-384 2017年3月
ピロリ菌におけるゲノムとエピゲノムの独立な進化

古田芳一, 小島健司, 矢原耕史, 福世真樹, 志波優, 西海信, 吉田優, 東健, 吉川博文, 小林一三

日本細菌学雑誌 72(1) 125-125 2017年2月
厚生労働省院内感染対策サーベイランス(JANIS)事業の検査部門・全入院患者部門における病院特性別集計の検討

筒井敦子, 鈴木里和, 矢原耕史, 柴山恵吾

日本環境感染学会総会プログラム・抄録集 32回 352-352 2017年2月
相同組換えから見た種

矢原耕史, 河合幹彦, 古田芳一, 高橋規子, 半田直史, 鶴剛史, 大島健志朗, 吉田優, 東健, 服部正平 …

日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web) 14th 2012年
日本のピロリ菌 : 発癌細菌の素顔がいま明らかにピロリ菌の種内多ゲノム比較

内山郁夫, 河合幹彦, 矢原耕史

細胞工学 31(2) 222-227 2012年
日本分離ピロリ菌4株の全ゲノム解読と種内比較解析についてのプログレス・レポート

小林一三, 河合幹彦, 矢原耕史, 古田芳一, 鶴剛史, 高橋規子, 半田直史, 吉田優, 大嶋健志朗, 内山郁夫 …

日本ヘリコバクター学会誌 11(2) 31-38 2010年1月
超利己的遺伝子の自律的進化:ホーミング・エンドヌクレアーゼ遺伝子は閉じた集団でどう生き延びるか

矢原耕史, 小林一三

細胞工学 29(2) 190-195 2010年

共同研究・競争的資金等の研究課題

４つのビッグデータを統合した薬剤耐性菌の疾病負荷に関する研究

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2022年4月 - 2027年3月

矢原耕史
薬剤関連顎骨壊死に関わる微生物の疾患関連遺伝子と新たなサブタイプの解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 2021年4月 - 2024年3月

矢原寛子, 矢原耕史
ピロリ菌の病原性と薬剤耐性を考慮したテーラーメード治療の確立に関する国際共同研究

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2018年10月 - 2023年3月

山岡吉生, 松本昂, 矢原耕史
多剤耐性淋菌のゲノム解読に基づくサーベイランスと進化・伝播の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究 2018年4月 - 2023年3月

矢原耕史
新規2次元胃上皮細胞培養系を用いた疾患特異的ピロリ菌病原因子の追及

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2019年4月 - 2022年3月

山岡吉生, 塚本善之, 濱田文彦, 矢原耕史
拡張viromeデータと長鎖シーケンサーを用いたファージと宿主のビッグデータ解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2019年4月 - 2021年3月

矢原耕史
発がんに影響するピロリ菌の遺伝子とエピゲノム状態のPacBio解読による探索

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2017年4月 - 2020年3月

小林一三, 神谷茂, 矢原耕史
細菌感染ウィルスのゲノム組み換えの宿主依存性と疾患特異性のビッグデータ解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 2017年4月 - 2019年3月

矢原耕史
1塩基単位の組換え率推定に基づく病原細菌13種のゲノムの組換えのホット領域の解析

日本学術振興会科学研究費助成事業若手研究(B) 2015年4月 - 2019年3月

矢原耕史, 小林一三

矢原耕史

基本情報

研究分野

論文

MISC

共同研究・競争的資金等の研究課題

メニュー

共著者の一覧