木村幸太郎 (Kimura Kotaro) - マイポータル

基本情報

所属: 名古屋市立大学大学院理学研究科生命情報系教授
: 大阪大学大学院理学研究科招へい教授

学位: 博士（農学）(東京大学)

連絡先: kokimuransc.nagoya-cu.ac.jp
研究者番号: 20370116
J-GLOBAL ID: 200901060539811011
researchmap会員ID: 5000063094

外部リンク: https://www.kokimura-lab.org

研究分野

ライフサイエンス / 神経科学一般 /

経歴

2018年4月 - 現在

大阪大学, 大学院理学研究科, 招へい教授
2018年4月 - 現在

名古屋市立大学, 大学院理学研究科生命情報系, 教授
2022年4月 - 2022年9月

東京大学, 教養学部・大学院総合文化研究科, 非常勤講師
2018年5月 - 2022年3月

理化学研究所, 革新知能統合研究センターデータ駆動型生物医科学チーム, 客員研究員
2021年4月 - 2021年9月

東京大学, 教養学部・大学院総合文化研究科, 非常勤講師
2017年4月 - 2018年3月

理化学研究所, 革新知能統合研究センターデータ駆動型生物医科学チーム, 客員研究員
2013年4月 - 2018年3月

大阪大学, 大学院理学研究科, 准教授
2009年1月 - 2013年3月

大阪大学, 大学院理学研究科, 特任准教授（テニュアトラック）
2006年10月 - 2010年3月

科学技術振興機構, さきがけ「生命システム」, 研究員（兼務）
2004年4月 - 2008年12月

総合研究大学院大学, 遺伝学専攻, 助教（兼任）
2003年3月 - 2008年12月

国立遺伝学研究所, 構造遺伝学研究センター, 助教
1998年5月 - 2003年2月

科学技術振興事業団, 戦略的基礎研究 (CREST), 博士研究員
1997年1月 - 1998年4月

日本学術振興会, 海外特別研究員
1996年2月 - 1998年4月

ハーバード大学医学部遺伝学科, マサチューセッツ総合病院分子生物学科, 博士研究員
1995年4月 - 1996年12月

日本学術振興会, （東京大学大学院農学生命科学研究科応用生命化学専攻）, 特別研究員

学歴

1992年4月 - 1995年3月

東京大学, 大学院農学生命科学研究科博士課程応用生命化学専攻
1990年4月 - 1992年3月

東京大学, 大学院農学系研究科修士課程農芸化学専攻
1986年4月 - 1990年3月

東京大学, 農学部
1980年4月 - 1986年3月

筑波大学附属駒場中高等学校

主要な論文

Electric shock causes a fleeing-like persistent behavioral response in the nematode Caenorhabditis elegans

Ling Fei Tee, Jared J Young, Ryoga Suzuki, Keisuke Maruyama, Sota Kimura, Yuto Endo, Koutarou D Kimura

GENETICS 2023年8月18日
Seg2Link: an efficient and versatile solution for semi-automatic cell segmentation in 3D image stacks.

Chentao Wen, Mami Matsumoto, Masato Sawada, Kazunobu Sawamoto, Koutarou D Kimura

Scientific reports 13(1) 7109-7109 2023年5月22日
Optical Control of Cell Signaling with Red/Far-Red Light-Responsive Optogenetic Tools in Caenorhabditis elegans.

Shigekazu Oda, Emi Sato-Ebine, Akinobu Nakamura, Koutarou D Kimura, Kazuhiro Aoki

ACS synthetic biology 12(3) 700-708 2023年3月17日
Neural mechanism of experience-dependent sensory gain control in C. elegans.

