清水啓介 (KEISUKE SHIMIZU) - マイポータル

基本情報

所属: 国立研究開発法人海洋研究開発機構地球環境部門　地球表層システム研究センター副主任研究員

学位: 博士(理学)(2014年東京大学)

研究者番号: 00757776
J-GLOBAL ID: 202001020907806593
researchmap会員ID: R000014832

研究キーワード

バイオミネラリゼーション、形態進化、分子進化、進化発生学、海洋酸性化、軟体動物、腕足動物、浮遊性有孔虫

研究分野

自然科学一般 / 地球生命科学 / 進化生物学、進化発生学、進化古生物学、系統分類学、海洋生態学

経歴

2024年4月 - 現在

国立研究開発法人海洋研究開発機構, 地球環境部門地球表層システム研究センター, 副主任研究員
2023年4月 - 2024年3月

早稲田大学, 教育・総合科学学術院, 嘱託職員
2021年7月 - 2023年3月

東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 特任助教
2019年12月 - 2021年6月

東京大学, 大学院農学生命科学研究科, 特任研究員
2017年12月 - 2019年11月

独立行政法人日本学術振興会, 海外特別研究員
2015年4月 - 2018年3月

国立研究開発法人海洋研究開発機構, 海洋生命理工学研究開発センター, ポストドクトラル研究員
2014年6月 - 2015年3月

京都大学, 大学院理学研究科生物科学専攻, 特定研究員
2014年4月 - 2014年5月

東京大学, 大学院理学系研究科, 特任研究員

学歴

2011年4月 - 2014年3月

東京大学, 大学院理学系研究科大学院博士課程, 地球惑星科学専攻
2009年4月 - 2011年3月

筑波大学, 教育研究科, 教科教育専攻
2004年4月 - 2008年3月

信州大学, 理学部, 生物科学科

論文

Zinc accumulation in the jaw of Nereis aibuhitensis.

Yugo Kato, Wataru Kashiwabara, Mayumi Iijima, Keisuke Shimizu, Lumi Negishi, Hitoshi Kurumizaka, Yu Maekawa, Takenori Sasaki, Akiko Hokura, Shino Homma-Takeda …

The Journal of experimental biology 229(8) 2026年4月15日査読有り
Brachiopod genome unveils the evolution of BMP signalling in bilaterian body patterning.

Thomas D Lewin, Tosuke Sakagami, Keisuke Shimizu, Li-Jung Kao, Yi-Ling Chiu, Isabel Jiah-Yih Liao, Mu-En Chen, Kanako Hisata, Kazuyoshi Endo, Noriyuki Satoh …

Nature communications 2026年3月12日査読有り
A window into the effect of ocean acidification on molluscan larval shell development using a quantitative approach

Keisuke Shimizu, Katsunori Kimoto, Masahide Wakita, Takenori Sasaki

JOURNAL OF MOLLUSCAN STUDIES 91(3) 2025年9月査読有り筆頭著者責任著者
Wnt activation causes shell malformation in lymnaeoidean gastropods

Shigeaki Ohta, Koji Noshita, Katsunori Kimoto, Akito Ishikawa, Hideaki Sato, Keisuke Shimizu, Kazuyoshi Endo

Journal of Molluscan Studies 91(1) 2025年2月26日査読有り
Possible roles of Wnt in the shell growth of the pond snail Lymnaea stagnalis

Shigeaki Ohta, Koji Noshita, Katsunori Kimoto, Akito Ishikawa, Hideaki Sato, Keisuke Shimizu, Kazuyoshi Endo

Scientific Reports 14(1) 2024年11月3日査読有り
Diversification of von Willebrand Factor A and Chitin-Binding Domains in Pif/BMSPs Among Mollusks

Keisuke Shimizu, Lumi Negishi, Hitoshi Kurumizaka, Michio Suzuki

Journal of Molecular Evolution 2024年6月12日査読有り筆頭著者
Structural and functional analyses of chitinolytic enzymes in the nacreous layer of Pinctada fucata

Lingxiao Zhu, Keisuke Shimizu, Hiroyuki Kintsu, Lumi Negishi, Zehua Zheng, Hitoshi Kurumizaka, Shohei Sakuda, Isao Kuriyama, Takashi Atsumi, Kaoru Maeyama …

BIOCHEMICAL ENGINEERING JOURNAL 191 2023年2月査読有り
Evolution of nacre- and prisms-related shell matrix proteins in the pen shell, Atrina pectinata.

Keisuke Shimizu, Lumi Negishi, Takumi Ito, Shogo Touma, Toshie Matsumoto, Masahiko Awaji, Hitoshi Kurumizaka, Kazutoshi Yoshitake, Shigeharu Kinoshita, Shuichi Asakawa …

Comparative biochemistry and physiology. Part D, Genomics & proteomics 44 101025-101025 2022年12月査読有り筆頭著者
Evolution of EGF-like and Zona pellucida domains containing shell matrix proteins in mollusks.