Yosuke Ikejiri, Yuki Tanimoto, Kosuke Fujita, Fumie Hiramatsu, Shuhei J Yamazaki, Yuto Endo, Yasushi Iwatani, Koichi Fujimoto, Koutarou D Kimura

Neuroscience research 191 2023年1月19日
Cross-species behavior analysis with attention-based domain-adversarial deep neural networks

Takuya Maekawa, Daiki Higashide, Takahiro Hara, Kentarou Matsumura, Kaoru Ide, Takahisa Miyatake, Koutarou D. Kimura, Susumu Takahashi

Nature Communications 12(1) 2021年12月査読有り
3DeeCellTracker, a deep learning-based pipeline for segmenting and tracking cells in 3D time lapse images

Chentao Wen, Takuya Miura, Venkatakaushik Voleti, Kazushi Yamaguchi, Motosuke Tsutsumi, Kei Yamamoto, Kohei Otomo, Yukako Fujie, Takayuki Teramoto, Takeshi Ishihara, Kazuhiro Aoki, Tomomi Nemoto, Elizabeth MC Hillman, Koutarou D Kimura

eLife 10 2021年3月30日査読有り最終著者
Deep learning-assisted comparative analysis of animal trajectories with DeepHL.

Takuya Maekawa, Kazuya Ohara, Yizhe Zhang, Matasaburo Fukutomi, Sakiko Matsumoto, Kentarou Matsumura, Hisashi Shidara, Shuhei J Yamazaki, Ryusuke Fujisawa, Kaoru Ide, Naohisa Nagaya, Koji Yamazaki, Shinsuke Koike, Takahisa Miyatake, Koutarou D Kimura, Hiroto Ogawa, Susumu Takahashi, Ken Yoda

Nature communications 11(1) 5316-5316 2020年10月20日査読有り
How do we know how the brain works?—Analyzing whole brain activities with classic mathematical and machine learning methods

Chentao Wen, Koutarou D. Kimura

Japanese Journal of Applied Physics 2020年3月1日査読有り
Real-time volumetric microscopy of in vivo dynamics and large-scale samples with SCAPE 2.0.

Voleti V, Patel KB, Li W, Perez Campos C, Bharadwaj S, Yu H, Ford C, Casper MJ, Yan RW, Liang W, Wen C, Kimura KD, Targoff KL, Hillman EMC

Nature methods 16(10) 1054-1062 2019年10月査読有り
Neuronal, mathematical, and molecular bases of perceptual decision-making in C-elegans

Tanimoto Yuki, Kimura Koutarou D

NEUROSCIENCE RESEARCH 140 3-13 2019年3月査読有り
Efficient learning algorithm for sparse subsequence pattern-based classification and applications to comparative animal trajectory data analysis

Takuto Sakuma, Kazuya Nishi, Kaoru Kishimoto, Kazuya Nakagawa, Masayuki Karasuyama, Yuta Umezu, Shinsuke Kajioka, Shuhei J. Yamazaki, Koutarou D. Kimura, Sakiko Matsumoto, Ken Yoda, Matasaburo Fukutomi, Hisashi Shidara, Hiroto Ogawa, Ichiro Takeuchi

ADVANCED ROBOTICS 33(3-4) 134-152 2019年査読有り
STEFTR: A Hybrid Versatile Method for State Estimation and Feature Extraction From the Trajectory of Animal Behavior.

Shuhei J Yamazaki, Kazuya Ohara, Kentaro Ito, Nobuo Kokubun, Takuma Kitanishi, Daisuke Takaichi, Yasufumi Yamada, Yosuke Ikejiri, Fumie Hiramatsu, Kosuke Fujita, Yuki Tanimoto, Akiko Yamazoe-Umemoto, Koichi Hashimoto, Katsufumi Sato, Ken Yoda, Akinori Takahashi, Yuki Ishikawa, Azusa Kamikouchi, Shizuko Hiryu, Takuya Maekawa, Koutarou D Kimura

Frontiers in neuroscience 13 626-626 2019年査読有り
Neural Mechanisms of Animal Navigation