Keisuke Shimizu, Takeshi Takeuchi, Lumi Negishi, Hitoshi Kurumizaka, Isao Kuriyama, Kazuyoshi Endo, Michio Suzuki

Molecular biology and evolution 39(7) 2022年7月7日査読有り筆頭著者
Dimorphic life cycle through transverse division in burrowing hard coral Deltocyathoides orientalis.

Asuka Sentoku, Keisuke Shimizu, Tsubasa Naka, Yuki Tokuda

Scientific reports 12(1) 9359-9359 2022年6月7日査読有り
Phylogeography and shell morphology of the pelagic snail Limacina helicina in the Okhotsk Sea and western North Pacific

Keisuke Shimizu, Koji Noshita, Katsunori Kimoto, Takenori Sasaki

MARINE BIODIVERSITY 51(2) 2021年4月査読有り筆頭著者責任著者
Evolution of Biomineralization Genes in the Prismatic Layer of the Pen Shell Atrina pectinata.

Keisuke Shimizu, Hiroyuki Kintsu, Masahiko Awaji, Toshie Matumoto, Michio Suzuki

Journal of molecular evolution 88(10) 742-758 2020年12月査読有り筆頭著者
Hydrophilic Shell Matrix Proteins ofNautilus pompiliusand The Identification of a Core Set of Conchiferan Domains

Davin H. E. Setiamarga, Kazuki Hirota, Masa-aki Yoshida, Yusuke Takeda, Keiji Kito, Keisuke Shimizu, Yukinobu Isowa, Kazuho Ikeo, Takenori Sasaki, Kazuyoshi Endo

2020年11月16日査読有り
Characterization of the chalky layer-derived EGF-like domain-containing protein (CgELC) in the pacific oyster, Crassostrea gigas.

Shihori Iwamoto, Keisuke Shimizu, Lumi Negishi, Nobuo Suzuki, Koji Nagata, Michio Suzuki

Journal of structural biology 212(1) 107594-107594 2020年10月1日査読有り筆頭著者
Functional shell matrix proteins tentatively identified by asymmetric snail shell morphology.

Akito Ishikawa, Keisuke Shimizu, Yukinobu Isowa, Takeshi Takeuchi, Ran Zhao, Keiji Kito, Manabu Fujie, Noriyuki Satoh, Kazuyoshi Endo

Scientific reports 10(1) 9768-9768 2020年6月17日査読有り
Insights into the Evolution of Shells and Love Darts of Land Snails Revealed from Their Matrix Proteins.

Keisuke Shimizu, Kazuki Kimura, Yukinobu Isowa, Kenshiro Oshima, Makiko Ishikawa, Hiroyuki Kagi, Keiji Kito, Masahira Hattori, Satoshi Chiba, Kazuyoshi Endo

Genome biology and evolution 11(2) 380-397 2019年2月1日査読有り
Phylogeography of the pelagic snail Limacina helicina (Gastropoda: Thecosomata) in the subarctic western North Pacific

Keisuke Shimizu, Katsunori Kimoto, Koji Noshita, Masahide Wakita, Tetsuichi Fujiki, Takenori Sasaki

JOURNAL OF MOLLUSCAN STUDIES 84 30-37 2018年2月査読有り
Possible co-option of engrailed during brachiopod and mollusc shell development.

Keisuke Shimizu, Yi-Jyun Luo, Noriyuki Satoh, Kazuyoshi Endo

Biology letters 13(8) 2017年8月査読有り
Geometric analysis and estimation of the growth rate gradient on gastropod shells.

Koji Noshita, Keisuke Shimizu, Takenori Sasaki

Journal of theoretical biology 389 11-9 2016年1月21日査読有り
Evo-Devo of spiral shell growth in gastropods

KEISUKE Shimizu, Kazuyoshi Endo

130-137 2015年査読有り筆頭著者責任著者

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講演・口頭発表等

Effects of ocean acidification on larval shell development in Scallop

清水啓介 (海洋研究開発機構)、木元克典 (海洋研究開発機構)、脇田昌英 (海洋研究開発機構)

The International Symposium on the Okhotsk Sea & Polar Oceans 2026年2月17日
浮遊性有孔虫の遺伝子解析の基盤構築

清水啓介 (海洋研究開発機構)

CREST「海洋カーボン」第３回領域会議 2025年11月27日
100 年後の海では貝が殻を作りにくくなる? ~酸性化が進んだ“海の脅威”~

清水啓介 (海洋研究開発機構)

第21回むつ海洋・環境科学シンポジウム 2025年11月19日
二枚貝幼生の貝殻成長の定量解析 -酸性化実験を例に-

清水啓介 (海洋研究開発機構)、木元克典 (海洋研究開発機構)、脇田昌英 (海洋研究開発機構)、遊佐貴志 (青森県産業技術センター)

第20回バイオミネラリゼーションワークショップ 2025年11月13日
海洋酸性化による貝殻形成への影響

清水啓介 (海洋研究開発機構)