Koutarou D. Kimura, Masaaki Sato, Midori Sakura

Distributed, Ambient and Pervasive Interactions: Technologies and Contexts 65 2018年6月査読有り
Measuring Spatiotemporal Dynamics of Odor Gradient for Small Animals by Gas Chromatography

Koutarou D. Kimura

BIO-PROTOCOL 2018年4月5日査読有り
Calcium dynamics regulating the timing of decision-making in C. elegans

Yuki Tanimoto, Akiko Yamazoe-Umemoto, Kosuke Fujita, Yuya Kawazoe, Yosuke Miyanishi, Shuhei J. Yamazaki, Xianfeng Fei, Karl Emanuel Busch, Keiko Gengyo-Ando, Junichi Nakai, Yuichi Lino, Yuishi Iwasaki, Koichi Hashimoto, Koutarou D. Kimura

ELIFE 6 e21629 2017年5月査読有り
From connectome to function: Using optogenetics to shed light on the Caenorhabditis elegans nervous system

Koutarou D. Kimura, Karl Emanuel Busch

Optogenetics: From Neuronal Function to Mapping and Disease Biology 37-54 2017年1月1日査読有り
In actio optophysiological analyses reveal functional diversification of dopaminergic neurons in the nematode C-elegans

Yuki Tanimoto, Ying Grace Zheng, Xianfeng Fei, Yukako Fujie, Koichi Hashimoto, Koutarou D. Kimura

SCIENTIFIC REPORTS 6 2016年5月査読有り
Modulation of different behavioral components by neuropeptide and dopamine signalings in non-associative odor learning of Caenorhabditis elegans

Akiko Yamazoe-Umemoto, Kosuke Fujita, Yuichi Lino, Yuishi Iwasaki, Koutarou D. Kimura

NEUROSCIENCE RESEARCH 99 22-33 2015年10月査読有り
A simple optogenetic system for behavioral analysis of freely moving small animals

Yuya Kawazoe, Hiromu Yawo, Koutarou D. Kimura

NEUROSCIENCE RESEARCH 75(1) 65-68 2013年1月査読有り
A novel and conserved protein AHO-3 is required for thermotactic plasticity associated with feeding states in Caenorhabditis elegans

Nana Nishio, Akiko Mohri-Shiomi, Yukuo Nishida, Naoya Hiramatsu, Eiji Kodama-Namba, Kotaro D. Kimura, Atsushi Kuhara, Ikue Mori

GENES TO CELLS 17(5) 365-386 2012年5月査読有り
Ultradian rhythm in the intestine of Caenorhabditis elegans is controlled by the C-terminal region of the FLR-1 ion channel and the hydrophobic domain of the FLR-4 protein kinase

Yuri Kobayashi, Koutarou D. Kimura, Isao Katsura

GENES TO CELLS 16(5) 565-575 2011年5月査読有り
The C. Elegans DAF-2 insulin-like receptor is abundantly expressed in the nervous system and regulated by nutritional status

K. D. Kimura, D. L. Riddle, G. Ruvkun

Cold Spring Harbor Symposia on Quantitative Biology 76 113-120 2011年査読有り
Enhancement of Odor Avoidance Regulated by Dopamine Signaling in Caenorhabditis elegans

Koutarou D. Kimura, Kosuke Fujita, Isao Katsura

JOURNAL OF NEUROSCIENCE 30(48) 16365-16375 2010年12月査読有り
FLR-2, the glycoprotein hormone alpha subunit, is involved in the neural control of intestinal functions in Caenorhabditis elegans

Akane Oishi, Keiko Gengyo-Ando, Shohei Mitani, Akiko Mohri-Shiomi, Koutarou D. Kimura, Takeshi Ishihara, Isao Katsura

GENES TO CELLS 14(10) 1141-1154 2009年10月査読有り
Temperature sensing by an olfactory neuron in a circuit controlling behavior of C-elegans

Atsushi Kuhara, Masatoshi Okumura, Tsubasa Kimata, Yoshinori Tanizawa, Ryo Takano, Koutarou D. Kimura, Hitoshi Inada, Kunihiro Matsumoto, Ikue Mori

SCIENCE 320(5877) 803-807 2008年5月査読有り
Insulin-like signaling and the neural circuit for integrative behavior in C-elegans

Eiji Kodama, Atsushi Kuhara, Akiko Mohri-Shiomi, Koutarou D. Kimura, Masatoshi Okumura, Masahiro Tomioka, Yuichi Iino, Ikue Mori

GENES & DEVELOPMENT 20(21) 2955-2960 2006年11月査読有り
Diverse regulation of sensory signaling by C-elegans nPKC-epsilon/eta TTX-4

Y Okochi, KD Kimura, A Ohta, Mori, I

EMBO JOURNAL 24(12) 2127-2137 2005年6月査読有り
Genetic control of temperature preference in the nematode Caenorhabditis elegans

A Mohri, E Kodama, KD Kimura, M Koike, T Mizuno, Mori, I

GENETICS 169(3) 1437-1450 2005年3月査読有り
The C. elegans thermosensory neuron AFD responds to warming

KD Kimura, A Miyawaki, K Matsumoto, Mori, I

CURRENT BIOLOGY 14(14) 1291-1295 2004年7月査読有り
Slow Ca2+ dynamics in pharyngeal muscles in Caenorhabditis elegans during fast pumping

S Shimozono, T Fukano, KD Kimura, Mori, I, Y Kirino, A Miyawaki

EMBO REPORTS 5(5) 521-526 2004年5月査読有り
Regulation of C-elegans life-span by insulinlike signaling in the nervous system

CA Wolkow, KD Kimura, MS Lee, G Ruvkun

SCIENCE 290(5489) 147-150 2000年10月査読有り
Microinjection of activated phosphatidylinositol-3 kinase induces process outgrowth in rat PC12 cells through the Rac-JNK signal transduction pathway

Y Kita, KD Kimura, M Kobayashi, S Ihara, K Kaibuchi, S Kuroda, M Ui, H Iba, H Konishi, U Kikkawa, S Nagata, Y Fukui

JOURNAL OF CELL SCIENCE 111(7) 907-915 1998年4月査読有り
daf-2, an insulin receptor-like gene that regulates longevity and diapause in Caenorhabditis elegans

KD Kimura, HA Tissenbaum, YX Liu, G Ruvkun

SCIENCE 277(5328) 942-946 1997年8月査読有り
A target of phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate with a zinc finger motif similar to that of the ADP-ribosylation-factor GTPase-activating protein and two pleckstrin homology domains

K Tanaka, S ImajohOhmi, T Sawada, R Shirai, Y Hashimoto, S Iwasaki, K Kaibuchi, Y Kanaho, T Shirai, Y Terada, K Kimura, S Nagata, Y Fukui

EUROPEAN JOURNAL OF BIOCHEMISTRY 245(2) 512-519 1997年4月査読有り
P13キナーゼスーパーファミリーの構造と機能-最近の知見から

木村幸太郎, 福井泰久

生化学 68(5) 362-367 1996年5月25日査読有り
EGF or PDGF receptors activate atypical PKCλ, through phosphatidylinositol 3-kinase

Akimoto K, Takahashi R, Moriya S, Nishioka N, Takayanagi J, Kimura K, Fukui Y, Osada S.-I, Mizuno K, Hirai S.-I, Kazlauskas A, Ohno S

EMBO Journal 15(4) 788-798 1996年2月査読有り
SYNTHESIS OF 1-O-ALKYL-MYO-INOSITOL 3,4,5-TRISPHOSPHATES AND 1-O-ACYL-MYO-INOSITOL 3,4,5-TRISPHOSPHATES AS NOVEL ANALOGS OF PHOSPHATIDYL-MYO-INOSITOL 3,4,5-TRISPHOSPHATE