海洋酸性化適応プロジェクトワークショップ 2025年10月30日招待有り
ミドリシャミセンガイに残された付着痕の形成過程と保存性の解析

吉原桃果 (琉球大学), 千徳明日香(琉球大学), 長澤祥太郎(琉球大学), 清水啓介(JAMSTEC)

第96回日本動物学会 (2025) 2025年9月5日
有殻翼足類ミジンウキマイマイの分子系統地理

清水啓介 (海洋研究開発機構), 木元克典 (海洋研究開発機構), 松野孝平 (北海道大学), 山口篤 (北海道大学), 野下浩司 (九州大学)

第96回日本動物学会 (2025) 2025年9月5日

担当経験のある科目(授業)

2022年9月 - 2023年3月

地学通論実験II (早稲田大学)
2022年4月 - 2023年3月

生命の歩み (全学共通カリキュラム) (立教大学)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

貝殻と分子から解く海洋環境変化に対する生物応答

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2025年4月 - 2029年3月

清水啓介, 木元克典, 脇田昌英
海洋酸性化によるホタテガイ幼生への影響評価と将来予測

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 2023年4月 - 2027年3月

木元克典, 脇田昌英, 藤井賢彦, 清水啓介
腕足動物におけるキチンを介した貝殻形成の分子機構

公益社団法人日本動物学会茗原眞路子研究奨励助成 2022年8月 - 2023年7月
季節海氷域における海洋酸性化と石灰質生物の応答メカニズムの解明

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2019年4月 - 2023年3月

木元克典, 山口篤, 下島公紀, 清水啓介
有殻翼足類の高精度観測：海洋酸性化に対する応答

日本学術振興会科学研究費助成事業基盤研究(B) 基盤研究(B) 2016年4月 - 2019年3月

木元克典, 佐々木洋, 清水啓介
貝殻形成メカニズムから探る酸性化影響の実態と環境適応の可能性

日本学術振興会科学研究費助成事業研究活動スタート支援研究活動スタート支援 2015年8月 - 2017年3月

清水啓介
軟体動物の貝殻色素：その正体から模様形成へ

日本学術振興会科学研究費助成事業挑戦的萌芽研究挑戦的萌芽研究 2014年4月 - 2017年3月

遠藤一佳, 加藤尚志, 佐藤矩行, 藤江学, 清水啓介, 鍵裕之, 佐々木猛智, 服部正平, 大島健志朗, 筒井・石川牧子
軟体動物の貝殻が巻く分子メカニズム：貝殻形態の進化発生学的解析

日本学術振興会科学研究費助成事業特別研究員奨励費特別研究員奨励費 2012年 - 2013年

清水啓介

メディア報道

発見！あおもり深世界～どうなる？陸奥湾のホタテ～

NHK青森放送局 2026年4月17日テレビ・ラジオ番組
酸性化する海未来の姿か

日本経済新聞 In Focus 環境アップデート 2026年4月2日新聞・雑誌
陸奥湾ホタテクライシス(3) 最新の取り組み

NHK青森放送局あっぷるワイド 2026年3月25日テレビ・ラジオ番組
紋別沖の環境変化を探る

民友新聞 2026年3月21日新聞・雑誌
ホタテの人工採苗試験に着手陸奥湾産再生目指し／野辺地町漁協

デーリー東北 2026年3月4日新聞・雑誌
陸奥湾ホタテ、青森・野辺地町漁協が人工種苗の実験開始

河北新報 2026年3月4日新聞・雑誌
ホタテ再生へ人工採苗に挑戦

東奥日報 2026年3月4日新聞・雑誌
「まずは陸奥湾で再生を」野辺地町漁協がホタテ人工採苗に挑む高水温やタイ食害で9割へい死

RAB青森放送 2026年3月3日テレビ・ラジオ番組
湾内初ホタテの人工種苗野辺地町漁協「まず陸奥湾で再生」

ABA青森朝日放送 2026年3月3日テレビ・ラジオ番組
「まず陸奥湾で再生しないといけない」大量死した青森県の「陸奥湾ホタテ」の復活に向けた挑戦

ATV青森テレビ 2026年3月3日テレビ・ラジオ番組
ホタテ、「海の酸性化」で成長妨げられ将来減少の可能性実験で判明

朝日新聞 2025年12月28日新聞・雑誌
CO2増加、貝類もピンチ

朝日新聞 2025年11月13日新聞・雑誌
「100年後、海で貝は育たない?」海洋機構の青森での研究で浮かんだ懸念とは

河北新報 2025年10月16日テレビ・ラジオ番組
「海の酸性化で貝が育たなくなる？ 100年後には「骨粗鬆症」状態に」

朝日新聞 2025年10月16日新聞・雑誌
未来の海では貝が育たない？ ―酸性化が進んだ"海の脅威"を数値化し、貝類幼生への影響を予測―

海洋研究開発機構 2025年9月18日インターネットメディア

その他

個人ホームページ

https://sites.google.com/view/kshimizu/home

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学歴

論文

講演・口頭発表等

担当経験のある科目(授業)

所属学協会

共同研究・競争的資金等の研究課題

メディア報道

その他

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