T SAWADA, R SHIRAI, Y MATSUO, Y KABUYAMA, K KIMURA, Y FUKUI, Y HASHIMOTO, S IWASAKI

BIOORGANIC & MEDICINAL CHEMISTRY LETTERS 5(19) 2263-2266 1995年10月査読有り
NEURITE OUTGROWTH OF PC12 CELLS IS SUPPRESSED BY WORTMANNIN, A SPECIFIC INHIBITOR OF PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE

K KIMURA, S HATTORI, Y KABUYAMA, Y SHIZAWA, J TAKAYANAGI, S NAKAMURA, S TOKI, Y MATSUDA, K ONODERA, Y FUKUI

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 269(29) 18961-18967 1994年7月査読有り
INHIBITION OF HISTAMINE-SECRETION BY WORTMANNIN THROUGH THE BLOCKADE OF PHOSPHATIDYLINOSITOL 3-KINASE IN RBL-2H3 CELLS

H YANO, S NAKANISHI, K KIMURA, N HANAI, Y SAITOH, Y FUKUI, Y NONOMURA, Y MATSUDA

JOURNAL OF BIOLOGICAL CHEMISTRY 268(34) 25846-25856 1993年12月査読有り

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主要なMISC

クローズアップ実験法 series 338 三次元自動細胞追跡ツール:3DeeCellTrackerで解析できることと使い方

WEN Chentao, 木村幸太郎

実験医学 39(14) 2021年
統計解析 III.運動・行動解析 6.機械学習による移動行動解析の考え方

木村幸太郎

実験医学増刊「機械学習を生命科学に使う！」 38(20) 2020年招待有り
生物のナビゲーションに学ぶ(第4回)動物ナビゲーションの神経基盤

木村幸太郎, 佐藤正晃, 佐倉緑

遺伝 : 生物の科学 72(5) 512-518 2018年9月
感覚情報の微分・積分による線虫の意思決定

谷本悠生, 木村幸太郎

生物物理 58(2) 83-85 2018年
匂いナビゲーションのための線虫の「意思決定」とその情報演算 : 感覚情報の微分・積分による効率的なナビゲーション戦略 (特集生物のナビゲーションを科学する : なぜたどりつけるのか : 生物のナビゲーションに秘められた謎に迫る)

谷本悠生, 木村幸太郎

遺伝 : 生物の科学 71(6) 512-518 2017年11月
匂い濃度の微分と積分による線虫の意思決定

木村幸太郎, 谷本悠生

Aroma research = アロマリサーチ : journal of aroma science technology and safety 18(3) 266-271 2017年
ロボット顕微鏡システムによる神経細胞活動計測と操作 : 線虫のドーパミン細胞と刺激応答行動の関連の解明 (特集光×ロボット)

谷本悠生, 木村幸太郎

Optronics : 光技術コーディネートジャーナル 35(12) 69-74 2016年12月
ロボット顕微鏡が解析する線虫の行動とドーパミンの関係

木村幸太郎, 谷本悠生

日本ロボット学会誌 = Journal of the Robotics Society of Japan 34(9) 609-613 2016年11月
線虫の忌避匂い学習にはドーパミンが必要

木村幸太郎

Aroma Research 12(1) 50-51 2011年2月

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講演・口頭発表等

線虫×ロボット顕微鏡×人工知能」で解明する脳の基本的動作原理

木村幸太郎

順天堂大学大学院医学研究科 DBSB Seminar 2022年4月15日招待有り
進化を越えて保存されたドーパミンの役割とは何か？〜線虫の遺伝学および機械学習による汎動物学的行動分析から見えてくるもの〜

木村幸太郎

大阪大学蛋白質研究所セミナー「多様なドーパミン神経伝達から脳を探る」 2021年12月13日招待有り
“Machine learning × worm’s brain and behavior” and beyond

木村幸太郎, Wen Chentao

京都大学大学院理学研究科 MACS教育プログラムデータ駆動生物学ワークショップ 2021年3月23日招待有り
C. エレガンスの情報処理〜分子レベルから全脳神経活動へ

木村幸太郎, Wen Chentao

北海道大学脳科学研究教育センターシンポジウム「感覚と運動の神経基盤の進化〜非哺乳類脳から学ぶ計算原理〜」 2020年11月13日招待有り
シンプルな神経系における「演算」と「因果律」

木村幸太郎

応用物理学会秋季学術講演会 2019年9月19日招待有り
Data-driven predictive models for information processing in the (small) brain.

Chentao Wen, Kotaro Kimura

Neuro2019（第42回日本神経科学大会第62回日本神経化学会大会）公募シンポジウム「データ駆動型／モデル駆動型神経科学研究の幕開け」 2019年7月26日招待有り
微分・積分フィルタによる線虫の意思決定

木村幸太郎

RIMS共同研究「自己組織化による適応フィルタの創発性について」（京都大学数理解析研究所） 2019年5月22日招待有り
線虫の脳における数学的計算と"因果律"」

木村幸太郎

統合量子素子研究室セミナー（高知工科大学） 2019年4月12日招待有り
（線虫の）脳活動を理解するための微分積分とcausality

木村幸太郎

「数学の創成」研究会（北海道大学理学部） 2019年2月16日招待有り
Robotic Microscope System for Studying the basie principles of brain function

木村幸太郎

Micro-Nano Bio platform and Its Applications, 2018 International Symposium on Mcro-Nano Mechatronics and Human Science 2018年12月10日招待有り
Neural mechanism of animal navigation

木村幸太郎

Understanding Human and Animal Behavior, Distributed, Ambient and Pervasive Interactions, 20th International conference on Human-Computer Interaction. 2018年7月18日招待有り
The multiplex regulation of neural circuits for odor learning in worms

木村幸太郎

RIKEN CBS Forum, 2018年4月20日招待有り
Calcium dynamics regulating the timing of decision-making in C. elegans

木村幸太郎

Columbia University, Informal seminar 2017年9月14日招待有り
Calcium dynamics regulating the timing of decision-making in C. elegans

木村幸太郎

Princeton University, Informal seminar 2017年9月13日招待有り
Calcium dynamics regulating the timing of decision-making in C. elegans

木村幸太郎

The Optical Revolution in Physiology: From Membrane to Brain, Society of General Physiologists 71st Annual Symposium. 2017年9月9日
Reading the mind of a worm—with a robot microscope and machine learning analysis

木村幸太郎

Harvard University, Informal seminar 2017年9月5日招待有り
Differential equations for decision-making in worm’s navigation

木村幸太郎

IEEE ICMA 2017 Conference, Tutorial Workshops on Systems Science on Bio-navigation 2017年8月6日招待有り
Measuring the mind of a worm: In actio optophysiological analyses of neural activity in the nematode C. elegans

木村幸太郎

Lecture, Neuroscience Program in Academia Sinica (Taipei, Taiwan) 2016年9月21日招待有り
A neuronal algorithm for navigation along a repulsive odor gradient in the nematode C. elegans.

木村幸太郎

Seminar, Center for Functional Connectomics, Korea Institute of Science and Technology (Seoul, Korea) 2013年6月19日招待有り
Repulsive odor learning regulated by dopamine signaling in worms

木村幸太郎

Comprehensive Brain Science Network. Symposium — Reward and aversive information processing and monoamine signalings (Kobe, Japan) 2011年8月22日招待有り

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担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

自律的に計測・介入を行うχログボットのアルゴリズム開発

日本学術振興会科学研究費助成事業学術変革領域研究(A) 学術変革領域研究(A) 2021年9月 - 2026年3月

前川卓也、木村幸太郎、竹内孝
自動追跡ロボット技術と超高速三次元イメージング技術の統合による脳動作原理の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 国際共同研究加速基金(国際共同研究強化(B)) 2022年10月 - 2025年3月

木村幸太郎, 武石明佳, 大友康平, 堤元佐
遺伝学と全脳イメージングで解明する「複数型ドーパミン受容体による学習の多重制御」

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2021年4月 - 2025年3月

木村幸太郎, 加藤昇平, 佐久間拓人, 疋田貴俊
新生児脳におけるニューロン新生とその病態：先端分析技術による統合的理解

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(S) 基盤研究(S) 2020年8月 - 2025年3月

澤本和延, 齋藤伸治, 木村幸太郎, 財津桂
脳神経細胞ネットワークの理解と人工再構築に向けて

自然科学研究機構生命創成探究センター (ExCELLS) ExCELLS課題研究（シーズ発掘） 2022年6月 - 2023年3月

木村幸太郎, 青木一洋, 根本知己, 本田直樹
遺伝学とイメージングによる「感情」の基本原理の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的研究(萌芽) 挑戦的研究(萌芽) 2021年7月 - 2023年3月

木村幸太郎、中川敦子
生物ナビゲーションのシステム科学

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2021年4月 - 2022年3月

橋本浩一, 木村幸太郎, 前川卓也, 小川宏人
神経科学・光工学・データ科学の融合による線虫の全脳機能的神経回路の同定

自然科学研究機構分野融合型共同研究事業 2020年4月 - 2022年3月

木村幸太郎, 根本知己, 大友康平, 竹内一郎
人工知能とデータ科学に基づく神経活動と動物行動の関連解析

理化学研究所革新知能統合研究センター共同研究 2017年4月 - 2022年3月

竹内一郎, 木村幸太郎
線虫の全脳イメージングによる探索型ナビゲーション神経基盤の解明

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2016年6月 - 2021年3月

木村幸太郎, 石原健
生物ナビゲーションのシステム科学（総括班）

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2016年6月 - 2021年3月

橋本浩一, 木村幸太郎, 妻木勇一, 竹内一郎, 前川卓也, 玉木徹, 依田憲, 高橋晋, 飛龍志津子, 小川宏人
「移動」を中心とした理学とデータ科学と基礎医学の融合研究

名古屋市立大学特別研究奨励費（国の競争的資金獲得活性化事業） 2019年4月 - 2021年3月

木村幸太郎, 澤本和延, 中川秀彦
人工知能を用いた生体神経回路ダイナミクスの理解

公益財団法人豊秋奨学会研究費助成 2018年10月 - 2020年9月

木村幸太郎, 竹内一郎
線虫の全脳イメージングによる探索型ナビゲーション神経基盤の解明

文科省新学術領域研究 2016年 - 2020年

木村幸太郎
光刺激ビジュアルサーボ顕微鏡の開発

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(A) 基盤研究(A) 2013年5月 - 2017年3月

橋本浩一, 木村幸太郎, 東谷篤志, 鏡慎吾, 荒井翔悟
光刺激ビジュアルサーボ顕微鏡の開発

文科省基盤研究（Ａ）（分担） 2013年 - 2016年

木村幸太郎
線虫Ｃ．ｅｌｅｇａｎｓの匂い応答行動を制御する神経ネットワークの統合的機能解析

日本学術振興会科学研究費助成事業新学術領域研究(研究領域提案型) 新学術領域研究(研究領域提案型) 2011年4月 - 2013年3月

木村幸太郎
線虫C. elegansの匂い応答行動を制御する神経ネットワークの統合的機能解析

文科省新学術領域研究 2011年 - 2013年

木村幸太郎
追跡型新規カルシウムイメージングシステムによるシンプルな神経回路活動の動作原理の解明

三菱財団自然科学助成 2011年 - 2012年

木村幸太郎
線虫G. elegansの忌避行動を制御するドーパミンシグナル伝達の逆遺伝学的解析

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(C) 基盤研究(C) 2009年 - 2011年

木村幸太郎